BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155P08
Chromosome3 (Build37)
Map Location 50,030,579 - 50,186,985
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039628, LOC639469, Slc7a11
Upstream gene4932443G14, LOC545519, LOC676568, LOC666247, LOC100039579, LOC100039587, LOC638779, Pcdh18
Downstream geneEG621304, LOC100039667, Ccrn4l, Elf2, A630062H14
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155P08.bB6Ng01-155P08.g
ACCDH950592DH950593
length1,1151,111
definitionDH950592|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P08, 5' end.DH950593|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,185,851 - 50,186,985)(50,030,579 - 50,031,696)
sequence
gaattcactcattaactcaaagccaggaagggtgaaaacttaacaacatg
cagtgacactcccatccaccaaggggcagttccttttcacatggtatcac
ttcctatcagcaacacccacagggaacggttaactcctgtcctgtgaacc
agtgtctgagggctttgtccactgcagtgctgtcaggcagtgaaatggac
aaagcttccggtgtctggtcggttgcctcacgtttctaggcaaagggcag
cactaatttgtggaaagcataatggggtctgctaattgcataacaccagc
tgcatcaaggacaatgaaaaaaaaatcttatattaacaacaacaacaaca
acaaacagcatcctttatacaaatgtgcaagactacccccatgacagcct
aggaggaaagcttagaactttgtctaccatttatttcatttatttatagt
ttctgtcgcttgtcaggattggaattttgttctagccttttacaggaaac
cctggaaggaaatgatggcctcctagggtgggggagggctgactccataa
acaggttcagctggtagggcttacccggtaaagaacctccagagtggctc
actcctgtgatgaaatggtcaacttgtctattgttttgatttatcctccc
gaactgaggttggtatgtgaaacaagtacccgaaacactcgccagtgtgt
atctatacctcttcatacaaaggtggctttctgggattgtgcagaacaat
ttctgtctctaaatgtagaatttccgaactgagccccttcctcttatcgg
aggcgatagttgataaagagtcagtaaacggatcgttgctttggagggac
agagaaggcgactgcttagacctttgcccacaggtctgagacaaggaatg
ccgtggtacccgctgctggtgattgtcttgtggagtcagtttgaccctac
gaaaagaaggattataaacattcacgtagcacaggctaaaagaaagtcaa
agagcagtttgctaaatgtttcattttattccactttcgggaaagcaata
ttgttcgttcttcttcctcagacttctctgacgctgctggaaattctcat
tagcagtccgatctt
gaattcccagcacagggtggcaggataggctggtccttgaaatttgtact
aagacttagtcaaaccattgaacttcagtctattgagacactgtctcaaa
aaactaaggtggagagcttttgaggtagtaatgaagaagacttttagtcc
ccacaggtacatacacacatactttcatgcatacctacacacatacactc
acatacaaagaggtacacacacatatgctatgtgcacacacatatatgca
tataaaaccatgtagacacacatacactatgtacacacaggtgttcatat
acaaacatgtttacacatgtattatgcatatatactatgtacacacatgt
attcatatgcaaaatgtacacacacacacaatgaaaattaccaaagaatc
tattaagtactattctaataactaacaatgaattcagcattcttaagtat
gtaaacattactctatttttgttattcttctactacttaagtgtccatgt
gtgtgctagcaccataaccagtaagaacaaatactaaatgtgtaaaggcg
gtctccgagcttacagacaccttgttatgcttttctatgaacagcaagtc
ttccattattgatggcacttgccatttcacagtatggtggtatcatacat
acaaaccaaggaaggggagataaaaaattattttttaaactcctgcattt
aacttcagaaaaaagtacacaaaatgaatgtaattgtgactgttcatgaa
tctcaccattgtaacaagaggctgaagtgttgactcctgtatctgtgctg
aatactgtattgttttgacaatgtagtacacaagtttgatagggagatga
aatcctaaaggccataatttaaaaagcatggcttttgttattttaatgat
tttagataatcatatctgtttctttaagatctactcaccatatgataact
aaataatcatgcttatcttttgaaaccaggtttatttttatgtatgtata
tgttattttatgtaagcacaatgtgtggtgagtgctgtgggagacaagaa
gagggcactgatcttgccagcctcagaatgggcagttgggcatggtgaaa
tgtgggtctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_50185851_50186985
seq2: B6Ng01-155P08.b_48_1162 (reverse)

seq1  AAGATCGGGACTGCTAATGAGAATTTTCCCAGCAGCCGCTCAGAGAAGGT  50
      |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| ||
seq2  AAGATC-GGACTGCTAATGAGAATTT--CCAGCAGC--GTCAGAGAA-GT  44

seq1  CTGAGGAAGGAAAGAACGGAACAAATTAATGCTTTCCCCGAAAGTGGAAT  100
      |||||||||  |||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||
seq2  CTGAGGAAG--AAGAAC-GAACAA--TATTGCTTT-CCCGAAAGTGGAAT  88

