BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-043K12
ChromosomeX (Build37)
Map Location 37,183,004 - 37,284,735
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene6030498E09Rik, LOC547171, LOC670539, LOC100039700, 1700085A12Rik, LOC100039715
Downstream geneEG636756, EG636766, EG245391, LOC100039769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-043K12.bB6Ng01-043K12.g
ACCDH869653DH869654
length9261,157
definitionDH869653|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043K12, 5' end.DH869654|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-043K12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,283,810 - 37,284,735)(37,183,004 - 37,184,175)
sequence
gaattcctttctatgaccatttaaataagcccaaattgacctattttaac
aaagagaaatccttaatcctcttgatatgctaactgatacctgtatttaa
ttctctggttacaatcaaactttggagaaaatatttacaattgctatcat
tatattgtactctgaacatattgctcatctaaacatactaggtttcttta
ccttattgttgttgtcaatccagcccaatcctgatattgttgacaaatcc
ttttttctacaattatgctcttctttcagtttttcttacccttcacatga
ggaatttaccttctcttttaattcctgatgttcttcagaattctttactg
catacttctttcccccttttgcactttccatacatttttagaaaaatgag
aaatcatgtccattcacataattttggttgttacagatatgccagacact
ccaaattttattttttctgagtcctctttccttagattcaagtgcatata
ttctgttccctaaaggcatcattatttggatatagaacacacatataaat
cacagcatatctagaatatttgccttatatttttcccttaagggtagcat
tatatgcactgaatataaattaaaacagtatcccatctatctcactttca
agtgtaaagcattattttcctgcattttgtatggaggttgtttaatagta
aatgtgttctttgccaaatatttaaaattacagttagatatgctttggtt
tatggtgggtatgggtggtattatagccttgtgcatgctacacacaagct
tactaccattgatctatatcctctacaggttttaaattcctaaaattaaa
ataattaccataaacttgtttttcttgacaaattatcagtagtattctct
tccttactcaaaggtatggttttgtt
gaattctcctacactgtagacttacactgggatacagaatatatacaatg
atctaaagaagacagactccagagaaccaaataaccctattaaaaatgga
gtagagggctaaacaatgaattctcaaccaagcaatattgaatggctgag
aagcacctaaaaatgttcaacatccttagtcctcagtgaaatataaatca
aaacaaccctgagattccacctcataccagtcagaatagctaatataaaa
aaactcagttgaaaaatggatactggcaagaatgtggtgaaagcagaaca
ctcctccattgctggtgcaaatgcaagctggtacaaccattatggcaatt
agtttggtcattcctcagaaaattgggcatagtacttataggagaaccca
gctataccactcttgggcatatacccagaagatgctccaacatgtaataa
agacacatgctccactatgttcatagcagccttatttctaaaagccagaa
gctgaaaagaacccagttgttcctcaatagatgactggatacagagaatg
tggtacatttacacaatggagtaatactcagctattaaaaccaaagaatt
tatgcaattcttaggcaaatggatggatctggaggatattatcctgagtg
aggtaacccaatcttaaaagaacacacatggtatgcactcactgatagtg
gatatttgcccaaaaactcagattattcaagatacaattcatagaccaca
tgaatctcaagaataaggaagatcacagtgtggatactttggtccttctt
agaatggggatcaatatacccatgtgagaaaatgcagacacaatgtttgg
agcagaaactaaaggaaaggctatccagtgactgccccaccttggcatcc
atcccatacacagttatcaaacccaggcactattgtggatgaaaaagtgg
ttgctgacaggacctgatatagctttttttttttttttctagagactttg
ccagttcctgacaaaaagaggtgaatgccaagcatctgtactcattcttt
atcttttcttaaggattctaacatgaattatacaagcatatacagtatta
tttttcattgccatttcaaatttacataacaaatggaatctatattttct
ttcagct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_37283810_37284735
seq2: B6Ng01-043K12.b_41_965 (reverse)

seq1  ACAAAGACCATACCTTTGAGTAAGTGAAGAGAATACTTACTGATAATTTG  50
      ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACAAA-ACCATACCTTTGAGTAAG-GAAGAGAATAC-TACTGATAATTTG  47

seq1  TC-AGGAAAACAAGTTTATGGTAATTATTTTAATTTTAAGAATTTAGAA-  98
      || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || 
seq2  TCAAGAAAAACAAGTTTATGGTAATTATTTTAATTTTAGGAATTTAAAAC  97

