BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-059M23
Chromosome3 (Build37)
Map Location 75,842,741 - 75,990,107
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFstl5
Upstream geneBC050789, Serpini2, Wdr49, Pdcd10, Serpini1, Golph4
Downstream geneLOC100041625, LOC100041635
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-059M23.bB6Ng01-059M23.g
ACCDH880977DH880978
length1,121396
definitionDH880977|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059M23, 5' end.DH880978|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059M23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,988,982 - 75,990,107)(75,842,741 - 75,843,142)
sequence
gaattccacaccagaaaggaaagagcttgagcacggaaaacctcaaagcc
tgaaacaacagttacatgcttcctccaacaagaacaatctcctaacagtg
ctactccacatggtccaagcattcaaacacatgagtgtaagggggccata
cctcttcaaactaccacaggtactcaatcttttttttttataacatagtc
actaaatcaacagcactagctatttaagagaccagcaccattataaatca
acaattacacttattgtacaactacgacattggatatataacccaaaaac
tttggggtatactgttgggagttggtcttgtgcactgtgtatatcccaga
cacaggctttgccacaaatatcaaggaatcttctgtatcaatgttatgtg
aagaacactccccaattatctctgattggttaataagaggcttaccagcc
aattactgggcaaaggatatagaaagactgaacttctgatcccagtcagg
agtcccatagagttttggagaggagaacgagtttgccacaaggcaggtaa
gggtccaattgaataaatgaccaaaaggtggagaaagaagaagatagttg
tcatgagattgggtatgaagagaagtcaccaagaaaactcttcaggagaa
ctgacatctatagcagagttagctgaggagggaatacatgcatggagcca
cagttgtgtggttgggaaatagctaagatagcgtagagggttaggaatat
cttagtcaatgcacgtaaagcttgttgaataaatcaatgggtctctgttt
cagtctaaggatggtatatgaatcccactagacattgcaaacatacaata
tcatacaaacttacatttgtattatattggtttttctaagggcattatgg
agtagtagggaaaataaagtacttataaaataattcatatcaacaaattc
tgattatttgtgtgtggatgaaatttaagaataatagaaagaaagttaga
aaaataacattattatggtgtcatcaatgcagttgtcactatgagttttc
ttttttggttggatgagatgtaaatatgacctaaatatttttcctgaatt
attgaccaagcaagatgtgca
actcagtatagggtaaaacatgttcacaacaggctaaccacatagaattt
tatataatatattccttctcatagactgttctttgcctaaatgaattcac
gcattatactctgctgcattatttagtgttctatttctgtgaaaagaaaa
tgtaagcacaacaacttatagaaggaaatatttaattaatggggtagtac
attatcatggaagtatggaatatattctttgatctgggctgccttgtctg
gcttcagtgagagaggatgtgcctatcccagaagagatttgatgtgccag
ggtggagggtatagtcagcgtgggtcttcaccctctcagaggggatgggg
gatgactatgggagggggctcgaggggggcagaaatggggatgtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_75988982_75990107
seq2: B6Ng01-059M23.b_50_1170 (reverse)

seq1  TGCACATTCTTGCTTTGGTCAATAAATCAAGAAAAATATATTAGTCATAT  50
      |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| 
seq2  TGCACA-TCTTGC-TTGGTCAATAATTCAGGAAAAATATTTAGGTCATA-  47

seq1  TTTACATCTCATCCAACCAATAAAGAATACTCATAGTGACAACTGCATTG  100
      |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATCTCATCCAACCAAAAAAGAAAACTCATAGTGACAACTGCATTG  97

seq1  ATGAACACATAATAATGTTATTTTTCTAACTTTCTTTCCTATTATTCTTA  150
      ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATGACACCATAATAATGTTATTTTTCTAACTTTCTTT-CTATTATTCTTA  146

seq1  AATTTCATCCACACACAAATAATCAGAATTTTGTTGATATGAATTATTTT  200
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCATCCACACACAAATAATCAGAA-TTTGTTGATATGAATTATTTT  195

seq1  ATAAGTACTTTATTTTCCCTACTACTCCATAATGCCCCTTAG-AAAACCA  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
seq2  ATAAGTACTTTATTTTCCCTACTACTCCATAATG-CCCTTAGAAAAACCA  244

seq1  ATATAATACAAATGTAAGTTTGTATGATATTGTATGTTTGCAATGTCTAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATACAAATGTAAGTTTGTATGATATTGTATGTTTGCAATGTCTAG  294

seq1  TGGGATTCATATACCATCCTTAGACTGAAACAGAGACCCATTGATTTATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTCATATACCATCCTTAGACTGAAACAGAGACCCATTGATTTATT  344

seq1  CAACAAGCTTTACGTGCATTGACTAAGATATTCCTAACCCTCTACGCTAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGCTTTACGTGCATTGACTAAGATATTCCTAACCCTCTACGCTAT  394

seq1  CTTAGCTATTTCCCAACCACACAACTGTGGCTCCATGCATGTATTCCCTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCTATTTCCCAACCACACAACTGTGGCTCCATGCATGTATTCCCTC  444

