BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169G11
Chromosome3 (Build37)
Map Location 75,992,150 - 76,101,962
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFstl5
Upstream geneSerpini2, Wdr49, Pdcd10, Serpini1, Golph4
Downstream geneLOC100041625, LOC100041635
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169G11.bB6Ng01-169G11.g
ACCDH960391DH960392
length1,1301,149
definitionDH960391|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169G11, 5' end.DH960392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169G11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,100,826 - 76,101,962)(75,992,150 - 75,993,304)
sequence
gaattcctcaaaattgttaaaccaaagtgcctttctgcactaacagtata
ttatataatggaaaatcaaaatacacccttataaaggctacttttaaaat
atggcatctcattttcagtattaaagaattgtttgttaacatgaaatgta
agaaacaggtcttgaaaatgggtcagtagttaagaatgtgctcttcttgc
aaagaacctagttccatttcaagcaaccatattgagaagttcatctggat
ctcaactctaactccaggtcatttgttacctctggcctcatgaaccacca
tatgctgacccatgcctacacataattaaaaacataaaaataaagtttaa
agataaatctaaattatgagtcaacaaaaggggggacataattttccctt
tctctatgaccaacctcacaacattttccttctttcagcatgagattcct
ggataaattctcatatcttgaaggcatagtctgatagtgaaattgaagac
catagtgtctatttagaatattttcattttggccaggccatttgtataag
tgggttttgttttgtttttatgttaatgtctgtcttctttactgtgactc
agactcttctcttcattctgttttttctatatcactctcctccacctcat
gaaaattaaaaacacagaaacagaattatccagtattgtccattcccatt
cagtcaccttggaatatagaacagaaaaaagattaaaagtatttgcagac
agaggggagccttcagggtaacactaccctcatgaggacaattacttgtg
acaactaagtcacagactaaagcagatatgataggagcctctctctggat
acaacaataattaacagattaacagtccattagatgctacagaggacact
ccgtgcataagcttttcatctcttttaacctatagctaaaaacagtaatc
aaatgaccttaagtatgaatgctctttactgtcccaccacaacaaacaca
cacacacacacacctcacacacacacacacaaatgtctccacactgaact
gtcctcttgatagcttttgtcagcactcatcttgtgaatgggtgatttga
ataggcatgccagcctatgtttgacatgcc
gaattccacctgtattgaagagcacttttgtttgtgctataataataata
gtgatagaaaagcaattatcctctcaaaggggataagaggtagtatattc
cgggacccattttgagtgattgtagtccagaatctgaggtttaggttact
tcaaataccatgtttcaatgtagaaacagtttattaagcttcaataacaa
caaataagaatatcataaatgaatgactttccaaatataatggaggaaac
atccaataggtaggttgaagcaaaaatgtaggccctgttataggtcccag
aaaatatctgatggcatttatagctcttccttgtctggaaactagtgctc
tgtttgtaaattacaaactatgtatctaatggtcacaaagatgttaacta
agttatagaggatgacaattacgggggataaaggtgcccaaagataagga
acccatggaactgcaatatttgagtctattgccacaagaattctagtgcc
ttaatcagccctgcagagtacttatggaaaggtgcaactttttggtaaat
ttgttcacagtacttagagtacaatcatgccttatttttgtctgctatgt
gatatgtctccagttggatgtttacgctaagatagtaatttgaagttctc
tgttgtagaagtcctgagaaaaccatctttaagtaataatgctgagaggc
ctgggcagaaaaggagttaatttacagtgagcttataatataggttctga
ttatccccaaagggagtactaggatagcctagttttgcacaaggatgaca
gattttgtaacctgttattagccagttaccatggtggctcacccttagaa
ataaataaagtagctctttggctatttcttcactgcatggggtgagttgg
gatataaagacaaatagcaaaattcttgaatcttaaactttctgtttgtc
attaatagttagtcattttcctataatatagtagactggtattgccagcc
accagcaaatagagactctcattattatgtaaggaaatcattctacagct
tctctcagttcttaatattgaattgtaaaactgaaagaaccagcagaact
ttcttttccaaagagtgatatccaggccctgaagcctctacaatacatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_76100826_76101962
seq2: B6Ng01-169G11.b_47_1176 (reverse)

seq1  GGCATTGTCAAACACTAGGCTGGGCCATGCCTA-TCAATACA-CCATTCA  48
      |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||  || |||||||
seq2  GGCA-TGTCAAACA-TAGGCTGG--CATGCCTATTCAAATCACCCATTCA  46

seq1  CAAAGATGAGTGCTGACAAAAAGCATCAAGA-GACAGTTCAGTGTGGAGA  97
      | |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||
seq2  C-AAGATGAGTGCTGACAAAAGCTATCAAGAGGACAGTTCAGTGTGGAGA  95

seq1  CATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  147
      || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||
seq2  CA-TTTGTGTGTGTGTGTGTGAG-GTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGT-TGT  142

