BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-181I15
ChromosomeX (Build37)
Map Location 126,927,438 - 127,033,675
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040092
Upstream geneLOC100040570, LOC669120, Diap2
Downstream geneLOC665773, LOC665799, LOC670449
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-181I15.bB6Ng01-181I15.g
ACCGA007671GA007672
length1,1321,163
definitionB6Ng01-181I15.b B6Ng01-181I15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,927,438 - 126,928,583)(127,032,514 - 127,033,675)
sequence
gaattcatatccttggcagtatatagactcttaaaaatatatataacatg
tctttgtagcagattaaaacatgtttgcattaatcaacaaatacgtctaa
actctaaattgcatttggttaaaaaatcctgacttctttccttagcaatt
gaattagccaaattccatatttcagaaaagcaaattactttactagggtt
taattgattattaagttaaaatattccattgcttttgccctttgtgtctt
ttattaatagtgccggctcttgctttagtgagcagaagatagtcatagat
acatttttgtgaacagtgagcatattacttcctgcccaggaacacatctt
tcccttttgagccacatggagagtttgttcacaagttatcagtctcccta
gtggactccattaacagcaacagtcgtgaactaagagcacaaggaaatgg
agctggtgttcataagcaaagagcacaaagcttttaagcttctcaaacca
catccagcaaggtctgcctactttattatctgaggtgttgccgttctctt
tcatgcctttagagatgctggctgaatcatacctctgtctcacagggctt
ctgcagagaacaggaattcatttcaacacagagacaaggaggctttttct
ttctaaaacttttgttcttactgcctggtgaactttgaagtcaaattggt
gtaaaattggaatgctttcctctcttgtgtccccttatacttccatgctc
accccaaacacacaattattgaaaccagctagaagcaagtagattcacag
gggaatcctttgtcccgacccctggctacaatccttgccctttctaatac
gtatagaaatgatttgaaagaattctaactaacctcagatacaagcctga
gataatgaccaagattaaatggactgaacatctcattcctatcaattcca
attcataatcctattttatttaagtcgtagctttgtcctttggaattcca
ttagccaaagatgccagtgctgttaatatactgcctgcaagggaaattac
tgctccgcttctacagctacagatcacttgtgagctatgtcataacataa
ttttcttgtcaaacccaccttcaactttaggc

gaattccaaatggcatattaagcatgtataatgccatattgtcttctgta
cctttatagaagcacactgagctgtgttcctgtgagtgttcacacatgtg
gttattcgaatgtatgatgcaaaaggaagaggaaaaagaaacagaagggg
aaggaccttgaggtgatattaagcaccgtgaagcaaaattgatctcgttc
tgcagtgtttcttccaggaagctggtgtgctccacagcatcgcccaaagc
agaagccaaatcacctacacttaatggttgtgcacatcagctgcaaaggg
ctttccagaagtttcataaaaacaagaagatgaattcaggtaataacaag
aaaatgaaatgggaagaaaataaatgttatagttctagagagttggatca
agttcagaacaaaggctaccttacttctcaatatcttattaggatcccac
ccttaattattaaatatgttaatgatttatctgcctacatttacaatggg
aatcaatatttcccctgaaaatagtaattggtaagaaacaaatgtcataa
cgaaaaagcatctgtggtattcatttcctacccattcagactctccacag
ccatgcactacttttctgagaaagtatatggatattgtttttttgtttgt
ttgtttcaccatgatcctttgtttagacaacaatgaacatcctatagtca
gggtgactttgactattttcttagaacctgggtttcttttttgtattatt
agatattttctttatttacatttcaaatactatcccaaaagttccctata
ccctccccccaccctgctcccctacccacccactcccacttcttggccct
agcattcccctgtactggggcatataaagtttgcaagacctaggggggtc
tctcttcccaatgatgggccgactaggccatcttctgctacatatgcagc
tagagacacaagctctgggggtactggtttagttcatatgttgttccccc
tattagggttgcagaccccttcagctccttgggtaccttctctagctcct
ccatttgggggtcctgtgatcattcatagctgaacagtgagccatcccac
tcctgtattttggccaggcactgcatagcctcacaagacatgctatatca
gggtcttcagcaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_126927438_126928583
seq2: B6Ng01-181I15.b_45_1176

seq1  GAATTCATATCCTTGGCAGTATATAGACTCTTAAAAATATATATAACATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATCCTTGGCAGTATATAGACTCTTAAAAATATATATAACATG  50

seq1  TCTTTGTAGCAGATTAAAACATGTTTGCATTAATCAACAAATACGTCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTAGCAGATTAAAACATGTTTGCATTAATCAACAAATACGTCTAA  100

seq1  ACTCTAAATTGCATTTGGTTAAAAAATCCTGACTTCTTTCCTTAGCAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAAATTGCATTTGGTTAAAAAATCCTGACTTCTTTCCTTAGCAATT  150

