BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-281D10
ChromosomeX (Build37)
Map Location 128,956,739 - 129,104,992
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC245600, EG631264
Downstream geneLOC665846, LOC665850, LOC665854, LOC100040794
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-281D10.bB6Ng01-281D10.g
ACCGA080748GA080749
length1,1561,172
definitionB6Ng01-281D10.b B6Ng01-281D10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,956,739 - 128,957,910)(129,103,819 - 129,104,992)
sequence
gaattcacagtatcctgagagtataagtctgtttcttagtcactcttaca
tccatgtgagcccatgggagcaagttgggtctaaaggtatatgaagaaaa
gagatttaaggtgtgtaattttcaaatggtatctttgaaccaaaaaaaaa
aaaaaaaccctctggtcactcttttctttttctgccctacttggattatt
agcaacaagacaatacctattatcattctgtccctccataaatgtcttct
gcccttgcaacctccccaaaagaaatcaatctatatatctatatgtctat
atctatatatctatctatatctctatctatctacctatctatctatctag
atatatatatagtaaatttttaaaaaaagaataagaaagaatcatgctac
gtaggctatgacctttttctcaaatggttttacttgcaaattttcattgc
aatgctttgaggcatctgccttctgctacaccatcaattctggattatca
ctcacgattcctctcagatattcaatttttactctgggtcatggagatcc
tgtggctttggttctatacaattggtcccttcatgccctctagccattca
tagatgggttagctgttgtggtcagacaactcaaagttctggatctgggc
ctggatggtagctgagttgatcagcacaccaactcttttatgctcatagg
atcagggccatcttgtttgtgaccatgccactagggccaactctactgag
ctgcccacacaaggtgtggaataaatactcttctaagtaaataaaaggtt
aaataaaaaacaatgttgctagagtattttagttgagacttcaatgaaaa
tactaggaagagaaataatttgtaggaaaaatttcaaccaataagataca
gtagagtgatataagttattgtaatacaaaaattttaatctttatcattt
tgtttatatttaactgagaagtagagattatagaaaaactggaattttct
ttctcttgtccattctgtatcctccctgcctctttcatgatacttaatat
atctacatcatgtcagattctggtaaaaacaagatgatgaaattattata
gtatggcttttccatcattatagagctgatgactgtaagacctccagggt
tggaca
gaattcagtgcttcctaacatcaaagatggttttgttggacaatcttttt
tctttgagtgaatgtgaaattatgagtcaattgaggtgcaaatggttacg
cttttataatgctccaagaaaatattttacctgaagttctttagcctctg
ggaagaaataaataaaaactatagaatttaagaatttaaggctacaagtg
tccatactgatggtaaaagtattgagatctttgataatggaagatgataa
gacagtcctatatcttttttcttgaatttttatatattaattaattaatt
aatgttaaaccctaatcacagcttcacatcccacctctccacccagttcc
tgcccttcatctaccctcccctccatttcctctcctccttttcttctcag
gtatccgtcagccttgacaatagaggttaggaccagagaaaagtttccta
acaccaggtatgtgttgtatgtatgatccataggtgttttttcagtggta
gtgatatgcataatacctgtgaagtttgcatggcactaaattttggaata
taggcatatattatgggattatgtcccatgtctaggacagtgataaaaga
ggtccttgcagcatatgcatcccaacttgtatatcacctatattatatga
gaacatgagactttggagcaataagagtttatatccagaccatgggatta
tgtagattgaagttagatactgtgccttcactgcagatgcatcaatgaca
tgtgaccccagttttttttaaacacagtcactaaaaattcaacttctgaa
ccagtttccaaagtaaaagcatgtacagaatgcctgcccctaaaaagaat
agagtattaatagatgaaatacaatgatggttctggcatccatcatgtgg
tggtttgaatgagaaatatccatcacagtttcatgcaattgcctgctggg
tcttgacatgacattatagaatctaagtgtatatgccaaaataaactctt
tattctctaaattactttgatatagtgttttatccacaggataaaagtag
ccaatacacatggtgatgtatgaattgtctatgtaatgtcaatgacttac
atattagccaaatattaagtgcctgttatttaggtataaatctccctgct
agtaatataggagaggtatctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_128956739_128957910
seq2: B6Ng01-281D10.b_46_1201

seq1  GAATTCACAGTATCCTGAGAGTATAAGTCTGTTTCTTAGTCACTCTTACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGTATCCTGAGAGTATAAGTCTGTTTCTTAGTCACTCTTACA  50

seq1  TCCATGTGAGCCCATGGGAGCAAGTTGGGTCTAAAGGTATATGAAGAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGTGAGCCCATGGGAGCAAGTTGGGTCTAAAGGTATATGAAGAAAA  100

seq1  GAGATTTAAGGTGTGTAATTTTCAAATGGTATCTTTGAACCAAAAAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTTAAGGTGTGTAATTTTCAAATGGTATCTTTGAACCAAAAAAAAA  150

seq1  AAAAAAACCCTCTGGTCACTCTTTTCTTTTTCTGCCCTACTTGGATTATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAACCCTCTGGTCACTCTTTTCTTTTTCTGCCCTACTTGGATTATT  200

