BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-072H06.T7 (MSMg01no072_h06.b1) | MSMg01-072H06.TJ (MSMg01no072_h06.g1) |
ACC | AG295993 | AG295994 |
length | 724 | 719 |
length of high quality (start - end) | 222 (71 - 292) | 337 (75 - 411) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no072_h06.b1 PHD_FILE: MSMg01no072_h06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:20:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no072_h06.g1 PHD_FILE: MSMg01no072_h06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:20:12 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CAAAATTTGCGGCGCTAAACGACTACTAATTCGAGAAGATCCGCGGAATT
CTCTTTATTCCCCGGTTGATCTGAAGCCAGCAGGTGCGCAGTTATTAGCT
TGTCTGCTACGGAGCACATAAAAACAAAACAAAACTAAACAAAACAAAAC
AAAACAAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTGAGATCTGAACCATGATCC
AGGCTCCTCTCATCCCTATACCAATACTTTTTCAAATTAGTAATGACTAG
TCTCTAGAACTACAAAGACTTACCTGTATATCCAGTATTCTACTATGGGA
TGTACAATATCATTTTAAATGATATTCTGTATTAACTGTGGATACATGTT
TTCATCTCCACTACTGTGTTTATATTCTAGGGTTACCGACCATTATCTGT
TTTTAATGGTAATTGCCACTCTATTTCTGGTTCAATCTGACTTTATACTC
CCAAAATATTAAAACATTTACGGCTAAGAGAAATAGCGTTTATGAATAGT
CTGATCTCGTAAATATACTGACTATTTGTGGAATCTCTTTGAATCATCGC
AGACTAGTATCTGATGAAAAATACTGCTAATACAATATTGCTCCCTCTAT
AACCCGTCATATCTAGTTTATATATCCACTTAATTCACTTCCAATATGAT
CACCGATTCGCATATACTATTCCATAATTTGCGCGATTGGACTCCGGATA
TTTTATGTCTCTTGCTGATACAGG
| NCAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGA
GAAGCACCTGAAAAAATGCTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAA
TCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATC
AAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAAC
ACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAGAT
CAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGGAGGATCCA
GCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAA
GGACACATGCTGCACTATGTTCATAGCAGTCTTATTTATAATAGCCAGAA
GCTGGAAGGAGCCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGAGACAGAAGACG
TGGGACTTCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAATAAGAATGAAGT
TATGAAATTCCTGGCCAAATGGATGGAGCTGTAGGGCGTCTTCCTGACTG
AGGTAACACATTCACAAAGGAACTCACTCAATACGTACTCTCTGATAAGC
GGGAATTATCCTCATACCTAAGATACTCAAGATTTAAGATACCCTTTCCA
AATCACTTGAAACTCAAGA
|
quality values | Open.Hide.11 11 14 16 15 27 23 30 23 15 9 9 10 19 15 13 9 8 10 17 17 16 19 9 9 8 19 8 6 6 7 6 8 11 14 11 9 9 9 10 13 13 20 27 28 32 32 30 30 36
36 48 50 41 39 37 34 34 21 21 13 11 9 9 11 13 17 11 11 10 22 25 37 28 30 33 33 33 33 39 39 43 43 37 43 43 47 43 31 31 20 20 23 34 32 42 42 32 32 32
34 35 39 42 43 43 54 42 42 30 28 28 29 29 42 42 46 42 32 27 20 20 16 24 24 22 22 26 32 36 37 35 35 37 37 32 36 22 28 28 32 32 37 36 42 32 32 29 29 29
44 35 35 35 42 32 32 23 27 27 28 28 29 32 28 24 21 13 13 15 38 38 52 43 43 37 43 43 52 52 43 44 25 25 25 36 36 50 57 52 52 52 52 52 52 57 43 37 32 32
20 27 27 43 41 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 41 36 32 19 19 22 38 38 50 50 43 43 37 37 35 35 35 32 30 15 14 15 15 24 24 32 32 29 29 32 32
35 42 42 43 42 32 28 23 28 32 32 30 20 24 20 30 30 35 41 41 41 35 35 35 36 36 25 25 25 33 28 28 28 36 23 25 28 28 23 22 22 17 17 15 24 21 21 11 11 11
