BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-359N10.T7 (MSMg01no359_n10.b1) | MSMg01-359N10.TJ (MSMg01no359_n10.g1) |
ACC | AG469158 | AG469159 |
length | 777 | 767 |
length of high quality (start - end) | 379 (45 - 423) | 378 (58 - 435) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no359_n10.b1 PHD_FILE: MSMg01no359_n10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:54:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no359_n10.g1 PHD_FILE: MSMg01no359_n10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:54:25 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAAACTCAGTATT
TAGGATCTAAACTTCAAGAAAGGAATGGAAAGAATCCAAGGTACCTACCC
AGAGTTTACAATTAGAGATTTCAGACACAGACCAGGTGAGGTGGCACAGG
CCCATCATCTCAGCTATTCAAGAGGATCACCTACTCAAGGCTAGCTTAGT
CAACCTGGTGAAGTCTTTGTCTCAGAATAAAATGGAGTTTGTGGATGTAG
CTCCATGGTTGAGTACTTTACCTACATCTCATATGTATAAGACCTAATAC
TTACTATCACACACAAATACAGAAAAATCTGGGGGCTGGAGAGGTAGTTG
GGCCAGCAAAGTCCTTGCAACACAAGCACGAGGACCTGAGTTTAATTCTC
AGAATGAACACACACACACACTAGCTGTACAAGTTGGCCAGGCAGTAGTG
GCACACACCTTTAATTCCAGCAGGGTCAGAAGCATGCATATGCCTGCGCT
CCATGCCTGTTTGGTTGGTCTACATAGCTAGTTCCAGAACAGTCAGGTTA
CACATACCCCGGGCTGGTGGTCAAAAAAACAAATGTGCGCCCGAGACGAC
CCTCCGGTCTAAATCTTCGGTCCTTTTTGGGCAACACCCCGCCCCCGTTT
TTCCCTTTTTTCCTATGCAANACCCGGGTTTCCTACTCTTTGCCGTCAAT
CCGCCTCTCCTTTCATCTCATTATTCTCCGCCCATTATTTTATCCGTCCT
CCTTTCATTGTTACTTTTTACCCTCGT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXTGGGAACTATGTGTCCATCTTTACTTCTAGCATTAACAAGAGG
ATCCCATGACAATGAAAGATGGCAGCAGAAGCAGGAACAATAACAGCAAA
ATGCATGTACTTACCAACAAGGAGTAAAGGGGACGCAGTCAAAGCAGTCT
TGATTTTTTCTCAGACTCTTGATACATGGGCCACTGGCACTGTACTATCC
ACTCAGGGAAAAAGTCTTCTCTTTTGTGTAATGGTTTTCAGGAAATACCC
TCACAAAACCCAGATCTAATTAAGTTGAAAACAAGATTAATATCATACAT
AACTCTTAACATTTAGTATGGTGGTCATCTGCCATAAATGGCATTTACTC
CTCATTGGTGGAAATTTTTAGTTGCTTTTTTATTCTGTCACCCGCGCATG
TTTATACTGCACAATATTTGATACCCTGCCCCCACACCCTTTCCTTATTA
CTTTACCTCCCTTTCTGTCCTTTCATCCCCCTTTATTTCCCTTCCTTCTT
TTTGTCCATCATTTCTCTCCCTTCACTCTTTTATCTTTCCCCTTTTTTTT
CACTTCCTTTTTTTTTTATCTTCCCCTTTCTCCCCCCTCCCCCATATCAT
TCCTTTCTTCTCTCTCCCCTCTCTATATTTTCTCTCTTTACCCTTTTTTC
CTCTATTTTTTCTTTTTTACCCCCCTTTTTTTTTCTTTTCTCCTCCCCCT
TTTTTTTTTCCTCCTCN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 16 28 19 10 8 8 8 8 14 8 8 8 8 16 19 39 37 13 12 10 10 10 19 28 39 39 19 10 10 10 9 12 14 15 19 28 26 25 23 22 22 30 37 37
37 37 32 32 37 44 39 41 42 42 42 42 33 33 28 27 25 29 36 41 44 59 37 30 31 31 31 31 41 50 48 36 30 35 32 35 36 47 47 53 59 59 59 59 59 59 57 48 48 50
50 50 50 57 57 57 48 48 47 47 47 42 50 54 54 41 50 50 68 50 50 50 47 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59
59 57 52 52 59 57 57 57 57 57 57 50 43 37 37 43 59 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 44 44 47 47 50 43 43 43 57 50 50 59 50 35 35 43
42 57 46 47 47 43 42 42 35 32 36 30 35 39 59 34 42 30 42 42 42 42 43 43 43 36 40 26 26 30 30 28 28 28 28 30 37 44 42 48 48 40 43 29 30 28 37 28 28 28
24 24 37 42 42 43 39 43 33 37 34 25 23 26 24 23 30 32 28 20 20 20 20 18 21 18 18 18 21 15 15 12 13 10 10 12 11 16 14 21 18 21 18 16 16 12 11 11 12 20