seq1  AGCAACAAGACAATACCTATTATCATTCTGTCCCTCCATAAATGTCTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACAAGACAATACCTATTATCATTCTGTCCCTCCATAAATGTCTTCT  250

seq1  GCCCTTGCAACCTCCCCAAAAGAAATCAATCTATATATCTATATGTCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTGCAACCTCCCCAAAAGAAATCAATCTATATATCTATATGTCTAT  300

seq1  ATCTATATATCTATCTATATCTCTATCTATCTACCTATCTATCTATCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATATATCTATCTATATCTCTATCTATCTACCTATCTATCTATCTAG  350

seq1  ATATATATATAGTAAATTTTTAAAAAAAGAATAAGAAAGAATCATGCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATAGTAAATTTTTAAAAAAAGAATAAGAAAGAATCATGCTAC  400

seq1  GTAGGCTATGACCTTTTTCTCAAATGGTTTTACTTGCAAATTTTCATTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCTATGACCTTTTTCTCAAATGGTTTTACTTGCAAATTTTCATTGC  450

seq1  AATGCTTTGAGGCATCTGCCTTCTGCTACACCATCAATTCTGGATTATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTTTGAGGCATCTGCCTTCTGCTACACCATCAATTCTGGATTATCA  500

seq1  CTCACGATTCCTCTCAGATATTCAATTTTTACTCTGGGTCATGGAGATCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACGATTCCTCTCAGATATTCAATTTTTACTCTGGGTCATGGAGATCC  550

seq1  TGTGGCTTTGGTTCTATACAATTGGTCCCTTCATGCCCTCTAGCCATTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTTTGGTTCTATACAATTGGTCCCTTCATGCCCTCTAGCCATTCA  600

seq1  TAGATGGGTTAGCTGTTGTGGTCAGACAACTCAAAGTTCTGGATCTGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGGGTTAGCTGTTGTGGTCAGACAACTCAAAGTTCTGGATCTGGGC  650

seq1  CTGGATGGTAGCTGAGTTGATCAGCACACCAACTCTTTTATGCTCATAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATGGTAGCTGAGTTGATCAGCACACCAACTCTTTTATGCTCATAGG  700

seq1  ATCAGGGCCATCTTGTTTGTGACCATGCCACTAGGGCCAACTCTACTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGGCCATCTTGTTTGTGACCATGCCACTAGGGCCAACTCTACTGAG  750

seq1  CTGCCCACACAAGGTGTGGAATAAATACTCTTCTAAGTAAATAAAAGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCACACAAGGTGTGGAATAAATACTCTTCTAAGTAAATAAAAGGTT  800

seq1  AAATAAAAAACAATGTTGCTAGAGTATTTTAGTTGAGACTTCAATGAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAAAACAATGTTGCTAGAGTATTTTAGTTGAGACTTCAATGAAAA  850

seq1  TACTAGGAAGAGAAATAATTTGTAGGAAAAATTTCAACCAATAAGATACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAGGAAGAGAAATAATTTGTAGGAAAAATTTCAACCAATAAGATACA  900

seq1  GTAGAGTGATATAAGTTATTGTAATACAAAAATTTTAATCTTTTATCATT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GTAGAGTGATATAAGTTATTGTAATACAAAAATTTTAATC-TTTATCATT  949

seq1  TTGTTTATATTTAACTGAGAAGTAGAGATTATAGAAAAACTGGAATTTTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTATATTTAACTGAGAAGTAGAGATTATAGAAAAACTGGAATTTTC  999

seq1  TTTTCTTCTTGTCAATTCTGTATTCCTCCCTGCCTTCTTTCATGATTACT  1050
      |||   ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  TTT--CTCTTGTCCATTCTGTA-TCCTCCCTGCC-TCTTTCATGA-TACT  1044

seq1  TAATATATCTACATCATTGTTCAGAATTCTGGTAAAAACAAGATGATGGA  1100
      |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||  
seq2  TAATATATCTACATCAT--GTCAG-ATTCTGGTAAAAACAAGATGATG--  1089

seq1  AATTTATTATAAGTAATTGGC-TTTCCATCATTATAGAGGCTGATGAGCT  1149
      || ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||
seq2  AAATTATTAT-AGTA--TGGCTTTTCCATCATTATAGA-GCTGATGA-CT  1134

seq1  GTAAGACTTTCAGGTGTTGGACA  1172
      ||||||| | |||| ||||||||
seq2  GTAAGACCTCCAGG-GTTGGACA  1156

seq1: chrX_129103819_129104992
seq2: B6Ng01-281D10.g_67_1238 (reverse)

seq1  GAGATA---CTTCTATA-TACTAGCA-GGAGATTATATA-CTAAATATAC  44
      ||||||   || ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||
seq2  GAGATACCTCTCCTATATTACTAGCAGGGAGATT-TATACCTAAATA-AC  48

