BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-083F07
ChromosomeX (Build37)
Map Location 145,802,424 - 145,961,564
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666923, EG624378, LOC100039934, LOC100039629
Upstream geneLOC666837, LOC100039553, LOC100034729, LOC666861, EG666864, LOC434866, EG666868, EG624260, LOC434865, EG624310, Ott, LOC666888, LOC100039598, LOC100039890, LOC100039612
Downstream geneLOC382243, EG666961, EG666968, OTTMUSG00000018988, LOC100039651, EG624568, LOC382244, LOC100039669, EG666982, EG624631, EG546387, LOC333588, Tmem29, LOC100040101
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-083F07.bB6Ng01-083F07.g
ACCDH897622DH897623
length1,1461,080
definitionDH897622|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083F07, 5' end.DH897623|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083F07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,960,401 - 145,961,564)(145,802,424 - 145,803,515)
sequence
gaattccaagtttgtcagcttcaaggattttctgggatgttggaacactg
gtgaaggcttagctatgtcagaactcaatccttaaaggcacttatgataa
aatagtactaaaagagagcacatggatccatacaccagactaactccggg
atagggtatgagtatacgggctatgagaatgccaaggttccaggaggttg
agtttgcttgaaactctttgcctcatgagtgcttccagtcctctcagcct
gccaaacagacttcactggagtgtgcatagcagtccccagagtatcattt
cagtggtcccctgtcgccagagacacatccttcctctgtaggaaccatgc
cttcttgtaagttggccacaataaaatgcttcatcctaaccctcccctgc
caccccacggcccaggaatttcatttttcaaatctgcaagacaagatcta
gaaatcaactgtctttggaagatactgagttttcttacctgtctaaagct
gagttcaccaagaactgagaaaggctgcactcccaaagatacgacaaaca
tttcctctataacttacctgtctgaataatcaacccctttccactcttgc
tccctggttgtgattatccttttcctactcaccaagactgaatccactgt
ctacagctatagaaactgtttaagcaacaaaatgtactgagcattctagt
attgtaagaatcgtaccttctctgtacttgtagttacccatatatatttg
tagaaacacaaactgtgtttgaatatatcttcaagcttttattaattgta
tgttttgggtgaagttaaaagccaaaacaacacaaaagaaaacaccccct
tcctcgggtggtgtagagctcatgcacagctccgtgatatatcatttcac
tcagtgtgtgcacgtgatgctacaattcgttcccagtagtgccagaaaca
gcaacaaccagcaccagttcctcagtttcaatctatccttctgtatatgg
aaatggtagtatctacccacaaagatctagctagattaaaccatgatata
aagtattagagcttcataaatcacaagttacctttggtagtatatttcca
aggtagtatagaaacaaatttctcattccattttataatctcctgg
gaattcttatgtgcttaattcctgctgtgtcagagagagcagatttcact
ttttaaacggaaaagtaaagttggaaatgctcagtgattgacttagcatg
caaaagtttttttacccacgaatgaatgaatggcttgggcaagtagtttg
taaagaaaaaaagccatgaaacattaaagtaagggataatgtttctgaag
catcttgttttggaaaaaccacagttgctttgatttcaagatagtacaga
tactggcatgcctaaaggttatggtttcaaaaccattacataatttgggt
aacttgcttacattcagctctagttttaggtcaacataattaatagtctt
gccactgaaaataactgagagtggagaaaaggtttggtttgtaggacagt
gtcaactgaagaacaaagtgatcataatttcagatatattgcatttattg
gtgctaactttacatggtggggggacagatttgttacacaataagacaca
aataatatatcttcagtcatacaatgcaaccataccaataatataatgaa
ggggttctaagactcataccacattcaaaaatttggtgacagcacaacat
gtatcaccttaggacatagaaattcacacttgtggattaaaagcttggag
gaggtacttggaaaattggtaaaatcctttcaccattcaacagctttgca
aaccacaggcacaatgggaaaggtagctgtgtgcctggttctcaccctgg
ggctcagtacttgtcagcatcagttattcctctgaggattctgagaaaat
ttaggacagatattactctctacttcacacctactaaatatgaaagtctg
atgaatgtggggtacaatttgcgtgcttaaggagagagagctcctagtga
ttctgaaatacactatagtctgactctgggacactctagagcagtgcttc
tggactcttacttagctctggtaaagatgtaagaccggtgtggtggtgca
cgctttatctcagcacttgggagcaaagcagcagatttctgagttcgagg
cgcagcttgtctacaagagagtcagacagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_145960401_145961564
seq2: B6Ng01-083F07.b_48_1193 (reverse)

seq1  CCAGGAGAATTTATAAAAATGGGAATGAGAAATATGTTTCTATACTACCT  50
      ||||||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGA--TTATAAAA--TGGAATGAGAAATTTGTTTCTATACTACCT  46

seq1  TTGAAATATACCTAACCAAAGGTAACTTGTGATTTAATTGAAAGCTCTAA  100
      | |||||||||   ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |
seq2  TGGAAATATAC--TACCAAAGGTAACTTGTGATTTA--TG-AAGCTCT-A  90

