BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145G15
ChromosomeX (Build37)
Map Location 162,329,518 - 162,494,213
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMospd2, Fancb, LOC627045, Glra2, LOC100040753
Downstream geneGemin8, Gpm6b, Ofd1, Trappc2, Rab9, LOC100040795, A630018P17Rik, Egfl6, LOC100041912, LOC641660, LOC667791
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145G15.bB6Ng01-145G15.g
ACCDH942822DH942823
length1,0061,085
definitionDH942822|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145G15, 5' end.DH942823|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145G15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(162,493,200 - 162,494,213)(162,329,518 - 162,330,628)
sequence
gaattctcaactgaagaagtgttgttttaacttcttttcaccatccctct
tgcagtttttctctccatattatcagctcagatgctagaaggatctttac
cagcccataggccctgaagaacttgtctttctgtttggatgtgtattacc
tccttaaggtagtttctctgtctctgtttcttttttttttttttttaaag
ccattttttctttttctttttttttttaaagatttatttattattatatg
taagtacactgtagctgtcttcagacacaccagaagagggagtcagatct
tgttagggatggttgtgagccaccatgtggttgctgggatttgaactctg
gaccttcagaagagcagtcgggtgctcttacccactgagccatctcacca
gcccctctgtctctgtttctatctctgtctctctccctccttttcctttc
tcccctcataaatagtagatttctcaaggatttactgtaattatcatatc
aggcctttaaaaggctgctttagaattcaactccaagtgggggaaaaagt
ttttgagggaaataggtgtgacaatgcagagtgggctcaggagaaagtag
gagaggcctgggtagctcatagtattaaccaaagaacacagggggtccca
agccactctcagggatttaccttgtgtcttgggtatgtcagggagcagag
tgacatccttcaagatggctgtcaataacctgttggccttttctcacaga
gggatgatgggagttggcccaggggcccatgtggggactgcacatctgca
cttgtaaacattcccttccgatgcttggcatgcttccctcacatgcttga
acatccctccgactgctttctaaagctgacagtgaagccaaatcttagac
taggactttcgagggaatgttccttttcctgcagaatgcagtcatgtgac
tggatcaggcctttacatgactgggtatgggaggtagcctctggggcaga
ggaggg
gaattcttttctcggtgggactaccctgagtctgcatgtctttgtctgga
gagtgtccttgaacacaagtggcaagccttggatggtcttggctgaatga
aaagtgaccttattcaaagctctctgcaaagatgcataactcagcacaca
tgtcccactctggcttcccacctccatggttattatgtactgtacctatc
atcccttcctgctcacttgattctatgagtaattagccatttccacctgt
acctctaaaaaacaccttatataccctatacctgaaacaataaagtagcc
ttgtctcagtgcagtgggctccagaggccattctgtccttaccctgctcc
ccacgtctgctcccttttttccctcaggctggtggccaataacatccagg
gagaaagagaggggcataagataggagattagataaacattgaaggcata
gaaaatctattcaaggaaatcagcagaaattttgcaaaattacgtgaaca
aatagccatcaaatacaagaagcatttagaatgtcaaggtgctgaaaata
caaagcaaagaaacaacatattaagagatgagtgcttagaacacactaag
gagactgcagaattagggagtgagaaacacctaactcaaggtagagcaca
caggtgtacaaggcttacaacacacagtggaagctatggaagcaaagaat
ggactgtgaacatgaaggactaacctaaaagtacattttaaaacattttt
aaaatcgaccttttctcagattcctcattctcaaacttactcaccaggat
ggaacaactcagttcctgtaggactccttcttggtaagctatgactcaac
tattcaatatcatatccctactcagaatgatctatgaaattccatcacag
gaccctgggtgtctccagtacatgatttcttgtccttagtaatctattct
gtaccaatgtgtcataaccctgctatgattactcttcatttgaactttgt
atgatgtcttctttgatgacaatgatggcttgttctcgcactcactccac
tagtgatgctaagtcattcatctcattataagatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_162493200_162494213
seq2: B6Ng01-145G15.b_46_1051 (reverse)

seq1  CCCTCCCTCTGCCCCAGAGGCTTCCCTCCCATTTCCCAGTCATTGTAAAG  50
      |||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||
seq2  CCCT-CCTCTGCCCCAGAGGC-TACCTCCCA-TACCCAGTCA-TGTAAAG  46

seq1  GGCTGGTTCCCAAGTTCACATGGACTGCATTCTGCAGGAAAAGG-ACATT  99
      | ||| |  |||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCCTGAT--CCA--GTCACAT-GACTGCATTCTGCAGGAAAAGGAACATT  91

