| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-064K19.T7 (MSMg01no064_k19.b1) | MSMg01-064K19.TJ (MSMg01no064_k19.g1) |
|---|
| ACC | AG290081 | AG290082 |
|---|
| length | 1,251 | 1,259 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 696 (129 - 824) | 143 (501 - 643) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_k19.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_k19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_k19.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_k19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:48 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCCTCTCCTTTNNNNCACAGTGCGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCATGTGGAACCTTTAACCCTTTATAAAGCAGTCTCTCC
CCTTTCTCTGTTGCCTGCCTCCCTTATATTTTCAGCTGATTGAGCTGCCT
CTTCCTGCTTTAATAGGAGAGGATGTTCCTAGACTGTAATTTGTTATGAC
AAGGCAGTTTTATATCCATGGGAGGTCTCTCCTTTTCTGAAGAGAAAGAG
AGGAGGAATGCATTGGGGAAGGTGAGCTCCTGGGAAGGACTTCAAGAAGA
GGAGGAAGGTGAAGCTACATTTAGGATTTATTTTCTGATTACAGTTTCCC
CTAACAGTTACTCCTTCAGGTTCCTTCCCACTTCTCCTCTAATCCAGATT
CCTACTGTCTGTCTCTTTTTAGGAAACTAATAGTTATCTAAAGAATACTA
ATGAAATAAACCAAACTAACTGAGTAGGACAAAACAGCCAAAGAAAATAA
ACAAATTCACACACACAGACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACAAAACATATATAGATACAGAAACACACATTCACATA
CTCTATCTAATCAAAACCCCAAACCAGAAAACATAATATACACAAAGAAC
CTGTATGATAGGAAAGCAAACAAACAAAATACCCAAAGTTAACTTTCTTA
CACAAAGATGCTCTAAAGATGCTGTCTTAGTTAGGGTTTTACTGCAGTGA
ACAGGCATTATGACCAAGGCAAGCCTTATAAAGGACAACATTTAATTGGA
GCTAGCTTACAGGTTCAGATGTTCAGTCCATTATCATCAAGGTGGGACAT
GGCAGCATCGAAGCAGGCATAGAGTTGGCACAGATGAAAGTTCTACATCT
TCATCTGTAAAGCTGCTAGTGAAAGACTGACTTCCTCACACTTAAAAGGA
GGTATTAAACCCCCCCCTTATAGTGACCCACCTACTCCTAGAACCCCATC
TCCTAATAAGGCCATTCCCCGGGGCCAGGCTTATACAATCCCCGAATATT
TTTTGGGGGGAACCCTTACCCCACAAAGGTTTTGATGGGCCCAAAACCCC
CCATCTAATAATTGCCCCGGGTTTTTTAGAAAAAAGCGAGATTTTCCTTT
CTTCTTGGGGGAATACCCGNTTAATGGCCCCCGGTTCATTTTTTTCTTAT
TTCCCACAAACGGGATTGTGTGCTCCTTTCTCTCCTCCAAAAATAACCTC
T
| NTTTAAGATGGTAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCATGTGTTTATTAGTATTTTACTGTGCAATTC
TTGCTCATAATAATTAAGTTATAACCCCGTAACCTACCTTTAAAAACTTT
AGCTTTATTTCAATTATTTTTGTTACCCCTAATATATAGTCATTCATGTC
ATTACATTCAAAATATAAACTTTTATATTCTGCTTTACATTGTGCTCCAT
TCCACTGGTAAAAAGTATGATTATATTATAATACCTTGATTCTCTTTAAG
AACATTATTTTTATGATTGTTCTCCTTGAATTTCTAAAAAGATGGCAATG
ATTTTATTTAATTCTTAAATGCAAGAGAAGAATTCTCTACTGGCTTAATT
GCATAAAAACACATGTAAATAACAGCATCCAGAAGATATGAGCTATATTT
TTTTTCCCTCCCCCCCCGGAAACTTGCTGGAATGTAAAAAACAGAAATAC
TTTCCTCTTGGAAGTAAGAATTGTATTTCAATATTTATTTTTATAAACAT
GAGTAATTTAAAAGTATTTATTTCATGAATCTTTTATTGAAGGGTCTTAA
ATTAGCATCATAATTTTCCAAAATTGAATACTTTAAATATCTGAAATTTA
GCTGTATGTTTGTAATGATTCATTGAAAAATGAAGTGCTATATTATCCTA
ACCATTTTAAAAATAATTGAACTCCTTTTGGCGATCATTATGGAAATGTG
TTATACATGTTAAATTATGATATTTTACTATACTTAGTGTGTTTATAGAT
TTACTTTAGGCCATCATTCCCAGAAGTTCAAGGACTGTTACCAAAATTTA
AATTTAAAAAAATTTTGCTAATCCAATTAATACCTTGATGGGAAAAATTA
AGGTCTTTTTTTCCTTTTAATTAAAAAAATTCTTTTTCTTTTATTTTTTC
CTTTTATTTATATCCACTCATTAATGGAATCATATAAATTTTTTCTCATG
CAACCATATATTTTTATTAATTTGTTTTTTAATTATAACTAGGAAATTTT
CCCAGTGTTTTATTTAATTATATGTCATTTCTTTTAAATATCTTACTTAT
CCGCTAAAATCGCTTTCTTTAATATACATTCTTTTCCTGCTTGTGCTTTA
AACAAATTTCCTTTGCTTTATTTAATATTTTTTTCTCTTTTTACAATTTG
TCTTCTATACATTTATGGTCTTAGTCATTCTCATTCTATATTTCCTTTCC
TCTTATACT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 10 8 8 8 8 9 23 3 0 0 0 0 3 9 9 7 7 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 19 19 10 8 8 10 12 10 24 26 42 36 34 36 36 42 42
42 48 42 47 37 50 47 47 47 43 42 50 50 35 35 35 35 31 31 31 33 33 33 28 21 19 9 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 19 21 33 33 33 33 33 44 53