18 16 18 13 13 13 21 22 21 10 10 9 14 10 14 14 14 18 19 19 21 10 8 8 10 10 13 22 21 21 20 20 20 28 28 24 25 18 20 15 18 11 12 12 15 19 19 21 24 16
16 12 12 12 10 15 15 15 19 21 16 15 16 15 10 8 8 10 15 18 16 13 13 15 21 21 11 11 12 18 12 14 14 21 21 12 13 13 18 18 18 24 18 18 15 28 22 22 12 12
12 12 12 10 16 15 12 8 9 10 8 10 12 8 10 11 11 11 13 18 28 28 32 24 24 19 16 10 12 14 11 8 11 8 12 12 15 20 19 13 10 13 11 11 14 13 15 14 14 13
13 11 11 11 13 18 26 24 23 18 11 11 11 18 21 28 24 32 8 8 6 6 8 8 10 10 12 12 11 11 11 19 19 14 14 14 11 14 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 10 10
10 10 12 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 9 16 11 8 8 8 8 8 10 15 12 12 11 9 9 8 8 8 8 8 8 12 15 15 15 10 10 10 10 10 12 12 13
10 10 10 13 10 9 9 9 9 9 19 21 24 23 12 10 8 8 10 9 9 9 8 10 10 12 15 10 8 8 8 10 10 11 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 11 12 14 9 8 8 10 10 11 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 10 13 12 12 12 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 6 6 8 8 8 11 11 11 11 10 10 11 11 11 12 11 9 9 9 9 9 9 10 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10
11 12 8 8 8 8 8 8 9 9 12 8 10 6 6 8 6 11 8 10 10 8 7 7 | Open.Hide. 0 3 10 9 9 8 8 8 8 17 15 11 11 11 19 16 39 37 37 41 41 37 37 43 40 40 41 41 27 21 9 9 6 7 7 7 6 6 6 10 11 11 16 10 10 27 27 31 36 36
50 36 36 36 36 33 33 21 21 11 11 17 17 21 16 14 15 20 15 27 30 32 33 33 33 36 36 36 36 47 47 40 43 34 43 43 48 37 36 48 48 42 42 48 48 42 42 39 39 48
43 36 42 33 34 46 42 54 57 57 57 68 68 54 50 50 50 41 41 41 41 41 41 41 41 41 50 57 57 68 57 51 48 50 50 47 47 44 57 57 57 50 48 42 46 46 46 57 57 57
57 57 57 57 57 50 50 50 48 48 48 52 50 50 50 50 50 43 43 43 36 36 37 37 52 52 52 57 57 57 57 54 54 57 57 54 46 46 46 57 57 57 57 57 59 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 43 43 35 35 43 43 57 57 57 57 52 52 42 43 31 31 31 43 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 35 35 35 43 43 43 62 43 52 52 62 62 62 43 43 43 43 43 43
43 52 52 52 43 43 35 20 20 35 35 39 62 43 62 43 43 31 34 34 23 23 26 32 18 13 13 13 32 38 43 44 44 43 43 43 43 52 57 43 39 39 39 39 45 52 43 43 42 42
35 35 33 43 43 52 52 52 57 59 52 52 57 44 39 33 27 27 27 33 43 43 57 43 43 23 23 23 38 24 28 28 43 38 43 32 33 28 43 23 23 17 20 18 32 32 35 42 29 32
33 33 33 35 35 42 43 38 27 13 10 10 10 15 18 11 9 9 20 20 33 30 32 28 27 19 24 19 12 12 12 32 32 47 47 47 47 44 42 42 35 42 42 32 26 17 17 17 26 28
37 32 36 32 32 32 21 17 10 10 10 9 9 9 12 9 9 9 24 24 35 41 32 32 31 25 25 25 25 33 33 33 28 28 23 28 17 12 8 8 8 8 9 13 20 16 9 8 10 10
8 8 10 8 8 6 6 8 19 15 20 11 10 10 15 15 18 18 19 22 19 21 22 19 23 28 24 24 14 13 9 9 10 12 9 10 10 10 13 15 14 14 26 26 23 15 8 8 8 8
15 19 26 21 12 11 11 12 15 23 19 19 10 10 10 10 19 19 15 13 16 10 10 12 10 9 9 9 10 15 11 11 11 11 8 8 8 13 13 10 18 14 15 15 13 15 8 8 8 10
10 9 8 10 8 8 10 10 14 17 17 22 10 10 10 10 11 18 18 24 21 15 12 16 12 12 12 9 10 9 12 12 8 8 8 12 13 21 13 8 8 8 15 15 11 13 21 8 8 8
8 8 14 14 16 9 10 9 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 9 8 8 9 8 8 8 9 9 9 13 13 11 11 11 12 12 12 10 10 9 9 8 8 10 9 9 10
9 9 11 12 15 10 9 9 11 12 10 12 12 13 10 8 8 8 8 |