BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-025G19
ChromosomeX (Build37)
Map Location 67,787,847 - 67,897,684
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040409, LOC628053, LOC100040432
Upstream geneAff2, EG666577, 1700020N15Rik, Ids, 1110012L19Rik, 4930567H17Rik, LOC100040304, LOC628002, LOC628012, BC023829, EG547447, LOC666981
Downstream geneEG280121, LOC666993, Ppia-psx_466.1, EG628080, G630014P10Rik, LOC667013, Mtm1, Mtmr1, Cd99l2, LOC667017, Hmgb3, LOC100040549
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-025G19.bB6Ng01-025G19.g
ACCDH856780DH856781
length760958
definitionDH856780|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025G19, 5' end.DH856781|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025G19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,787,847 - 67,788,605)(67,896,718 - 67,897,684)
sequence
gaattcatgtcagcagttgtgtccgtcttcatagggttaatgggattcaa
ggtttggacctcccctgaggactgtgggtgcttaaaggaatgaatgaagt
gacagcagaacctggccatgtcctaaagtccaccctcacaggcagtaagt
gcctttcttacctaaggttcctgtcttagttagggttttactgctgtgaa
cagacaccatgaccatggcaagtcttaggaaaaacaacatttagctgggg
cttccttacaggttcagaagctcagtccattgtcatcaaggtggaagcat
ggcagcatcttggcaggcatggcgcaggcagagctgagagttctatgtct
tcatccaaaggctgctagtggaagactgacttccaggcaactagggtgag
gatcttaagcccacacccacagtgacacacctactccaaccaggacaaac
ctataccaacaaggccacacctccaaatggtgccatgccctgatccaaga
atatagaaaccatcacagtacctcgggatgaaaggggtgggtgtctttgg
tcagatgaggtctagtggaaaaggaagttgtcaggaaggatagataagat
gaatgcatgtaagctgtgcttcaggaaaccctgtcttagtagagatgatt
ctaggtcatgtgggcatcacttgagaccccacacaggttttgatgggata
caataccagctcaagtctttctgggagtgttgtgttttctcaggagccga
tgaaagagat
gaattcttcatataactatttgttgttgacttaaaaattcccaacagcat
ctttctacttcaccagtagagatatgcccattttccttcaccctaacttg
aacttagcttacaaaataaataattacagaatttttataaggcttaactt
atagagcttagccatttttgttttcattgtaagggatgggcctagagaac
tgagaataggtaagctataattggagcatgcctgggattggaatagagca
aaatgaaaagattaaaaactcacataccaaacaggcatataatggatttg
atgtgaaagtctctagtgagatgtaagaaattgaggctaaaaatctctat
cagaaagtccaagatatgagtgacaagacagtgtctgcatagtgcaaagc
aaacacaccttaagaagttttagtaacaagcaacggtaggtacaggatgc
agctgtggtgaggactagcagtaagaagttgagagctaaattggcctgga
ggctatgaggcatcctaccgtcccagtcatatgtgctgcacacagatgtc
tcagcagatgggcagatgggcaacttcagagaatcctggaaatggtcaga
cccaagctcccaaactgaaaatagcaacagaatcccaatgttcaatagac
atgcactccaagcatggagccaaggcaggcacccaggttcttagaagatc
ctggtttgctaaaagaaaaaggatcaccaagagaccatgagtttctagat
gtggaggagacaacaagggattggtcacagaaaagtggcaaaatatatat
ttattagggctgagggaaacagcttgagaacatgtagctataactcatca
gtgacacctccaggatggaatttctattcccatttctctcggcggctgca
ggctgtctgtctccctcttctgtttctctcctcttctcccatatgtgtga
tgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_67787847_67788605
seq2: B6Ng01-025G19.b_44_803

seq1  GAATTCATGTCAGCAGTTGTGTCCGTCTTCATAGGGTTAATGGGATTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGTCAGCAGTTGTGTCCGTCTTCATAGGGTTAATGGGATTCAA  50

