BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-323E02
ChromosomeX (Build37)
Map Location 151,706,369 - 151,735,085
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAcot9
Upstream gene4930524N10Rik, EG434879, LOC667313, 4930542N07Rik, EG434881, LOC100040899, LOC667331, LOC100040925, LOC100040937, Magea6, Magea3, LOC626034, Magea8, Magea2, Magea5, Magea1, 1700042B14Rik, LOC245676, Amd-ps1, LOC667369, Sat1
Downstream geneLOC667383, Prdx4, LOC667394, Ptchd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-323E02.bB6Ng01-323E02.g
ACCGA111885GA111886
length1,1571,134
definitionB6Ng01-323E02.b B6Ng01-323E02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,733,930 - 151,735,085)(151,706,369 - 151,707,508)
sequence
gaattcactatttagaaatagactggcctcaaacttagtgatccacctgc
ctctgcctcctgagtgctgggattaaagacatgcatcatgctgaggttga
ctttaaactgcctctatcaccaggttggggcttttatgggtgtgcatcac
tacacccagtttatatggtggtgggtggaaatgaacccagggctcaggca
tgctagacaatagctctaacaagtgagctacatcctcagcccttctaatt
atttcttaagagaaacagaacaatctagaaaccttatcttttaatgtacg
ttttaatatcacctacttaaaatcctggattaaatatagaaccaacttta
ttttttgtgcttgaggttgaactggtaaatgctaacaaattttggtttaa
gcttctaatagccaaaattacttgaaaagcttaatgaaaaagaaaataag
ctatttgtttgatctcagcaggattcaaagaaaaacaataacaaaactta
agtgtcaaagagacttttaaaagacaaaagtctggcttaagtctggagaa
actgaggacatgtaactgagtgtgctagacgattctggaattttctatct
ttgctgtttgcatattgttctgcctagtgtttcatcatacttctcctgag
aaagaattttagaggccaaatgttttaggtgtttaggatatttctttttt
taattagatattttcttcatttacatttccaatgctatccaaaaagttcc
ccataccctccctccaactcccctacccacccactcccacttcttggccc
tggcgttcccctgtactgaggcatataaagttgcaagaccgatgggcctc
cctttccagtgatggccaactaggccatctttttgatacatatgcagcta
gagacagagctctgggggtactgggtagttcatatgtgttccacctatag
ggttgcagacccctttagctccttgggtactttctctagcctctccattg
gggggtccctgtgatccatccaatagctgactggtgagcatcccacttct
ggtgtttgctaggcccaagcataagcctcacaagagaactgctaattctg
gatccctttcagcaatttggctaggtatgccaatggtcagcattgcaagc
ctgatta
gaattcctgaatcttttgatacattttgagtgcatgagaaactttcctta
gttcctgaccatcttgccttaacccagctttgctatttcttggtttcatg
gaataaagtctttatctttgtttcagttcgagacaagctgcgggagatag
taggcgtatccacagtctggaggtatggactttcgtctttcatccccaag
ggatcacgctaagtgatagttaggcttagatgctgatccccttctatggt
cggagagccctgtctggagatagagctttctggtgagaaggaaaagagcc
gcgtcttagtgtagtgatcagctgatgcctcattaccatggaagaatgtg
atttatgtatattgtgcattttcaaaacctgtttgggtatattcactgat
ttttcagaagaaaatatatgatatgcttatgacatattttttcctatttc
agttttttgtttacacacattaaaactgaagttcagaattgggacttgaa
ttcaagccttctgattttactatttcatatagctttactattgaaagttt
tatgacctgggaaagtcctgtgttttgggcaatggatagagcatatcttt
acccaagcctagagatcctttgctgagaaggcagagaagggcagactagg
gtagtgcagtttgtgggactcaggctcaatctggaaggctgagaaaaggc
ttggatggataggttaagggtacccattaggctaatccccagagtgggct
tggagatagagtgtttcctggaggaaaacaacaagcagtgctcttaacca
ctgagtgatatctcaattcctgaagaaactttttggtcagttgactgtgt
gtcccaattaaatgtatcgatatcagtaagtatgcatttcttatgcatac
tcctagtccccagctatttaagttgggtagagcatgagactcttatctac
aagcttaaaattatcattagcaatgctcagtttttccaagagggttcatg
agaaggagtgaagggattgaagatgagagcacagagctccctttctccac
ttatttatgtctgactatcatgtttggagggggtgggactagatgtggtc
aggcactgttctggtatgccagccttacttttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_151733930_151735085
seq2: B6Ng01-323E02.b_46_1202 (reverse)

seq1  TAATCAGCCTCCAAATGCTGACACCATT-GCATACACTAGCAAAATTTTG  49
      ||||||| ||   |||||||  |||||| |||||| ||||| |||  |||
seq2  TAATCAGGCTTGCAATGCTG--ACCATTGGCATAC-CTAGCCAAA--TTG  45

seq1  CTGAAA-GGACCCAGATATAGCTG-TCTCTTGTGAGGC-TATGCTGGGGC  96
      |||||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||| |||||| ||||
seq2  CTGAAAGGGATCCAGAATTAGCAGTTCTCTTGTGAGGCTTATGCTTGGGC  95

