BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170D14
Chromosome3 (Build37)
Map Location 148,491,870 - 148,615,908
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLphn2
Upstream geneLOC100040354
Downstream geneLOC100040368, LOC668893, EG381483, LOC100040620
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170D14.bB6Ng01-170D14.g
ACCDH960992DH960993
length1,070318
definitionDH960992|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170D14, 5' end.DH960993|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170D14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(148,491,870 - 148,492,941)(148,615,591 - 148,615,908)
sequence
gaattctaagaagtaatttgcattatgtacctccagtggagaaactgctg
agttctagagacctggctgctaagctacttcttgatgttgaccaactaaa
cacatggaatgagacttggatgatccatgcactaaggcgaccgagaggaa
ccaattacacacagcccacgaaacagttaacattaatgagaaggtaacgt
ttttattgtctgcatacttcccacctaatgttaaaaggcttttgtctttt
cttctcatgtttacactgcatgaaacttagttgtttccaacagagtaagt
cctactaagtgttcagctgaatgaacacttgaagggacaatcaaatgcaa
actgtgagagatggaatttgatccagaggcctggactccctacaggtttg
actgaggagaggtaaaggctggaaaaaggctgcagcttccagccccaggc
tgagagcggagggggacactcttgtttttcgatcctacaaccagagctaa
gctggactacccatgcctgtgactggtttacagacacactttttatcctc
agagatggaccacccatctctcacccatacaatacttctcacccaacaag
tagttaagtgcctagcctgtgctatataagggtgtgtttatcctgctgtg
gacacctaagatggactcagcctctgagaaattagaaccctctgtagcaa
tggagtaaacactgatgactttgtaaaggattatggtaagaaggattcct
aacagttttaaaaagggaaaaaaaaaaaatcaacagtgccattaattttc
tatttaagtagcagtagccttaactagtaacattaaagaatggctgaaag
gcagaacactgtagcaagcccaggctctgctgggaatctgttagatgcca
gtgtattagttagggtggcagctgctgacactctacatttcaatatactg
aacacaaaccacccaatgtcaaggtaaacaaccaatggactccaactcct
gaatgcaatgtccttcttacagaggtagatgaaatctttcacccctcttt
gagtgctctgaatggggagg
cctcctactggcaaaaaaagagcctgggaaggactcacactgctggcttt
aagagtagccacagtgatcacacaccgccagaacatgtccccacagaggc
actcgagtttgttttagaagagttgcatgtgacactggctgcctttatta
ccagatatcagataatgacccaaggatgcccgttgagaaactaatcaaag
ttaggtgttcaggcgacgggacagaagtagaaatccaactctcagccatt
aagtttcttcttacatggattttctttttcttcttttcattgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_148491870_148492941
seq2: B6Ng01-170D14.b_45_1114

seq1  GAATTCTAAGAAGTAATTTGCATTATGTACCTCCAGTGGAGAAACTGCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGAAGTAATTTGCATTATGTACCTCCAGTGGAGAAACTGCTG  50

seq1  AGTTCTAGAGACCTGGCTGCTAAGCTACTTCTTGATGTTGACCAACTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTAGAGACCTGGCTGCTAAGCTACTTCTTGATGTTGACCAACTAAA  100

seq1  CACATGGAATGAGACTTGGATGATCCATGCACTAAGGCGACCGAGAGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGAATGAGACTTGGATGATCCATGCACTAAGGCGACCGAGAGGAA  150

seq1  CCAATTACACACAGCCCACGAAACAGTTAACATTAATGAGAAGGTAACGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTACACACAGCCCACGAAACAGTTAACATTAATGAGAAGGTAACGT  200

seq1  TTTTATTGTCTGCATACTTCCCACCTAATGTTAAAAGGCTTTTGTCTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTGTCTGCATACTTCCCACCTAATGTTAAAAGGCTTTTGTCTTTT  250