seq1  GGTTTGGACCTCCCCTGAGGACTGTGGGTGCTTAAAGGAATGAATGAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGACCTCCCCTGAGGACTGTGGGTGCTTAAAGGAATGAATGAAGT  100

seq1  GACAGCAGAACCTGGCCATGTCCTAAAGTCCACCCTCACAGGCAGTAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCAGAACCTGGCCATGTCCTAAAGTCCACCCTCACAGGCAGTAAGT  150

seq1  GCCTTTCTTACCTAAGGTTCCTGTCTTAGTTAGGGTTTTACTGCTGTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTCTTACCTAAGGTTCCTGTCTTAGTTAGGGTTTTACTGCTGTGAA  200

seq1  CAGACACCATGACCATGGCAAGTCTTAGGAAAAACAACATTTAGCTGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACACCATGACCATGGCAAGTCTTAGGAAAAACAACATTTAGCTGGGG  250

seq1  CTTCCTTACAGGTTCAGAAGCTCAGTCCATTGTCATCAAGGTGGAAGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTACAGGTTCAGAAGCTCAGTCCATTGTCATCAAGGTGGAAGCAT  300

seq1  GGCAGCATCTTGGCAGGCATGGCGCAGGCAGAGCTGAGAGTTCTATGTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCATCTTGGCAGGCATGGCGCAGGCAGAGCTGAGAGTTCTATGTCT  350

seq1  TCATCCAAAGGCTGCTAGTGGAAGACTGACTTCCAGGCAACTAGGGTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCAAAGGCTGCTAGTGGAAGACTGACTTCCAGGCAACTAGGGTGAG  400

seq1  GATCTTAAGCCCACACCCACAGTGACACACCTACTCCAACCAGGACAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTAAGCCCACACCCACAGTGACACACCTACTCCAACCAGGACAAAC  450

seq1  CTATACCAACAAGGCCACACCTCCAAATGGTGCCATGCCCTGATCCAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACCAACAAGGCCACACCTCCAAATGGTGCCATGCCCTGATCCAAGA  500

seq1  ATATAGAAACCATCACAGTACCTCGGGATGAAAGGGGTGGGTGTCTTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGAAACCATCACAGTACCTCGGGATGAAAGGGGTGGGTGTCTTTGG  550

seq1  TCAGATGAGGTCTAGTGGAAAAGGAAGTTGTCAGGAAGGATAGATAAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATGAGGTCTAGTGGAAAAGGAAGTTGTCAGGAAGGATAGATAAGAT  600

seq1  GAATGCATGTAAGCTGTGCTTCAGGAAACCCTGTCTTAGTAGAGATGATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCATGTAAGCTGTGCTTCAGGAAACCCTGTCTTAGTAGAGATGATT  650

seq1  CTAGGTCATGTGGGCATCACTTGAGACCCCACACAGGTTTTGATGGGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTCATGTGGGCATCACTTGAGACCCCACACAGGTTTTGATGGGATA  700

seq1  CAATACCAGCTCAAGTC-TTCTGGGAGTGTTGTG-TTTCTCAGGGAGCCG  748
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||
seq2  CAATACCAGCTCAAGTCTTTCTGGGAGTGTTGTGTTTTCTCA-GGAGCCG  749

seq1  ATGAAAGAGAT  759
      |||||||||||
seq2  ATGAAAGAGAT  760

seq1: chrX_67896718_67897684
seq2: B6Ng01-025G19.g_66_1023 (reverse)

seq1  CACACACA-CACACATATGCGGAGAAAGAGAGAGAGAAACAGAAAGAGGG  49
      |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||
seq2  CACACACATCACACATATG-GGAG-AAGAG-GAGAGAAACAG-AAGAGGG  46

seq1  AGACAGACAGACAGACAGACAGACAGAGAGAAAAATGAGAAATAGAAATT  99
      |||||||||| | |     ||| |   |||| ||||| | ||||||||||
seq2  AGACAGACAGCCTG-----CAGCCGCCGAGAGAAATG-GGAATAGAAATT  90

