BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-307M11
ChromosomeX (Build37)19 (Build37)
Map Location 95,391,409 - 95,391,70435,274,895 - 35,275,687
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap geneAr
Upstream geneEda2r, LOC668244
Downstream geneLOC100042324, Ophn1, Yipf6, LOC100042932, Stard8, LOC436219, Efnb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307M11.bB6Ng01-307M11.g
ACCGA100459GA100460
length581797
definitionB6Ng01-307M11.b B6Ng01-307M11.g
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,391,409 - 95,391,704)(35,274,895 - 35,275,687)
sequence
tctcttcttaacttagagagaggttcacatatcttttagttgcatgatct
aatattttttagaaattcaaccaaagttaatgtaccatgaatgtaataaa
atatgagaaaaggtctaagaagggaggcaattttataaaactactgtttg
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tctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctatc
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tctatctttctatctatcatctatatttctatattgatagatgatagata
gaggaatagaaaggttattgcttgatagataaattattgatagatagata
gacaaacagacagacagatagatagattgatagatgatagaaaaatggta
gatagatagatagatagagataggtagatagatagatagatagatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_95391409_95391704
seq2: B6Ng01-307M11.b_383_630 (reverse)

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      ||||||||||||          ||||| | | ||||||||||| ||||||
seq2  TATATATATATA----------TGTGTCTATATATATATATATATATATA  40

seq1  TATATAAATTTGCTTTATATATTTGTCTTGTTTTATATATAAATTTGCTA  100
      |||||| || |  | ||||||| | | |   | |||||||| || || ||
seq2  TATATATATAT-ATATATATATCTCTATATATATATATATATATATG-TA  88

seq1  TATACATACACACACACACACACACACATATATATATGGGGGGGTTTTGT  150
      |||| ||| | | | | | | | | | |||||||||              
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATATATA--------------  124

seq1  GTGTGTGTATATATATATATATATATATATATGTGTGTATATATATATAA  200
             |||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||| 
seq2  -------TATATATATATATATATACATATATACATATATATATATATAT  167

seq1  ATTTGCTTTATATATTTGTCTTGTTTTATATATAAATTTGCTATACACAC  250
      |     | ||||||| |  ||   | || ||||| | |  || || ||  
seq2  A-----TATATATATATACCT--ATATAGATATATACTAACTGTATAC--  208

seq1  ACACACACACACACACACACACACATATATATCAAGAC---ATATATGT  296
                |   ||||||||||||||||||  | ||   ||||||||
seq2  ---------TATGTACACACACACATATATATACATACTGTATATATGT  248


seq1: chr19_35274895_35275687
seq2: B6Ng01-307M11.g_68_864

seq1  GAATTCATTTCAATAATGAATGTTTTTACATACTGAATTAGATACTGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCAATAATGAATGTTTTTACATACTGAATTAGATACTGGCT  50

seq1  TTGTGGCAAGGGTGTTAAAGCTTGATCTTTAGCACATGTTTAGGTTGAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCAAGGGTGTTAAAGCTTGATCTTTAGCACATGTTTAGGTTGAAC  100

seq1  TTTGAACTTAGGTGCTATATCTAGAGCAGAAGCTTCTGGAGGCTCACCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAACTTAGGTGCTATATCTAGAGCAGAAGCTTCTGGAGGCTCACCTC  150

seq1  TTACCCACTGCTACCACACTTTTTTCCCCCACATTTTAAAAGTGTAATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCCACTGCTACCACACTTTTTTCCCCCACATTTTAAAAGTGTAATAT  200

seq1  TTTATTAATTGTTTAAACATTTTATACATGTACACAACACATTTTGATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTAATTGTTTAAACATTTTATACATGTACACAACACATTTTGATCA  250

seq1  TATTCATCCTGTTACTTTTCTCTCTAACTTCTCCTAGCTCTATCCTCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCATCCTGTTACTTTTCTCTCTAACTTCTCCTAGCTCTATCCTCTCT  300

seq1  GCACTCTCAAAACTTTATGTTCCATCTATTTTCTATCTATCTATCTATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCTCAAAACTTTATGTTCCATCTATTTTCTATCTATCTATCTATCT  350

seq1  ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCATCCATCCATCCATCCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCATCCATCCATCCATCCAC  400

seq1  CCACCCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCATCTA----TCTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||
seq2  CCACCCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCATCTATCTGTCTG  450

seq1  TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATC  500

seq1  TATCTTTCTATCATTTTCCATCTATCTACCTATCATCTATCATCTTTCTA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTCTATCATTTTCCATCTATCTACCTATCATCTATCATCTTTCTA  550

seq1  CCATTTTCTATTATCTACCTATCATCTATCTATCATCTATTTTTCTATCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTCTATTATCTACCTATCATCTATCTATCATCTATTTTTCTATCA  600

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GATAGATAGATAGATAGAGATAGGTAGATAGATAGATAGATAGATAG  793
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATAGAGATAGGTAGATAGATAGATAGATAGATAG  797


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