BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-102G23
ChromosomeX (Build37)
Map Location 93,301,282 - 93,402,362
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMsn, Psmb7-ps1
Upstream geneArhgef9, LOC619688, LOC100042189, 2810002O09Rik, Asb12, LOC668202, AK129302, A130028J20Rik, 1700010D01Rik, Las1l
Downstream geneLOC668221, Vsig4, B230358A15Rik, Heph, Gpr165, LOC675824, LOC668234, EG668236, LOC668238, Pgr15l
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-102G23.bB6Ng01-102G23.g
ACCDH911329DH911330
length9841,133
definitionDH911329|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102G23, 5' end.DH911330|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-102G23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,401,384 - 93,402,362)(93,301,282 - 93,302,473)
sequence
gaattcagttttcaattctgtatggagtttttcgtttcatcttgccatat
atttccttttctttatatcactgaggtgtttatttgctattcttcttaag
ttcattaagtctacatgttctttaaactctgaattttttaatgaaaatta
tgattgtttgtgggtcctggaaattcctgttttggttttgttgttgttgt
tttttggtttgtttttgttttgttttgttttgtttttataaatttcatta
gagaacatttctatagtaactggtgggactcgggaggggggatatgtatt
atctcggtctgtgatattgtttgactttttatggtaagacctatgtacat
ggctttctttattggtatgtttctgatttgaggctttagggtatctcagg
ctaggcatgcataaaggctatgaagtcaaggcaaacctcaagagttggtc
ttggcataggcaagcaatgttccaggaactcatcatactggattcacaca
cagaatgtggctaggcctagagtttggatataaaacaggtgacccagggc
ccagagatctcaccagactggatcagtgtgttgatgctgtcagtactgac
caggctgggctgggctattggatgtggacttggagccagtcctgaagagg
acagctcaggtcggactgatcaggctgagctgctgcacagaatttgctac
atgggtttatatttgggggacttgagagcatgaatgcagtctaggattca
gggaactcaccagactggacccgggcacagggtgtagtaccttgaaaggg
actaaaagttgggtatgacttgggctataagaagacatgatggagagtac
ttgtagtcaacctggatccatctcatgtgtattggtccagacttcctagt
gacattaggcaaaaaaaaaaaaaatcttcagaggagatcctgatatcttt
agaaagtttattcacgtttaagacacaatatgaa
gaattctagtaaaatcttatttttcttgctgaagtaggattctaaatggc
tccagtagatggttctgtgggtgaagtgaggacctgggtttggcatccca
gaacccatgttaaagatacatctgcagttcctgagttcctactgctagat
gggaggcagagacaggagaattctggaagcatatgggccacatgacctgg
aatgaagtaggagaaataagagagatactctccttcataagaggaagtct
aggactgataattaaggtcatcctctggttctctacatgcattttgtggc
atgtacctatacgcacacgtgatggaaaatggttccttccttcatgtatc
tttttgaactaaattaagaaatagaactcagtgaagactttctattctgt
ctattcttgtccattggctgtgctgtggtttggtggaaaaaaaatggagg
acggtttctcagagactgcttgtaattgagatggaggagtatgatgcttt
ccaaatgtagcctccctgcagaatgggcaccttgaactgggagacagata
ttttggtgtaagttttcaagtacagctctttgggtatgcctgacagtgga
aatagcagatctaagactgttttcaaatttactttttgcctgtgaaattt
tgatagaacgtgtgtgtgattatgatactaattgatacaaattatgggaa
tcactgaggtttgaacatttggtgatacagggcaaagtagagtcccgaac
aattatgtcttggttacatatttaggagataataggggccaacacctgtg
agagggagtacagcatatgtatggggcatggaacattttattccctttag
ttctggttgccttagaaatataggatgggtaatatagctcattattatta
ttttctgagacaaggtattagcatatgacaggtgacttgaaactcagaga
tcacttctctgctctataaggcatattcacgaagctgaaagccacactat
tttagatagctgagtagttctgatttacatttgctcttgtctgctcatcc
cggtccagtcttatttattccaaatctcagctggtatttggatagtacaa
ggcctctctgatacggtcataactgtggtatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_93401384_93402362
seq2: B6Ng01-102G23.b_43_1026 (reverse)

seq1  TTCATATTGTGTCTTAATGCTG-ATTAACTTCTTAAAGATATCA-GATCT  48
      |||||||||||||||||   || || |||||  ||||||||||| |||||
seq2  TTCATATTGTGTCTTAAACGTGAATAAACTTTCTAAAGATATCAGGATCT  50

seq1  CCTCTGAAGA-TTTTTTTTTTTTTGCCTAATGTCACTAGGAAGTCTGGAC  97
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGAAGATTTTTTTTTTTTTTGCCTAATGTCACTAGGAAGTCTGGAC  100