seq1  ATACTTTTATATCATGGTTTAATCTAGCCTTAGAATTCCTTTGTGGGTAG  150
      |||| |||||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||||||
seq2  ATAC-TTTATATCATGGTTTAATCTAGC--TAGA---TCTTTGTGGGTAG  134

seq1  ATACTACCATTTCCATATTACAGAAGGATAGATTGAAACTGAGGAACTGG  200
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTACCATTTCCATA-TACAGAAGGATAGATTGAAACTGAGGAACTGG  183

seq1  TGCTGGTTGTTGCTTGTTTCTGGCACTACTGGGAACGAATTGTAGCATCA  250
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGTTGTTGC-TGTTTCTGGCACTACTGGGAACGAATTGTAGCATCA  232

seq1  CGTGCACACACTGAGTGAAATGATATATCACGGAGCTGTGCATGAGCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCACACACTGAGTGAAATGATATATCACGGAGCTGTGCATGAGCTCT  282

seq1  ACACCACCCGAGGAAGGGGGTGTTTTCTTTTGTGTTGTTTTGGCTTTTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCACCCGAGGAAGGGGGTGTTTTCTTTTGTGTTGTTTTGGCTTTTAA  332

seq1  CTTCACCCAAAACATACAATTAATAAAAGCTTGAAGATATATTCAAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACCCAAAACATACAATTAATAAAAGCTTGAAGATATATTCAAACAC  382

seq1  AGTTTGTGTTTCTACAAATATATATGGGTAACTACAAGTACAGAGAAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTGTTTCTACAAATATATATGGGTAACTACAAGTACAGAGAAGGT  432

seq1  ACGATTCTTACAATACTAGAATGCTCAGTACATTTTGTTGCTTAAACAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATTCTTACAATACTAGAATGCTCAGTACATTTTGTTGCTTAAACAGT  482

seq1  TTCTATAGCTGTAGACAGTGGATTCAGTCTTGGTGAGTAGGAAAAGGATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATAGCTGTAGACAGTGGATTCAGTCTTGGTGAGTAGGAAAAGGATA  532

seq1  ATCACAACCAGGGAGCAAGAGTGGAAAGGGGTTGATTATTCAGACAGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAACCAGGGAGCAAGAGTGGAAAGGGGTTGATTATTCAGACAGGTA  582

seq1  AGTTATAGAGGAAATGTTTGTCGTATCTTTGGGAGTGCAGCCTTTCTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATAGAGGAAATGTTTGTCGTATCTTTGGGAGTGCAGCCTTTCTCAG  632

seq1  TTCTTGGTGAACTCAGCTTTAGACAGGTAAGAAAACTCAGTATCTTCCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGTGAACTCAGCTTTAGACAGGTAAGAAAACTCAGTATCTTCCAA  682

seq1  AGACAGTTGATTTCTAGATCTTGTCTTGCAGATTTGAAAAATGAAATTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTTGATTTCTAGATCTTGTCTTGCAGATTTGAAAAATGAAATTCC  732

seq1  TGGGCCGTGGGGTGGCAGGGGAGGGTTAGGATGAAGCATTTTATTGTGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCGTGGGGTGGCAGGGGAGGGTTAGGATGAAGCATTTTATTGTGGC  782

seq1  CAACTTACAAGAAGGCATGGTTCCTACAGAGGAAGGATGTGTCTCTGGCG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTACAAGAAGGCATGGTTCCTACAGAGGAAGGATGTGTCTCTGGCG  832

seq1  ACAGGGGACCACTGAAATGATACTCTGGGGACTGCTATGCACACTCCAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGGACCACTGAAATGATACTCTGGGGACTGCTATGCACACTCCAGT  882

seq1  GAAGTCTGTTTGGCAGGCTGAGAGGACTGGAAGCACTCATGAGGCAAAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCTGTTTGGCAGGCTGAGAGGACTGGAAGCACTCATGAGGCAAAGA  932

seq1  GTTTCAAGCAAACTCAACCTCCTGGAACCTTGGCATTCTCATAGCCCGTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAAGCAAACTCAACCTCCTGGAACCTTGGCATTCTCATAGCCCGTA  982

seq1  TACTCATACCCTATCCCGGAGTTAGTCTGGTGTATGGATCCATGTGCTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATACCCTATCCCGGAGTTAGTCTGGTGTATGGATCCATGTGCTCT  1032

seq1  CTTTTAGTACTATTTTATCATAAGTGCCTTTAAGGATTGAGTTCTGACAT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAGTACTATTTTATCATAAGTGCCTTTAAGGATTGAGTTCTGACAT  1082

seq1  AGCTAAGCCTTCACCAGTGTTCCAACATCCCAGAAAATCCTTGAAGCTGA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAAGCCTTCACCAGTGTTCCAACATCCCAGAAAATCCTTGAAGCTGA  1132

