BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-063G08
ChromosomeX (Build37)
Map Location 41,505,680 - 41,625,008
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneOdz1, Gm362, LOC100039977, LOC100039987
Downstream geneLOC637141, Wdr40c, Wdr40b, LOC665585, 1110059M19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063G08.bB6Ng01-063G08.g
ACCDH883507DH883508
length1,137965
definitionDH883507|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063G08, 5' end.DH883508|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063G08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(41,623,845 - 41,625,008)(41,505,680 - 41,506,637)
sequence
gaattcctagtaatatctcataatgtaattgtaattacaaattctatgcc
atatactgggaaaggaacaatttatctgacaatcctatataaattcacta
ctatcatatgtctttgcaacataaaaatcagaactcaaaaacactttgca
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catctttaattaagcttgtaccatgatgctttgattgatatagttatgtg
tatattgtaatctgatagtgtggcaactttgggatgtcttcttggctatt
tgattaaaattttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_41623845_41625008
seq2: B6Ng01-063G08.b_48_1184 (reverse)

seq1  TCATTGTAAATGCTGAGAGTAATGAATAGTGCTGGGCATAATTAAAATTA  50
      ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  ||
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       ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||| ||||||
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      ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||
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      ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||
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      ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACTTAGTCTATCCAAAATAAAATTTAAACGGAGAAAGAATGTTCT  473

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCATATAGTTTCATCCCTAACTCCCAAAACTTGTGCAAAAATGTTGC  573

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGCTAGTGAGTGACACTAAATCTCCTATATCATGACAGGCATAATC  623

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCTCTATAATTATTTAAAGTACTTATGACAAAGTAGCATAATTTGT  823

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATTGCAAGCATAATTGCAATGTGAGTAGTCATAATAATTGTGATTA  873

seq1  AACTGCTCTTTAGACACTGTTTAGAAGAGGATAAAATGAAAATGACAAGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCTCTTTAGACACTGTTTAGAAGAGGATAAAATGAAAATGACAAGG  923

seq1  AAACGTGGTTACTGACATTTATAAATCAGGGAGGATTTCAACCTATCTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGTGGTTACTGACATTTATAAATCAGGGAGGATTTCAACCTATCTTT  973

seq1  AGAGATTGCTTTCATGCAAAGTGTTTTTGAGTTCTGATTTTTATGTTGCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATTGCTTTCATGCAAAGTGTTTTTGAGTTCTGATTTTTATGTTGCA  1023

seq1  AAGACATATGATAGTAGTGAATTTATATAGGATTGTCAGATAAATTGTTC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCCAGTATATGGCATAGAATTTGTAATTACAATTACATTATGAGAT  1123

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      ||||||||||||||
seq2  ATTACTAGGAATTC  1137

seq1: chrX_41505680_41506637
seq2: B6Ng01-063G08.g_68_1018

seq1  GAATTCTTTTAAGGCAAATTTCTGGATTTTGGGTTATACAACTCAGATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTAAGGCAAATTTCTGGATTTTGGGTTATACAACTCAGATGA  50

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTGTTTAATTAATAACTTCCATTGAATTCAGGTACTTAATTCTG  100

seq1  TTTCCTGAGATGGAGATTCAATATCAGATAACTAATCTAATTTAATTGCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGAGATGGAGATTCAATATCAGATAACTAATCTAATTTAATTGCG  150

seq1  ATGTGCAATGTAAGTATAATATTAAGACAATAAAGACATTTCAGGAGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCAATGTAAGTATAATATTAAGACAATAAAGACATTTCAGGAGAAT  200

seq1  TGTAAGTAGAATGTTCTACTTCCTTTTTCTATCTTTTTATGGATCTTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTAGAATGTTCTACTTCCTTTTTCTATCTTTTTATGGATCTTTAT  250

seq1  GAAATGCTGATTTTAATTCTATTGAATCTGTATAGAGAACTTTGCTTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGCTGATTTTAATTCTATTGAATCTGTATAGAGAACTTTGCTTTCT  300

seq1  AGATTATCTTAATTCTGATTAATTTATATGTTATTTGTAGATCATTGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTATCTTAATTCTGATTAATTTATATGTTATTTGTAGATCATTGAAG  350

seq1  AAAATTTTTGAATGGTACTTATCAATTAAGATTAATGATATGTTTTGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTTTGAATGGTACTTATCAATTAAGATTAATGATATGTTTTGTAA  400

seq1  CTATTATGTTTTTGGTATAATTTTGATTGTAGAGATTATAAAATGATGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTATGTTTTTGGTATAATTTTGATTGTAGAGATTATAAAATGATGAG  450

seq1  GTTGAACACTTTTTTTTTTCTCATTATGTATGCTTTATGTTTAATTTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAACACTTTTTTTTTTCTCATTATGTATGCTTTATGTTTAATTTTAT  500

seq1  GGCTATTTTCTTGATTATGTGGAAGCTTTTTAAAAGTCTGATCCCATTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATTTTCTTGATTATGTGGAAGCTTTTTAAAAGTCTGATCCCATTGT  550

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TCCTCATCAAATGTACTGGCATATTTCTCTTTTTTCCTTAAATAGTTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAATGTCAGATATTATATTGAAGTCTCAGTATTACTGAGTTTATTTTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATAGAGGTGAAATGTACAATTGTATTGTCTATGAAACACCCAGTTTGTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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      ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||   ||
seq2  GTATA-TTGT-AATCTGATAGTGTGGCAACTTTGGGAT--GTCTT--CTT  943

seq1  GGCTATTT  958
      ||||||||
seq2  GGCTATTT  951