seq1  CAATACACATGAGATGGATCCAGGTTGACTACAAGTACTCTCCATCATGT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACACATGAGATGGATCCAGGTTGACTACAAGTACTCTCCATCATGT  150

seq1  CTTCTTATAGCCCAAGTCATACCCAACTTTTAGTCCCTTTCAAGGTACTA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTATAGCCCAAGTCATACCCAACTTTTAGTCCCTTTCAAGGTACTA  200

seq1  CACCCTGTGCCCGGGTCCAGTCTGGTGAGTTCCCTGAATCCTAGACTGCA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGTGCCCGGGTCCAGTCTGGTGAGTTCCCTGAATCCTAGACTGCA  250

seq1  TTCATGCTCTCAAGT-CCCCAAATAT-AACCCATGTAGCAAATTCTGTGC  295
      ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGCTCTCAAGTCCCCCAAATATAAACCCATGTAGCAAATTCTGTGC  300

seq1  AGCAGCTCAGCCTGATCAGTCCGACCTGAGCTGTCCTCTTCAGGACTGGC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTCAGCCTGATCAGTCCGACCTGAGCTGTCCTCTTCAGGACTGGC  350

seq1  TCCAAGTCCACATCCAATAGCCCAGCCCAGCCTGGTCAGTACTGACAGCA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGTCCACATCCAATAGCCCAGCCCAGCCTGGTCAGTACTGACAGCA  400

seq1  TCAACACACTGATCCAGTCTGGTGAGATCTCTGGGCCCTGGGTCACCTGT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACACACTGATCCAGTCTGGTGAGATCTCTGGGCCCTGGGTCACCTGT  450

seq1  TTTATATCCAAACTCTAGGCCTAGCCACATTCTGTGTGTGAATCCAGTAT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATCCAAACTCTAGGCCTAGCCACATTCTGTGTGTGAATCCAGTAT  500

seq1  GATGAGTTCCTGGAACATTGCTTGCCTATGCCAAGACCAACTCTTGAGGT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTTCCTGGAACATTGCTTGCCTATGCCAAGACCAACTCTTGAGGT  550

seq1  TTGCCTTGACTTCATAGCCTTTATGCATGCCTAGCCTGAGATACCCTAAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTGACTTCATAGCCTTTATGCATGCCTAGCCTGAGATACCCTAAA  600

seq1  GCCTCAAATCAGAAACATACCAATAAAGAAAGCCATGTACATAGGTCTTA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAAATCAGAAACATACCAATAAAGAAAGCCATGTACATAGGTCTTA  650

seq1  CCATAAAAAGTCAAACAATATCACAGACCGAGATAATACATATCCCCCCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAAAAGTCAAACAATATCACAGACCGAGATAATACATATCCCCCCT  700

seq1  CCCGAGTCCCACCAGTTACTATAGAAATGTTCTCTAATGAAATTTATAAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGAGTCCCACCAGTTACTATAGAAATGTTCTCTAATGAAATTTATAAA  750

seq1  AACAAAACAAAACAAAACAAAAACAAACCAAAAAACAACAACAACAAAAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAACAAAACAAAACAAAAACAAACCAAAAAACAACAACAACAAAAC  800

seq1  CAAAACAGGAATTTCCAGGACCCACAAACAATCATAATTTTCATTAAAAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAGGAATTTCCAGGACCCACAAACAATCATAATTTTCATTAAAAA  850

seq1  ATTCAGAGTTTAAAGAACATGTAGACTTAATGAACTTAAGAAGAATAGCA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGAGTTTAAAGAACATGTAGACTTAATGAACTTAAGAAGAATAGCA  900

seq1  AATAAACACCTCAGTGATATAAAGAAAAGGAAATATATGGCAAGATGAAA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACACCTCAGTGATATAAAGAAAAGGAAATATATGGCAAGATGAAA  950

seq1  CGAAAAACTCCATACAGAATTGAAAACTGAATTC  979
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAAAACTCCATACAGAATTGAAAACTGAATTC  984

seq1: chrX_93301282_93302473
seq2: B6Ng01-102G23.g_65_1197

seq1  GAATTCTAGTAAAATCTTATTTTTCTTGCTGAAGTAGGATTCTAAATGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGTAAAATCTTATTTTTCTTGCTGAAGTAGGATTCTAAATGGC  50

seq1  TCCAGTAGATGGTTCTGTGGGTGAAGTGAGGACCTGGGTTTGGCATCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTAGATGGTTCTGTGGGTGAAGTGAGGACCTGGGTTTGGCATCCCA  100

seq1  GAACCCATGTTAAAGATACATCTGCAGTTCCTGAGTTCCTACTGCTAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCATGTTAAAGATACATCTGCAGTTCCTGAGTTCCTACTGCTAGAT  150

seq1  GGGAGGCAGAGACAGGAGAATTCTGGAAGCATATGGGCCACATGACCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGCAGAGACAGGAGAATTCTGGAAGCATATGGGCCACATGACCTGG  200

