BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-182F01.T7 (MSMg01no182_f01.b1) | MSMg01-182F01.TJ (MSMg01no182_f01.g1) |
ACC | AG375233 | AG375234 |
length | 721 | 712 |
length of high quality (start - end) | 571 (46 - 616) | 234 (126 - 359) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_f01.b1 PHD_FILE: MSMg01no182_f01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:56:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_f01.g1 PHD_FILE: MSMg01no182_f01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:56:01 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (90,374,680 - 90,375,246) | (90,509,180 - 90,509,413) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTTCAATCTTGCTAGATGTTCTAATGAATGCCTTTTTTCTCATCCT
GCTTTAAAACAGAGCTTGTGTTCAAAGCTTTCTTCATGCACAAAGTGATA
AGACCCATGGGGCCACCCTGGATTGTTTTATGCCAAGAAAATAAGAGAAG
GAATGTGGGCCCTTCTCTTTTAATAGCTCAATGGTTATGATCCAATTATT
TCAGAGAGCTAAGTTATTTATATTTTATCTACCCTTTAAATTAGGTAAAT
TCTAAGGCTATTTGATTGCAAGAATGCATTAATTCTCCATAGAGAAATGT
GATTTTCTTTGTTCAAAATTCAATGCACTATCCATTATTCCTTTTTGTAT
AGAATTTCTTGTTTGTCCCATTAGTGTCTGGCCCAACAAAAGAGGAGGGT
AAAATCTCTGGCAGACATAGTCGACTTGCCTTGGCCACAGCCCTGCCCCA
CTGTTTTTGCTTATAGACTCCTATAACTATCAATGAACCAAAAATAGACT
GGAGGCATGTTAGAACCTAGGAGGATTGTGCCTGGTTTCCTATTTCTTCT
AGTTGAGTTGCTGAAAGCCAAAAGTGTATACTAATTTGTATCACCTGTGG
ATGTGCCTATACTAAAACATGCTCATAAATTATTTGAGGGCACTCCCATC
CATTATACAATCAACCCATAN
| CAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTATTCACCATTATGGTATTGCT
ACTGACCAAGAAACCTTCTTTCCAGCCAAAGAAGGGCAGCAGTGTGTTCA
TACTCATTGACTGAAACTGCTATTGGGTTCTCAGTATCTCTGGTAGGTAC
ACAATAATTATTAATACTCTTACACAGTATCTATCTTATAAACTAGTTCT
GTTCTTTTAAAGAACCATGCATATTATAGGGGAGTACTAACCTGTATTAT
GTTGGTGGGCATGATGGGCAAGTATTAGGTAGAGAGAGAAGGTTGTCTAA
GGGTTTTGAATTTTGAAAAATCGCCACCTTCTTCACAGAACTGAGAGAGG
GCCAGTTTGACCAAGTTCACCGCAAGAGATACTAGAAGAACTTCAGAACC
TGATTAAGGATACAAAATAACGAGAATCTGTTGAAAAACGGTGAGCCAAG
AAAACAACTAGAAAGGTCAAAATGTGCATGTGACGACATCAGCAAAGAAG
CTAAGTGTCGAGTCTAGGATGATAATGGTGTTTGAATGGACCATTGTGTG
TTAGACGTTAAACAAAGCATCTAATACGTGCTATGTCAGGCATCCTCTCA
AGCCTTGTTTTATGTCTGCGGTATAAGGATTACACTTGTCACTCGCATTT
GCCACTACCTCA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 11 19 39 30 29 27 24 22 22 30 37 33 33 33 37 33 33 43 47 30 30 31 30 29 21 23 10 9 9 9 11 12 18 18 25 25 31 31 31 31 34 34 28 33
33 36 36 47 47 34 34 34 23 27 14 21 23 24 20 15 15 12 23 23 42 36 41 41 46 47 57 57 68 51 50 47 47 47 47 48 48 59 59 59 59 57 41 41 41 41 41 41 57 57
48 48 48 59 59 59 59 48 41 41 41 41 41 42 42 37 42 37 50 50 50 43 37 37 43 50 50 50 50 50 43 48 43 43 37 37 50 50 52 52 52 52 57 57 57 57 52 57 57 57
43 44 32 43 36 52 43 43 38 43 44 32 27 28 38 38 43 43 43 39 39 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 43 43 39 39 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68
57 57 57 57 52 43 43 44 43 31 43 43 62 62 62 52 52 52 62 59 68 68 68 62 62 62 62 43 43 43 35 35 39 44 62 62 62 62 62 62 43 43 39 39 62 62 68 68 62 62
43 43 31 44 44 44 43 43 43 43 44 44 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 52 52 52 62 44 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 62
52 52 43 44 44 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 44 44 43 43 52 52 52 43 44 43 52 52 62 43 62 52 52 52 52
