BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-334E12.T7 (MSMg01no334_e12.b1) | MSMg01-334E12.TJ (MSMg01no334_e12.g1) |
ACC | AG449817 | AG449818 |
length | 709 | 710 |
length of high quality (start - end) | 508 (61 - 568) | 425 (58 - 482) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no334_e12.b1 PHD_FILE: MSMg01no334_e12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:21:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no334_e12.g1 PHD_FILE: MSMg01no334_e12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:21:39 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (105,703,465 - 105,703,862) | (105,531,896 - 105,532,320) |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCATAAGGATCCGCGGAATTCTCTACT
ATCCTATGAAGGATATTTTTTCTCTATATTTTTAGAGATATTGGCTTGTA
GCTGACTTTTCTTCGATTATTTTGACATTGGTATGAATGTGAACTATAGA
CTAATTTAGGAAGTGCTTCTATTTCTATTCCATATGTCACCAAACTCTAA
TATGCATTTTTATATTTCTTCTATTATCTTTGGAAATGATTTGATATTTT
TAAACTCCTCCTTCCGATCTGGGCTAGTGCCCTGAGCAGACATTGGGCAC
ATACTTTGCAGCCAGTCCCACAATATCCAGAGGAAGCTCCAATCCCAGGT
GCTCTAACACTCCCAGAATCATAGGATCAGAGGTGAGGAGCACACATCAT
CTGCTCCATCACTGGGAGTAACTGGGACTAGTGGGACCCAGGTACCCAAG
ATTCTAACCAGACCAGTAGCACTGGTTCCTTCTGGTATGGGCCGGTGCCC
TGAGTAGACCTTGACCACAAACTTCGCAGCCAATATTACAACATTCAGAG
GAAGCTCCACTCCCAGGTGTTCTAATATGCCCAGGATCACAGGATCACAA
GATCATAGTACTCACAGGATCACAGGATCACAGGATCACAGGATCACAGG
ATCTCAGGATCACAGGATCTCAGGATCACCGGACCTTGTTCACTCCAAGA
TCTCAGGGT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTACCAA
AAAAATTCAGAAAGTGAGCTTGGAGGTCAATTTTAAAGAAGAAATAAATA
GAAATCCTTTGATGGATTTAAAAAGTAGATTCTAAAACTCATAGGAAAGG
TTAAAAATAATAATGCAGTAAATACTGTGGGAGATTTAAAAGGGAATACA
TTCCCAAGAGAAATAGAAAACATAGAATACAAAAGACAAGGAAAATCAAC
AAGTAATTTTTATATTTTTTATATAATATAGTAGGCTTAAAAGCAATAGT
TTTTTTTTGGATGAAGATCATCATGTATATTTTTTAAACTTCATAAAGTT
ATAATAAATATAATACCTATAACTCTTGGTGGCTAGAAAGAGTTTTTAAA
TTATCACAAGGTCTGCTCCCAAAGAAACAGTTTGACTCTTGACAATTAGA
CATTTGTATGTGACTCTAATAACGAATGAAATATAGTAGGTCAGAATAAA
TATATAATGTAGAGAGCTACTCATAAATCCATCAAGAGATATTTATATGA
CCTACTGTCTCTGAACAAGAATTTATGAATGTTATGGCTATTACAACTTT
ATTTTTTGAAATACACCTCCAGAGATATTTATTATATATAGGTTATAGAA
TACAATATTTGCGTGACTTTTTCTGGGGATACTTAAAGTAATATCCACTA
CTCTAGCTAT
|
quality values | Open.Hide.11 11 25 25 37 21 21 10 10 10 21 21 47 48 46 30 27 22 17 16 8 9 9 12 8 6 7 7 7 7 8 10 10 13 17 25 33 41 31 31 31 31 33 33 41 28 28 12 12 9
11 11 12 11 11 11 16 16 19 19 15 21 29 29 36 35 53 53 59 57 57 57 53 53 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 57 39 59 59
34 34 23 30 37 37 32 31 28 30 28 32 32 37 37 39 57 57 57 57 68 68 68 51 50 51 57 57 57 54 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57
57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 51 51 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 57 57 44
44 39 43 43 43 38 28 12 12 12 15 24 38 44 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 50 50 39 39 39 43
43 52 52 59 50 39 41 39 43 50 59 59 59 50 43 39 39 43 59 59 59 59 57 57 57 59 57 48 48 44 44 44 44 44 44 43 43 42 42 37 37 43 59 59 59 59 48 48 48 59