seq1  GAATTAGCCAAATTCCATATTTCAGAAAAGCAAATTACTTTACTAGGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTAGCCAAATTCCATATTTCAGAAAAGCAAATTACTTTACTAGGGTT  200

seq1  TAATTGATTATTAAGTTAAAATATTCCATTGCTTTTGCCCTTTGTGTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGATTATTAAGTTAAAATATTCCATTGCTTTTGCCCTTTGTGTCTT  250

seq1  TTATTAATAGTGCCGGCTCTTGCTTTAGTGAGCAGAAGATAGTCATAGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAATAGTGCCGGCTCTTGCTTTAGTGAGCAGAAGATAGTCATAGAT  300

seq1  ACATTTTTGTGAACAGTGAGCATATTACTTCCTGCCCAGGAACACATCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTTTGTGAACAGTGAGCATATTACTTCCTGCCCAGGAACACATCTT  350

seq1  TCCCTTTTGAGCCACATGGAGAGTTTGTTCACAAGTTATCAGTCTCCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTTGAGCCACATGGAGAGTTTGTTCACAAGTTATCAGTCTCCCTA  400

seq1  GTGGACTCCATTAACAGCAACAGTCGTGAACTAAGAGCACAAGGAAATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACTCCATTAACAGCAACAGTCGTGAACTAAGAGCACAAGGAAATGG  450

seq1  AGCTGGTGTTCATAAGCAAAGAGCACAAAGCTTTTAAGCTTCTCAAACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGTGTTCATAAGCAAAGAGCACAAAGCTTTTAAGCTTCTCAAACCA  500

seq1  CATCCAGCAAGGTCTGCCTACTTTATTATCTGAGGTGTTGCCGTTCTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAGCAAGGTCTGCCTACTTTATTATCTGAGGTGTTGCCGTTCTCTT  550

seq1  TCATGCCTTTAGAGATGCTGGCTGAATCATACCTCTGTCTCACAGGGCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCCTTTAGAGATGCTGGCTGAATCATACCTCTGTCTCACAGGGCTT  600

seq1  CTGCAGAGAACAGGAATTCATTTCAACACAGAGACAAGGAGGCTTTTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAGAACAGGAATTCATTTCAACACAGAGACAAGGAGGCTTTTTCT  650

seq1  TTCTAAAACTTTTGTTCTTACTGCCTGGTGAACTTTGAAGTCAAATTGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAACTTTTGTTCTTACTGCCTGGTGAACTTTGAAGTCAAATTGGT  700

seq1  GTAAAATTGGAATGCTTTCCTCTCTTGTGTCCCCTTATACTTCCATGCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATTGGAATGCTTTCCTCTCTTGTGTCCCCTTATACTTCCATGCTC  750

seq1  ACCCCAAACACACAATTATTGAAACCAGCTAGAAGCAAGTAGATTCACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAAACACACAATTATTGAAACCAGCTAGAAGCAAGTAGATTCACAG  800

seq1  GGGAATCCTTTGTCCCGACCCCTGGCTACAATCCTTGCCCTTTCTAATAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATCCTTTGTCCCGACCCCTGGCTACAATCCTTGCCCTTTCTAATAC  850

seq1  GTATAGAAATGATTTGAAAGAATTCTAACTAACCTCAGATACAAGCCTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGAAATGATTTGAAAGAATTCTAACTAACCTCAGATACAAGCCTGA  900

seq1  GATAATGACCAAGATTAAATGGACTGAACATCTCATTCCTATCAATTCCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATGACCAAGATTAAATGGACTGAACATCTCATTCCTATCAATTCCA  950

seq1  ATTCATAATCCTATTTTATTTAAGTCGTTAGCTTTGTCCTTTGGAATTCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATAATCCTATTTTATTTAAGTCG-TAGCTTTGTCCTTTGGAATTCC  999

seq1  AATTAGCCAAAAGATGCCAGTGCTGTTAATAATACTGCCTGCCAAGGGAA  1050
       ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  -ATTAGCC-AAAGATGCCAGTGCTGTTAAT-ATACTGCCTG-CAAGGGAA  1045

seq1  ATTACTGCCTCCGCTTCTACAGCTACCAGAATTCACTTTGTGGAAGCTAT  1100
      ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||  ||||||
seq2  ATTACTG-CTCCGCTTCTACAGCTA-CAGA--TCAC-TTGTG--AGCTAT  1088

seq1  GTCATAACATAATTTTTCTTGTCAAACCCACCCTCAACTTTTAGGC  1146
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  GTCATAACATAA-TTTTCTTGTCAAACCCACCTTCAAC-TTTAGGC  1132


seq1: chrX_127032514_127033675
seq2: B6Ng01-181I15.g_64_1226 (reverse)

seq1  TTGCTGAAAGGACCCTGATATAGAGCTGTCTTGTGTGAGGCTATGCCAGT  50
      ||||||||  |||||||||||||   |||||  |||||||||||| ||||
seq2  TTGCTGAA--GACCCTGATATAG-CATGTCT--TGTGAGGCTATG-CAGT  44