seq1  CTCAGCTAACTCTGCTATAGATGTCAGTTCTCCTGAAGAGTTTTCTTGGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTAACTCTGCTATAGATGTCAGTTCTCCTGAAGAGTTTTCTTGGT  494

seq1  GACTTCTCTTCATACCCAATCTCATGACAACTATCTTCTTCTTTCTCCAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCTCTTCATACCCAATCTCATGACAACTATCTTCTTCTTTCTCCAC  544

seq1  CTTTTGGTCATTTATTCAATTGGACCCTTACCTGCCTTGTGGCAAACTCG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGGTCATTTATTCAATTGGACCCTTACCTGCCTTGTGGCAAACTCG  594

seq1  TTCTCCTCTCCAAAACTCTATGGGACTCCTGACTGGGATCAGAAGTTCAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTCTCCAAAACTCTATGGGACTCCTGACTGGGATCAGAAGTTCAG  644

seq1  TCTTTCTATATCCTTTGCCCAGTAATTGGCTGGTAAGCCTCTTATTAACC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTATATCCTTTGCCCAGTAATTGGCTGGTAAGCCTCTTATTAACC  694

seq1  AATCAGAGATAATTGGGGAGTGTTCTTCACATAACATTGATACAGAAGAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGAGATAATTGGGGAGTGTTCTTCACATAACATTGATACAGAAGAT  744

seq1  TCCTTGATATTTGTGGCAAAGCCTGTGTCTGGGATATACACAGTGCACAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGATATTTGTGGCAAAGCCTGTGTCTGGGATATACACAGTGCACAA  794

seq1  GACCAACTCCCAACAGTATACCCCAAAGTTTTTGGGTTATATATCCAATG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAACTCCCAACAGTATACCCCAAAGTTTTTGGGTTATATATCCAATG  844

seq1  TCGTAGTTGTACAATAAGTGTAATTGTTGATTTATAATGGTGCTGGTCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTAGTTGTACAATAAGTGTAATTGTTGATTTATAATGGTGCTGGTCTC  894

seq1  TTAAATAGCTAGTGCTGTTGATTTAGTGACTATGTTATAAAAAAAAAAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAGCTAGTGCTGTTGATTTAGTGACTATGTTATAAAAAAAAAAGA  944

seq1  TTGAGTACCTGTGGTAGTTTGAAGAGGTATGGCCCCCTTACACTCATGTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTACCTGTGGTAGTTTGAAGAGGTATGGCCCCCTTACACTCATGTG  994

seq1  TTTGAATGCTTGGACCATGTGGAGTAGCACTGTTAGGAGATTGTTCTTGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATGCTTGGACCATGTGGAGTAGCACTGTTAGGAGATTGTTCTTGT  1044

seq1  TGGAGGAAGCATGTAACTGTTGTTTCAGGCTTTGAGGTTTTCCGTGCTCA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGAAGCATGTAACTGTTGTTTCAGGCTTTGAGGTTTTCCGTGCTCA  1094

seq1  AGCTCTTTCCTTTCTGGTGTGGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTTTCCTTTCTGGTGTGGAATTC  1121

seq1: chr3_75842741_75843142
seq2: B6Ng01-059M23.g_67_468

seq1  GAATTCACTCAGTATAGGGTAAAACATGTTCACAACAGGCTAACCACATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCAGTATAGGGTAAAACATGTTCACAACAGGCTAACCACATA  50

seq1  GAATTTTATATAATATATTCCTTCTCATAGACTGTTCTTTGCCTAAATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTTATATAATATATTCCTTCTCATAGACTGTTCTTTGCCTAAATGA  100

seq1  ATTCACGCATTATACTCTGCTGCATTATTTAGTGTTCTATTTCTGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACGCATTATACTCTGCTGCATTATTTAGTGTTCTATTTCTGTGAAA  150

seq1  AGAAAATGTAAGCACAACAACTTATAGAAGGAAATATTTAATTAATGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGTAAGCACAACAACTTATAGAAGGAAATATTTAATTAATGGGG  200

seq1  TAGTACATTATCATGGAAGTATGGAATATATTCTTTGATCTGGGCTGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTACATTATCATGGAAGTATGGAATATATTCTTTGATCTGGGCTGCCT  250

seq1  TGTCTGGCTTCAGTGAGAGAGGATGTGCCTATCCCAGAAGAGATTTGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGGCTTCAGTGAGAGAGGATGTGCCTATCCCAGAAGAGATTTGATG  300

seq1  TGCCAGGGTGGAGGGTATAGTCAGCGTGGGTCTTCACCCTCTCAGAGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGGGTGGAGGGTATAGTCAGCGTGGGTCTTCACCCTCTCAGAGGGG  350

seq1  ATGGGGGATGACTATGGGAGGGGGCTCGAGGGGGGCAGAAATGGGGATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGGATGACTATGGGAGGGGGCTCGAGGGGGGCAGAAATGGGGATGT  400

seq1  AA  402
      ||
seq2  AA  402