BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155P20
ChromosomeX (Build37)
Map Location 156,770,271 - 156,827,738
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRps6ka3, Eif1ay, Mtap7d2, A830080D01Rik, LOC100041359, Sh3kbp1, LOC667524, Pdha1, LOC100041403, LOC100041416, LOC100041427
Downstream geneGpr64, Phka2, Ppef1, Rs1, Gja6, Scml2, LOC414364
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155P20.bB6Ng01-155P20.g
ACCDH950616DH950617
length1,095892
definitionDH950616|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P20, 5' end.DH950617|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(156,770,271 - 156,771,377)(156,826,791 - 156,827,738)
sequence
gaattcatatgcacattagtattttagaagcagtggtttatgctaccatg
cttcattatttaagcactcaatagaaaaatagttgctgggtaaggaagaa
agtgctgattgatagaagtatctttctccaaagatgtatggatgagaata
aaccttccactttccactaacccaactcaaagcaaaaatttaatagccca
cttggctatgcagcccaatagttgagcacaaagtgaatctgaggtttgtt
gaatgagatccaaaatgtcaatgtgagacagacttcaaagaaaaaatggt
aatctgatcattacacaagaattctttaaaagtttttttttttttttaat
agctatggttaccagcaagccagagcttgccaaggtgggataacattcta
aggactaagatatgcctttagtcttggatgtatggagtttaggaaatctc
agctagagcaaacccagaaggctggccagctgaggcaaagatgccatgag
ggaagactgatgcaaaacatctgggccagttttggcagccaccctgaaaa
accatttggggagaaaggctatgtgaaagtgttcacacccacagtataat
ttggggaaatatcttttgcattatatttgatactagaatgaacaaatttt
atttccctactgggagattttgatttctaacgtcctgtaaaagcaaacgt
tgttgtctccgtttttccttgtgaacatctatggttgttaaattgcttta
gaataaagggctgaaaatagacacacatctgactcatcaaatggtcatat
aggtttacaagctagagcaaatctgtatttggcaaatttatcagcaagca
aagcatttgaatttttcttactttaacttttttttaatgaaaaaagaaac
ccagaaatttcctccctttccttcctttcatgacataaatcatggaaaac
attgaccactttcatgggaaaaatcctgatcatatttattctttgctcag
acaggtttaataaatggcccatcagacccatgcttcttctctccctcaca
ttgacctggggaacatactacttgtagtggagatggagttggaaa
gaattcacaatcctggggatctgctatttataaagggcaaatctgaagag
tagggtgactgagtctgctacatcagccccattgaacaaagctcagggta
tacattctgcctggcaggatgggttgtatttgttttacaaacaccaagtt
attaacactcacaacagtctagctggagaaatgaatgggcagtgttttca
gacagacttttgcctggatggattaagggagagttggtggagaagaggaa
gcacatccaggttacataacaagccagaagttgtggctggaagtggggag
tatatttaagaaacagactgcatgtcattccaaagggttaaaatggttgt
gtttgtcttattataaaacagactccatagcatatagagccacaagaatt
cttatacaaagctagttggatgtaaattgcttttagcgctttagagctct
gtcaggatgtactaaagtgagtaccactattgtatgacaagcaattcccc
cttagattcagcctcaacagaaatgagttgtatgtttaccaagagagatg
agtaaggatatcacagcacagtatttgtgttacttagaacatgcccaaat
gcccattggccatagaacaaactgagggtcagcctggtagtataacccca
gatatcctggaaactagggcaagggatagtgaattcaaggcaaggccagt
atgggctacatagtgagttcaaggacagtctgggcaacttagtgagagcc
ccctccaaagaaaaagtaaaaagaagtctgaagatgtcacctagtggtat
aaatattagcacttgcatagtatgtgtgagggcctagattcaattcctac
cattgaaaattcaatgaaatgtggtggtggtggtgggtggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_156770271_156771377
seq2: B6Ng01-155P20.b_47_1141

seq1  GAATTCATATGCACATTAGTATTTTAGAAGCAGTGGTTTATGCTACCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATGCACATTAGTATTTTAGAAGCAGTGGTTTATGCTACCATG  50

seq1  CTTCATTATTTAAGCACTCAATAGAAAAATAGTTGCTGGGTAAGGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTATTTAAGCACTCAATAGAAAAATAGTTGCTGGGTAAGGAAGAA  100

