BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-159P06.T7 (MSMg01no159_p06.b1) | MSMg01-159P06.TJ (MSMg01no159_p06.g1) |
ACC | AG359750 | AG359751 |
length | 728 | 735 |
length of high quality (start - end) | 677 (46 - 722) | 289 (79 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no159_p06.b1 PHD_FILE: MSMg01no159_p06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:25:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no159_p06.g1 PHD_FILE: MSMg01no159_p06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:25:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCACAAACTTCAATCTAATGTTCTGTGAATCTGTTCCTATGAGTTTG
CTGAATGAAGCCACTCTGAAGATACTTGTACTAGGTGGTGGTCTACTATG
AGTATAGCAGAATATCATTAAGAATCATTTCAACCATTTTGCCTGAAATT
TTGGCTCTCTACTAGGTCTCTGTGCTATTCAGCCTCTCTTCCTGCCCCTC
CAGGAATTGAAGGCATTGGGCTTCCTCTTGTGGCATGAATCGTAATTTGG
GCCAGTGATTTGTTGGCCACTCACACAAGTTCTGCATCAACTTTATCCCA
GCACGTATTGCAGCAAGACAAACTGTACGTTGAAAGTTTCTGGACTGGTT
GATGCCCTAACCCCTCTGCTGTAAGTTTTGCCTGGTTACAGAAGAATTCC
AGTTCAAGCTCCATATCTATCCCCCTCCCCCTGATTACTGGGAGGTTTTG
TTGGTGTCATCTTCATAGATTTCAGGAAGTTTCCACTGCACTAGGTTTCT
ACCTCATGTCAAAGATCAGCTTTGACCCCACAGGGTAAACTGAAGCAGGC
AGCAAATGGGGGTCAGTGCTGAGTTTTGCTGATGGGGTTTGGTCCAAATA
CTGACATGGGCTGCCACCTGTGGCAGCCAATGATTAAAGAAGAATAAGGA
GGAAATCAAACATTTGCACACACACAGA
| CGCGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGCAGAGTTCCAGTCCTTTA
AAAATATTTGAAACACACTTTCATGCTGTCATTGTACATTGCATGGTTTT
ATGGAAATATATTTTAATAGTTTTATTCTGGTAAGCAGTTCACAAAGATT
ACCCCACAAAGACTCTCCTGCCCTATTTAATGCATTGTTTCTTTCCCTCT
TTTCTCATTCTTTGTATTTCTCTTGTTGTTTTAACCTTTGCATATTTTTT
AAGCATCCCTTTATAAGATAAATCCAATTCTTCTTAGGGGGGTTGAGATG
TCAGTTGTGAGTTGTGTATAACTAACCCTATGACAAGATTCTGATACAAG
TTTCACAATATGGACTTTAAAGGTGGTTGCTTCTTAAAGATCCAATAAAA
TGCTAGGCATACTTTTGTTGATTAGAATTCAATAGTAGAATATCAGCTTA
GTAATATACATTACTTAGAACTTGGTGGAAAATTATGAATTTATATGAAA
AACATAAAAACATAAAATATTTAAACATAAAAAGAGAATTGTTGAAAAGA
TCTAGAAAAGAGGATAAACACACATACACACATGCACGCACACACACACA
CACACACACACACACACATACTTACACACCCTCAATACCTTTTGTGTAAT
GAACCTACAGAAATGTAACCAGACCCTGAACTACT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 6 6 6 13 15 20 37 39 33 33 33 33 36 47 50 38 42 42 39 34 37 43 27 21 11 9 9 23 22 53 50 54 54 59 59 68 68 42 42 29 29 29 42 44 68 68 50
50 50 50 68 68 50 50 50 51 51 68 48 48 46 46 46 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 43 43 36 22 22 17 17 17 24 29 32 32 19 13 10 9 9 9 9 9 11 11 11 20 26 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 59 59 54 47 47 43 43 48 48 48 57 48 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 53 47 47 47 47 57 57 57 57 50 53 57 57 53 53 59 50 50 47 47 47 44 59 44 37 37 44
