BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263N06
ChromosomeX (Build37)
Map Location 56,257,266 - 56,441,949
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFgf13
Upstream geneZic3, LOC631581, LOC631621, 4930550L24Rik
Downstream geneF9, EG434782, Mcf2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263N06.bB6Ng01-263N06.g
ACCGA067895GA067896
length1,0921,176
definitionB6Ng01-263N06.b B6Ng01-263N06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,440,853 - 56,441,949)(56,257,266 - 56,258,357)
sequence
gaattctcatctgtggcacccagaattttagagtgatggcttggagttct
tctccctgaagattgctgagaagaaattttcaggccactcgaattatcat
taatcacaccaattcttactgatcatagtagtgaaagactgaagtaccat
ttagagccttgattctcatagcgtggtccatggactgacagcataaaatg
aaggatctcagtccccatcccagactgcctgagagaaattttgaatttta
acaagttcgcagcaaatgggcttttgtatacacattaagctttgagacac
atcattgaatgctgacatgggcttatgtagtacttctatcttgggagaaa
gaaatagtaagattattattgttttgttcattttaagaagaagggaaaga
agccactgctgtaggcttattgaggcaatgcgaggctttgaggagattag
aatagaaacaacctccctcattcacttcaccttttttttgtgcacagttg
gaacattagcattaactggagttacagtattcacacacctgctggagaaa
aatagataccttaatttgctccagtgtaaggaaacatcagccatttcagc
tatgcctttgtagactttataaattatgtgcaatttcaaaaagatattta
aacaccctaaatatgggctgtattatctggctcgtaatagcagtgtgagt
agcaactgcaaagggaaacacgtttgcactgaaacggtgtcatcggggaa
cttggacttgctcctccgaagtttccctgtttctccaaggtttcttggtc
agcagataaatgattgtgctgaagttctcgttgcctgggttctatgaaat
ggtgtcttagttacttctcatgatgctgaaaccaaagaactgacaagaat
aaactttaggaagggtttatttaggctttcactttgaggtgatacagtcc
atcatgataggtaaggctattccacaggccaagagagtgtagccagaact
ccacacctcaagtcttcactacagagactatgcactttattgcttttcaa
gtatttctagaggtacaatagataatgagatacatgatagat
gaattctagagtaggagactagctgtacttctagagagttggtacctctc
tagggtccaaggcctcacaagtcgcaggtaattggctccacttacagtaa
tacatattagtcccctcctactgagtaggatttaagtacaattagatggg
caatggcacaatacgctcaagatgttaatggtactactgcatcattgggt
atattttgccatgctggtcattgttatggttcctaggctttatagctgtg
taggaatcttaattgcttttctcccttggcagctcacatagcttcttcag
atgctcagagctagtcctcagggaggattctgaacggttagatctagttt
gaatcttttgagtcttgtttctgaagtgtgatgttttcaggaataatgtc
ttacctccaacttcttggaggtaaccagagataatggcaatagtctatat
tttctcttggactcacctaatgaacaatttgaaggaaatattatcttctc
tgacactgatgctttacttggatagttatgactcatgggggagcattatc
atcccaactagcttaactttatttaaattgcttatatatgtatacatatg
aacataacttgtctctctatgactttttaaatcatccttagtacacacat
attttattcttgttagaaatactctaatacacatatgcatgtgcatctca
caggattcatttcattttaaaaagcaaaatttcctagatcaaagtatatg
tcagctacattattgcagaaggaaatttcatgtagaacaactattcactt
atgcataaatttgtaggttggaagtctggacagtgacttatctatgttcc
acaggatgctgcttagatctccttatgcattttccatttttttttttttt
ttggtgggttggctggggcccttgctggtctcagatgatcttttctgccc
actgaaggagccatggtgtggagctttcatggcatgaagagttagccctt
ctttgtcctctttacaagtctttttccatattgttgatttcattgcccaa
gatgtaggctctttcttgtcacaaattctacgaatcaagtatagtcaggc
tgcaaactctgagctaattggaaccatacagtgccatagcaagttcaatg
ctacggcatctatagtagctctatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_56440853_56441949
seq2: B6Ng01-263N06.b_46_1137 (reverse)

seq1  ATCTATCATGTATCTCATTTATCTATTTGTACCCTCTAG-AATACTTGAA  49
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||
seq2  ATCTATCATGTATCTCA-TTATCTA-TTGTA-CCTCTAGAAATACTTGAA  47

seq1  AAGCAATAAAGGTGCATAGTTCCTCTGTAGTTGAGACTTGAGGTGTGGAG  99
      |||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||
seq2  AAGCAATAAA-GTGCATAGT--CTCTGTAGTGAAGACTTGAGGTGTGGAG  94

seq1  TTCTGGCTACACTCTCTTGGCCTGTGGAATAGCCTTACCTATCATGATGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGCTACACTCTCTTGGCCTGTGGAATAGCCTTACCTATCATGATGG  144

