BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-345D19
ChromosomeX (Build37)
Map Location 110,578,389 - 110,734,006
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDach2
Upstream geneEG623341, 2010106E10Rik, Zfp711, Pof1b, LOC623412, EG623428, LOC100039112, Chm, EG664918
Downstream geneLOC237016, EG664945, EG634881, LOC100039201, Klhl4, Gm1866
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-345D19.bB6Ng01-345D19.g
ACCGA127497GA127498
length1,1291,080
definitionB6Ng01-345D19.b B6Ng01-345D19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(110,578,389 - 110,579,528)(110,732,934 - 110,734,006)
sequence
gaattcttttacccgttttttgttctgttcaaaagaaagtgtagaattta
ataattggaaaatatatgtagcggatgggaaagagaagagggtttaatat
tagattatgtgtactatgactgaatacttgtaacgattactatttttctc
ccagaaaccactactttctctcaaaacatggagtgtccatttagaattat
caatttgagattttattgtattagctatttcagcttttgttcaaatatac
agggtgttatttaattgaataagaagactctcatgtattttgaggagaat
gaagctaatttgttatgtagaatctaatcataatttttaaaaaatgagca
attacagtgagctttaaaacagatctttcaactttattctgtaagttaca
tttaagacacttttcttgtataaacatactgagtttaccaatctttaacc
aataaattccagcacggcaaaataattagtgaaattaagttgaaaatgta
aacaaataaagttattactcattctgtaccaaactacaaatgtgggagaa
tattttaagtgataaattaagcatgaactgcttgaatctgtaagctgaac
atgttagcaaatggcttgtgtttgtaattagtatttatggccacaggaga
gtgcctctattaaaaagagtgacaggaaattgatcagtttaggttgccat
agaaaccaaaaaagttccattgcttgtgttgagcttaatctatcaggtta
tatatctacgcttagaatatttttattaactgaaaaaataaactattcaa
taatgcaaaagaggttaggctactgaaatgattaacaaagtccagatgaa
cactcgactacttaataacaagcttaagtgttctatggttgtcatgacat
ttcttctacaagaaaatgatgtcttccaaaaaaaaatcttaaaactcgat
gaaaatgcaaatctctttatgacagtatgtggtgtcacatatatgagaga
cataattgatgatttatgagatataccatggcacaagtctttcatcatgg
cacccctcgtcactctttttaattagatgctgtgagtgccctctgaaaag
gttcacccatgaaatacaagaaggatcta
gaattctgatttctttgaaatagttttatagtttcaaatttcaacacatg
aatgcaccagtgtaacttgaaagttatagggggagtttccctgattcttt
tcctaattattttccctaattgttgattagttaataatgacagtagaagg
taatcactggttgaagatatggaggcagggttttctgggcaggacaggag
agaggattagggtcagattaggcaggtggtggtgaagtggcagacatgta
ggtttctcagggcactggtagttttgtggcctccacagcttgcagaggcc
aaggaagatggggtaggatagtctttatccagcctttgagttatctggtc
agttctaaagtataaaagtatctggtattttccattcgcggcattaaagt
ggtctggtagggagctgagccagactaggacagacactggcagagctggc
cacacggtggttagctggcaagagagcaatcttgtagctctggagaggca
aagccagcatttgtgggagaggggtgtggctaggaggagcgggctggtga
ctgctggtcccagagtctagctggaccaagcctgggttttataaaatgac
atgctacacacagtaatcttgcttttaaagaaagtggatgaatatgatca
aatatattatatttatgtatgagattatcttctaatgtagagtagtacaa
aaatattttttgcttattaaattgtgagttaaatatgcaaattaattcac
taggttactcaaaattgtatagaatattttcagtgactcattaaaatata
tttatctcaaaaattatatatgagggcatctttaacatacagtctcccca
atagaagaaaagtaacaaaaagtcatcatatatcacagatctttaaatgt
gggacaaagaaatattagctacctgtctcttttataacagtaagtcgagg
agcatccagaatttaatgtaatgattgcactataagctacagtattgaca
cattaagtcagtttccaggatacactaccctcaattttaaaatgctgttt
tggattagtttcaatatatgttataatgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_110578389_110579528
seq2: B6Ng01-345D19.b_46_1174

seq1  GAATTCTTTTACCCGTTTTTTGTTCTGTTCAAAAGAAAGTGTAGAATTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTACCCGTTTTTTGTTCTGTTCAAAAGAAAGTGTAGAATTTA  50

seq1  ATAATTGGAAAATATATGTAGCGGATGGGAAAGAGAAGAGGGTTTAATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTGGAAAATATATGTAGCGGATGGGAAAGAGAAGAGGGTTTAATAT  100

seq1  TAGATTATGTGTACTATGACTGAATACTTGTAACGATTACTATTTTTCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATTATGTGTACTATGACTGAATACTTGTAACGATTACTATTTTTCTC  150