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 59 43 44 43 43 43 59 44 37 37 37 37 37 41 41 34 36 40 44 44 39 39 39 36 32 36 37 37 37 37 37 37
37 37 37 37 39 39 44 37 37 44 59 59 41 37 37 41 37 37 41 39 35 32 34 39 39 30 30 22 22 22 30 34 44 44 41 37 39 44 44 41 32 28 19 22 27 24 22 35 31 41
34 37 37 37 34 34 25 25 20 30 34 37 41 36 31 35 28 30 20 24 20 20 20 23 19 19 19 18 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 15 13 8 10 10 10 12 13 27 18 28 28 34 37 47 39 39 35 43 43 48 57 48 48 37 43 37 37 30 43 40 57 57 48 43 42 28 33 33 42 42 48 42 43 36
39 36 48 43 47 47 50 48 48 48 54 48 57 36 40 35 35 35 40 57 57 47 47 47 48 47 48 50 59 57 57 37 40 28 28 28 44 44 57 57 47 47 44 44 43 57 57 57 57 54
57 57 57 47 48 48 57 50 50 50 52 50 50 50 50 50 38 52 52 57 43 43 28 28 32 43 43 32 43 43 43 32 43 31 43 43 43 43 35 43 33 43 29 27 28 44 44 59 57 57
52 52 52 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 52 52 52 45 57 59 59 43 52 52 57 57 42 43 35 43 43 52 57 57 57 57 62 52 52 52 62 62 62 62 45 45 45 52 52
52 62 62 59 57 57 57 59 47 39 39 39 43 43 52 57 57 42 42 35 47 47 52 52 52 59 57 43 43 29 27 23 44 44 31 42 31 44 42 52 52 59 57 57 57 59 52 52 52 59
59 57 57 52 52 52 52 52 54 52 59 38 36 20 32 32 44 44 52 52 43 43 43 43 29 33 33 35 44 50 50 50 48 57 57 50 50 43 43 43 50 43 43 43 57 57 59 57 48 47
47 47 47 48 48 47 57 48 54 54 57 57 54 44 44 25 25 26 44 44 57 48 48 47 59 47 43 43 43 46 48 48 48 37 37 30 44 43 59 59 47 47 41 41 41 43 43 39 47 39
43 43 46 57 43 43 39 39 39 43 32 36 28 28 20 20 20 18 18 24 24 22 19 14 14 12 12 12 13 14 14 12 16 11 21 21 37 37 43 43 43 43 43 40 47 47 48 48 48 48
57 57 57 57 48 54 54 47 43 43 43 43 43 43 46 41 41 41 20 20 15 15 11 11 15 25 24 37 37 37 43 39 39 24 24 12 18 18 36 36 57 47 57 48 48 48 57 32 32 20
27 23 36 36 44 44 44 43 37 43 43 44 47 59 50 50 47 47 47 48 57 44 50 38 37 32 44 43 43 43 44 44 57 52 52 52 52 43 43 43 43 52 44 47 52 52 52 43 44 33
43 43 43 43 43 52 43 50 43 52 37 50 43 52 36 38 18 20 20 32 32 33 32 21 15 15 15 38 38 59 57 57 57 44 48 44 46 57 57 59 59 59 59 43 43 43 44 47 59 57
47 47 43 42 39 42 44 57 37 37 33 33 33 42 42 43 43 43 43 47 59 44 44 25 25 25 36 28 39 32 32 25 36 31 43 37 39 42 42 36 32 36 39 42 44 59 59 47 33 33
39 29 29 30 30 28 32 32 43 43 43 43 43 43 43 43 39 39 28 31 21 23 14 23 21 25 12 15 15 25 25 22 28 28 23 28 28 37 26 28 20 23 19 31 24 29 22 22 22 31
22 18 18 18 16 15 13 11 12 12 21 12 13 13 12 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 13 23 18 12 11 10 8 8 8 9 12 12 10 12 10 19 18 11 10 10 10 10 11 17
21 17 14 14 10 10 8 8 8 10 9 12 12 14 16 9 11 10 10 10 8 12 21 19 14 10 10 16 10 9 9 9 11 11 11 |