seq1  GGTGGGGACAGTAAAGAGCATTCATACCTTAAGGTCATTTGATTACTGTT  197
      ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGT-GGGACAGTAAAGAGCATTCATA-CTTAAGGTCATTTGATTACTGTT  190

seq1  TTTAGCTATAGGTTAAAAGAGATGAAAAGCTTATGCACGGAGTGTCCTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTATAGGTTAAAAGAGATGAAAAGCTTATGCACGGAGTGTCCTCT  240

seq1  GTAGCATCTAATGGACTGTTAATCTGTTAATTATTGTTGTATCCAGAGAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCATCTAATGGACTGTTAATCTGTTAATTATTGTTGTATCCAGAGAG  290

seq1  AGGCTCCTATCATATCTGCTTTAGTCTGTGACTTAGTTGTCACAAGTAAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCCTATCATATCTGCTTTAGTCTGTGACTTAGTTGTCACAAGTAAT  340

seq1  TGTCCTCATGAGGGTAGTGTTACCCTGAAGGCTCCCCTCTGTCTGCAAAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCATGAGGGTAGTGTTACCCTGAAGGCTCCCCTCTGTCTGCAAAT  390

seq1  ACTTTTAATCTTTTTTCTGTTCTATATTCCAAGGTGACTGAATGGGAATG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTAATCTTTTTTCTGTTCTATATTCCAAGGTGACTGAATGGGAATG  440

seq1  GACAATACTGGATAATTCTGTTTCTGTGTTTTTAATTTTCATGAGGTGGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATACTGGATAATTCTGTTTCTGTGTTTTTAATTTTCATGAGGTGGA  490

seq1  GGAGAGTGATATAGAAAAAACAGAATGAAGAGAAGAGTCTGAGTCACAGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGTGATATAGAAAAAACAGAATGAAGAGAAGAGTCTGAGTCACAGT  540

seq1  AAAGAAGACAGACATTAACATAAAAACAAAACAAAACCCACTTATACAAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGACAGACATTAACATAAAAACAAAACAAAACCCACTTATACAAA  590

seq1  TGGCCTGGCCAAAATGAAAATATTCTAAATAGACACTATGGTCTTCAATT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTGGCCAAAATGAAAATATTCTAAATAGACACTATGGTCTTCAATT  640

seq1  TCACTATCAGACTATGCCTTCAAGATATGAGAATTTATCCAGGAATCTCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTATCAGACTATGCCTTCAAGATATGAGAATTTATCCAGGAATCTCA  690

seq1  TGCTGAAAGAAGGAAAATGTTGTGAGGTTGGTCATAGAGAAAGGGAAAAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAAAGAAGGAAAATGTTGTGAGGTTGGTCATAGAGAAAGGGAAAAT  740

seq1  TATGTCCCCCCTTTTGTTGACTCATAATTTAGATTTATCTTTAAACTTTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCCCCCTTTTGTTGACTCATAATTTAGATTTATCTTTAAACTTTA  790

seq1  TTTTTATGTTTTTAATTATGTGTAGGCATGGGTCAGCATATGGTGGTTCA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATGTTTTTAATTATGTGTAGGCATGGGTCAGCATATGGTGGTTCA  840

seq1  TGAGGCCAGAGGTAACAAATGACCTGGAGTTAGAGTTGAGATCCAGATGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCCAGAGGTAACAAATGACCTGGAGTTAGAGTTGAGATCCAGATGA  890

seq1  ACTTCTCAATATGGTTGCTTGAAATGGAACTAGGTTCTTTGCAAGAAGAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCAATATGGTTGCTTGAAATGGAACTAGGTTCTTTGCAAGAAGAG  940

seq1  CACATTCTTAACTACTGACCCATTTTCAAGACCTGTTTCTTACATTTCAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTCTTAACTACTGACCCATTTTCAAGACCTGTTTCTTACATTTCAT  990

seq1  GTTAACAAACAATTCTTTAATACTGAAAATGAGATGCCATATTTTAAAAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACAAACAATTCTTTAATACTGAAAATGAGATGCCATATTTTAAAAG  1040

seq1  TAGCCTTTATAAGGGTGTATTTTGATTTTCCATTATATAATATACTGTTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTTTATAAGGGTGTATTTTGATTTTCCATTATATAATATACTGTTA  1090

seq1  GTGCAGAAAGGCACTTTGGTTTAACAATTTTGAGGAATTC  1137
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGAAAGGCACTTTGGTTTAACAATTTTGAGGAATTC  1130

seq1: chr3_75992150_75993304
seq2: B6Ng01-169G11.g_65_1213

seq1  GAATTCCACCTGTATTGAAGAGCACTTTTGTTTGTGCTATAATAATAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCTGTATTGAAGAGCACTTTTGTTTGTGCTATAATAATAATA  50

seq1  GTGATAGAAAAGCAATTATCCTCTCAAAGGGGATAAGAGGTAGTATATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAGAAAAGCAATTATCCTCTCAAAGGGGATAAGAGGTAGTATATTC  100