53 57 50 53 53 53 42 35 35 35 35 31 31 31 30 31 25 21 8 8 8 8 8 7 6 6 6 12 12 23 27 30 37 33 33 33 27 26 11 13 13 13 13 15 32 35 57 53 53 53
53 53 53 53 53 68 68 68 42 47 47 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 54 59 59 37 37 35 39 42 44 44 57
57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 50 50 44 57 57 68 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 68 59 59 68 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59
59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 68 68 68 57 57 52 52 52 57 59 52 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 50 50 50 46 46 30 25 12 10 9 9 9 23 33 59 59 59 59 59 50 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 59
57 57 59 57 57 57 47 43 39 39 43 43 43 48 48 48 57 57 48 48 44 57 57 57 43 43 43 47 57 57 54 54 57 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48
57 57 54 54 57 57 59 57 57 59 59 52 52 52 57 52 57 57 57 52 52 52 52 50 50 39 39 39 43 43 52 59 52 52 52 52 59 52 52 52 52 52 52 43 43 43 52 50 50 43
52 43 50 43 43 35 38 38 43 43 52 43 59 38 42 42 52 52 52 52 52 57 54 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 54 54 54 57 57 44 37 28 28 42 42 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 54 47 47 43 43 43 43 43 57 48 48 43 43 32 32 23 28 32 42 40 43 43 43 46 48
48 48 48 48 57 48 48 43 43 36 39 39 40 41 39 39 35 31 31 35 32 32 30 23 22 20 20 24 34 37 39 39 39 39 48 48 48 34 34 30 35 35 37 37 59 47 47 23 11 6
6 6 15 19 28 28 22 22 24 33 37 39 37 24 18 19 10 10 10 14 14 22 30 40 39 37 30 28 14 14 14 27 30 37 39 41 40 40 40 48 48 48 39 39 32 39 39 43 43 57
46 48 48 46 46 43 37 37 34 34 37 37 32 31 27 39 37 37 33 30 24 22 28 22 25 32 24 30 26 18 12 12 12 22 23 32 25 27 32 36 29 30 24 18 18 24 30 22 22 12
11 11 26 26 28 28 28 30 24 17 19 26 24 28 28 28 22 22 30 27 28 18 18 19 19 19 20 16 22 16 15 17 17 19 19 14 13 10 16 16 22 13 15 22 19 10 8 14 14 12
9 12 20 16 12 12 18 18 17 11 13 13 18 14 19 19 10 11 10 8 7 7 11 18 19 30 25 10 10 10 11 12 12 12 15 11 11 11 10 10 9 16 13 10 10 8 8 8 12 10
10 9 11 11 17 15 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 11 9 9 9 10 10 10 10 13 10 12 12 11 14 12 15 11 10 10 8 8 8 8 8 15 9 9 9 8 8
8 8 10 9 15 15 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 11 12 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 9 9 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 10 7 11 14 11 11 11 10 10 9 12 10 8 8 8 9 13 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 13 18 11 8 8 9 8 10 12 12
23 16 12 11 11 10 11 10 11 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 13 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 10 11 14 15 13
12 9 8 8 8 8 10 10 11 11 11 12 14 15 15 9 10 10 10 12 10 11 11 10 8 8 8 8 8 10 19 20 24 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 14 10 10 8 6
6 6 6 6 8 8 10 11 14 17 14 10 8 12 10 10 10 9 3 0 3 10 10 10 10 13 12 10 8 9 8 8 8 10 6 7 7 9 10 10 10 9 9 8 6 6 6 7 8 8
8 9 9 8 13 8 9 13 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 15 8 9 9 9 9 9 10 10 10 8 6 6 6 6 10 9 9 13 9 11 9 9 8 11 10 11 9 9 10 9
9 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 7 8 7 7 8 9 11 9 11 9 8 9 8 9 10 16 14 10 9 9 10 12 15 24 17 24 17 24 24 28 34 34 34 34 37 33 29
36 29 40 27 39 39 39 39 39 30 31 23 23 21 26 24 37 29 28 13 13 11 19 19 36 26 26 37 18 17 10 13 13 20 35 42 42 36 36 16 16 15 21 21 42 32 42 35 37 37
33 33 25 33 33 34 34 34 34 33 33 33 33 37 37 33 33 33 28 33 30 19 16 10 9 9 9 11 17 17 25 22 18 22 22 24 26 33 36 32 32 34 36 44 57 48 43 43 31 31
