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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-001H05
Chromosome	3 (Build37)
Map Location	98,079,108 - 98,080,223
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Olfr1402, Chd1l, Fmo5, Prkab2, Pde4dip, Sec22b, EG433632, LOC100042975, Notch2, Adam30, LOC622561, Reg4
Downstream gene	Hmgcs2, Phgdh, Zfp697, LOC100043461, Hsd3b4, LOC100043456, EG545555, LOC676433, Hsd3b5, LOC668543, Hsd3b2, Hsd3b3, Hsd3b6, LOC545556, Hsd3b1, Hao3, LOC668557, Wars2, Tbx15
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-001H05.b	B6Ng01-001H05.g
ACC	DH839765	DH839766
length	1,194	1,102
definition	DH839765\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001H05, 5' end.	DH839766\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001H05, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattcattttttgagatcacagttacccttacacctgaactatacaaaa actcaataataaagagaattacataccaaattccctcatgcataccaata caaaaaaccaaatccaagaacacattaaaaacaatcatctaccatgatca agtacacttcatcccaaaaatgcaggggtggttcaacatacaaaaatcta tcaatgtaatctaccatataaacaaactgaaagaaaataaaccacatgat catctaattagatgctgaaaatgtctgacaaaatcaaacatcccttcatg atgaatgtcttagattggggatacaagggacttaactaaatataataaag gcaaattatagcaagccaatagccagcatcaaatggagagaaactcaaaa acaattccactaaaatcaggaataagacacggctgtccactctctctaca tctatttagtaccatacttgaagttctagttggaacaataagacaattaa aggagagcaaagggctacaaagtggaaagaaagaagtcaaagtatcatta tttgcatatgatgtgatagtatacataagcaaccccccaaattctatcag agaattatagctggtaagcaccttccacgaagtggttggatataagatta acaacaacaacaacaacaaaaatcagtagctggagagatgactcagtggt taagagcactgatcactcttctagaggtcccgagttcaattcccagcaac cacatggtggcttacaaccatctgtattgggatctgatgccctcttgtgg tgtgtctgaagacagctactgtgtacttatatacaaatgacaaatgggtt gagaaagaaatcaaggaaacaatgccatttacaacagccacaaataatat aaaaatcttggggaaattttaacccaacaagtaaagacttgtatgacaga acttcaagtctttgaagaaaaaaatgaagaagatatcagagatagaacat ctcccagctatggatcagtagatacacagtagatgtcatttacccaacat ctacagatcagacattccaatcaatcacacatctacggactggaagacaa ctcactatgcaaatgaaataggatgctaaaatcttgtaagagactcaggt tacattccgatcagctatcagagctatgcacactgcattgaatg	gaattccaggatagaatatgtgtacacaggctggttgatttttgaaactt caatgatgtttgaacacgtttcaacatgcagttgaatgttgccattccag agatgacgtgtctatcacatacacacacacaaagacttttttattaaagc attttaaatgccacattctacagatctctgaaatgtttttggaggaccac ccatctatctaaaatacacttgaataagcaaactgcttttttctagttac ttactttgaaaacacatctaggggtctaatatggcttgttcctgtgatta attatatcagttcttctagataaatattattatgaacctgagtatatctt aggaatttataaatcttgattaaagacaaagaatctagataaatatacat cattagttatctaaattttctagcaccttggtgttgaacaattagcaaag acttgagttgttagacatacatcttaaattagcttttgttaatctgagta gatcttcataacaatttatcctaggtggtctctagcaccccaacaagcca gtccttgccccttagacttaacacctggtactacctagacctaaaatctg acaggtaaaaagcttttgggatgtactaacgtaacaaaaccctagttctc caccaatagaagggccaagattgttgaagatagcatcctccaactttctg taacttgtctctctgatgttctatcaacgtatttcaaaaataccttaatt ttcaactttcttagttttgttagcataaaactccatgaaactgctcccat gttggaccctgtgtttaaagagacctgaacatatgttctcagtcatggtc actcaaattttgtccagaataaacatgtctgttattccttttgatgctag agctgtttcttttgacacacaaaaatccagtctgttagactggatgttta tagtcttctggttttatcaatcgacacattaatatgtttgcattctgtgt gtttgtgcaatagcccaggttccttattcggctcatcatctatgacccca gcttatgtgagcactgctggatcagtcaaaggtgagtcagaactgagagc ag