seq1  AATGAAGTAGGAGAAATAAGAGAGATACTCTCCTTCATAAGAGGAAGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAGTAGGAGAAATAAGAGAGATACTCTCCTTCATAAGAGGAAGTCT  250

seq1  AGGACTGATAATTAAGGTCATCCTCTGGTTCTCTACATGCATTTTGTGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTGATAATTAAGGTCATCCTCTGGTTCTCTACATGCATTTTGTGGC  300

seq1  ATGTACCTATACGCACACGTGATGGAAAATGGTTCCTTCCTTCATGTATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACCTATACGCACACGTGATGGAAAATGGTTCCTTCCTTCATGTATC  350

seq1  TTTTTGAACTAAATTAAGAAATAGAACTCAGTGAAGACTTTCTATTCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAACTAAATTAAGAAATAGAACTCAGTGAAGACTTTCTATTCTGT  400

seq1  CTATTCTTGTCCATTGGCTGTGCTGTGGTTTGGTGGAAAAAAAATGGAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCTTGTCCATTGGCTGTGCTGTGGTTTGGTGGAAAAAAAATGGAGG  450

seq1  ACGGTTTCTCAGAGACTGCTTGTAATTGAGATGGAGGAGTATGATGCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTTTCTCAGAGACTGCTTGTAATTGAGATGGAGGAGTATGATGCTTT  500

seq1  CCAAATGTAGCCTCCCTGCAGAATGGGCACCTTGAACTGGGAGACAGATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATGTAGCCTCCCTGCAGAATGGGCACCTTGAACTGGGAGACAGATA  550

seq1  TTTTGGTGTAAGTTTTCAAGTACAGCTCTTTGGGTATGCCTGACAGTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGTGTAAGTTTTCAAGTACAGCTCTTTGGGTATGCCTGACAGTGGA  600

seq1  AATAGCAGATCTAAGACTGTTTTCAAATTTACTTTTTGCCTGTGAAATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCAGATCTAAGACTGTTTTCAAATTTACTTTTTGCCTGTGAAATTT  650

seq1  TGATAGAACGTGTGTGTGATTATGATACTAATTGATACAAATTATGGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAACGTGTGTGTGATTATGATACTAATTGATACAAATTATGGGAA  700

seq1  TCACTGAGGTTTGAACATTTGGTGATACAGGGCAAAGTAGAGTCCCGAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAGGTTTGAACATTTGGTGATACAGGGCAAAGTAGAGTCCCGAAC  750

seq1  AATTATGTCTTGGTTACATATTTAGGAGATAATAGGGGCCAACACCTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATGTCTTGGTTACATATTTAGGAGATAATAGGGGCCAACACCTGTG  800

seq1  AGAGGGAGTACAGCATATGTATGGGGCATGGAACATTTTATTCCCTTTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAGTACAGCATATGTATGGGGCATGGAACATTTTATTCCCTTTAG  850

seq1  TTCTGGTTGCCCTTAGAAATATAGGATGGGTAATATAGCCTCATTATTAT  900
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTCTGGTTG-CCTTAGAAATATAGGATGGGTAATATAG-CTCATTATTAT  898

seq1  TATTTTTCTGAGACAAGGTATTAGCATATGACCAAGGTGACTTGAAACTC  950
      || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
seq2  TA-TTTTCTGAGACAAGGTATTAGCATATGAC--AGGTGACTTGAAACTC  945

seq1  AGAGATCCACCTTCCTCTGCCTCCTTATTAAGGGCATATTCCACGGAGCC  1000
      |||||| |||  | ||||| |||  |||  | |||||||| |||| || |
seq2  AGAGAT-CAC--TTCTCTG-CTC--TAT--AAGGCATATT-CACGAAG-C  985

seq1  TGGAAAAGCCACACTATTTTTAAGATAGCTGAAGTAGTTTCTGATTTTAC  1050
      ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||
seq2  TG--AAAGCCACACTATTTT--AGATAGCTG-AGTAG-TTCTGA-TTTAC  1028

seq1  CATTTTGCTCTTGTCTGCTCCAATCCCCGGGTCCAGTCTTTTTTTTTTTT  1100
         |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||| ||   
seq2  --ATTTGCTCTTGTCTGCTC--ATCCC--GGTCCAGTCTTATTTATT---  1069

seq1  TTTTTCTCAAAAATCTCAGGCTGGGTATTTGATTAAGTACACCAAAAGGC  1150
                |||||||| ||| ||||||||  | |||||     |||||
seq2  --------CCAAATCTCA-GCT-GGTATTTGGAT-AGTAC-----AAGGC  1103

seq1  TCTTTCTTCCTTGATATACTGTTTAATTAATCTGTGGTATAG  1192
       || |||        |||| |  | ||  | |||||||||||
seq2  -CTCTCT-------GATACGG--TCAT--AACTGTGGTATAG  1133