seq1  CCATCCTGGAGGTGTCACTGATGAGTTATAGCTACATGTTCTCAAGCTGT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTGGAGGTGTCACTGATGAGTTATAGCTACATGTTCTCAAGCTGT  140

seq1  TTCCCTCAGCCCTAATAAATATATATTTTGCCACTTTTCTGTGACCAATC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCAGCCCTAATAAATATATATTTTGCCACTTTTCTGTGACCAATC  190

seq1  CCTTGTTGTCTCCTCCACATCTAGAAACTCATGGTCTCTTGGTGATCCTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTTGTCTCCTCCACATCTAGAAACTCATGGTCTCTTGGTGATCCTT  240

seq1  TTTCTTTTAGCAAACCAGGATCTTCTAAGAACCTGGGTGCTTGCCTTGGC  299
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTCTTTTAGCAAACCAGGATCTTCTAAGAACCTGGGTGCCTGCCTTGGC  290

seq1  TCCATGCTTGGAGTGCATGTCTATTGAACATTGGGATTCTGTTGCTATTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCTTGGAGTGCATGTCTATTGAACATTGGGATTCTGTTGCTATTT  340

seq1  TCAGTTTGGGAGCTTGGGTCTGACCATTTCCAGGATTCTCTGAAGTTGCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTTGGGAGCTTGGGTCTGACCATTTCCAGGATTCTCTGAAGTTGCC  390

seq1  CATCTGCCCATCTGCTGAGACATCTGTGTGCAGCACATATGACTGGGACG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCCCATCTGCTGAGACATCTGTGTGCAGCACATATGACTGGGACG  440

seq1  GTAGGATGCCTCATAGCCTCCAGGCCAATTTAGCTCTCAACTTCTTACTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGATGCCTCATAGCCTCCAGGCCAATTTAGCTCTCAACTTCTTACTG  490

seq1  CTAGTCCTCACCACAGCTGCATCCTGTACCTACCGTTGCTTGTTACTAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTCCTCACCACAGCTGCATCCTGTACCTACCGTTGCTTGTTACTAAA  540

seq1  ACTTCTTAAGGTGTGTTTGCTTTGCACTATGCAGACACTGTCTTGTCACT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTTAAGGTGTGTTTGCTTTGCACTATGCAGACACTGTCTTGTCACT  590

seq1  CATATCTTGGACTTTCTGATAGAGATTTTTAGCCTCAATTTCTTACATCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCTTGGACTTTCTGATAGAGATTTTTAGCCTCAATTTCTTACATCT  640

seq1  CACTAGAGACTTTCACATCAAATCCATTATATGCCTGTTTGGTATGTGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAGAGACTTTCACATCAAATCCATTATATGCCTGTTTGGTATGTGAG  690

seq1  TTTTTAATCTTTTCATTTTGCTCTATTCCAATCCCAGGCATGCTCCAATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAATCTTTTCATTTTGCTCTATTCCAATCCCAGGCATGCTCCAATT  740

seq1  ATAGCTTACCTATTCTCAGTTCTCTAGGCCCATCCCTTACAATGAAAACA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTTACCTATTCTCAGTTCTCTAGGCCCATCCCTTACAATGAAAACA  790

seq1  AAAATGGCTAAGCTCTATAAGTTAAGCCTTATAAAAATTCTGTAATTATT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGCTAAGCTCTATAAGTTAAGCCTTATAAAAATTCTGTAATTATT  840

seq1  TATTTTGTAAGCTAAGTTCAAGTTAGGGTGAAGGAAAATGGGCATATCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTGTAAGCTAAGTTCAAGTTAGGGTGAAGGAAAATGGGCATATCTC  890

seq1  TACTGGTGAAGTAGAAAGATGCTGTTGGGAATTTTTAAGTCAACAACAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGTGAAGTAGAAAGATGCTGTTGGGAATTTTTAAGTCAACAACAAA  940

seq1  TAGTTATATGAAGAATTC  967
      ||||||||||||||||||
seq2  TAGTTATATGAAGAATTC  958