BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-324N06.T7 (MSMg01no324_n06.b1) | MSMg01-324N06.TJ (MSMg01no324_n06.g1) |
ACC | AG442873 | AG442874 |
length | 773 | 766 |
length of high quality (start - end) | 377 (45 - 421) | 549 (78 - 626) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no324_n06.b1 PHD_FILE: MSMg01no324_n06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:09:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no324_n06.g1 PHD_FILE: MSMg01no324_n06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:09:14 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCGAGAATCCGCGG
AATTCAGGCATCCTTACTCTTCTGTTGTCCTTTCTTCCCAATCAGCGATT
TGTGGATGTGTCCAGTGACACCACCACCAGCAATGATAGCCTTTGTCAGA
GAATCCAATTCTCCACTTATAGCAAGTTGCAAGTGAAGAGGGGTAATACA
CTTTACCTTTAAGTCTTTTTGGGGGGGGGATTTTTTTTAATTAGGTATTT
TCCTCATTTACATTTCAAATGCTATCCAAAAAGTCCCCCATACCCTCCCC
CCACCCCCTACCCACCCACTCCCACTTTTTGGCCCTAGTGTTCCCCTGTA
CTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATG
ACCTACTAGGCCATCTTTTGACACCTATTGCAGTTAGATACTAGAGCTCC
GGGGTACTGGTTATATCATAATGCTGTTCCTCCTATATGGTTGCAGATCC
CTTTAGCTTCTTGGGTATTTTCTCCTAGCCCTTGTTTGTTGGACCTGCTG
ACCATCCCATAGCTGACTGTGAGTATCCTCTTCTGTGTTTGCTAGGTCCC
AAGTATTCCCACTTAAGACTGCCATATCATGTTCCTATCCCCCACTTTTT
TTCTTATGTCTGCTTTGACGTTCACTTTTTTGCATTCCGATATTTGCTTT
GTTTTCCCCGTTATCAGGTAACCGCTCTTACTGTAACCCTTCTCCTTTGT
AATCTCTCCCCCTACTTTGCCTT
| CCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTACAGCTGATAAACAAATTAAC
AAAGTGACTGGATATAAAATTTACTCAGATAAATCACTATCCTTCTTACA
CTCAAAGGATAAACAGCCTGGGAAAGAAATTAGGGAAATGAAGGGTGCTT
CACAATAGTCACAAACAATATAAAATATCTTGGTATGACCCTAACTAAGC
AATCCTTGACCTCAAGCTGTACTATGGAGCAATAGTTATGAAAACTGCAT
GATATTGGTACAGTGACAAGCAGGTAGATAAACGGAATAGTATTGAAGTC
CTAGAAATGATCCCACACACCTATGGTCATTTGATCTTTGACAAAGGAGC
TAAAACCATCCAGTGGAAAAAAAGACAGCATTTTCAGCAAACGGTGCTGT
TTCAACCTGAGGTCAACATGTAGAAGAATGCAAACCAACCAAAAGTTTGG
GAAATGATCTTTACCAACCCTACATCTGATACAGGGCTAATATCCAATAT
ATATAAAGAGCTCAAGAAGGTAGACTCCAGAGAAACAAATAACCCCATTA
TAAATTGGGTACAGAGCTAAACAAAGAATACAGAATGGCTGAGAAAAAAC
TAAAGAAAAAAAGTTCAACATCCTTAGTCATAAGGGAAATGCAAATCAAA
ACAACCCTGAGATTCCATCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCACATA
CTCAGGTGACAGCAGA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 13 16 31 39 33 32 30 28 28 37 37 30 27 15 23 10 10 11 27 21 28 28 28 25 27 28 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 18 30 34 34 31
31 31 31 36 36 36 36 31 44 41 40 39 39 37 19 15 9 9 9 21 25 39 39 40 40 42 48 50 53 53 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 53 53 50 48 48 50 50 50 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 57 59 57 59 59 59 57 57 57 68 68 68
48 48 46 46 46 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 68 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68
62 62 62 62 62 59 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 52
43 43 41 35 35 43 59 41 44 23 23 23 43 43 52 52 57 57 57 57 44 44 28 23 23 27 44 44 59 43 32 27 32 32 44 44 57 57 50 50 37 37 37 43 43 25 21 10 10 10
17 24 36 27 27 27 23 36 36 42 36 32 23 23 23 28 32 36 32 25 25 36 25 25 25 32 24 27 14 15 14 18 18 25 32 33 46 46 48 54 57 43 43 36 26 30 19 28 28 37