seq1  AGCCACTTAATATGTGGCTTAATATGTAGTTCTATGAACATTACATAGAC  94
      || |||||||||| |||| |||||||||  || ||  |||||||||||||
seq2  AGGCACTTAATATTTGGC-TAATATGTAAGTC-ATTGACATTACATAGAC  96

seq1  CATTCCATACCTTCACCATGTGTATTGGCTACTTTTTATTCCTGT-GATA  143
       ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||
seq2  AATT-CATA-CATCACCATGTGTATTGGCTACTTTT--ATCCTGTGGATA  142

seq1  AAACACTATAATCAAAGTAATTTAGAGAATAAAGAGTTTATTTTGGCATA  193
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTAT-ATCAAAGTAATTTAGAGAATAAAGAGTTTATTTTGGCATA  191

seq1  TACACTTTAGATTCTATAATGTCATGTCAAGACCCAGCAGGCAATTGCAT  243
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAC-TTAGATTCTATAATGTCATGTCAAGACCCAGCAGGCAATTGCAT  240

seq1  GAAACTGTGATGGATATTTCTCATTCAAACCACCACATGATGGATGCCAG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGTGATGGATATTTCTCATTCAAACCACCACATGATGGATGCCAG  290

seq1  AACCATCATTGTATTTCATCTATTAATACTCTATTCTTTTTAGGGGCAGG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCATTGTATTTCATCTATTAATACTCTATTCTTTTTAGGGGCAGG  340

seq1  CATTCTGTACATGCTTTTACTTTGGAAACTGGTTCAGAAGTTGAATTTTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTGTACATGCTTTTACTTTGGAAACTGGTTCAGAAGTTGAATTTTT  390

seq1  AGTGACTGTGTTT-AAAAAAACTGGGGTCACATGTCATTGATGCATCTGC  442
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACTGTGTTTAAAAAAAACTGGGGTCACATGTCATTGATGCATCTGC  440

seq1  AGTGAAGGCACAGTATCTAACTTCAATCTACATAATCCCATGGTCTGGAT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAGGCACAGTATCTAACTTCAATCTACATAATCCCATGGTCTGGAT  490

seq1  ATAAACTCTTATTGCTCCAAAGTCTCATGTTCTCATATAATATAGGTGAT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTCTTATTGCTCCAAAGTCTCATGTTCTCATATAATATAGGTGAT  540

seq1  ATACAAGTTGGGATGCATATGCTGCAAGGACCTCTTTTATCACTGTCCTA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAGTTGGGATGCATATGCTGCAAGGACCTCTTTTATCACTGTCCTA  590

seq1  GACATGGGACATAATCCCATAATATATGCCTATATTCCAAAATTTAGTGC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGGGACATAATCCCATAATATATGCCTATATTCCAAAATTTAGTGC  640

seq1  CATGCAAACTTCACAGGTATTATGCATATCACTACCACTGAAAAAACACC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAAACTTCACAGGTATTATGCATATCACTACCACTGAAAAAACACC  690

seq1  TATGGATCATACATACAACACATACCTGGTGTTAGGAAACTTTTCTCTGG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATCATACATACAACACATACCTGGTGTTAGGAAACTTTTCTCTGG  740

seq1  TCCTAACCTCTATTGTCAAGGCTGACGGATACCTGAGAAGAAAAGGAGGA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAACCTCTATTGTCAAGGCTGACGGATACCTGAGAAGAAAAGGAGGA  790

seq1  GAGGAAATGGAGGGGAGGGTAGATGAAGGGCAGGAACTGGGTGGAGAGGT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAATGGAGGGGAGGGTAGATGAAGGGCAGGAACTGGGTGGAGAGGT  840

seq1  GGGATGTGAAGCTGTGATTAGGGTTTAACATTAATTAATTAATTAATATA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGTGAAGCTGTGATTAGGGTTTAACATTAATTAATTAATTAATATA  890

seq1  TAAAAATTCAAGAAAAAAGATATAGGACTGTCTTATCATCTTCCATTATC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATTCAAGAAAAAAGATATAGGACTGTCTTATCATCTTCCATTATC  940

seq1  AAAGATCTCAATACTTTTACCATCAGTATGGACACTTGTAGCCTTAAATT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATCTCAATACTTTTACCATCAGTATGGACACTTGTAGCCTTAAATT  990

seq1  CTTAAATTCTATAGTTTTTATTTATTTCTTCCCAGAGGCTAAAGAACTTC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATTCTATAGTTTTTATTTATTTCTTCCCAGAGGCTAAAGAACTTC  1040

seq1  AGGTAAAATATTTTCTTGGAGCATTATAAAAGCGTAACCATTTGCACCTC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAAATATTTTCTTGGAGCATTATAAAAGCGTAACCATTTGCACCTC  1090

seq1  AATTGACTCATAATTTCACATTCACTCAAAGAAAAAAGATTGTCCAACAA  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGACTCATAATTTCACATTCACTCAAAGAAAAAAGATTGTCCAACAA  1140

seq1  AACCATCTTTGATGTTAGGAAGCACTGAATTC  1174
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCTTTGATGTTAGGAAGCACTGAATTC  1172