seq1  CTGTAGAGGATATAGATCAATGGTAGTAAGCTTGTGTGTAGCATGCACAA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGAGGATATAGATCAATGGTAGTAAGCTTGTGTGTAGCATGCACAA  147

seq1  GGCTATAATACCACCCATACCCACCATAAACCAAAGCATATCTAACTGTA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATAATACCACCCATACCCACCATAAACCAAAGCATATCTAACTGTA  197

seq1  ATTTTAAATATTTGGCAAAGAACACATTTACTATTAAACAACCTCCATAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAATATTTGGCAAAGAACACATTTACTATTAAACAACCTCCATAC  247

seq1  AAAATGCAGGAAAATAATGCTTTACACTTGAAAGTGAGATAGATGGGATA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGCAGGAAAATAATGCTTTACACTTGAAAGTGAGATAGATGGGATA  297

seq1  CTGTTTTAATTTATATTCAGTGCATATAATGCTACCCTTAAGGGAAAAAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTAATTTATATTCAGTGCATATAATGCTACCCTTAAGGGAAAAAT  347

seq1  ATAAGGCAAATATTCTAGATATGCTGTGATTTATATGTGTGTTCTATATC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGCAAATATTCTAGATATGCTGTGATTTATATGTGTGTTCTATATC  397

seq1  CAAATAATGATGCCTTTAGGGAACAGAATATATGCACTTGAATCTAAGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATGATGCCTTTAGGGAACAGAATATATGCACTTGAATCTAAGGA  447

seq1  AAGAGGACTCAGAAAAAATAAAATTTGGAGTGTCTGGCATATCTGTAACA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGACTCAGAAAAAATAAAATTTGGAGTGTCTGGCATATCTGTAACA  497

seq1  ACCAAAATTATGTGAATGGACATGATTTCTCATTTTTCTAAAAATGTATG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAATTATGTGAATGGACATGATTTCTCATTTTTCTAAAAATGTATG  547

seq1  GAAAGTGCAAAAGGGGGAAAGAAGTATGCAGTAAAGAATTCTGAAGAACA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTGCAAAAGGGGGAAAGAAGTATGCAGTAAAGAATTCTGAAGAACA  597

seq1  TCAGGAATTAAAAGAGAAGGTAAATTCCTCATGTGAAGGGTAAGAAAAAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAATTAAAAGAGAAGGTAAATTCCTCATGTGAAGGGTAAGAAAAAC  647

seq1  TGAAAGAAGAGCATAATTGTAGAAAAAAGGATTTGTCAACAATATCAGGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGAAGAGCATAATTGTAGAAAAAAGGATTTGTCAACAATATCAGGA  697

seq1  TTGGGCTGGATTGACAACAACAATAAGGTAAAGAAACCTAGTATGTTTAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTGGATTGACAACAACAATAAGGTAAAGAAACCTAGTATGTTTAG  747

seq1  ATGAGCAATATGTTCAGAGTACAATATAATGATAGCAATTGTAAATATTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCAATATGTTCAGAGTACAATATAATGATAGCAATTGTAAATATTT  797

seq1  TCTCCAAAGTTTGATTGTAACCAGAGAATTAAATACAGGTATCAGTTAGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAAAGTTTGATTGTAACCAGAGAATTAAATACAGGTATCAGTTAGC  847

seq1  ATATCAAGAGGATTAAGGATTTCTCTTTGTTAAAATAGGTCAATTTGGGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAAGAGGATTAAGGATTTCTCTTTGTTAAAATAGGTCAATTTGGGC  897

seq1  TTATTTAAATGGTCATAGAAAGGAATTC  926
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTAAATGGTCATAGAAAGGAATTC  925

seq1: chrX_37183004_37184175
seq2: B6Ng01-043K12.g_69_1225

seq1  GAATTCTCCTACACTGTAGACTTACACTGGGATACAGAATATATACAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTACACTGTAGACTTACACTGGGATACAGAATATATACAATG  50

seq1  ATCTAAAGAAGACAGACTCCAGAGAACCAAATAACCCTATTAAAAATGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAAGAAGACAGACTCCAGAGAACCAAATAACCCTATTAAAAATGGA  100

seq1  GTAGAGGGCTAAACAATGAATTCTCAACCAAGCAATATTGAATGGCTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGGGCTAAACAATGAATTCTCAACCAAGCAATATTGAATGGCTGAG  150