seq1  GCCTGGC--AAATACAGAAGT-GGAT-GCTCACTG-TCAGCTATTGGATG  95
      |||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  ||  
seq2  GCCTGGCCAAAATACAGGAGTGGGATGGCTCACTGTTCAGCTAT--GAAT  92

seq1  GATCACAGGACCCCC-AATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAA-GAGCTG  143
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||
seq2  GATCACAGGACCCCCAAATGGAGGAGCTAGAGAAGGTACCCAAGGAGCTG  142

seq1  AAGGGGTCTGCAACCCT-ATAGGGGGAACAACAATATGAACT-AACCAGT  191
      ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  AAGGGGTCTGCAACCCTAATAGGGGGAACAAC-ATATGAACTAAACCAGT  191

seq1  ACCCCCAGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCAGAGCTTGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAG  241

seq1  TCGG-CCATCATTGGGAAGAGAGACCCCCCTAGGTCTTGCAAACTTTATA  290
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGCCCATCATTGGGAAGAGAGACCCCCCTAGGTCTTGCAAACTTTATA  291

seq1  TGCCCCAGTACAGGGGAATGCTAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCAGTACAGGGGAATGCTAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTA  341

seq1  GGGGAGCAGGGTGGGGGGAGGGTATAGGGAACTTTTGGGATAGTATTTGA  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGCAGGGTGGGGGGAGGGTATAGGGAACTTTTGGGATAGTATTTGA  391

seq1  AATGTAAATAAAGAAAATATCTAATAATACAAAAAAGAAACCCAGGTTCT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAATAAAGAAAATATCTAATAATACAAAAAAGAAACCCAGGTTCT  441

seq1  AAGAAAATAGTCAAAGTCACCCTGACTATAGGATGTTCATTGTTGTCTAA  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAATAGTCAAAGTCACCCTGACTATAGGATGTTCATTGTTGTCTAA  491

seq1  ACAAAGGATCATGGTGAAACAAACAAACAAAAAAACAATATCCATATACT  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGATCATGGTGAAACAAACAAACAAAAAAACAATATCCATATACT  541

seq1  TTCTCAGAAAAGTAGTGCATGGCTGTGGAGAGTCTGAATGGGTAGGAAAT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGAAAAGTAGTGCATGGCTGTGGAGAGTCTGAATGGGTAGGAAAT  591

seq1  GAATACCACAGATGCTTTTTCGTTATGACATTTGTTTCTTACCAATTACT  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACCACAGATGCTTTTTCGTTATGACATTTGTTTCTTACCAATTACT  641

seq1  ATTTTCAGGGGAAATATTGATTCCCATTGTAAATGTAGGCAGATAAATCA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCAGGGGAAATATTGATTCCCATTGTAAATGTAGGCAGATAAATCA  691

seq1  TTAACATATTTAATAATTAAGGGTGGGATCCTAATAAGATATTGAGAAGT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATATTTAATAATTAAGGGTGGGATCCTAATAAGATATTGAGAAGT  741

seq1  AAGGTAGCCTTTGTTCTGAACTTGATCCAACTCTCTAGAACTATAACATT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGCCTTTGTTCTGAACTTGATCCAACTCTCTAGAACTATAACATT  791

seq1  TATTTTCTTCCCATTTCATTTTCTTGTTATTACCTGAATTCATCTTCTTG  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTTCCCATTTCATTTTCTTGTTATTACCTGAATTCATCTTCTTG  841

seq1  TTTTTATGAAACTTCTGGAAAGCCCTTTGCAGCTGATGTGCACAACCATT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATGAAACTTCTGGAAAGCCCTTTGCAGCTGATGTGCACAACCATT  891

seq1  AAGTGTAGGTGATTTGGCTTCTGCTTTGGGCGATGCTGTGGAGCACACCA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTAGGTGATTTGGCTTCTGCTTTGGGCGATGCTGTGGAGCACACCA  941

seq1  GCTTCCTGGAAGAAACACTGCAGAACGAGATCAATTTTGCTTCACGGTGC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTGGAAGAAACACTGCAGAACGAGATCAATTTTGCTTCACGGTGC  991

seq1  TTAATATCACCTCAAGGTCCTTCCCCTTCTGTTTCTTTTTCCTCTTCCTT  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATCACCTCAAGGTCCTTCCCCTTCTGTTTCTTTTTCCTCTTCCTT  1041

seq1  TTGCATCATACATTCGAATAACCACATGTGTGAACACTCACAGGAACACA  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATCATACATTCGAATAACCACATGTGTGAACACTCACAGGAACACA  1091

seq1  GCTCAGTGTGCTTCTATAAAGGTACAGAAGACAATATGGCATTATACATG  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGTGTGCTTCTATAAAGGTACAGAAGACAATATGGCATTATACATG  1141

seq1  CTTAATATGCCATTTGGAATTC  1162
      ||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATATGCCATTTGGAATTC  1163


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |