BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-231H04.T7 (MSMg01no231_h04.b1) | MSMg01-231H04.TJ (MSMg01no231_h04.g1) |
ACC | AG398260 | AG398261 |
length | 721 | 731 |
length of high quality (start - end) | 316 (45 - 360) | 292 (77 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no231_h04.b1 PHD_FILE: MSMg01no231_h04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:47:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no231_h04.g1 PHD_FILE: MSMg01no231_h04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:47:44 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCACAATCCCCGACATTGTCAAGAACTTAATATGAAGAGACTGCACCA
CTGCCTATATTCAATTGTCTGCCAACGCCTCATGTATGATCATGCATCTA
AATGCCTCCATAAAAGTGTTACCGAATTCTGGTTTCCAGCAGATGAACAT
GCATTGTTTCATGGAAATATGTGTGTATGTGTTGGTCTACTATACCTGGT
TATATGTATAACATTACCTATATACTTGTGAATATACATATACTTTGCTT
TATAAAATAGTCTTTAAATGAGCCTCATACTACAATTCTGGATTTGATAC
TGAATGTGTATTTTTTAATGCCACTCTCCTATTCTGTTACCAGAATAATC
TTTTATCCAATTGCATAACCGCACAGGCACAGATTAGTCTTATTATCACT
ATCTGATAGATGGTCAATATTTCTATTAACTACTCAATAAATTTAACATT
ATTTAGTAGTTAATATATATTCACAATTCCTTTCCATTCATCCCATGTCA
TGTTCCCTGGATACATAGGAAAAAGTCTGCCCTTAATCTCTACATCTGAG
GTCTGAAAAGATAATTCTAGGAGAATCATTGTACTTCTTGTGGAAAAGAA
ACTGATGTCCATGTGGCTTTTAGGTCTGAAAATCAAAGTGTGAGATGCTA
TTCATTTGTGGCTGCAGATCA
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGGCCCACACCTAAACGTGATAA
AAGCAATCTACAGCAAACCAGGAGCCAGCATCAAAGTAAATGGAGAGAAG
CTGGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTCTC
TCCCTACCTCTTCAACATAGTACTTGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCCAC
AACAAGAGGAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAAGGAGGAAGTCAAAATA
TCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTC
TCCAGAGAACTCCTATTTTTTGATAACCCGCCCCCCCCAAGTAGCTGGAT
ATAAAATAAACTCAAACAAGCCCCCGCCCTTTCACTACACAAAGAATAAN
CAGGCTGAGAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAA
TAGTATAAAATATCTCGGCGTGACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGT
ATGATAAAAACTTCAAACCTCTGAAGAAAGAAATTAAAGAAGATCTCAGA
AGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATGGGCAGGATCAACATTGTAAA
AATGGCTATCTTGCCAAAAGCAATCTAAAGATTCATTGCAATCCCCATCA
AAATTCAAACACATTCTTTCAACGAATTAAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 9 9 9 9 16 25 39 34 33 32 32 28 28 37 23 23 22 24 24 28 39 44 35 30 30 30 35 36 57 44 43 36 36 36 36 43 43 29 29 14 19 19 42 34 68 68 47 47
47 47 68 68 68 68 51 51 51 57 68 68 68 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
50 50 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 31 32 20 20 20 31 32 47 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 35 14 13 9 9 8 12 14 10 10 10 10 14 19 22 10 11 11 9 9 9 9 9 11 11 11 12 19 20 29 26 39 41 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 39 32 26 15 14 12 12 12 12 13 26 26 20 18 17 17 15 23 14 14 14 20 20 12 21 24 47 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 57
59 59 59 59 59 59 59 57 57 43 44 43 37 39 40 47 47 37 37 37 37 37 41 43 44 44 39 37 37 39 39 39 41 41 41 41 41 41 41 39 38 34 35 39 39 44 47 47 41 41
48 48 47 59 39 39 39 39 39 39 34 37 37 43 34 39 43 43 43 43 43 43 43 50 50 50 50 50 42 41 39 39 37 31 21 28 13 15 13 24 24 39 43 48 43 43 37 36 36 43
43 39 39 40 37 37 32 31 25 29 24 29 41 37 34 28 28 22 15 13 14 15 17 18 32 37 39 39 37 37 37 37 39 41 37 37 43 40 43 36 31 28 31 34 41 39 27 27 9 9
9 12 12 24 20 21 19 25 16 15 10 8 8 10 10 11 16 24 28 20 18 15 15 12 15 17 16 14 14 16 11 10 17 19 15 16 10 10 10 13 16 16 14 17 24 26 10 10 8 8
8 10 13 16 15 15 13 10 10 10 10 11 15 16 17 14 24 17 16 19 10 8 8 8 11 10 12 9 10 9 9 8 14 10 10 10 15 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 9 10 8
8 8 8 8 8 15 19 13 10 8 8 8 8 15 12 9 9 9 12 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 14 15 8 8 8 8 17 19 34 35 39 41 47 41 41 41 50 50 53 53 57 53 50 50 57 57 53 53 44 43 36 36 43 39 39 37 30 32 32 42 42 43 36 36 36 43 43
54 54 54 54 54 57 54 54 54 54 54 42 50 41 41 46 46 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 50 50 50 50 50 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 57
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 59 59 39 28 36 28 30 33 41 41 47 42 43 47 48 48 48 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 57 57 57
57 57 57 48 48 48 48 48 41 39 39 23 18 10 13 12 16 18 12 15 10 11 11 8 8 6 6 7 6 6 7 9 13 22 12 14 11 10 11 11 16 30 41 59 46 48 59 48 48 48
48 48 48 48 48 48 48 59 59 53 50 50 50 43 43 36 39 37 43 28 20 8 10 8 8 8 8 11 21 19 15 12 12 12 11 11 11 11 10 10 10 20 20 37 39 30 20 12 3 0
3 11 11 21 19 25 28 34 34 39 43 43 43 47 43 43 43 43 37 37 43 43 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 48 43 43 43 43 48 48 34 34 23 23 23 37 37 43
39 39 42 35 35 40 40 43 43 36 36 37 47 47 48 46 46 39 37 35 33 33 33 30 33 37 34 30 18 22 19 28 27 28 31 39 41 41 41 40 40 40 43 43 40 40 37 37 28 35
35 39 37 43 36 36 43 39 40 39 30 19 20 12 20 21 40 59 43 41 41 41 32 29 27 32 24 26 28 28 16 20 25 19 20 19 28 13 13 10 10 10 10 12 9 9 9 10 16 20
22 24 28 30 13 11 9 9 9 14 17 25 25 34 19 23 16 15 11 11 24 11 11 11 21 18 19 30 21 17 14 24 21 25 10 9 8 8 8 11 13 18 37 34 30 23 14 14 10 10
11 11 13 10 8 10 9 10 10 12 8 9 8 8 8 10 12 26 24 17 15 15 19 15 14 13 10 10 10 10 10 8 8 8 11 9 10 11 10 10 11 11 11 22 25 22 15 10 8 8
8 8 9 10 10 9 8 8 11 8 10 12 18 10 10 13 13 16 24 17 18 14 16 14 18 18 24 37 36 32 29 |