BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-108F22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 150,036,658 - 150,179,685
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040455, LOC100040463, LOC623554
Upstream geneLOC100040620, LOC100040633
Downstream geneEltd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-108F22.bB6Ng01-108F22.g
ACCDH915573DH915574
length3371,119
definitionDH915573|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108F22, 5' end.DH915574|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108F22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,179,349 - 150,179,685)(150,036,658 - 150,037,794)
sequence
accacactgactcccaactggatgactctctcccctgtgctgctcttaaa
tagcatctctttcatgtgctattctcctgggagttggacatatcctgtct
ctgatttattctgctaattttttttctggttcatcatattgtctactctt
tgattagatctcactttcaaatgtggttacttccttctacaaagtaattt
taacttaaaggtgtgaaataaaggcatgtctgcattccagccaggacaca
cagactttaggattaagatatgatataaaatactatatactctaatctgg
tttgaattggtttgtttggcgttggggtggggggggg
gaattctgtataattcaagtgaatagtaggggttgcttaaagaaacaatt
ccccgtgagataagcaactacatctaaaatctcctttcttcccaacacta
gaactttcgacttgaagggagcatattagcttttaattttttaaaatacc
ctgaataatctatccatgtttggattctcgatttaacgataagtggagta
aaatacattgggtagattcaagactagacagattttgtctggatttggac
ttcctataatagctttgtcttatggacaggttataaatgttctttgaact
tcatgcatgtaacaatccataagacaattatatcttcctgacagctttcc
agggatttctacaggggaaataagaacaatactccaaagatggtaccata
attcctaaatgatatatgttattacgaatgccaatgccattcacattatt
ctatgtctttcataaagcatcaggttctgctatcctttctttggtatgat
gctaaatgttgtgcccatcttttattttatagaatgagagcactgctggt
gttcttgtacattaagtccctttctttgttgcaagggcctcagaagactt
gggtctttgatttcagaatattcctgggaccaagtcaatagcttctgcag
tgaagtaaagggtctttactatgatatgtccactagcacatgacccaaaa
agtccctatgtaattgacctttagtccccaagtggtggccctgatttgca
aggctctgaaaaattttcaaagtgcagcctgcctggtggaagttgatcac
taaggatcagcattcagatttgatagctctaggtcatatgtgttcactac
ttcctgattgcaggggcaatgtgaacattagtctcagtctctttctgtca
tatcattgctgttgcgatgggttgtaaatcctcaaactaaaatgaaataa
gttttccttctcttgttgcattatcagacattttatcacagcagcttaaa
agaaattaacacatcagctaatctatctttatatttaacaatatttaaat
taacatagtggtacaaaagaaattcctaggataaattatatcacatcaga
ccccaagattcaggactac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_150179349_150179685
seq2: B6Ng01-108F22.b_51_387 (reverse)

seq1  CCCCCCCCCACCCCAACGCCAAACAAACCAATTCAAACCAGATTAGAGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCACCCCAACGCCAAACAAACCAATTCAAACCAGATTAGAGTA  50

seq1  TATAGTATTTTATATCATATCTTAATCCTAAAGTCTGTGTGTCCTGGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTATTTTATATCATATCTTAATCCTAAAGTCTGTGTGTCCTGGCTG  100

seq1  GAATGCAGACATGCCTTTATTTCACACCTTTAAGTTAAAATTACTTTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCAGACATGCCTTTATTTCACACCTTTAAGTTAAAATTACTTTGTA  150

seq1  GAAGGAAGTAACCACATTTGAAAGTGAGATCTAATCAAAGAGTAGACAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGTAACCACATTTGAAAGTGAGATCTAATCAAAGAGTAGACAAT  200

seq1  ATGATGAACCAGAAAAAAAATTAGCAGAATAAATCAGAGACAGGATATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGAACCAGAAAAAAAATTAGCAGAATAAATCAGAGACAGGATATGT  250

seq1  CCAACTCCCAGGAGAATAGCACATGAAAGAGATGCTATTTAAGAGCAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTCCCAGGAGAATAGCACATGAAAGAGATGCTATTTAAGAGCAGCA  300

seq1  CAGGGGAGAGAGTCATCCAGTTGGGAGTCAGTGTGGT  337
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGAGAGAGTCATCCAGTTGGGAGTCAGTGTGGT  337

seq1: chr3_150036658_150037794
seq2: B6Ng01-108F22.g_66_1184

seq1  GAATTCTGTATAATTCAAGTGAATAGTAGGGGTTGCTTAAAGAAACAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTATAATTCAAGTGAATAGTAGGGGTTGCTTAAAGAAACAATT  50

seq1  CCCCGTGAGATAAGCAACTACATCTAAAATCTCCTTTCTTCCCAACACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGTGAGATAAGCAACTACATCTAAAATCTCCTTTCTTCCCAACACTA  100