seq1  AAAATGAAACAATTTAGGCCAAACTTGCTCTTTGACTTTCTATTAGCCTG  150
      |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| 
seq2  AAAATGAAAC-ATTTAG--CAAAC-TGCTCTTTGACTTTCTTTTAGCCT-  133

seq1  GTGCTACGTGAATGTTTTATAATCCTTCTTTTTCGTTAGGGTCAAACTGA  200
      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  GTGCTACGTGAATG-TTTATAATCCTTC-TTTTCG-TAGGGTCAAACTGA  180

seq1  CTCCACAAGACAATCACCAGCAGCGGGTACCACGGCATTCCTTGTCTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACAAGACAATCACCAGCAGCGGGTACCACGGCATTCCTTGTCTCAG  230

seq1  ACCTGTGGGCAAAGGTCTAAGCAGTCGCCTTCTCTGTCCCTCCAAAGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGGGCAAAGGTCTAAGCAGTCGCCTTCTCTGTCCCTCCAAAGCAA  280

seq1  CGATCCGTTTACTGACTCTTTATCAACTATCGCCTCCGATAAGAGGAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCCGTTTACTGACTCTTTATCAACTATCGCCTCCGATAAGAGGAAGG  330

seq1  GGCTCAGTTCGGAAATTCTACATTTAGAGACAGAAATTGTTCTGCACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGTTCGGAAATTCTACATTTAGAGACAGAAATTGTTCTGCACAAT  380

seq1  CCCAGAAAGCCACCTTTGTATGAAGAGGTATAGATACACACTGGCGAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAAAGCCACCTTTGTATGAAGAGGTATAGATACACACTGGCGAGTG  430

seq1  TTTCGGGTACTTGTTTCACATACCAACCTCAGTTCGGGAGGATAAATCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCGGGTACTTGTTTCACATACCAACCTCAGTTCGGGAGGATAAATCAA  480

seq1  AACAATAGACAAGTTGACCATTTCATCACAGGAGTGAGCCACTCTGGAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATAGACAAGTTGACCATTTCATCACAGGAGTGAGCCACTCTGGAGG  530

seq1  TTCTTTACCGGGTAAGCCCTACCAGCTGAACCTGTTTATGGAGTCAGCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTACCGGGTAAGCCCTACCAGCTGAACCTGTTTATGGAGTCAGCCC  580

seq1  TCCCCCACCCTAGGAGGCCATCATTTCCTTCCAGGGTTTCCTGTAAAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCACCCTAGGAGGCCATCATTTCCTTCCAGGGTTTCCTGTAAAAGG  630

seq1  CTAGAACAAAATTCCAATCCTGACAAGCGACAGAAACTATAAATAAATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAACAAAATTCCAATCCTGACAAGCGACAGAAACTATAAATAAATGA  680

seq1  AATAAATGGTAGACAAAGTTCTAAGCTTTCCTCCTAGGCTGTCATGGGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATGGTAGACAAAGTTCTAAGCTTTCCTCCTAGGCTGTCATGGGGG  730

seq1  TAGTCTTGCACATTTGTATAAAGGATGCTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTTGCACATTTGTATAAAGGATGCTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGT  780

seq1  TAATATAAGATTTTTTTTTCATTGTCCTTGATGCAGCTGGTGTTATGCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATAAGATTTTTTTTTCATTGTCCTTGATGCAGCTGGTGTTATGCAA  830

seq1  TTAGCAGACCCCATTATGCTTTCCACAAATTAGTGCTGCCCTTTGCCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCAGACCCCATTATGCTTTCCACAAATTAGTGCTGCCCTTTGCCTAG  880

seq1  AAACGTGAGGCAACCGACCAGACACCGGAAGCTTTGTCCATTTCACTGCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGTGAGGCAACCGACCAGACACCGGAAGCTTTGTCCATTTCACTGCC  930

seq1  TGACAGCACTGCAGTGGACAAAGCCCTCAGACACTGGTTCACAGGACAGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGCACTGCAGTGGACAAAGCCCTCAGACACTGGTTCACAGGACAGG  980

seq1  AGTTAACCGTTCCCTGTGGGTGTTGCTGATAGGAAGTGATACCATGTGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAACCGTTCCCTGTGGGTGTTGCTGATAGGAAGTGATACCATGTGAA  1030

seq1  AAGGAACTGCCCCTTGGTGGATGGGAGTGTCACTGCATGTTGTTAAGTTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACTGCCCCTTGGTGGATGGGAGTGTCACTGCATGTTGTTAAGTTT  1080

seq1  TCACCCTTCCTGGCTTTGAGTTAATGAGTGAATTC  1135
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCTTCCTGGCTTTGAGTTAATGAGTGAATTC  1115

seq1: chr3_50030579_50031696
seq2: B6Ng01-155P08.g_68_1178

seq1  GAATTCCCAGCACAGGGTGGCAGGATAGGCTGGTCCTTGAAATTTGTACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGCACAGGGTGGCAGGATAGGCTGGTCCTTGAAATTTGTACT  50