seq1  CGGGACCCATTTTGAGTGATTGTAGTCCAGAATCTGAGGTTTAGGTTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGACCCATTTTGAGTGATTGTAGTCCAGAATCTGAGGTTTAGGTTACT  150

seq1  TCAAATACCATGTTTCAATGTAGAAACAGTTTATTAAGCTTCAATAACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATACCATGTTTCAATGTAGAAACAGTTTATTAAGCTTCAATAACAA  200

seq1  CAAATAAGAATATCATAAATGAATGACTTTCCAAATATAATGGAGGAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAGAATATCATAAATGAATGACTTTCCAAATATAATGGAGGAAAC  250

seq1  ATCCAATAGGTAGGTTGAAGCAAAAATGTAGGCCCTGTTATAGGTCCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAATAGGTAGGTTGAAGCAAAAATGTAGGCCCTGTTATAGGTCCCAG  300

seq1  AAAATATCTGATGGCATTTATAGCTCTTCCTTGTCTGGAAACTAGTGCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTGATGGCATTTATAGCTCTTCCTTGTCTGGAAACTAGTGCTC  350

seq1  TGTTTGTAAATTACAAACTATGTATCTAATGGTCACAAAGATGTTAACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTAAATTACAAACTATGTATCTAATGGTCACAAAGATGTTAACTA  400

seq1  AGTTATAGAGGATGACAATTACGGGGGATAAAGGTGCCCAAAGATAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATAGAGGATGACAATTACGGGGGATAAAGGTGCCCAAAGATAAGGA  450

seq1  ACCCATGGAACTGCAATATTTGAGTCTATTGCCACAAGAATTCTAGTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGGAACTGCAATATTTGAGTCTATTGCCACAAGAATTCTAGTGCC  500

seq1  TTAATCAGCCCTGCAGAGTACTTATGGAAAGGTGCAACTTTTTGGTAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAGCCCTGCAGAGTACTTATGGAAAGGTGCAACTTTTTGGTAAAT  550

seq1  TTGTTCACAGTACTTAGAGTACAATCATGCCTTATTTTTGTCTGCTATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCACAGTACTTAGAGTACAATCATGCCTTATTTTTGTCTGCTATGT  600

seq1  GATATGTCTCCAGTTGGATGTTTACGCTAAGATAGTAATTTGAAGTTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGTCTCCAGTTGGATGTTTACGCTAAGATAGTAATTTGAAGTTCTC  650

seq1  TGTTGTAGAAGTCCTGAGAAAACCATCTTTAAGTAATAATGCTGAGAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAGAAGTCCTGAGAAAACCATCTTTAAGTAATAATGCTGAGAGGC  700

seq1  CTGGGCAGAAAAGGAGTTAATTTACAGTGAGCTTATAATATAGGTTCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCAGAAAAGGAGTTAATTTACAGTGAGCTTATAATATAGGTTCTGA  750

seq1  TTATCCCCAAAGGGAGTACTAGGATAGCCTAGTTTTGCACAAGGATGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCCCAAAGGGAGTACTAGGATAGCCTAGTTTTGCACAAGGATGACA  800

seq1  GATTTTGTAACCTGTTATTAGCCAGTTACCATGGTGGCTCACCCTTAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTGTAACCTGTTATTAGCCAGTTACCATGGTGGCTCACCCTTAGAA  850

seq1  ATAAATAAAGTAGCTCTTTGGCTATTTCTTCACTGCATGGGGTGAGTTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAAGTAGCTCTTTGGCTATTTCTTCACTGCATGGGGTGAGTTGG  900

seq1  GATATAAAGACAAATAGCAAAATTCTTGAATCTTAAACTTTCTGTTTTGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GATATAAAGACAAATAGCAAAATTCTTGAATCTTAAACTTTCTG-TTTGT  949

seq1  CATTAATAGTTTAGTCATTTTCCTATAATATAGTAGACTGGTATTGCCAG  1000
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATAG-TTAGTCATTTTCCTATAATATAGTAGACTGGTATTGCCAG  998

seq1  CCACCAGCAAAATTAGAAGACTCTCATTATTATGTAAGGAAAATCATTCC  1050
      |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  CCACCAGCAAA--TAG-AGACTCTCATTATTATGTAAGG-AAATCATT-C  1043

seq1  TACAGCTTCTC-CAGTTCTTAATATTGAAATTGTTAAAACTGATAGA--C  1097
      ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |
seq2  TACAGCTTCTCTCAGTTCTTAATATTG-AATTG-TAAAACTGAAAGAACC  1091

seq1  AGCAG-ACTTTCTTGTCCAAATGATGAATATCCAGGCTCTGAAGCCTCTA  1146
      ||||| |||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||
seq2  AGCAGAACTTTCTTTTCCAAA-GAGTGATATCCAGGCCCTGAAGCCTCTA  1140

seq1  ACATACATG  1155
        |||||||
seq2  CAATACATG  1149