seq1  CAAACTTGGAATTC  1164
      ||||||||||||||
seq2  CAAACTTGGAATTC  1146

seq1: chrX_145802424_145803515
seq2: B6Ng01-083F07.g_68_1147

seq1  GAATTCTTATGTGCTTAATTCCTGCTGTGTCAGAGAGAGCAGATTTCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATGTGCTTAATTCCTGCTGTGTCAGAGAGAGCAGATTTCACT  50

seq1  TTTTAAACGGAAAAGTAAAGTTGGAAATGCTCAGTGATTGACTTAGCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAACGGAAAAGTAAAGTTGGAAATGCTCAGTGATTGACTTAGCATG  100

seq1  CAAAAGTTTTTTTACCCACGAATGAATGAATGGCTTGGGCAAGTAGTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTTTTTTTACCCACGAATGAATGAATGGCTTGGGCAAGTAGTTTG  150

seq1  TAAAGAAAAAAAGCCATGAAACATTAAAGTAAGGGATAATGTTTCTGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAAAAAAAGCCATGAAACATTAAAGTAAGGGATAATGTTTCTGAAG  200

seq1  CATCTTGTTTTGGAAAAACCACAGTTGCTTTGATTTCAAGATAGTACAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGTTTTGGAAAAACCACAGTTGCTTTGATTTCAAGATAGTACAGA  250

seq1  TACTGGCATGCCTAAAGGTTATGGTTTCAAAACCATTACATAATTTGGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGCATGCCTAAAGGTTATGGTTTCAAAACCATTACATAATTTGGGT  300

seq1  AACTTGCTTACATTCAGCTCTAGTTTTAGGTCAACATAATTAATAGTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGCTTACATTCAGCTCTAGTTTTAGGTCAACATAATTAATAGTCTT  350

seq1  GCCACTGAAAATAACTGAGAGTGGAGAAAAGGTTTGGTTTGTAGGACAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTGAAAATAACTGAGAGTGGAGAAAAGGTTTGGTTTGTAGGACAGT  400

seq1  GTCAACTGAAGAACAAAGTGATCATAATTTCAGATATATTGCATTTATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACTGAAGAACAAAGTGATCATAATTTCAGATATATTGCATTTATTG  450

seq1  GTGCTAACTTTACATGGTGGGGGGACAGATTTGTTACACAATAAGACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTAACTTTACATGGTGGGGGGACAGATTTGTTACACAATAAGACACA  500

seq1  AATAATATATCTTCAGTCATACAATGCAACCATACCAATAATATAATGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATATATCTTCAGTCATACAATGCAACCATACCAATAATATAATGAA  550

seq1  GGGGTTCTAAGACTCATACCACATTCAAAAATTTGGTGACAGCACAACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTCTAAGACTCATACCACATTCAAAAATTTGGTGACAGCACAACAT  600

seq1  GTATCACCTTAGGACATAGAAATTCACACTTGTGGATTAAAAGCTTGGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCACCTTAGGACATAGAAATTCACACTTGTGGATTAAAAGCTTGGAG  650

seq1  GAGGTACTTGGAAAATTGGTAAAATCCTTTCACCATTCAACAGCTTTGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTACTTGGAAAATTGGTAAAATCCTTTCACCATTCAACAGCTTTGCA  700

seq1  AACCACAGGCACAATGGGAAAGGTAGCTGTGTGCCTGGTTCTCACCCTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACAGGCACAATGGGAAAGGTAGCTGTGTGCCTGGTTCTCACCCTGG  750

seq1  GGCTCAGTACTTGTCAGCATCAGTTATTCCTCTGAGGATTCTGAGAAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGTACTTGTCAGCATCAGTTATTCCTCTGAGGATTCTGAGAAAAT  800

seq1  TTAGGACAGATATTACTCTCTACTTCACACCTACTAAATATGAAAGTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACAGATATTACTCTCTACTTCACACCTACTAAATATGAAAGTCTG  850

seq1  ATGAATGTGGGGTACAATTTGCGTGCTTAAGGAGAGAGAGCTCCTAGTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGTGGGGTACAATTTGCGTGCTTAAGGAGAGAGAGCTCCTAGTGA  900

seq1  TTCTGAAATACACTATAGTCTGACTCTGGGACACTCTAGAGCAGTGCTCC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTCTGAAATACACTATAGTCTGACTCTGGGACACTCTAGAGCAGTGCTTC  950

seq1  TGGACTCTTACTTAGCTCTTGGTAAAGAATGTAAGACCGGGTGTGGTGGT  1000
      |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  TGGACTCTTACTTAGCTC-TGGTAAAG-ATGTAAGACC-GGTGTGGTGGT  997

seq1  GCACGCCTTTAATCTCAGCACTTGGGAGGCAAAGGCAAGCAGATTTCTGA  1050
      ||||||  || |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||
seq2  GCACGC--TTTATCTCAGCACTTGGGA-GCAAAG--CAGCAGATTTCTGA  1042

seq1  GTTCGA-GCGCAGCCTGGTCTACAAAGAGAGTTCCAGGACAGC  1092
      |||||| |||||| || |||||| ||||||||  || ||||||
seq2  GTTCGAGGCGCAG-CTTGTCTAC-AAGAGAGT--CA-GACAGC  1080