seq1  CTAGCAAACA-CAGAAGT-GGATGCTCA-CAGTCAGCTATTGGATGGATC  143
      |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCAAACACCAGAAGTGGGATGCTCACCAGTCAGCTATTGGATGGATC  145

seq1  ACAGG--ACCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAG  191
      |||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGACCCCCCAATGGAGAGGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAG  195

seq1  GGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTACCCAGTACCCC  241
      ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACA--CATATGAACTACCCAGTACCCC  243

seq1  CAGAGCTCTTGTCTCTAGCTGCATATGTATC-AAAAGATGGCCTAGTTGG  290
      |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTC-TGTCTCTAGCTGCATATGTATCAAAAAGATGGCCTAGTTGG  292

seq1  CCATCACTGGAAAGGGAGGCCCATCGGTCTTGCAAACTTTATATGCCTCA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCATCACTGGAAAGGGAGGCCCATCGGTCTTGC-AACTTTATATGCCTCA  341

seq1  GTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGT  391

seq1  TGGAGGGAGGGTATGGGGAACTTTTTGGATAGCATTGGAAATGTAAATGA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGGAGGGTATGGGGAACTTTTTGGATAGCATTGGAAATGTAAATGA  441

seq1  AGAAAATATCTAATTAAAAAAAGAAATATCCTAAACACCTAAAACATTTG  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATATCTAATTAAAAAAAGAAATATCCTAAACACCTAAAACATTTG  491

seq1  GCCTCTAAAATTCTTTCTCAGGAGAAGTATGATGAAACACTAGGCAGAAC  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTAAAATTCTTTCTCAGGAGAAGTATGATGAAACACTAGGCAGAAC  541

seq1  AATATGCAAACAGCAAAGATAGAAAATTCCAGAATCGTCTAGCACACTCA  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCAAACAGCAAAGATAGAAAATTCCAGAATCGTCTAGCACACTCA  591

seq1  GTTACATGTCCTCAGTTTCTCCAGACTTAAGCCAGACTTTTGTCTTTTAA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATGTCCTCAGTTTCTCCAGACTTAAGCCAGACTTTTGTCTTTTAA  641

seq1  AAGTCTCTTTGACACTTAAGTTTTGTTATTGTTTTTCTTTGAATCCTGCT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTCTTTGACACTTAAGTTTTGTTATTGTTTTTCTTTGAATCCTGCT  691

seq1  GAGATCAAACAAATAGCTTATTTTCTTTTTCATTAAGCTTTTCAAGTAAT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCAAACAAATAGCTTATTTTCTTTTTCATTAAGCTTTTCAAGTAAT  741

seq1  TTTGGCTATTAGAAGCTTAAACCAAAATTTGTTAGCATTTACCAGTTCAA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCTATTAGAAGCTTAAACCAAAATTTGTTAGCATTTACCAGTTCAA  791

seq1  CCTCAAGCACAAAAAATAAAGTTGGTTCTATATTTAATCCAGGATTTTAA  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAGCACAAAAAATAAAGTTGGTTCTATATTTAATCCAGGATTTTAA  841

seq1  GTAGGTGATATTAAAACGTACATTAAAAGATAAGGTTTCTAGATTGTTCT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTGATATTAAAACGTACATTAAAAGATAAGGTTTCTAGATTGTTCT  891

seq1  GTTTCTCTTAAGAAATAATTAGAAGGGCTGAGGATGTAGCTCACTTGTTA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCTTAAGAAATAATTAGAAGGGCTGAGGATGTAGCTCACTTGTTA  941

seq1  GAGCTATTGTCTAGCATGCCTGAGCCCTGGGTTCATTTCCACCCACCACC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTATTGTCTAGCATGCCTGAGCCCTGGGTTCATTTCCACCCACCACC  991

seq1  ATATAAACTGGGTGTAGTGATGCACACCCATAAAAGCCCCAACCTGGTGA  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAACTGGGTGTAGTGATGCACACCCATAAAAGCCCCAACCTGGTGA  1041

seq1  TAGAGGCAGTTTAAAGTCAACCTCAGCATGATGCATGTCTTTAATCCCAG  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGCAGTTTAAAGTCAACCTCAGCATGATGCATGTCTTTAATCCCAG  1091

seq1  CACTCAGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCACTAAGTTTGAGGCCAGTCTATT  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCACTAAGTTTGAGGCCAGTCTATT  1141

seq1  TCTAAATAGTGAATTC  1156
      ||||||||||||||||
seq2  TCTAAATAGTGAATTC  1157

seq1: chrX_151706369_151707508
seq2: B6Ng01-323E02.g_67_1200

seq1  GAATTCCTGAATCTTTTGATACATTTTGAGTGCATGAGAAACTTTCCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAATCTTTTGATACATTTTGAGTGCATGAGAAACTTTCCTTA  50

seq1  GTTCCTGACCATCTTGCCTTAACCCAGCTTTGCTATTTCTTGGTTTCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTGACCATCTTGCCTTAACCCAGCTTTGCTATTTCTTGGTTTCATG  100