22 24 24 31 31 34 42 48 42 43 37 42 36 22 28 28 46 46 46 43 43 36 36 36 39 42 48 48 47 44 41 41 41 41 42 39 42 31 30 30 30 42 37 40 36 28 28 24 33 33
37 32 37 36 32 32 33 32 31 20 20 20 32 32 43 50 44 48 48 48 43 59 43 43 43 52 52 43 43 35 35 35 47 43 52 52 52 43 43 24 32 17 18 18 38 38 52 52 52 43
43 43 43 43 24 24 16 28 28 52 57 57 57 57 43 42 35 43 43 52 43 43 43 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 50 59 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 32 30 12 12
12 32 32 43 44 44 48 59 59 57 43 43 43 43 43 43 42 42 35 35 35 42 42 43 57 47 48 48 48 57 57 47 47 43 32 32 17 14 14 15 15 18 30 27 44 44 42 32 32 37
43 46 48 54 54 54 59 48 48 48 48 48 48 48 47 47 41 42 35 35 35 37 37 20 20 17 21 21 14 14 14 31 28 48 48 48 48 39 37 24 24 18 18 15 15 22 12 11 11 12
12 11 11 12 29 30 47 47 47 37 37 35 35 35 35 47 47 48 48 48 48 47 48 43 43 43 43 43 47 39 37 31 31 20 20 20 32 32 43 43 36 34 32 18 23 12 12 12 12 16
17 16 15 12 12 9 10 9 9 9 12 12 13 9 9 9 10 16 16 23 34 32 41 37 37 32 25 21 12 11 11 13 13 10 10 10 11 13 19 12 11 9 12 9 11 11 12 15 23 14
14 14 31 30 46 43 46 32 32 21 32 32 37 32 32 28 23 23 23 32 30 42 30 30 30 43 37 43 43 43 43 43 43 46 47 48 48 48 57 57 46 43 43 43 59 43 43 43 43 37
40 30 28 25 30 40 47 57 57 54 54 43 43 40 40 39 43 43 48 43 43 39 39 35 32 32 37 39 35 35 35 43 43 37 37 36 24 24 12 12 15 13 13 14 21 18 28 28 33 33
37 28 30 14 12 12 21 21 32 39 39 35 35 35 59 39 37 37 37 37 37 37 39 39 37 19 15 15 17 22 19 31 30 34 30 30 22 22 22 20 17 18 17 17 15 25 12 12 12 18
11 11 15 25 22 22 26 24 20 22 27 22 27 27 28 33 40 37 37 37 37 28 28 30 30 37 37 39 39 39 39 37 37 30 21 21 15 15 15 21 15 20 19 26 26 28 34 17 15 10
12 13 15 15 22 36 34 37 37 32 31 31 35 36 36 37 37 30 32 15 12 13 14 13 9 11 12 15 15 8 8 8 10 10 13 10 10 8 8 8 8 8 9 10 23 31 39 39 19 16
12 12 12 12 16 11 9 8 10 8 9 13 11 18 16 19 14 13 15 15 10 10 15 23 19 21 19 21 21 28 33 33 37 26 23 15 9 10 8 8 8 15 14 17 13 13 11 10 10 11
10 10 10 8 8 9 12 9 10 10 8 8 8 8 10 8 13 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 14 14 20 16 18 18 12 11 11 11 11 10 12 10 8 8 8 8 10 10 12 11 9
8 8 8 8 8 8 13 19 18 11 11 15 19 19 13 8 8 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 10 9 10 8 6 6 6 6 11 15 11 8 8 8 8 11 10
14 10 12 10 10 10 13 8 9 8 15 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 15 17 14 10 10 12 12 13 11 13 12 17 10 10 10 10 13 21 21 12 10 10 10 8 13 6 6
8 8 15 12 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 12 10 11 11 12 12 16 13 10 10 8 8 7 6 8 8 11 14 28 25 28 12 10 7 6 8 8 8 10
10 10 10 9 9 10 10 13 16 22 31 32 23 11 9 9 9 10 10 12 12 8 12 8 8 10 8 10 9 9 10 10 14 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 15 11 18 18 12 12
11 13 10 10 10 8 8 8 9 12 11 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 19 14 11 8 10 10 8 8 8 8 12 7 6 8 8 8 7 8 8 8 8 6
6 8 8 8 12 11 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 12 10 10 6 6 6 7 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 10 10 8 8 9 8 8 14 10 8 8 6 6 6 10 8 8
8 6 6 8 10 12 8 12 7 6 8 8 9 9 9 9 10 10 10 12 12 12 8 8 6 6 8 8 8 9 16 17 11 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 7 8
9 9 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 10 8 10 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 11 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 11 15 8 7 9 9 10 13 10 10 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 8 |
|---|
