BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032H02
ChromosomeX (Build37)
Map Location 91,469,996 - 91,471,007
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneArx, Pola1, EG629581, Pcyt1b, Pdk3, EG668103, LOC100042041, AU015836, EG245516, LOC100042062, EG629591, Zfx, Eif2s3x
Downstream geneKlhl15, LOC385495, LOC670263, LOC100042098, LOC631145, 0610008C08Rik, EG668148, Maged1, LOC668150, EG385499, EG668156, Gspt2, LOC385500, Zxdb, LOC631331, EG631319, Zxda, Gm371, 9630042H07Rik, Arhgef9, LOC619688
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032H02.b
ACCDH861779
length1,007
definitionDH861779|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032H02, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccggatccttttgcttctaactccctagggctcataacttctaaa
tatttccattagtagaaggtattgtctatgttaatgtttcaaagtaagaa
tatttagttaacatagcaatagtcattgcattttgtttgtttgtttgttt
gtttcttctaagcagagtttctctgtgtagccttggctgtcccagaactc
ttggctggcctcaaactcatagagatccaagtgcctctgcttccggaatg
ctgggattaaaggcgtgcaccgccgacaccaccaccacctggcacatctt
ttgatggttgatgttaaaagatacttatactgtctttttcaaaagtttgt
cttttatgatcttattagcatgtatatgttttgatgactgtaagcttctt
gtgtgtatgcctgtggagctcagaagaggtcatcagataccctggagctg
gagttaccagcagttctcagtcatgtgagcgctgggaattgaactagtcc
acgagaagatcagtaaatgctcttaatcaatgagccatctctcagcccta
gtatccctgcctcgcccctttgagactagatttcctgtagtacagacaag
cattaaactaacactatctacatgatgtggtctttctgctttcatctccc
aagtgctggcattacaagtgtgactccaccctacgctgtgctcaccctac
ccaaccccccccccccatgttctaatactgcatcccagtctggtcttgaa
ctcaagatgatcctcctgcctcagcatccactcaagctctgaactaacac
acttttttcccctttttttacccagcttgtagcacaccgtgctgtctcat
cttttccattttatttatttattattgtgtgtttataatatgtgtgcttg
tgtatgtgcacatgtggaagtcagaggtaagttatggagttcccttctac
cttatatgggttctggagattgaattcagtgtcagcttgcctggcaagca
cctttac
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_91469996_91471007
seq2: B6Ng01-032H02.b_44_1050

seq1  GAATTCCGGATCCTTTTGCTTCTAACTCCCTAGGGCTCATAACTTCTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCGGATCCTTTTGCTTCTAACTCCCTAGGGCTCATAACTTCTAAA  50

seq1  TATTTCCATTAGTAGAAGGTATTGTCTATGTTAATGTTTCAAAGTAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCATTAGTAGAAGGTATTGTCTATGTTAATGTTTCAAAGTAAGAA  100

seq1  TATTTAGTTAACATAGCAATAGTCATTGCATTTTGTTTGTTTGTTTGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGTTAACATAGCAATAGTCATTGCATTTTGTTTGTTTGTTTGTTT  150

seq1  GTTTCTTCTAAGCAGAGTTTCTCTGTGTAGCCTTGGCTGTCCCAGAACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTTCTAAGCAGAGTTTCTCTGTGTAGCCTTGGCTGTCCCAGAACTC  200

seq1  TTGGCTGGCCTCAAACTCATAGAGATCCAAGTGCCTCTGCTTCCGGAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGGCCTCAAACTCATAGAGATCCAAGTGCCTCTGCTTCCGGAATG  250

seq1  CTGGGATTAAAGGCGTGCACCGCCGACACCACCACCACCTGGCACATCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGATTAAAGGCGTGCACCGCCGACACCACCACCACCTGGCACATCTT  300

seq1  TTGATGGTTGATGTTAAAAGATACTTATACTGTCTTTTTCAAAAGTTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGGTTGATGTTAAAAGATACTTATACTGTCTTTTTCAAAAGTTTGT  350

seq1  CTTTTATGATCTTATTAGCATGTATATGTTTTGATGACTGTAAGCTTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTATGATCTTATTAGCATGTATATGTTTTGATGACTGTAAGCTTCTT  400

seq1  GTGTGTATGCCTGTGGAGCTCAGAAGAGGTCATCAGATACCCTGGAGCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATGCCTGTGGAGCTCAGAAGAGGTCATCAGATACCCTGGAGCTG  450

seq1  GAGTTACCAGCAGTTCTCAGTCATGTGAGCGCTGGGAATTGAACTAGTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTACCAGCAGTTCTCAGTCATGTGAGCGCTGGGAATTGAACTAGTCC  500

seq1  ACGAGAAGATCAGTAAATGCTCTTAATCAATGAGCCATCTCTCAGCCCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGAAGATCAGTAAATGCTCTTAATCAATGAGCCATCTCTCAGCCCTA  550

seq1  GTATCCCTGCCTCGCCCCTTTGAGACTAGATTTCCTGTAGTACAGACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCCTGCCTCGCCCCTTTGAGACTAGATTTCCTGTAGTACAGACAAG  600

seq1  CATTAAACTAACACTATCTACATGATGTGGTCTTTCTGCTTTCATCTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAACTAACACTATCTACATGATGTGGTCTTTCTGCTTTCATCTCCC  650

seq1  AAGTGCTGGCATTACAAGTGTGACTCCACCCTACGCTGTGCTCACCCTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCTGGCATTACAAGTGTGACTCCACCCTACGCTGTGCTCACCCTAC  700

seq1  CCAACCCCCCCCCCCCATGTTCTAATACTGCATCCCAGTCTGGTCTTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCCCCCCCCCCCATGTTCTAATACTGCATCCCAGTCTGGTCTTGAA  750

seq1  CTCAAGATGATCCTCCTGCCTCAGCATCCACTCAGGCTCTGAACTAACAC  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTCAAGATGATCCTCCTGCCTCAGCATCCACTCAAGCTCTGAACTAACAC  800

seq1  ACTTTTTTCCCC-TTTTTTACCCAGCTTGTAGCACACCGTGCTGTCTCAT  849
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTTCCCCTTTTTTTACCCAGCTTGTAGCACACCGTGCTGTCTCAT  850

seq1  CTTTTCCATTTTATTTATTTATTATTGTGTGTTTATAATATGTGTGCTTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCATTTTATTTATTTATTATTGTGTGTTTATAATATGTGTGCTTG  900

seq1  TGTATGTGCACATGTGGAAGTCAGAGGGTAAGTTTATGGAGTTCCCTTCT  949
      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGCACATGTGGAAGTCAGA-GGTAAG-TTATGGAGTTCCCTTCT  948

seq1  ACCTTTATATGGGTTCTGGAGATTGAATTCAAGTTGTCAGCTTTGCCTGG  999
      ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||
seq2  ACC-TTATATGGGTTCTGGAGATTGAATTCA--GTGTCAGC-TTGCCTGG  994

seq1  CAAGCACCTTTAC  1012
      |||||||||||||
seq2  CAAGCACCTTTAC  1007