seq1  GAATAAAGTCTTTATCTTTGTTTCAGTTCGAGACAAGCTGCGGGAGATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAGTCTTTATCTTTGTTTCAGTTCGAGACAAGCTGCGGGAGATAG  150

seq1  TAGGCGTATCCACAGTCTGGAGGTATGGACTTTCGTCTTTCATCCCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCGTATCCACAGTCTGGAGGTATGGACTTTCGTCTTTCATCCCCAAG  200

seq1  GGATCACGCTAAGTGATAGTTAGGCTTAGATGCTGATCCCCTTCTATGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCACGCTAAGTGATAGTTAGGCTTAGATGCTGATCCCCTTCTATGGT  250

seq1  CGGAGAGCCCTGTCTGGAGATAGAGCTTTCTGGTGAGAAGGAAAAGAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGAGCCCTGTCTGGAGATAGAGCTTTCTGGTGAGAAGGAAAAGAGCC  300

seq1  GCGTCTTAGTGTAGTGATCAGCTGATGCCTCATTACCATGGAAGAATGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTCTTAGTGTAGTGATCAGCTGATGCCTCATTACCATGGAAGAATGTG  350

seq1  ATTTATGTATATTGTGCATTTTCAAAACCTGTTTGGGTATATTCACTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGTATATTGTGCATTTTCAAAACCTGTTTGGGTATATTCACTGAT  400

seq1  TTTTCAGAAGAAAATATATGATATGCTTATGACATATTTTTTCCTATTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCAGAAGAAAATATATGATATGCTTATGACATATTTTTTCCTATTTC  450

seq1  AGTTTTTTGTTTACACACATTAAAACTGAAGTTCAGAATTGGGACTTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTTTGTTTACACACATTAAAACTGAAGTTCAGAATTGGGACTTGAA  500

seq1  TTCAAGCCTTCTGATTTTACTATTTCATATAGCTTTACTATTGAAAGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGCCTTCTGATTTTACTATTTCATATAGCTTTACTATTGAAAGTTT  550

seq1  TATGACCTGGGAAAGTCCTGTGTTTTGGGCAATGGATAGAGCATATCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACCTGGGAAAGTCCTGTGTTTTGGGCAATGGATAGAGCATATCTTT  600

seq1  ACCCAAGCCTAGAGATCCTTTGCTGAGAAGGCAGAGAAGGGCAGACTAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGCCTAGAGATCCTTTGCTGAGAAGGCAGAGAAGGGCAGACTAGG  650

seq1  GTAGTGCAGTTTGTGGGACTCAGGCTCAATCTGGAAGGCTGAGAAAAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTGCAGTTTGTGGGACTCAGGCTCAATCTGGAAGGCTGAGAAAAGGC  700

seq1  TTGGATGGATAGGTTAAGGGTACCCATTAGGCTAATCCCCAGAGTGGGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATGGATAGGTTAAGGGTACCCATTAGGCTAATCCCCAGAGTGGGCT  750

seq1  TGGAGATAGAGTGTTTCCTGGAGGAAAACAACAAGCAGTGCTCTTAACCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATAGAGTGTTTCCTGGAGGAAAACAACAAGCAGTGCTCTTAACCA  800

seq1  CTGAGTGATATCTCAATTCCTGAAGAAACTTTTTGGTCAGTTGACTGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGATATCTCAATTCCTGAAGAAACTTTTTGGTCAGTTGACTGTGT  850

seq1  GTCCCAATTAAATGTATCGATATCAGTAAGTATGCATTTCTTATGCATAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAATTAAATGTATCGATATCAGTAAGTATGCATTTCTTATGCATAC  900

seq1  TCCTAGTCCCCAGCTATTTAAGTT-GGTAGAGCATGAGACTCTTATCTAC  949
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGTCCCCAGCTATTTAAGTTGGGTAGAGCATGAGACTCTTATCTAC  950

seq1  AAGCTTAAAATTATCATTAGCAATGCTCAGTTTTTCCAAGAGGG-TCATG  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AAGCTTAAAATTATCATTAGCAATGCTCAGTTTTTCCAAGAGGGTTCATG  1000

seq1  AGAAAGGAGTGAAGGGATTGAAGATGAGGAAGGCACAGAGCTCCCTTTCT  1048
      || |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| 
seq2  AG-AAGGAGTGAAGGGATTGAAGATGAG---AGCACAGAGCTCCCTTTC-  1045

seq1  TCCACTTA-TTATGTCTGACTATCATGTTT-GAGGGGTGGGGACTAGAAT  1096
      |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  
seq2  TCCACTTATTTATGTCTGACTATCATGTTTGGAGGGGGTGGGACTAGA--  1093

seq1  TGTGGGTCA-GCACTGTTCTTGTTTTATG-CAGCCTTACCTTTTCT  1140
      ||| ||||| |||||||||| |   |||| |||||||| |||||||
seq2  TGT-GGTCAGGCACTGTTCTGG---TATGCCAGCCTTA-CTTTTCT  1134