seq1  AGTGCTGATTGATAGAAGTATCTTTCTCCAAAGATGTATGGATGAGAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGATTGATAGAAGTATCTTTCTCCAAAGATGTATGGATGAGAATA  150

seq1  AACCTTCCACTTTCCACTAACCCAACTCAAAGCAAAAATTTAATAGCCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTCCACTTTCCACTAACCCAACTCAAAGCAAAAATTTAATAGCCCA  200

seq1  CTTGGCTATGCAGCCCAATAGTTGAGCACAAAGTGAATCTGAGGTTTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCTATGCAGCCCAATAGTTGAGCACAAAGTGAATCTGAGGTTTGTT  250

seq1  GAATGAGATCCAAAATGTCAATGTGAGACAGACTTCAAAGAAAAAATGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGATCCAAAATGTCAATGTGAGACAGACTTCAAAGAAAAAATGGT  300

seq1  AATCTGATCATTACACAAGAATTCTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGATCATTACACAAGAATTCTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTAAT  350

seq1  AGCTATGGTTACCAGCAAGCCAGAGCTTGCCAAGGTGGGATAACATTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGGTTACCAGCAAGCCAGAGCTTGCCAAGGTGGGATAACATTCTA  400

seq1  AGGACTAAGATATGCCTTTAGTCTTGGATGTATGGAGTTTAGGAAATCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTAAGATATGCCTTTAGTCTTGGATGTATGGAGTTTAGGAAATCTC  450

seq1  AGCTAGAGCAAACCCAGAAGGCTGGCCAGCTGAGGCAAAGATGCCATGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAGCAAACCCAGAAGGCTGGCCAGCTGAGGCAAAGATGCCATGAG  500

seq1  GGAAGACTGATGCAAAACATCTGGGCCAGTTTTGGCAGCCACCCTGAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGACTGATGCAAAACATCTGGGCCAGTTTTGGCAGCCACCCTGAAAA  550

seq1  ACCATTTGGGGAGAAAGGCTATGTGAAAGTGTTCACACCCACAGTATAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTTGGGGAGAAAGGCTATGTGAAAGTGTTCACACCCACAGTATAAT  600

seq1  TTGGGGAAATATCTTTTGCATTATATTTGATACTAGAATGAACAAATTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAAATATCTTTTGCATTATATTTGATACTAGAATGAACAAATTTT  650

seq1  ATTTCCCTACTGGGAGATTTTGATTTCTAACGTCCTGTAAAAGCAAACGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCCTACTGGGAGATTTTGATTTCTAACGTCCTGTAAAAGCAAACGT  700

seq1  TGTTGTCTCCGTTTTTCCTTGTGAACATCTATGGTTGTTAAATTGCTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTCTCCGTTTTTCCTTGTGAACATCTATGGTTGTTAAATTGCTTTA  750

seq1  GAATAAAGGGCTGAAAATAGACACACATCTGACTCATCAAATGGTCATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAGGGCTGAAAATAGACACACATCTGACTCATCAAATGGTCATAT  800

seq1  AGGTTTACAAGCTAGAGCAAATCTGTATTTGGCAAATTTATCAGCAAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTACAAGCTAGAGCAAATCTGTATTTGGCAAATTTATCAGCAAGCA  850

seq1  AAGCATTTGAA-TTTTCTTACTTTAACTTTTTTTTAATGAAAAAAGAAAC  899
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTTGAATTTTTCTTACTTTAACTTTTTTTTAATGAAAAAAGAAAC  900

seq1  CCAGAAATTTCCTCCCTTTCCTTCCTTTCATGACATAAATCATGGAAAAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAATTTCCTCCCTTTCCTTCCTTTCATGACATAAATCATGGAAAAC  950

seq1  ATTGACCACTTTCATGGGAAAAAATCCTGATCATATTTATTCTTTGCTCA  999
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGACCACTTTCATGGG-AAAAATCCTGATCATATTTATTCTTTGCTCA  999

seq1  GAACAGGGTTTAAATAAAATGGCCCATCAGAACCCATTGCTTCTTCTCT-  1048
      | ||| |||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| 
seq2  G-ACA-GGTTTAA--TAAATGGCCCATCAG-ACCCA-TGCTTCTTCTCTC  1043

seq1  CCTCACATTTGACCTGGGGAAACATTACTTACTTGGTTAGTGGAGATGGA  1098
      ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||
seq2  CCTCACA-TTGACCTGGGG-AACA-TAC-TACTTG--TAGTGGAGATGGA  1087

