BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113D08
ChromosomeX (Build37)X (Build37)
Map Location 88,885,969 - 88,886,63688,871,424 - 88,872,349
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC629471, LOC100041815, Gm44, LOC670074, LOC667972, LOC667976, Mageb2, EG278167, EG667988, EG667993, EG385489, 1700084M14Rik, EG236891, LOC629542
Downstream geneMageb5, LOC673766, LOC633484, LOC674396, EG278087, Mageb1, EG236892, EG236893, Mageb18, EG436259, EG668061, EG546347, LOC629568
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113D08.bB6Ng01-113D08.g
ACCDH919062DH919063
length668924
definitionDH919062|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113D08, 5' end.DH919063|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113D08, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,885,969 - 88,886,636)(88,871,424 - 88,872,349)
sequence
gaattcacatatgtttctgaacatattaaaggatttgatcatttacaagg
ttaccaactatcaaacccagttatgtttgttcctcacaaatgtagttttg
tgttgaagatattcattatactatcaaaataaacactttttcgttttatg
ggatttctttttacttatagttgcaaaacacataaaactcaagaagaaaa
agaccgaagtgtggatactttgagtcttcttagaagggggaacaaaatac
ccctggaaggagttacagagaaaaagttcagaacaaaataaccctagaaa
gagttagagagacaaagttcagagcagagactgaaagaatgaccatccag
agacagtcctacctagggatccatcccataaacaaccaccaaacccagac
actattgcagatgccagcaagattttgctgaaaggagactgatagagctg
tctcctgagaggctctgccagtgcctggcaaatacattagtggttgctca
cagtcatccattggatggaactcagggtccccagtgaaggaactaaagaa
agtgctcaaggaactgaaagggtttgcagccccataggaggaacaacagt
atgaactaaccagtacacccagagctcccagggactaaaccaccaaccaa
agaaaacacatagtggaa
gaattcctaaaagtagtggggatatatcctgggaaaagtcatgtaatctt
tggagaaccctgggaatttatcaccaaagatttggtggaggaaaattatg
tggtataccgccaagttcctggcagtgatcccccaagctatgagttccag
tggggtcccagagcctatgtggaaaccaccaagatgaaggtcctggaagt
tatagctaagataaataatacttcccctagtttcttcactagtatgtatg
aggaggctatgattgatgaggctaatagagcaacgaggagagttacagcc
atgcctggccatgttgtggatgtcagggatgtcaggactcatcgcagatc
catggcccatagctcctcttctaagcagtggaatgtgttatgagataaaa
ctaataaatttgcaacttattctgtaatacatgagaatttgtatatgcat
ttcctttgttattttgcaaatgagctttaatcgaggattagcttgcttca
caatctgtttcttaacattgtacctacatacatattgctgtttttcatat
ttaagatgaagatttggctaatttcaaacaaactgggaaatctttaaaat
gttaatgtggtattggaacaatgatttttctggtaatgtgttattgcttg
atggtgtagcaaaagtgacaatactaattcaaaatagttgtattttactc
tttcttgtaatgctgttggaaataaacttggattttatactcaaaatggc
ttagaaaataaattttaataagtaccaagaaaacaagcaatctaattgag
aaatgggacctggaactaaataaaattctcagaaagaactaatactaata
aacatttaaaatggtaaacatacctccctgggaaggggaaatagatagat
tttaagggtgggtggggatgggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_88885969_88886636
seq2: B6Ng01-113D08.b_49_716

seq1  GAATTCACATATGTTTCTGAACATATTAAAGGATTTGATCATTTACAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATATGTTTCTGAACATATTAAAGGATTTGATCATTTACAAGG  50

seq1  TTACCAACTATCAAACCCAGTTATGTTTGTTCCTCACAAATGTAGTTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAACTATCAAACCCAGTTATGTTTGTTCCTCACAAATGTAGTTTTG  100

seq1  TGTTGAAGATATTCATTATACTATCAAAATAAACACTTTTTCGTTTTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAAGATATTCATTATACTATCAAAATAAACACTTTTTCGTTTTATG  150

seq1  GGATTTCTTTTTACTTATAGTTGCAAAACACATAAAACTCAAGAAGAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTCTTTTTACTTATAGTTGCAAAACACATAAAACTCAAGAAGAAAA  200

seq1  AGACCGAAGTGTGGATACTTTGAGTCTTCTTAGAAGGGGGAACAAAATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCGAAGTGTGGATACTTTGAGTCTTCTTAGAAGGGGGAACAAAATAC  250

seq1  CCCTGGAAGGAGTTACAGAGAAAAAGTTCAGAACAAAATAACCCTAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGAAGGAGTTACAGAGAAAAAGTTCAGAACAAAATAACCCTAGAAA  300

seq1  GAGTTAGAGAGACAAAGTTCAGAGCAGAGACTGAAAGAATGACCATCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAGAGAGACAAAGTTCAGAGCAGAGACTGAAAGAATGACCATCCAG  350

seq1  AGACAGTCCTACCTAGGGATCCATCCCATAAACAACCACCAAACCCAGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTCCTACCTAGGGATCCATCCCATAAACAACCACCAAACCCAGAC  400

seq1  ACTATTGCAGATGCCAGCAAGATTTTGCTGAAAGGAGACTGATAGAGCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTGCAGATGCCAGCAAGATTTTGCTGAAAGGAGACTGATAGAGCTG  450