seq1  CCCTCGAAAGTCCTAGTCTAAGAATTTGGCTTCACTGTCAGCTTTAGAAA  149
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCGAAAGTCCTAGTCTAAG-ATTTGGCTTCACTGTCAGCTTTAGAAA  140

seq1  GCAGTCGGAGGGATG-TCAAGCATGTGAGGGAAGCATGCCAAGCATCGGA  198
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCGGAGGGATGTTCAAGCATGTGAGGGAAGCATGCCAAGCATCGGA  190

seq1  AGGGAATGTTTACAAGTGCAGATGTGCAGTCCCCACATGGGCCCCTGGGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAATGTTTACAAGTGCAGATGTGCAGTCCCCACATGGGCCCCTGGGC  240

seq1  CAACTCCCATCATCCCTCTGTGAGAAAAGGCCAACAGGTTATTGACAGCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCCCATCATCCCTCTGTGAGAAAAGGCCAACAGGTTATTGACAGCC  290

seq1  ATCTTGAAGGATGTCACTCTGCTCCCTGACATACCCAAGACACAAGGTAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGAAGGATGTCACTCTGCTCCCTGACATACCCAAGACACAAGGTAA  340

seq1  ATCCCTGAGAGTGGCTTGGGACCCCCTGTGTTCTTTGGTTAATACTATGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGAGAGTGGCTTGGGACCCCCTGTGTTCTTTGGTTAATACTATGA  390

seq1  GCTACCCAGGCCTCTCCTACTTTCTCCTGAGCCCACTCTGCATTGTCACA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACCCAGGCCTCTCCTACTTTCTCCTGAGCCCACTCTGCATTGTCACA  440

seq1  CCTATTTCCCTCAAAAACTTTTTCCCCCACTTGGAGTTGAATTCTAAAGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTTCCCTCAAAAACTTTTTCCCCCACTTGGAGTTGAATTCTAAAGC  490

seq1  AGCCTTTTAAAGGCCTGATATGATAATTACAGTAAATCCTTGAGAAATCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTTAAAGGCCTGATATGATAATTACAGTAAATCCTTGAGAAATCT  540

seq1  ACTATTTATGAGGGGAGAAAGGAAAAGGAGGGAGAGAGACAGAGATAGAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTATGAGGGGAGAAAGGAAAAGGAGGGAGAGAGACAGAGATAGAA  590

seq1  ACAGAGACAGAGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGACAGAGGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGAC  640

seq1  TGCTCTTCTGAAGGTCCAGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTCTGAAGGTCCAGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTC  690

seq1  ACAACCATCCCTAACAAGATCTGACTCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACCATCCCTAACAAGATCTGACTCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGAC  740

seq1  AGCTACAGTGTACTTACATATAATAATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACAGTGTACTTACATATAATAATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAAA  790

seq1  GAAAAAGAAAAAATGGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACAGAGACAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGAAAAAATGGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACAGAGACAGA  840

seq1  GAAACTACCTTAAGGAGGTAATACACATCCAAACAGAAAGACAAGTTCTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTACCTTAAGGAGGTAATACACATCCAAACAGAAAGACAAGTTCTT  890

seq1  CAGGGCCTATGGGCTGGTAAAGATCCTTCTAGCATCTGAGCTGATAATAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCCTATGGGCTGGTAAAGATCCTTCTAGCATCTGAGCTGATAATAT  940

seq1  GGAGAGAAAAACTGCAAGAGGGATGGTGAAAAGAAGTTAAAACAACACTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAAAAACTGCAAGAGGGATGGTGAAAAGAAGTTAAAACAACACTT  990

seq1  CTTCAGTTGAGAATTC  1014
      ||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTTGAGAATTC  1006

seq1: chrX_162329518_162330628
seq2: B6Ng01-145G15.g_65_1149

seq1  GAATTCTTTTCTCGGTGGGACTACCCTGAGTCTGCATGTCTTTGTCTGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTCTCGGTGGGACTACCCTGAGTCTGCATGTCTTTGTCTGGA  50

seq1  GAGTGTCCTTGAACACAAGTGGCAAGCCTTGGATGGTCTTGGCTGAATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTCCTTGAACACAAGTGGCAAGCCTTGGATGGTCTTGGCTGAATGA  100

seq1  AAAGTGACCTTATTCAAAGCTCTCTGCAAAGATGCATAACTCAGCACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGACCTTATTCAAAGCTCTCTGCAAAGATGCATAACTCAGCACACA  150