32 43 39 39 36 33 29 23 23 20 18 17 19 19 31 31 30 21 15 14 14 12 15 11 15 10 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 12 12 12 11 11 12 15 28 32 39
30 28 17 17 18 19 15 10 10 9 9 10 10 10 11 11 10 11 16 18 11 16 11 13 9 10 10 8 8 10 8 8 7 9 9 14 13 15 12 13 15 18 17 20 14 14 14 28 28 28
23 20 18 15 12 10 10 10 10 24 24 24 15 9 9 9 9 13 13 10 10 8 10 8 18 15 10 8 8 11 8 8 8 8 8 10 22 15 13 12 8 8 8 8 14 13 6 6 6 6
10 6 11 10 10 13 8 8 8 8 8 10 17 19 16 12 11 14 11 12 12 15 16 19 19 13 13 8 8 8 15 23 31 27 17 13 13 13 17 11 10 11 18 13 13 13 11 12 11 10
8 8 8 8 13 10 10 8 17 11 11 11 10 9 9 10 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 17 15 8 8 8 8 9 8 8 8 10 12 9 10 12
9 9 8 8 8 8 8 11 13 14 16 22 17 12 10 11 11 6 6 7 7 10 8 10 8 8 10 16 10 8 8 6 6 6 8 8 10 13 8 8 9 9 9 12 12 10 10 10 10 10
8 8 10 11 13 17 15 12 12 11 11 9 9 8 8 8 9 10 9 9 7 8 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 17 21 11 11 10 10 8 10 12 13 8 9 8
8 8 8 8 8 8 10 10 12 9 8 8 8 8 8 8 14 9 9 9 9 12 10 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 8 15 21 37 41 41 41 41 41 44 39 39 41 42 50 50 48 48 42 47 47 41 33 27 9 7 7 7 8 7 9 9 9 9 11 11 10 10 15 18 30 23
33 33 33 33 36 53 57 53 53 50 50 33 22 12 17 8 8 8 10 11 9 9 9 19 19 30 31 59 37 41 41 47 47 38 47 50 53 53 53 53 53 50 50 50 53 53 53 53 53 50
54 54 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 47 57 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50
50 50 68 68 68 68 48 48 46 42 46 46 57 57 57 57 59 57 59 54 54 54 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 59 59 59 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 59 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 52 52 62 52 52 52 52 62 62 62 62 44 44 26 26 26 26 26 23 23 27 35 39 43 43 43 45 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62
62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 62 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 59 52 52 52
57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 43 43 35 43 43 35 35 43 43 52 43 43 33 33 32 35 35 35 43 47 57 57 59 59 57 54 54 54 57 57 54 54 50 50 48 46 50 44 43 43
57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 57 44 47 41 41 41 47 42 47 50 50 50 47 48 48 48 48 47 47 47 47 48 47 48 48 48 59 59 59 59 68 68
59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 43 39 32 32 32 36 31 34 32 28 23 32 34 59 59 47 47 40 41 37 36 32 31 36 41 41 41 47 47 47 47 43 43 48 48 48 57 37
39 32 32 28 37 37 40 37 37 37 37 37 37 32 34 25 24 22 26 30 35 35 35 35 39 43 37 32 28 28 23 22 22 23 23 28 33 33 43 43 48 48 57 44 44 36 28 28 28 23
23 23 23 34 34 31 20 18 27 26 26 20 20 20 32 32 43 34 32 29 24 19 16 16 16 16 12 14 15 23 21 19 19 15 22 22 20 14 17 18 30 18 16 24 24 24 22 23 12 12
15 21 16 30 39 34 36 37 19 15 8 8 8 8 9 11 13 13 34 30 30 27 28 29 37 26 30 17 17 18 25 24 31 31 31 22 24 14 14 19 19 28 28 30 35 37 27 25 25 19
19 19 15 15 15 19 25 25 21 19 11 10 17 16 14 18 23 37 37 32 30 17 18 16 14 11 12 14 14 22 28 25 15 13 14 11 9 9 9 12 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8
13 16 22 20 17 16 19 19 15 15 15 15 24 15 14 14 |