20 24 24 17 17 15 16 24 26 27 34 18 16 12 9 8 10 18 14 16 13 11 10 8 8 8 8 10 9 12 12 12 12 14 10 8 8 8 10 7 7 6 9 9 19 16 15 12 12 12
9 8 10 10 10 10 8 8 8 8 9 15 11 10 9 8 8 8 10 8 8 12 8 10 8 8 13 9 10 10 10 10 18 13 10 8 8 8 8 11 12 10 13 15 19 17 13 14 9 8
8 8 8 8 8 10 15 12 11 11 11 8 8 8 13 10 9 9 8 8 8 8 8 19 24 30 21 22 11 11 11 10 10 10 10 10 8 8 8 9 8 8 10 10 8 8 6 10 6 6
8 8 10 13 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 8 9 11 9 9 9 9 9 9 7 6 6 6 8 10 13 10 6 6 6 8 8
12 13 12 12 16 24 28 28 13 12 8 8 8 8 9 8 8 8 7 3 0 3 10 13 10 10 10 10 9 13 18 19 15 10 10 10 12 10 13 15 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 9 9 9 10 12 14 10 11 6 6 8 8 10 8 8 8 6 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
8 10 8 11 8 8 8 8 9 10 11 9 8 8 8 12 8 11 9 9 10 9 8 8 8 8 8 | Open.Hide.10 10 15 10 12 21 22 30 37 37 37 28 24 22 18 19 30 34 34 30 22 22 22 28 23 34 30 26 26 32 27 29 30 37 33 33 37 37 37 39 39 35 27 29 37 37 37 37 47 47
47 33 33 36 47 38 38 48 48 48 47 57 57 57 53 48 47 48 57 57 36 36 42 42 42 47 54 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 54 54 57 59 50 51 50 50 50 50 59 57 57
57 57 57 57 57 57 54 57 47 47 47 41 44 44 46 47 47 47 47 42 42 37 43 43 57 44 43 43 57 57 57 48 48 48 50 50 54 54 57 57 57 54 52 52 52 52 52 52 52 57
52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 52 52 57 59 62 62 62 62 62 52 52 62 62 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 52 59 57 59 59 59 57 57 52
52 52 57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 59 57
57 52 52 52 57 57 57 59 68 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 59 48 44 44 43 44 44 44 43 42 42 42 42 43 57 44 48 48 48 48 48 48 57 48 57 48 57 48 48 48
48 48 54 57 57 57 57 48 59 47 47 47 42 42 39 39 39 39 34 30 18 18 19 19 20 20 32 32 59 59 57 57 59 59 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 46 37 37 30 30 30
37 37 30 30 28 30 30 37 15 15 6 6 8 15 17 41 41 39 37 30 22 17 17 25 31 47 48 43 37 28 20 15 10 10 10 16 16 19 15 13 8 8 10 10 10 9 11 11 16 16
16 16 14 16 15 12 12 13 10 8 6 6 6 8 11 12 12 11 15 8 8 6 6 8 8 9 10 10 13 10 11 11 12 11 11 12 11 12 12 21 15 18 22 17 12 7 6 6 8 8
8 6 7 7 7 8 8 8 8 9 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 15 14 9 9 9 8 8 8 8 8 22 17 13 10 11 10 10 8 8 10 10 10 20 20
21 15 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 15 8 8 10 10 9 9 9 10 11 10 10 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 11 23 15 17 19 18 10 13 10 10 12 10 18 14 14
8 8 8 8 8 10 10 8 12 16 19 24 15 20 15 12 8 8 8 8 8 11 22 20 12 12 9 8 8 8 6 6 8 8 10 11 13 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 8 16 13 11 9 9 9 8 8 8 6 8 6 6 10 9 12 14 11 10 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 13 8 10 8 15 13 16 12 11 10 13 20 15 15 17 19 19 12 8
8 8 8 8 9 10 12 12 17 14 14 9 9 10 14 17 15 9 11 11 11 11 11 14 12 15 14 14 19 24 26 26 15 15 11 11 11 15 23 23 21 16 12 16 16 18 9 12 9 9
12 12 22 22 22 19 15 14 15 11 10 8 10 10 11 3 0 |