seq1  TGTCCCACTCTGGCTTCCCACCTCCATGGTTATTATGTACTGTACCTATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCACTCTGGCTTCCCACCTCCATGGTTATTATGTACTGTACCTATC  200

seq1  ATCCCTTCCTGCTCACTTGATTCTATGAGTAATTAGCCATTTCCACCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTTCCTGCTCACTTGATTCTATGAGTAATTAGCCATTTCCACCTGT  250

seq1  ACCTCTAAAAAACACCTTATATACCCTATACCTGAAACAATAAAGTAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTAAAAAACACCTTATATACCCTATACCTGAAACAATAAAGTAGCC  300

seq1  TTGTCTCAGTGCAGTGGGCTCCAGAGGCCATTCTGTCCTTACCCTGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCAGTGCAGTGGGCTCCAGAGGCCATTCTGTCCTTACCCTGCTCC  350

seq1  CCACGTCTGCTCCCTTTTTTCCCTCAGGCTGGTGGCCAATAACATCCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGTCTGCTCCCTTTTTTCCCTCAGGCTGGTGGCCAATAACATCCAGG  400

seq1  GAGAAAGAGAGGGGCATAAGATAGGAGATTAGATAAACATTGAAGGCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGAGAGGGGCATAAGATAGGAGATTAGATAAACATTGAAGGCATA  450

seq1  GAAAATCTATTCAAGGAAATCAGCAGAAATTTTGCAAAATTACGTGAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATCTATTCAAGGAAATCAGCAGAAATTTTGCAAAATTACGTGAACA  500

seq1  AATAGCCATCAAATACAAGAAGCATTTAGAATGTCAAGGTGCTGAAAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCCATCAAATACAAGAAGCATTTAGAATGTCAAGGTGCTGAAAATA  550

seq1  CAAAGCAAAGAAACAACATATTAAGAGATGAGTGCTTAGAACACACTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCAAAGAAACAACATATTAAGAGATGAGTGCTTAGAACACACTAAG  600

seq1  GAGACTGCAGAATTAGGGAGTGAGAAACACCTAACTCAAGGTAGAGCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTGCAGAATTAGGGAGTGAGAAACACCTAACTCAAGGTAGAGCACA  650

seq1  CAGGTGTACAAGGCTTACAACACACAGTGGAAGCTATGGAAGCAAAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTACAAGGCTTACAACACACAGTGGAAGCTATGGAAGCAAAGAAT  700

seq1  GGACTGTGAACATGAAGGACTAACCTAAAAGTACATTTTAAAACATTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGTGAACATGAAGGACTAACCTAAAAGTACATTTTAAAACATTTTT  750

seq1  AAAATCGACCTTTTCTCAGATTCCTCATTCTCAAACTTACTCACCAGGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCGACCTTTTCTCAGATTCCTCATTCTCAAACTTACTCACCAGGAT  800

seq1  GGAACAACTCAGTTCCTGTAGGACTCCTTTCTTGGTAAGCTATGACTCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAACTCAGTTCCTGTAGGACTCC-TTCTTGGTAAGCTATGACTCAA  849

seq1  CTATTCAATATCATATCCCTACTCAGAATGATCTATGAAATTCCATCCAC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTATTCAATATCATATCCCTACTCAGAATGATCTATGAAATTCCAT-CAC  898

seq1  AAGGGACCCTGGGTGTCTCCAAGTACATGATTTCTTGGTCCTTAGTAAAT  950
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  A--GGACCCTGGGTGTCTCC-AGTACATGATTTCTT-GTCCTTAGT-AAT  943

seq1  CTTATTTCTGGTACCAATGTGGTTCATAACCCTGCTATGATTTACTCTTC  1000
      ||   |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CT--ATTCT-GTACCAATGTG--TCATAACCCTGCTATGA-TTACTCTTC  987

seq1  ATTTGAAACTTTGTTAGTGATGTCTTCTTCTGATGACAATGATTGCTTTG  1050
      ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| || |||
seq2  ATTTG-AACTTTGT--ATGATGTCTTCTT-TGATGACAATGATGGC-TTG  1032

seq1  TTCT-GCACTCACCTTCCACTTAGTGAGTGCTAAGTCATTTTCATTCTCA  1099
      |||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||
seq2  TTCTCGCACTCAC--TCCAC-TAGTGA-TGCTAAGTCA--TTCA-TCTCA  1075

seq1  TTTATAAAGATC  1111
       |||| ||||||
seq2  -TTAT-AAGATC  1085