seq1  ACTGTATCACCTCAAAGTGAAAGCCTAAATAAACCCTTCCTAAAGTTTAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTATCACCTCAAAGTGAAAGCCTAAATAAACCCTTCCTAAAGTTTAT  194

seq1  TCTTGTCAGTTCTTTGGTTTCAGCATCATGAGAAGTAACTAAGACACCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTCAGTTCTTTGGTTTCAGCATCATGAGAAGTAACTAAGACACCAT  244

seq1  TTCATAGAACCCAGGCAACGAGAACTTCAGCACAATCATTTATCTGCTGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAGAACCCAGGCAACGAGAACTTCAGCACAATCATTTATCTGCTGA  294

seq1  CCAAGAAACCTTGGAGAAACAGGGAAACTTCGGAGGAGCAAGTCCAAGTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAACCTTGGAGAAACAGGGAAACTTCGGAGGAGCAAGTCCAAGTT  344

seq1  CCCCGATGACACCGTTTCAGTGCAAACGTGTTTCCCTTTGCAGTTGCTAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGATGACACCGTTTCAGTGCAAACGTGTTTCCCTTTGCAGTTGCTAC  394

seq1  TCACACTGCTATTACGAGCCAGATAATACAGCCCATATTTAGGGTGTTTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACTGCTATTACGAGCCAGATAATACAGCCCATATTTAGGGTGTTTA  444

seq1  AATATCTTTTTGAAATTGCACATAATTTATAAAGTCTACAAAGGCATAGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTTTTTGAAATTGCACATAATTTATAAAGTCTACAAAGGCATAGC  494

seq1  TGAAATGGCTGATGTTTCCTTACACTGGAGCAAATTAAGGTATCTATTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGGCTGATGTTTCCTTACACTGGAGCAAATTAAGGTATCTATTTT  544

seq1  TCTCCAGCAGGTGTGTGAATACTGTAACTCCAGTTAATGCTAATGTTCCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGCAGGTGTGTGAATACTGTAACTCCAGTTAATGCTAATGTTCCA  594

seq1  ACTGTGCACAAAAAAAAGGTGAAGTGAATGAGGGAGGTTGTTTCTATTCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGCACAAAAAAAAGGTGAAGTGAATGAGGGAGGTTGTTTCTATTCT  644

seq1  AATCTCCTCAAAGCCTCGCATTGCCTCAATAAGCCTACAGCAGTGGCTTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCCTCAAAGCCTCGCATTGCCTCAATAAGCCTACAGCAGTGGCTTC  694

seq1  TTTCCCTTCTTCTTAAAATGAACAAAACAATAATAATCTTACTATTTCTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTTCTTCTTAAAATGAACAAAACAATAATAATCTTACTATTTCTT  744

seq1  TCTCCCAAGATAGAAGTACTACATAAGCCCATGTCAGCATTCAATGATGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCAAGATAGAAGTACTACATAAGCCCATGTCAGCATTCAATGATGT  794

seq1  GTCTCAAAGCTTAATGTGTATACAAAAGCCCATTTGCTGCGAACTTGTTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAAAGCTTAATGTGTATACAAAAGCCCATTTGCTGCGAACTTGTTA  844

seq1  AAATTCAAAATTTCTCTCAGGCAGTCTGGGATGGGGACTGAGATCCTTCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCAAAATTTCTCTCAGGCAGTCTGGGATGGGGACTGAGATCCTTCA  894

seq1  TTTTATGCTGTCAGTCCATGGACCACGCTATGAGAATCAAGGCTCTAAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGCTGTCAGTCCATGGACCACGCTATGAGAATCAAGGCTCTAAAT  944

seq1  GGTACTTCAGTCTTTCACTACTATGATCAGTAAGAATTGGTGTGATTAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTTCAGTCTTTCACTACTATGATCAGTAAGAATTGGTGTGATTAAT  994

seq1  GATAATTCGAGTGGCCTGAAAATTTCTTCTCAGCAATCTTCAGGGAGAAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATTCGAGTGGCCTGAAAATTTCTTCTCAGCAATCTTCAGGGAGAAG  1044

seq1  AACTCCAAGCCATCACTCTAAAATTCTGGGTGCCACAGATGAGAATTC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCAAGCCATCACTCTAAAATTCTGGGTGCCACAGATGAGAATTC  1092

seq1: chrX_56257266_56258357
seq2: B6Ng01-263N06.g_166_1242

seq1  ATACATATTAGTCCCCTCCTACTGAGTAGGATTTAAGTACAATTAGATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATTAGTCCCCTCCTACTGAGTAGGATTTAAGTACAATTAGATGG  50

seq1  GCAATGGCACAATACGCTCAAGATGTTAATGGTACTACTGCATCATTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGGCACAATACGCTCAAGATGTTAATGGTACTACTGCATCATTGGG  100