seq1  GTTGAGAAA  1107
      |||| ||||
seq2  GTTG-GAAA  1095

seq1: chrX_156826791_156827738
seq2: B6Ng01-155P20.g_67_958 (reverse)

seq1  CACCACCAGCACCACCACCAGCAACACCAGCACTACCACCACCACCACCA  50
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  CCACCACCACCACCACCACCACCACCACATTTCATTGAATTTTCAGTGGT  100
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ----CACCAC--CCACCACCACCACCACATTTCATTGAATTTTCAATGGT  44

seq1  AGGGATTGAATCTAGGCCCTCACACATACTATGCAAGTGCTAATATTAAT  150
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGGAATTGAATCTAGGCCCTCACACATACTATGCAAGTGCTAATATTTAT  94

seq1  ACCACTAGGTGACATCTTCAGACTTCTTTTTACTTTTTCTTTGGAGGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTAGGTGACATCTTCAGACTTCTTTTTACTTTTTCTTTGGAGGGGG  144

seq1  CTCTCACTAAGTTGCCCAGACTGTCCTTGAACTCACTATGTAGCCCATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACTAAGTTGCCCAGACTGTCCTTGAACTCACTATGTAGCCCATAC  194

seq1  TGGCCTTGCCTTGAATTCACTATCCCTTGCCCTAGTTTCCAGGATATCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTGCCTTGAATTCACTATCCCTTGCCCTAGTTTCCAGGATATCTG  244

seq1  GGGTTATACTACCAGGCTGACCCTCAGTTTGTTCTATGGCCAATGGGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTATACTACCAGGCTGACCCTCAGTTTGTTCTATGGCCAATGGGCAT  294

seq1  TTGGGCATGTTCTAAGTAACACAAATACTGTGCTGTGATATCCTTACTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCATGTTCTAAGTAACACAAATACTGTGCTGTGATATCCTTACTCA  344

seq1  TCTCTCTTGGTAAACATACAACTCATTTCTGTTGAGGCTGAATCTAAGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTTGGTAAACATACAACTCATTTCTGTTGAGGCTGAATCTAAGGG  394

seq1  GGAATTGCTTGTCATACAATAGTGGTACTCACTTTAGTACATCCTGACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTGCTTGTCATACAATAGTGGTACTCACTTTAGTACATCCTGACAG  444

seq1  AGCTCTAAAGCGCTAAAAGCAATTTACATCCAACTAGCTTTGTATAAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTAAAGCGCTAAAAGCAATTTACATCCAACTAGCTTTGTATAAGAA  494

seq1  TTCTTGTGGCTCTATATGCTATGGAGTCTGTTTTATAATAAGACAAACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTGGCTCTATATGCTATGGAGTCTGTTTTATAATAAGACAAACAC  544

seq1  AACCATTTTAACCCTTTGGAATGACATGCAGTCTGTTTCTTAAATATACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATTTTAACCCTTTGGAATGACATGCAGTCTGTTTCTTAAATATACT  594

seq1  CCCCACTTCCAGCCACAACTTCTGGCTTGTTATGTAACCTGGATGTGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACTTCCAGCCACAACTTCTGGCTTGTTATGTAACCTGGATGTGCTT  644

seq1  CCTCTTCTCCACCAACTCTCCCTTAATCCATCCAGGCAAAAGTCTGTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCTCCACCAACTCTCCCTTAATCCATCCAGGCAAAAGTCTGTCTG  694

seq1  AAAACACTGCCCATTCATTTCTCCAGCTAGACTGTTGTGAGTGTTAATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACTGCCCATTCATTTCTCCAGCTAGACTGTTGTGAGTGTTAATAA  744

seq1  CTTGGTGTTTGTAAAACAAATACAACCCATCCTGCCAGGCAGAATGTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTGTTTGTAAAACAAATACAACCCATCCTGCCAGGCAGAATGTATA  794

seq1  CCCTGAGCTTTGTTCAATGGGGCTGATGTAGCAGACTCAGTCACCCTACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGCTTTGTTCAATGGGGCTGATGTAGCAGACTCAGTCACCCTACT  844

seq1  CTTCAGATTTGCCCTTTATAAATAGCAGATCCCCAGGATTGTGAATTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGATTTGCCCTTTATAAATAGCAGATCCCCAGGATTGTGAATTC  892