59 59 59 59 59 57 48 44 44 43 57 57 39 39 30 32 32 43 43 47 59 39 36 36 19 19 17 24 24 30 27 31 41 19 19 22 31 28 33 25 28 28 35 39 40 40 43 40 39 30
30 39 39 39 48 48 59 39 39 35 35 30 39 37 37 25 21 12 12 12 19 28 34 37 37 39 43 48 59 59 59 43 43 43 43 43 43 37 32 23 23 23 32 32 35 35 35 42 39 48
43 43 43 33 33 28 28 37 44 44 48 42 42 32 32 25 28 36 36 43 44 44 44 59 48 48 41 37 28 28 28 31 33 28 30 39 31 31 36 42 42 36 43 42 42 32 32 35 35 42
40 48 48 57 57 39 37 34 31 31 20 28 28 27 21 19 14 10 11 14 20 19 21 22 18 22 20 26 28 25 27 30 32 29 23 31 28 25 28 28 28 22 28 16 21 14 22 22 24 24
28 28 34 28 28 20 20 20 19 29 24 24 12 19 19 28 28 34 32 27 15 16 15 19 19 28 19 19 15 17 17 20 13 24 21 26 17 25 28 24 27 15 16 18 11 11 12 21 23 30
26 26 13 13 13 16 21 22 18 15 11 11 13 17 13 13 8 8 8 8 9 19 13 13 10 10 10 14 9 8 8 15 6 7 8 12 14 10 11 10 10 12 12 12 13 10 8 8 8 8
10 16 13 10 9 9 9 9 9 | Open.Hide.37 39 39 39 39 46 46 47 59 29 27 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 10 11 12 27 23 33 33 33 33 33 33 41 27 27 12 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6
10 13 16 25 12 13 13 18 21 30 33 33 37 41 41 47 47 48 57 57 57 57 57 50 50 53 53 50 50 50 50 48 44 46 46 46 57 59 59 48 59 57 57 50 47 21 17 8 8 8
8 10 12 11 9 9 9 16 22 32 43 47 47 37 37 41 47 47 50 59 59 59 50 50 47 47 42 39 39 39 42 48 57 57 59 54 48 43 43 42 42 42 41 47 47 46 43 39 46 36
46 46 47 48 47 47 50 50 50 50 50 41 41 47 42 41 57 46 54 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 42 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 50 50 41 50 50 50 50 54
57 57 50 50 52 52 52 44 43 47 47 50 50 57 50 43 43 37 37 39 43 42 42 37 35 39 43 43 39 32 30 20 15 12 12 12 12 18 24 36 43 46 41 41 41 42 37 37 43 44
57 47 48 48 48 48 48 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 53 53 50 48 48 54 57 57 59 59 57 43 37 28 28 28 37 37 50 50 50 50 50 57 59 59 48 48 39 41 36 36 22
27 16 14 16 19 15 10 9 9 9 11 23 25 34 30 28 28 32 37 39 48 43 34 33 25 25 43 43 39 48 48 48 48 57 57 48 48 48 54 48 57 37 37 19 22 18 20 20 28 34
37 43 37 31 23 20 20 20 23 28 32 42 42 54 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 43 43 42 42 37 37 37 30 30 20 28 28 32 36 35 35 35 47 59 44 43 37 37
42 43 43 43 43 36 28 28 25 43 38 38 38 43 43 52 52 43 43 35 35 35 36 43 43 43 32 28 28 32 33 35 42 43 43 57 52 43 43 35 27 21 13 13 13 24 27 18 15 11
18 18 43 44 50 35 35 43 43 42 43 52 50 59 43 43 38 22 17 14 18 12 12 23 32 27 29 27 27 20 20 20 24 18 12 12 15 12 12 12 21 32 31 31 20 27 27 30 28 28
23 38 23 25 25 30 27 32 19 15 12 12 12 23 21 32 32 43 43 48 42 36 23 16 19 12 16 15 18 10 15 10 12 13 21 24 31 28 30 31 37 24 24 20 20 20 31 31 34 39
33 32 33 33 33 37 31 28 20 20 20 25 25 22 25 30 37 26 18 12 14 14 22 20 30 26 13 8 8 8 8 13 19 20 24 33 30 33 18 19 25 21 17 11 14 15 24 19 16 20
15 15 12 12 15 28 26 17 14 12 9 9 9 11 11 12 12 10 9 8 8 8 8 10 22 22 16 14 14 16 20 23 23 23 9 9 9 10 12 10 13 10 10 10 10 12 18 28 20 15
15 9 9 9 10 10 9 9 10 15 12 11 11 15 19 19 14 14 14 19 21 24 24 21 14 14 15 17 11 11 11 17 9 9 8 8 15 15 15 8 8 10 15 13 13 15 15 14 11 11
11 11 10 10 15 11 6 6 6 6 |