seq1  AAGACTTAGTCAAACCATTGAACTTCAGTCTATTGAGACACTGTCTCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTAGTCAAACCATTGAACTTCAGTCTATTGAGACACTGTCTCAAA  100

seq1  AAACTAAGGTGGAGAGCTTTTGAGGTAGTAATGAAGAAGACTTTTAGTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAGGTGGAGAGCTTTTGAGGTAGTAATGAAGAAGACTTTTAGTCC  150

seq1  CCACAGGTACATACACACATACTTTCATGCATACCTACACACATACACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGTACATACACACATACTTTCATGCATACCTACACACATACACTC  200

seq1  ACATACAAAGAGGTACACACACATATGCTATGTGCACACACATATATGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACAAAGAGGTACACACACATATGCTATGTGCACACACATATATGCA  250

seq1  TATAAAACCATGTAGACACACATACACTATGTACACACAGGTGTTCATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAACCATGTAGACACACATACACTATGTACACACAGGTGTTCATAT  300

seq1  ACAAACATGTTTACACATGTATTATGCATATATACTATGTACACACATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACATGTTTACACATGTATTATGCATATATACTATGTACACACATGT  350

seq1  ATTCATATGCAAAATGTACACACACACACAATGAAAATTACCAAAGAATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATATGCAAAATGTACACACACACACAATGAAAATTACCAAAGAATC  400

seq1  TATTAAGTACTATTCTAATAACTAACAATGAATTCAGCATTCTTAAGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAGTACTATTCTAATAACTAACAATGAATTCAGCATTCTTAAGTAT  450

seq1  GTAAACATTACTCTATTTTTGTTATTCTTCTACTACTTAAGTGTCCATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACATTACTCTATTTTTGTTATTCTTCTACTACTTAAGTGTCCATGT  500

seq1  GTGTGCTAGCACCATAACCAGTAAGAACAAATACTAAATGTGTAAAGGCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCTAGCACCATAACCAGTAAGAACAAATACTAAATGTGTAAAGGCG  550

seq1  GTCTCCGAGCTTACAGACACCTTGTTATGCTTTTCTATGAACAGCAAGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCGAGCTTACAGACACCTTGTTATGCTTTTCTATGAACAGCAAGTC  600

seq1  TTCCATTATTGATGGCACTTGCCATTTCACAGTATGGTGGTATCATACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTATTGATGGCACTTGCCATTTCACAGTATGGTGGTATCATACAT  650

seq1  ACAAACCAAGGAAGGGGAGATAAAAAATTATTTTTTAAACTCCTGCATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCAAGGAAGGGGAGATAAAAAATTATTTTTTAAACTCCTGCATTT  700

seq1  AACTTCAGAAAAAAGTACACAAAATGAATGTAATTGTGACTGTTCATGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCAGAAAAAAGTACACAAAATGAATGTAATTGTGACTGTTCATGAA  750

seq1  TCTCACCATTGTAACAAGAGGCTGAAGTGTTGACTCCTGTATCTGTGCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCATTGTAACAAGAGGCTGAAGTGTTGACTCCTGTATCTGTGCTG  800

seq1  AATACTGTATTGTTTTGACAATGTAGTACACAAGTTTGATAGGGAGATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTGTATTGTTTTGACAATGTAGTACACAAGTTTGATAGGGAGATGA  850

seq1  AATCCTAAAGGCCATAATTTAAAAAGCATGGCTTTTGTTATTTTAAATGA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AATCCTAAAGGCCATAATTTAAAAAGCATGGCTTTTGTTATTTT-AATGA  899

seq1  TTTTTAGATAATCATATCTGTTTTCTTTAAGATCTACTCACCATATGATA  950
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTTTAGATAATCATATCTG-TTTCTTTAAGATCTACTCACCATATGATA  947

seq1  ACTAAATAATCATGCTTATCTTTTGAAACCAGGTTTATTTTTTTATGTAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  ACTAAATAATCATGCTTATCTTTTGAAACCAGGTTTA--TTTTTATGTAT  995

seq1  GTATATGTTTATTTTTATGTAAGCAC-ATGTGT-GTGAGTGCTTGTGGAG  1048
      |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||
seq2  GTATATGTT--ATTTTATGTAAGCACAATGTGTGGTGAGTGCTGTGGGAG  1043

seq1  ACCAGAAGAGGGCACTGGATCTTTGCCAG-CTCAGAATGGGCAGTTGGGC  1097
      || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAAGAGGGCACT-GATC-TTGCCAGCCTCAGAATGGGCAGTTGGGC  1091

seq1  ATGGTGAGATGTGGGTGCTGG  1118
      ||||||| |||||||| ||||
seq2  ATGGTGAAATGTGGGT-CTGG  1111