Query= MSMg01no216_k17.b1 MSMg01no216_k17.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no216_k17.b1 PHD_FILE: MSMg01no216_k17.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
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(663 letters)
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Query: 181 atgatcatttatattcatgcaaatgtatgttaatttgttattttatctctaatttatctc 240
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Sbjct: 381 atgatcatttatattcatgcaaatgtatgttaatttgttattttatctctaatttatctc 440
Query: 241 tttaatttttattatatttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgcctgtgtg 300
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Sbjct: 441 tttaatttttattagatttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgcctgtgtg 500
Query: 301 tatgtatatgtgtgtattagaaaatcgttgcctggagtatgttctagtatcaccccct-- 358
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Sbjct: 557 ttagaccatatagagtacctagattgaaatcaaaatatcagattaggtagcaagcaattt 616
Query: 417 tactctctgacttatcacctcattcctgatgaattttattatcctattaccttatagtgg 476
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Sbjct: 617 tactctctgacttatcacctcattcctgatgaattttattatcctattaccttatagtgg 676
Query: 477 aatgtaaacatttttcattttataaaaatgtttgcagtaatgtttggagtaatagcttca 536
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Sbjct: 677 aatgtaaacatttttcattttataaaaatgtttgcagtaatgtttggagtaatagcttca 736
Query: 537 gttaccaatatatataggagtatatgtatatatatattctctttcatattatgtacttaa 596
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Sbjct: 737 gttaccaatatatataggagtatatgtatatatatattctctttcatattatgtacttaa 796
Query: 597 atgctcaagcatttttatgttataaagcttaatatatttttaatattttgacacatattt 656
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Sbjct: 797 atgctcaagcatttttatgttataaagcttaatatattttcaatattttgacacatattt 856
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Sbjct: 857 tataatt 863
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Lambda K H
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Effective search space: 687609
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| Query= MSMg01no216_k17.g1 MSMg01no216_k17.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no216_k17.g1 PHD_FILE: MSMg01no216_k17.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 20:43:45 2005
(349 letters)
>mm_chrX_64944331_64945079
Length = 749
Score = 346 bits (179), Expect = 1e-99
Identities = 281/351 (80%), Gaps = 67/351 (19%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tttatattcttttatggtaactgattatgagggagaaaatcaaagttgtcttggatatct 60
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Sbjct: 269 ttatatacatgatataaaataattaccatattgacttggacctttcttttctctacatca 210
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Sbjct: 209 agtagtggaatatatatatatatata------tatatatat---atat------atatat 165
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Sbjct: 164 -----atatatat--atat--atata--tatgg-----------tatatgt-------ac 134
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Sbjct: 133 -agatatatcattcatata-a-------------------atatatatatgtatacatat 95
Query: 301 gtaggacatttcatatacttgtgtataaatgatatatat--gtgtatgtat 349
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Sbjct: 94 gtaggacatttcatatacttgtgtataaatgatatatatatgtgtatgtat 44
Score = 112 bits (58), Expect = 3e-29
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Strand = Plus / Plus
Query: 130 atatatatatatatataca--cacatatatatatggtatatgtacaga--tatatca--t 183
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Sbjct: 30 atatacatatatatatacatacacatatatatatcatttat--acacaagtatatgaaat 87
Query: 184 -tcatatatatctatatccatatagatattgatat--atagatatatatgtgatatatac 240
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Sbjct: 88 gtcctacatatgtata--catatatatatttatatgaat-gatatatctgt-acatatac 143
Query: 241 cagatatatcattcatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatacatat 300
|| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct: 144 catatatat-at--atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 200
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 271
Number of extensions: 41
Number of successful extensions: 41
Number of sequences better than 10.0: 1
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Number of HSP's successfully gapped: 9
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Effective search space: 251600
Effective search space used: 251600
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
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