seq1  GAACTTTCGACTTGAAGGGAGCATATTAGCTTTTAATTTTTTAAAATACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTTCGACTTGAAGGGAGCATATTAGCTTTTAATTTTTTAAAATACC  150

seq1  CTGAATAATCTATCCATGTTTGGATTCTCGATTTAACGATAAGTGGAGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATAATCTATCCATGTTTGGATTCTCGATTTAACGATAAGTGGAGTA  200

seq1  AAATACATTGGGTAGATTCAAGACTAGACAGATTTTGTCTGGATTTGGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACATTGGGTAGATTCAAGACTAGACAGATTTTGTCTGGATTTGGAC  250

seq1  TTCCTATAATAGCTTTGTCTTATGGACAGGTTATAAATGTTCTTTGAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTATAATAGCTTTGTCTTATGGACAGGTTATAAATGTTCTTTGAACT  300

seq1  TCATGCATGTAACAATCCATAAGACAATTATATCTTCCTGACAGCTTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCATGTAACAATCCATAAGACAATTATATCTTCCTGACAGCTTTCC  350

seq1  AGGGATTTCTACAGGGGAAATAAGAACAATACTCCAAAGATGGTACCATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTTCTACAGGGGAAATAAGAACAATACTCCAAAGATGGTACCATA  400

seq1  ATTCCTAAATGATATATGTTATTACGAATGCCAATGCCATTCACATTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTAAATGATATATGTTATTACGAATGCCAATGCCATTCACATTATT  450

seq1  CTATGTCTTTCATAAAGCATCAGGTTCTGCTATCCTTTCTTTGGTATGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTCTTTCATAAAGCATCAGGTTCTGCTATCCTTTCTTTGGTATGAT  500

seq1  GCTAAATGTTGTGCCCATCTTTTATTTTATAGAATGAGAGCACTGCTGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAATGTTGTGCCCATCTTTTATTTTATAGAATGAGAGCACTGCTGGT  550

seq1  GTTCTTGTACATTAAGTCCCTTTCTTTGTTGCAAGGGCCTCAGAAGACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGTACATTAAGTCCCTTTCTTTGTTGCAAGGGCCTCAGAAGACTT  600

seq1  GGGTCTTTGATTTCAGAATATTCCTGGGACCAAGTCAATAGCTTCTGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTTTGATTTCAGAATATTCCTGGGACCAAGTCAATAGCTTCTGCAG  650

seq1  TGAAGTAAAGGGTCTTTACTATGATATGTCCACTAGCACATGACCCAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTAAAGGGTCTTTACTATGATATGTCCACTAGCACATGACCCAAAA  700

seq1  AGTCCCTATGTAATTGACCTTTAGTCCCCAAGTGGTGGCCCTGATTTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCTATGTAATTGACCTTTAGTCCCCAAGTGGTGGCCCTGATTTGCA  750

seq1  AGGCTCTGAAAAATTTTCAAAGTGCAGCCTGCCTGGTGGAAGTTGATCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCTGAAAAATTTTCAAAGTGCAGCCTGCCTGGTGGAAGTTGATCAC  800

seq1  TAAGGATCAGCATTCAGATTTGATAGCTCTAGGTCATATGTGTTCACTAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGATCAGCATTCAGATTTGATAGCTCTAGGTCATATGTGTTCACTAC  850

seq1  TTCCTGATTGCAGGGGCAATGTGAACATTAGTCTCAGTCTCTTTCTGTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGATTGCAGGGGCAATGTGAACATTAGTCTCAGTCTCTTTCTGTCA  900

seq1  TATCATTGCTGTTGCGATGGGTTGTAAATCCTCAAACTAAAATGAAAATA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TATCATTGCTGTTGCGATGGGTTGTAAATCCTCAAACTAAAATG-AAATA  949

seq1  AGTTTTCCTTCCTCTTGTTGCATTATCAGACATTTTATCACAGCAGCCTT  1000
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGTTTTCCTT-CTCTTGTTGCATTATCAGACATTTTATCACAGCAG-CTT  997

seq1  AAAAGAAAATAACACATCAGCTAAATCTATCCTTTATATTTAACAATATT  1050
      |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAATTAACACATCAGCT-AATCTAT-CTTTATATTTAACAATATT  1045

seq1  TAAATTAACATAGGTGTTACAAAAGAAATTTCATAGGGAGATAAATAATA  1100
      |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||   ||||||| |||
seq2  TAAATTAACATA-GTGGTACAAAAGAAA-TTCCTAG---GATAAATTATA  1090

seq1  TCAAACAACCAGACCCCCAAAAGATTCCAGGGACTAC  1137
      |||    | ||||||||   |||||||   |||||||
seq2  TCA---CATCAGACCCC---AAGATTC--AGGACTAC  1119