52 62 62 62 62 52 52 52 59 47 43 43 39 39 35 44 44 44 44 43 35 35 39 39 43 43 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 59 59 54 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 44 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 59 57 57 50 50 50 52 43 44 32 35 43 43 28 18 14 27 19 43 33 37 50 38 41 18 17 17 38 38 59 68 68 68
68 59 44 47 42 37 39 42 41 37 32 43 37 48 35 42 42 44 41 34 20 27 27 40 44 57 57 46 43 43 44 42 42 37 35 32 42 47 42 39 30 30 42 44 43 37 37 39 39 39
42 37 40 28 28 37 43 44 48 48 48 57 44 57 57 57 37 43 37 48 48 43 44 57 59 59 59 59 41 37 35 31 37 37 37 31 31 28 28 30 37 39 41 40 40 40 39 37 37 30
25 25 27 31 28 30 30 37 37 39 39 41 34 31 26 25 22 30 30 22 31 37 21 24 21 16 19 24 34 41 31 31 15 9 8 8 8 13 15 30 30 40 46 46 48 46 46 41 34 30
25 26 24 28 43 37 41 32 32 39 39 19 11 11 11 11 15 16 15 13 13 12 21 17 21 20 20 20 30 32 37 32 29 29 32 30 39 36 35 35 37 34 37 31 22 26 24 24 22 25
28 33 28 22 22 17 17 15 15 20 31 21 18 13 13 19 16 22 28 37 37 29 29 17 10 9 10 11 12 15 18 17 17 17 22 28 36 26 21 11 11 11 18 22 30 25 15 14 14 15
23 27 27 29 32 25 25 23 17 13 13 14 14 14 14 7 7 6 6 3 0 | Open.Hide.11 11 14 13 10 8 8 8 13 13 26 30 28 28 33 34 36 37 34 37 37 30 30 30 33 33 33 41 47 36 39 34 33 25 25 28 28 29 29 22 28 28 42 32 48 48 48 68 48 48
54 54 54 48 50 48 48 54 44 44 36 18 23 36 36 41 41 40 43 43 36 41 50 50 50 50 68 68 68 57 42 41 41 41 41 42 48 54 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 37 36 36 36 36 36 48 41 27 24 11 12 11 15 13 18 10 10 10 9 9 13 23 27 37 37 48 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 53 53 68 68 50 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 57 68 68 57 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57
57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 54 54 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 54 57 54 57 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 57 57 48 54 57 57 57 59 59 57 57 54 54 57 57 68 68 68
68 59 57 57 57 47 47 47 47 57 57 44 57 43 37 36 28 26 26 28 36 41 43 43 30 34 25 35 35 39 39 43 43 59 59 59 59 57 48 48 48 59 59 48 48 48 57 59 59 43
39 39 39 39 23 25 12 12 11 12 12 13 14 11 11 11 13 19 12 12 12 12 12 12 13 12 12 11 11 11 12 18 19 22 30 36 41 59 39 35 35 32 41 32 35 35 39 39 39 35
35 35 43 43 57 57 57 48 48 39 36 28 23 23 23 22 19 19 15 10 9 9 9 10 12 12 13 19 19 19 13 12 12 11 12 12 15 15 20 32 29 37 37 30 30 32 39 39 37 37
39 39 40 41 32 32 20 18 18 32 28 32 18 13 13 12 10 13 9 10 12 15 24 30 30 37 41 37 31 30 30 30 28 39 40 43 43 34 28 18 14 14 15 26 21 22 18 18 17 16
16 18 16 16 10 10 9 9 10 16 12 15 15 19 14 15 15 16 16 28 28 34 33 36 43 40 39 30 30 25 20 15 13 10 10 10 22 23 25 17 11 10 10 12 16 26 26 19 17 15
23 19 14 12 8 8 8 10 10 8 10 8 10 10 15 12 10 13 16 18 18 11 11 11 18 16 14 15 19 22 20 25 22 16 16 14 13 11 11 13 15 11 13 11 12 8 8 8 8 8
8 13 10 13 11 10 8 8 8 8 8 8 9 13 10 11 11 12 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 15 11 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10
10 8 9 10 9 17 15 12 10 9 9 10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 19 11 12 12 10 11 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11
15 12 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 |