seq1  CCAGAAACCACTACTTTCTCTCAAAACATGGAGTGTCCATTTAGAATTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAACCACTACTTTCTCTCAAAACATGGAGTGTCCATTTAGAATTAT  200

seq1  CAATTTGAGATTTTATTGTATTAGCTATTTCAGCTTTTGTTCAAATATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTGAGATTTTATTGTATTAGCTATTTCAGCTTTTGTTCAAATATAC  250

seq1  AGGGTGTTATTTAATTGAATAAGAAGACTCTCATGTATTTTGAGGAGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTTATTTAATTGAATAAGAAGACTCTCATGTATTTTGAGGAGAAT  300

seq1  GAAGCTAATTTGTTATGTAGAATCTAATCATAATTTTTAAAAAATGAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTAATTTGTTATGTAGAATCTAATCATAATTTTTAAAAAATGAGCA  350

seq1  ATTACAGTGAGCTTTAAAACAGATCTTTCAACTTTATTCTGTAAGTTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGTGAGCTTTAAAACAGATCTTTCAACTTTATTCTGTAAGTTACA  400

seq1  TTTAAGACACTTTTCTTGTATAAACATACTGAGTTTACCAATCTTTAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGACACTTTTCTTGTATAAACATACTGAGTTTACCAATCTTTAACC  450

seq1  AATAAATTCCAGCACGGCAAAATAATTAGTGAAATTAAGTTGAAAATGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATTCCAGCACGGCAAAATAATTAGTGAAATTAAGTTGAAAATGTA  500

seq1  AACAAATAAAGTTATTACTCATTCTGTACCAAACTACAAATGTGGGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATAAAGTTATTACTCATTCTGTACCAAACTACAAATGTGGGAGAA  550

seq1  TATTTTAAGTGATAAATTAAGCATGAACTGCTTGAATCTGTAAGCTGAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAAGTGATAAATTAAGCATGAACTGCTTGAATCTGTAAGCTGAAC  600

seq1  ATGTTAGCAAATGGCTTGTGTTTGTAATTAGTATTTATGGCCACAGGAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGCAAATGGCTTGTGTTTGTAATTAGTATTTATGGCCACAGGAGA  650

seq1  GTGCCTCTATTAAAAAGAGTGACAGGAAATTGATCAGTTTAGGTTGCCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTCTATTAAAAAGAGTGACAGGAAATTGATCAGTTTAGGTTGCCAT  700

seq1  AGAAACCAAAAAAGTTCCATTGCTTGTGTTGAGCTTAATCTATCAGGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACCAAAAAAGTTCCATTGCTTGTGTTGAGCTTAATCTATCAGGTTA  750

seq1  TATATCTACGCTTAGAAATATTTTTATTAACTGAAAAAATAAACTATTCA  800
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCTACGCTTAG-AATATTTTTATTAACTGAAAAAATAAACTATTCA  799

seq1  ATAATGCAAAAGAGGTTAGGCTACTGAAATGATTAACAAAGTCCAGATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGCAAAAGAGGTTAGGCTACTGAAATGATTAACAAAGTCCAGATGA  849

seq1  ACACTCGACTACTTAATAACAAGCTTAAGTGTTCTATGGTTGTCATGACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCGACTACTTAATAACAAGCTTAAGTGTTCTATGGTTGTCATGACA  899

seq1  TTTCTTCTACAAAGAAAATGATGTCTTCCAAAAAAAAATCTTAAAACTCG  950
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTAC-AAGAAAATGATGTCTTCCAAAAAAAAATCTTAAAACTCG  948

seq1  ATGAAAATGCAAATCTCTTTATGACAGTATGTGGTTGTCACAATTATAAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||
seq2  ATGAAAATGCAAATCTCTTTATGACAGTATGTGG-TGTCACA--TAT-AT  994

seq1  GAGAGACAATAATTGATGATTTATGAGATAATACCATGGCAACAAAGTCT  1050
      ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||
seq2  GAGAGAC-ATAATTGATGATTTATGAGAT-ATACCATGGCA--CAAGTCT  1040

seq1  TTCATCATTGGCACCCCTCGGTCACTCTTTTTAAATAGATGCTTGTGAGT  1100
      ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||
seq2  TTCATCA-TGGCACCCCTC-GTCACTCTTTTTAATTAGATGC-TGTGAGT  1087

seq1  G-CCTCTGAAAAGTTTTCACCATGAAATACAAGAA-GATCTA  1140
      | ||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||
seq2  GCCCTCTGAAAAGGTTCACCCATGAAATACAAGAAGGATCTA  1129

seq1: chrX_110732934_110734006
seq2: B6Ng01-345D19.g_63_1142 (reverse)

