Query= MSMg01no136_k19.b1 MSMg01no136_k19.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no136_k19.b1 PHD_FILE: MSMg01no136_k19.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 18:53:08 2005
(635 letters)
>mm_chrX_149000860_149001894
Length = 1035
Score = 1083 bits (560), Expect = 0.0
Identities = 603/632 (95%), Gaps = 24/632 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 4 ggaattcctggattgtgtctttaagtcctttaatgaaggcatgcaagatgtagggttaaa 63
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 204 ggaattcctggattgtgtgtttaagtcctttaatgaaggcatgcaagatgtagggttaaa 263
Query: 64 ccttgtctggattacagagtgctagagactcaaatttggaagtccaactaatagcagtat 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 264 ccttgtctggattacagagtgctagagactcaaatttggaagtccaactaatagcagtat 323
Query: 124 tctgtagatacaaaaaattatgtactactttttttcaccacatggaggcaaattttatta 183
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 324 tctgtagatacaaaaaattatgtactacttttcttcaccacatggaggcaaattttatta 383
Query: 184 tttcattttatattcacttggtagttatggcatgtggtgcctgtacataaacacatgacc 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 384 tttcattttatattcacttggtagttatggcatgtggtgcctgtacataaacacatgacc 443
Query: 244 tcttggttgactgcacttaagataattattctctggataaataatacaaaaagtaattag 303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 444 tcttggttgactgcacttaagataattattctctggataaataatacaaaaagtaattag 503
Query: 304 aaagggataatatatcattcatttttttatactgctgattctgacaaacaagtctgaatc 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 504 aaagggataatatatcattcatttttttatactgctgattctgacaaacaagtctgaatc 563
Query: 364 tcatcacatacccatcaaaattaatacttatgaacttgttatattccatgtctttttacc 423
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 564 tcatcacataggtatcaaaattaatacttatgaacttgttatattccatgtctttttacc 623
Query: 424 tcacttcctcctcacaatagcccttggtatattaaaatcaatttggaggttcagttttaa 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 624 tcacttcctcctcacaatagcccttggtatattaaaatcaatttggaggttcagttttaa 683
Query: 484 acttaggtagtgtgagttctattaattaattaattaattaattaattaattaattaatta 543
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 684 acttaggtagtgtgagttct-tt-----------------------taattaattaatta 719
Query: 544 attaattaattaattaattttttacaccatatttcattcctccccctgtccatcctttga 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 attaattaattaattaattttttacaccatatttcattcctccccctgtccatcctttga 779
Query: 604 ctgttccacatcccatacctcctccccacctc 635
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 780 ctgttccacatcccatacctcctccccacctc 811
Score = 66.5 bits (34), Expect = 6e-15
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 527 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 66.5 bits (34), Expect = 6e-15
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 523 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 66.5 bits (34), Expect = 6e-15
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 519 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 66.5 bits (34), Expect = 6e-15
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 515 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 66.5 bits (34), Expect = 6e-15
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 511 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 66.5 bits (34), Expect = 6e-15
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 507 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 64.5 bits (33), Expect = 2e-14
Identities = 33/33 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 504 attaattaattaattaattaattaattaattaa 536
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 737 attaattaattaattaattaattaattaattaa 705
Score = 62.6 bits (32), Expect = 9e-14
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 531 aattaattaattaattaattaattaattaatt 562
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 738 aattaattaattaattaattaattaattaatt 707
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 59
Number of extensions: 20
Number of successful extensions: 20
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 12
Number of HSP's successfully gapped: 9
Length of query: 635
Length of database: 1035
Length adjustment: 10
Effective length of query: 625
Effective length of database: 1025
Effective search space: 640625
Effective search space used: 640625
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
| |