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ACATCAGAGAGACAAGTTACAGAAAGTTGGAGGATGCTATCTTCAACAAT 433 seq1 CTTGGCCCTTCTATTGGTGGAGAACTAGGGTTTTGTTACGTTAGTACATC 497 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTGGCCCTTCTATTGGTGGAGAACTAGGGTTTTGTTACGTTAGTACATC 483 seq1 CCAAAAGCTTTTTACCTGTCAGATTTTAGGTCTAGGTAGTACCAGGTGTT 547 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCAAAAGCTTTTTACCTGTCAGATTTTAGGTCTAGGTAGTACCAGGTGTT 533 seq1 AAGTCTAAGGGGCAAGGACTGGCTTGTTGGGGTGCTAGAGACCACCTAGG 597 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAGTCTAAGGGGCAAGGACTGGCTTGTTGGGGTGCTAGAGACCACCTAGG 583 seq1 ATAAATTGTTATGAAGATCTACTCAGATTAACAAAAGCTAATTTAAGATG 647 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAAATTGTTATGAAGATCTACTCAGATTAACAAAAGCTAATTTAAGATG 633 seq1 TATGTCTAACAACTCAAGTCTTTGCTAATTGTTCAACACCAAGGTGCTAG 697 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATGTCTAACAACTCAAGTCTTTGCTAATTGTTCAACACCAAGGTGCTAG 683 seq1 AAAATTTAGATAACTAATGATGTATATTTATCTAGATTCTTTGTCTTTAA 747 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAATTTAGATAACTAATGATGTATATTTATCTAGATTCTTTGTCTTTAA 733 seq1 TCAAGATTTATAAATTCCTAAGATATACTCAGGTTCATAATAATATTTAT 797 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCAAGATTTATAAATTCCTAAGATATACTCAGGTTCATAATAATATTTAT 783 seq1 CTAGAAGAACTGATATAATTAATCACAGGAACAAGCCATATTAGACCCCT 847 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTAGAAGAACTGATATAATTAATCACAGGAACAAGCCATATTAGACCCCT 833 seq1 AGATGTGTTTTCAAAGTAAGTAACTAGAAAAAAGCAGTTTGCTTATTCAA 897 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGATGTGTTTTCAAAGTAAGTAACTAGAAAAAAGCAGTTTGCTTATTCAA 883 seq1 GTGTATTTTAGATAGATGGGTGGTCCTCCAAAAACATTTCAGAGATCTGT 947 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGTATTTTAGATAGATGGGTGGTCCTCCAAAAACATTTCAGAGATCTGT 933 seq1 AGAATGTGGCATTTAAAATGCTTTAATAAAAAAGTCTTTGTGTGTGTGTA 997 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAATGTGGCATTTAAAATGCTTTAATAAAAAAGTCTTTGTGTGTGTGTA 983 seq1 TGTGATAGACACGTCATCTCTGGAATGGCAACATTCAACTGCATGTTGAA 1047 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGATAGACACGTCATCTCTGGAATGGCAACATTCAACTGCATGTTGAA 1033 seq1 ACGTGTTCAAACATCATTGAAGTTTCAAAAATCAACCAGCCTGTGTACAC 1097 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACGTGTTCAAACATCATTGAAGTTTCAAAAATCAACCAGCCTGTGTACAC 1083 seq1 ATATTCTATCCTGGAATTC 1116 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATATTCTATCCTGGAATTC 1102

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr3_98079108_98080223
seq2: B6Ng01-001H05.g_70_1171 (reverse)

seq1  CTGCTTCTCAGTCTCTGACCTCTACCTTTGGACTGATCCCAGCAGTGCTC  50
      |||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  CTGC-TCTCAGT-TCTGA-CTC-ACCTTT-GACTGAT-CCAGCAGTGCTC  44

seq1  ACATATGCTTGGTGTCACTAAGATGGATGGAGCCGAATAAGGAACCTTGG  100
      ||||| || ||| ||||   |||| ||| ||||||||||||||||| |||
seq2  ACATAAGC-TGGGGTCA--TAGAT-GAT-GAGCCGAATAAGGAACC-TGG  88

seq1  GCTATTGCACAAACACACAGGATTGCAAACATA-TAATGTGTCGATTTGA  149
      ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  GCTATTGCACAAACACACA-GAATGCAAACATATTAATGTGTCGA-TTGA  136

seq1  TAAAACCAG-AGACTATAAACATCCAGTCTAACAGACTGGATTTTTGTGT  198
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TAAAACCAGAAGACTATAAACATCCAGTCTAACAGACTGGATTTTTGTG-  185

seq1  TGTCAAAAGAAACAGCTCTAGCATC-AAAGGAATAACAGACATGTTTTAT  247
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
seq2  TGTCAAAAGAAACAGCTCTAGCATCAAAAGGAATAACAGACATG-TTTAT  234

seq1  TCTGGACAAAATTTGAGTGACCATGACCTGAGAACATATGTTCAGGTCTC  297
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGACAAAATTTGAGTGACCATGA-CTGAGAACATATGTTCAGGTCTC  283

seq1  CTTAAACACAGGGTCCAACATGGGAGCAGTTTCATGGAGTTTTATGCTAA  347
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACACAGGGTCCAACATGGGAGCAGTTTCATGGAGTTTTATGCTAA  333

seq1  CAAAACTAAGAAAGTTGAAAATTAAGGTATTTTTGAAATACGTTGATAGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACTAAGAAAGTTGAAAATTAAGGTATTTTTGAAATACGTTGATAGA  383

seq1  ACATCAGAGAGACAAGTTACAGAAAGTTGGAGGATGCTATCTTCAACAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAGAGAGACAAGTTACAGAAAGTTGGAGGATGCTATCTTCAACAAT  433

seq1  CTTGGCCCTTCTATTGGTGGAGAACTAGGGTTTTGTTACGTTAGTACATC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCCTTCTATTGGTGGAGAACTAGGGTTTTGTTACGTTAGTACATC  483

seq1  CCAAAAGCTTTTTACCTGTCAGATTTTAGGTCTAGGTAGTACCAGGTGTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAGCTTTTTACCTGTCAGATTTTAGGTCTAGGTAGTACCAGGTGTT  533

seq1  AAGTCTAAGGGGCAAGGACTGGCTTGTTGGGGTGCTAGAGACCACCTAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTAAGGGGCAAGGACTGGCTTGTTGGGGTGCTAGAGACCACCTAGG  583

seq1  ATAAATTGTTATGAAGATCTACTCAGATTAACAAAAGCTAATTTAAGATG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTGTTATGAAGATCTACTCAGATTAACAAAAGCTAATTTAAGATG  633

seq1  TATGTCTAACAACTCAAGTCTTTGCTAATTGTTCAACACCAAGGTGCTAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTAACAACTCAAGTCTTTGCTAATTGTTCAACACCAAGGTGCTAG  683

seq1  AAAATTTAGATAACTAATGATGTATATTTATCTAGATTCTTTGTCTTTAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTAGATAACTAATGATGTATATTTATCTAGATTCTTTGTCTTTAA  733

seq1  TCAAGATTTATAAATTCCTAAGATATACTCAGGTTCATAATAATATTTAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATTTATAAATTCCTAAGATATACTCAGGTTCATAATAATATTTAT  783

seq1  CTAGAAGAACTGATATAATTAATCACAGGAACAAGCCATATTAGACCCCT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGAACTGATATAATTAATCACAGGAACAAGCCATATTAGACCCCT  833

seq1  AGATGTGTTTTCAAAGTAAGTAACTAGAAAAAAGCAGTTTGCTTATTCAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGTTTTCAAAGTAAGTAACTAGAAAAAAGCAGTTTGCTTATTCAA  883

seq1  GTGTATTTTAGATAGATGGGTGGTCCTCCAAAAACATTTCAGAGATCTGT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATTTTAGATAGATGGGTGGTCCTCCAAAAACATTTCAGAGATCTGT  933

seq1  AGAATGTGGCATTTAAAATGCTTTAATAAAAAAGTCTTTGTGTGTGTGTA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGTGGCATTTAAAATGCTTTAATAAAAAAGTCTTTGTGTGTGTGTA  983

seq1  TGTGATAGACACGTCATCTCTGGAATGGCAACATTCAACTGCATGTTGAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATAGACACGTCATCTCTGGAATGGCAACATTCAACTGCATGTTGAA  1033

seq1  ACGTGTTCAAACATCATTGAAGTTTCAAAAATCAACCAGCCTGTGTACAC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGTTCAAACATCATTGAAGTTTCAAAAATCAACCAGCCTGTGTACAC  1083

seq1  ATATTCTATCCTGGAATTC  1116
      |||||||||||||||||||
seq2  ATATTCTATCCTGGAATTC  1102

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