seq1  CACATTATAAACATATAT--GAACTATTC--AAACAGCATTTTAAAATTG  46
      |||||||| |||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||
seq2  CACATTAT-AACATATATTGAAACTAATCCAAAACAGCATTTTAAAATTG  49

seq1  AGGGTAGTGTATCCT-GAAACTGACTT-ATGTGTCAATACTGTAGCTTAT  94
      ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTAGTGTATCCTGGAAACTGACTTAATGTGTCAATACTGTAGCTTAT  99

seq1  AGTGCAAATCATTACATTAAATTCTGGATGCTCCTCGACTTACTGTTATA  144
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGC-AATCATTACATTAAATTCTGGATGCTCCTCGACTTACTGTTATA  148

seq1  AAAGAGACAGGTAGCTAATATTTCTTTGTCCCACATTT-AAGATCTGTGA  193
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAAGAGACAGGTAGCTAATATTTCTTTGTCCCACATTTAAAGATCTGTGA  198

seq1  TATATGATGACTTTTTGTTACTTTTCTTCTATTGGGG-GACTGTATGTTA  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TATATGATGACTTTTTGTTACTTTTCTTCTATTGGGGAGACTGTATGTTA  248

seq1  AAGATGCCCTCATATATAATTTTTGAGATAAATATATTTTAATGAGTCAC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGCCCTCATATATAATTTTTGAGATAAATATATTTTAATGAGTCAC  298

seq1  TGAAAATATTCTATACAATTTTGAGTAA-CTAGTGAATTAATTTGCATAT  341
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAATATTCTATACAATTTTGAGTAACCTAGTGAATTAATTTGCATAT  348

seq1  TTAACTCACAATTTAATAAGCAAAAAATATTTTTGTACTACTCTACATTA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTCACAATTTAATAAGCAAAAAATATTTTTGTACTACTCTACATTA  398

seq1  GAAGATAATCTCATACATAAATATAATATATTTGATCATATTCATCCACT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATAATCTCATACATAAATATAATATATTTGATCATATTCATCCACT  448

seq1  TTCTTTAAAAGCAAGATTACTGTGTGTAGCATGTCATTTTATAAAACCCA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTAAAAGCAAGATTACTGTGTGTAGCATGTCATTTTATAAAACCCA  498

seq1  GGCTTGGTCCAGCTAGACTCTGGGACCAGCAGTCACCAGCCCGCTCCTCC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGGTCCAGCTAGACTCTGGGACCAGCAGTCACCAGCCCGCTCCTCC  548

seq1  TAGCCACACCCCTCTCCCACAAATGCTGGCTTTGCCTCTCCAGAGCTACA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCACACCCCTCTCCCACAAATGCTGGCTTTGCCTCTCCAGAGCTACA  598

seq1  AGATTGCTCTCTTGCCAGCTAACCACCGTGTGGCCAGCTCTGCCAGTGTC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGCTCTCTTGCCAGCTAACCACCGTGTGGCCAGCTCTGCCAGTGTC  648

seq1  TGTCCTAGTCTGGCTCAGCTCCCTACCAGACCACTTTAATGCCGCGAATG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTAGTCTGGCTCAGCTCCCTACCAGACCACTTTAATGCCGCGAATG  698

seq1  GAAAATACCAGATACTTTTATACTTTAGAACTGACCAGATAACTCAAAGG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATACCAGATACTTTTATACTTTAGAACTGACCAGATAACTCAAAGG  748

seq1  CTGGATAAAGACTATCCTACCCCATCTTCCTTGGCCTCTGCAAGCTGTGG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATAAAGACTATCCTACCCCATCTTCCTTGGCCTCTGCAAGCTGTGG  798

seq1  AGGCCACAAAACTACCAGTGCCCTGAGAAACCTACATGTCTGCCACTTCA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCACAAAACTACCAGTGCCCTGAGAAACCTACATGTCTGCCACTTCA  848

seq1  CCACCACCTGCCTAATCTGACCCTAATCCTCTCTCCTGTCCTGCCCAGAA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACCTGCCTAATCTGACCCTAATCCTCTCTCCTGTCCTGCCCAGAA  898

seq1  AACCCTGCCTCCATATCTTCAACCAGTGATTACCTTCTACTGTCATTATT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGCCTCCATATCTTCAACCAGTGATTACCTTCTACTGTCATTATT  948

seq1  AACTAATCAACAATTAGGGAAAATAATTAGGAAAAGAATCAGGGAAACTC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATCAACAATTAGGGAAAATAATTAGGAAAAGAATCAGGGAAACTC  998

seq1  CCCCTATAACTTTCAAGTTACACTGGTGCATTCATGTGTTGAAATTTGAA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTATAACTTTCAAGTTACACTGGTGCATTCATGTGTTGAAATTTGAA  1048

seq1  ACTATAAAACTATTTCAAAGAAATCAGAATTC  1073
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAAAACTATTTCAAAGAAATCAGAATTC  1080