seq1  TATATTTTGCCATGCTGGTCATTGTTATGGTTCCTAGGCTTTATAGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTTGCCATGCTGGTCATTGTTATGGTTCCTAGGCTTTATAGCTGT  150

seq1  GTAGGAATCTTAATTGCTTTTCTCCCTTGGCAGCTCACATAGCTTCTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGAATCTTAATTGCTTTTCTCCCTTGGCAGCTCACATAGCTTCTTCA  200

seq1  GATGCTCAGAGCTAGTCCTCAGGGAGGATTCTGAACGGTTAGATCTAGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTCAGAGCTAGTCCTCAGGGAGGATTCTGAACGGTTAGATCTAGTT  250

seq1  TGAATCTTTTGAGTCTTGTTTCTGAAGTGTGATGTTTTCAGGAATAATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCTTTTGAGTCTTGTTTCTGAAGTGTGATGTTTTCAGGAATAATGT  300

seq1  CTTACCTCCAACTTCTTGGAGGTAACCAGAGATAATGGCAATAGTCTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCTCCAACTTCTTGGAGGTAACCAGAGATAATGGCAATAGTCTATA  350

seq1  TTTTCTCTTGGACTCACCTAATGAACAATTTGAAGGAAATATTATCTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTTGGACTCACCTAATGAACAATTTGAAGGAAATATTATCTTCT  400

seq1  CTGACACTGATGCTTTACTTGGATAGTTATGACTCATGGGGGAGCATTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACACTGATGCTTTACTTGGATAGTTATGACTCATGGGGGAGCATTAT  450

seq1  CATCCCAACTAGCTTAACTTTATTTAAATTGCTTATATATGTATACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCAACTAGCTTAACTTTATTTAAATTGCTTATATATGTATACATAT  500

seq1  GAACATAACTTGTCTCTCTATGACTTTTTAAATCATCCTTAGTACACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATAACTTGTCTCTCTATGACTTTTTAAATCATCCTTAGTACACACA  550

seq1  TATTTTATTCTTGTTAGAAATACTCTAATACACATATGCATGTGCATCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTATTCTTGTTAGAAATACTCTAATACACATATGCATGTGCATCTC  600

seq1  ACAGGATTCATTTCATTTTAAAAAGCAAAATTTCCTAGATCAAAGTATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGATTCATTTCATTTTAAAAAGCAAAATTTCCTAGATCAAAGTATAT  650

seq1  GTCAGGCTACATTATTGCAGAAGGAAATTTCATGTAGAACAACTATTCAC  700
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCA-GCTACATTATTGCAGAAGGAAATTTCATGTAGAACAACTATTCAC  699

seq1  TTATGCATAAATTTGTAGGTTGGAAGTCTGGACAGTGACTTATCTATGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCATAAATTTGTAGGTTGGAAGTCTGGACAGTGACTTATCTATGTT  749

seq1  CCACAGGATGCTGCTTAGATCTCCTTATGCATTTTCCA--TTTTTTTTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  CCACAGGATGCTGCTTAGATCTCCTTATGCATTTTCCATTTTTTTTTTTT  799

seq1  TTTTGGTGGGTTGGCTGGGG-CCTTGCTGGTCTCAGATGATC-TTTCTGC  846
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTTTGGTGGGTTGGCTGGGGCCCTTGCTGGTCTCAGATGATCTTTTCTGC  849

seq1  CCACTG-AGGAGCCATGGTGTGGAGGCTTTCATGGCATGAAGAGTTAG-C  894
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCACTGAAGGAGCCATGGTGTGGA-GCTTTCATGGCATGAAGAGTTAGCC  898

seq1  CTTCTTTGT-CTCTTTACATGGTCCTTTTTCCATAT--GTGATTTCATTG  941
      ||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||   |||||||||||
seq2  CTTCTTTGTCCTCTTTACAAG--TCTTTTTCCATATTGTTGATTTCATTG  946

seq1  CCAAAGATGTTAGGCTC-TTCTTGTTCACAAAATTCTACAGACCCAAGTA  990
      || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||  ||||| 
seq2  CCCAAGATG-TAGGCTCTTTCTTG-TCAC-AAATTCTAC-GAATCAAGT-  991

seq1  ATAGTCCAAGGCTGCAAAACCTCTGAAAGCATAAATGGGAAACCATACAG  1040
      ||||||  ||||||||||  |||||  ||| ||| |||  ||||||||||
seq2  ATAGTC--AGGCTGCAAA--CTCTG--AGC-TAATTGG--AACCATACAG  1032

seq1  TGCCAATTATGCCATGTTCTATTGGCTACGGAAAATCTATAGTAGCTC-A  1089
      ||||    ||  || |||| ||  |||||||   |||||||||||||| |
seq2  TGCC----ATAGCAAGTTCAAT--GCTACGG--CATCTATAGTAGCTCTA  1074

seq1  TAT  1092
      |||
seq2  TAT  1077