seq1  AAGCACCTAAAAATGTTCAACATCCTTAGTCCTCAGTGAAATATAAATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACCTAAAAATGTTCAACATCCTTAGTCCTCAGTGAAATATAAATCA  200

seq1  AAACAACCCTGAGATTCCACCTCATACCAGTCAGAATAGCTAATATAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAACCCTGAGATTCCACCTCATACCAGTCAGAATAGCTAATATAAAA  250

seq1  AAACTCAGTTGAAAAATGGATACTGGCAAGAATGTGGTGAAAGCAGAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCAGTTGAAAAATGGATACTGGCAAGAATGTGGTGAAAGCAGAACA  300

seq1  CTCCTCCATTGCTGGTGCAAATGCAAGCTGGTACAACCATTATGGCAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCATTGCTGGTGCAAATGCAAGCTGGTACAACCATTATGGCAATT  350

seq1  AGTTTGGTCATTCCTCAGAAAATTGGGCATAGTACTTATAGGAGAACCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGTCATTCCTCAGAAAATTGGGCATAGTACTTATAGGAGAACCCA  400

seq1  GCTATACCACTCTTGGGCATATACCCAGAAGATGCTCCAACATGTAATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATACCACTCTTGGGCATATACCCAGAAGATGCTCCAACATGTAATAA  450

seq1  AGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTCTAAAAGCCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTCTAAAAGCCAGAA  500

seq1  GCTGAAAAGAACCCAGTTGTTCCTCAATAGATGACTGGATACAGAGAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAAAGAACCCAGTTGTTCCTCAATAGATGACTGGATACAGAGAATG  550

seq1  TGGTACATTTACACAATGGAGTAATACTCAGCTATTAAAACCAAAGAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACATTTACACAATGGAGTAATACTCAGCTATTAAAACCAAAGAATT  600

seq1  TATGCAATTCTTAGGCAAATGGATGGATCTGGAGGATATTATCCTGAGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAATTCTTAGGCAAATGGATGGATCTGGAGGATATTATCCTGAGTG  650

seq1  AGGTAACCCAATCTTAAAAGAACACACATGGTATGCACTCACTGATAGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAACCCAATCTTAAAAGAACACACATGGTATGCACTCACTGATAGTG  700

seq1  GATATTTGCCCAAAAACTCAGATTATTCAAGATACAATTCATAGACCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTGCCCAAAAACTCAGATTATTCAAGATACAATTCATAGACCACA  750

seq1  TGAATCTCAAGAATAAGGAAGATCACAGTGTGGATACTTTGGTCCTTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCTCAAGAATAAGGAAGATCACAGTGTGGATACTTTGGTCCTTCTT  800

seq1  AGAATGGGGATCAATATACCCATGTGAGAAAATGCAGACACAATGTTTGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGGGATCAATATACCCATGTGAGAAAATGCAGACACAATGTTTGG  850

seq1  AGCAGAAACTAAAGGAAAGGCTATCCAGTGACTGCCCCACCTTGGCATCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAAACTAAAGGAAAGGCTATCCAGTGACTGCCCCACCTTGGCATCC  900

seq1  ATCCCATACACAGTTATCAAACCCAGGCACTATTGTGGATGAAAAAAGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATCCCATACACAGTTATCAAACCCAGGCACTATTGTGGATG-AAAAAGTG  949

seq1  GTTGCTGACAGGAACCTGATATAGCTTTTTTTTTTTTTTTCTAGGAGACT  1000
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTTGCTGACAGG-ACCTGATATAGCTTTTTTTTTTTTTTTCTA-GAGACT  997

seq1  ATGCCAGTTCCTGACAAATACAGAGGTGAATGCACACAGCCATCTGTACT  1050
       ||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||  ||||||||| 
seq2  TTGCCAGTTCCTGACAA--AAAGAGGTGAATGC---CAAGCATCTGTAC-  1041

seq1  TCATTCTTTATCTTTCCTTTAAGGATTCTAACATGAATGTATACAAGCAT  1100
      ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCATTCTTTATCTTTTC-TTAAGGATTCTAACATGAAT-TATACAAGCAT  1089

seq1  ATACAAGTATTATTTTTCATTGGCATTTCAAATTTACCATATACCAAATG  1150
      |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||
seq2  ATAC-AGTATTATTTTTCATTGCCATTTCAAATTTAC---ATAACAAATG  1135

seq1  G-ATCTATTATTTTCTCTCAGCT  1172
      | ||||| |||||||| ||||||
seq2  GAATCTA-TATTTTCTTTCAGCT  1157