seq1  TCTCCTGAGAGGCTCTGCCAGTGCCTGGCAAATACATTAGTGGTTGCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGAGAGGCTCTGCCAGTGCCTGGCAAATACATTAGTGGTTGCTCA  500

seq1  CAGTCATCCATTGGATGGAACTCAGGGTCCCCAGTGAAGGAACTAAAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCATCCATTGGATGGAACTCAGGGTCCCCAGTGAAGGAACTAAAGAA  550

seq1  AGTGCTCAAGGAACTGAAAGGGTTTGCAGCCCCATAGGAGGAACAACAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCAAGGAACTGAAAGGGTTTGCAGCCCCATAGGAGGAACAACAGT  600

seq1  ATGAACTAACCAGTACACCCAGAGCTCCCAGGGACTAAACCACCAACCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACTAACCAGTACACCCAGAGCTCCCAGGGACTAAACCACCAACCAA  650

seq1  AGAAAACACATAGTGGAA  668
      ||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACACATAGTGGAA  668

seq1: chrX_88871424_88872349
seq2: B6Ng01-113D08.g_67_989

seq1  GAATTCCTAAAAGTAGTGGGGATATATCCTGGGAAAAGTCATGTAATCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAAAGTAGTGGGGATATATCCTGGGAAAAGTCATGTAATCTT  50

seq1  TGGAGAACCCTGGGAATTTATCACCAAAGATTTGGTGGAGGAAAATTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAACCCTGGGAATTTATCACCAAAGATTTGGTGGAGGAAAATTATG  100

seq1  TGGTATACCGCCAAGTTCCTGGCAGTGATCCCCCAAGCTATGAGTTCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATACCGCCAAGTTCCTGGCAGTGATCCCCCAAGCTATGAGTTCCAG  150

seq1  TGGGGTCCCAGAGCCTATGTGGAAACCACCAAGATGAAGGTCCTGGAAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTCCCAGAGCCTATGTGGAAACCACCAAGATGAAGGTCCTGGAAGT  200

seq1  TATAGCTAAGATAAATAATACTTCCCCTAGTTTCTTCACTAGTATGTATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCTAAGATAAATAATACTTCCCCTAGTTTCTTCACTAGTATGTATG  250

seq1  AGGAGGCTATGATTGATGAGGCTAATAGAGCAACGAGGAGAGTTACAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCTATGATTGATGAGGCTAATAGAGCAACGAGGAGAGTTACAGCC  300

seq1  ATGCCTGGCCATGTTGTGGATGTCAGGGATGTCAGGACTCATCGCAGATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTGGCCATGTTGTGGATGTCAGGGATGTCAGGACTCATCGCAGATC  350

seq1  CATGGCCCATAGCTCCTCTTCTAAGCAGTGGAATGTGTTATGAGATAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCCCATAGCTCCTCTTCTAAGCAGTGGAATGTGTTATGAGATAAAA  400

seq1  CTAATAAATTTGCAACTTATTCTGTAATACATGAGAATTTGTATATGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAAATTTGCAACTTATTCTGTAATACATGAGAATTTGTATATGCAT  450

seq1  TTCCTTTGTTATTTTGCAAATGAGCTTTAATCGAGGATTAGCTTGCTTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTGTTATTTTGCAAATGAGCTTTAATCGAGGATTAGCTTGCTTCA  500

seq1  CAATCTGTTTCTTAACATTGTACCTACATACATATTGCTGTTTTTCATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTGTTTCTTAACATTGTACCTACATACATATTGCTGTTTTTCATAT  550

seq1  TTAAGATGAAGATTTGGCTAATTTCAAACAAACTGGGAAATCTTTAAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGATGAAGATTTGGCTAATTTCAAACAAACTGGGAAATCTTTAAAAT  600

seq1  GTTAATGTGGTATTGGAACAATGATTTTTCTGGTAATGTGTTATTGCTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATGTGGTATTGGAACAATGATTTTTCTGGTAATGTGTTATTGCTTG  650

seq1  ATGGTGTAGCAAAAGTGACAATACTAATTCAAAATAGTTGTATTTTACTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGTAGCAAAAGTGACAATACTAATTCAAAATAGTTGTATTTTACTC  700

seq1  TTTCTTGTAATGCTGTTGGAAATAAACTTGGATTTTTATACTCAAAATGG  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGTAATGCTGTTGGAAATAAACTTGGA-TTTTATACTCAAAATGG  749

seq1  CTTAGAAAATAAATTTTAATAAGTACCAAGAAAACAAGCAATCTAATTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAAAATAAATTTTAATAAGTACCAAGAAAACAAGCAATCTAATTGA  799

seq1  GAAATGGGACCTGGAACTAAATAAAATTCTCAGAAAGAACTAATACTAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGGACCTGGAACTAAATAAAATTCTCAGAAAGAACTAATACTAAT  849

seq1  AAACATTTAAAAATGGTAAACATACCTCCCTGGGAAGGGGAAATAGAATA  900
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AAACATTT-AAAATGGTAAACATACCTCCCTGGGAAGGGGAAATAG-ATA  897

seq1  GATTTTAAGGGTGGGTGGGGATGGGA  926
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTAAGGGTGGGTGGGGATGGGA  923