seq1  CTTCTCATGTTTACACTGCATGAAACTTAGTTGTTTCCAACAGAGTAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCATGTTTACACTGCATGAAACTTAGTTGTTTCCAACAGAGTAAGT  300

seq1  CCTACTAAGTGTTCAGCTGAATGAACACTTGAAGGGACAATCAAATGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTAAGTGTTCAGCTGAATGAACACTTGAAGGGACAATCAAATGCAA  350

seq1  ACTGTGAGAGATGGAATTTGATCCAGAGGCCTGGACTCCCTACAGGTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGAGAGATGGAATTTGATCCAGAGGCCTGGACTCCCTACAGGTTTG  400

seq1  ACTGAGGAGAGGTAAAGGCTGGAAAAAGGCTGCAGCTTCCAGCCCCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGGAGAGGTAAAGGCTGGAAAAAGGCTGCAGCTTCCAGCCCCAGGC  450

seq1  TGAGAGCGGAGGGGGACACTCTTGTTTTTCGATCCTACAACCAGAGCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGCGGAGGGGGACACTCTTGTTTTTCGATCCTACAACCAGAGCTAA  500

seq1  GCTGGACTACCCATGCCTGTGACTGGTTTACAGACACACTTTTTATCCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGACTACCCATGCCTGTGACTGGTTTACAGACACACTTTTTATCCTC  550

seq1  AGAGATGGACCACCCATCTCTCACCCATACAATACTTCTCACCCAACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGGACCACCCATCTCTCACCCATACAATACTTCTCACCCAACAAG  600

seq1  TAGTTAAGTGCCTAGCCTGTGCTATATAAGGGTGTGTTTATCCTGCTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAAGTGCCTAGCCTGTGCTATATAAGGGTGTGTTTATCCTGCTGTG  650

seq1  GACACCTAAGATGGACTCAGCCTCTGAGAAATTAGAACCCTCTGTAGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACCTAAGATGGACTCAGCCTCTGAGAAATTAGAACCCTCTGTAGCAA  700

seq1  TGGAGTAAACACTGATGACTTTGTAAAGGATTATGGTAAGAAGGATTCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGTAAACACTGATGACTTTGTAAAGGATTATGGTAAGAAGGATTCCT  750

seq1  AACAGTTTTAAAAAGGGAAAAAAAAAAAATCAACAGTGCCATTAATTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTTTTAAAAAGGGAAAAAAAAAAAATCAACAGTGCCATTAATTTTC  800

seq1  TATTTAAGTAGCAGTAGCCTTAACTAGTAACATTAAAGAATGGCTGAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAAGTAGCAGTAGCCTTAACTAGTAACATTAAAGAATGGCTGAAAG  850

seq1  GCAGAACACTGTAGCAAGCCCAGGCTCTGCTGGGAATCTGTTAGATGCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAACACTGTAGCAAGCCCAGGCTCTGCTGGGAATCTGTTAGATGCCA  900

seq1  GTGTATTAGTTAGGGTGGCAGCTGCTGACACTCTACATTTCAATATACTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATTAGTTAGGGTGGCAGCTGCTGACACTCTACATTTCAATATACTG  950

seq1  AACACAAACCACCCAATGTCAAGGTAAACAAACCAATGGACTCCAACTCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AACACAAACCACCCAATGTCAAGGTAAAC-AACCAATGGACTCCAACTCC  999

seq1  TGAATGCAATGTCCTTCTTTACAGAGGTAGATGAAATCTTTCAACCCTCT  1050
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGAATGCAATGTCCTTC-TTACAGAGGTAGATGAAATCTTTCACCCCTCT  1048

seq1  TTGAGTGCTCTGAATGGAGAGG  1072
      ||||||||||||||||| ||||
seq2  TTGAGTGCTCTGAATGGGGAGG  1070

seq1: chr3_148615591_148615908
seq2: B6Ng01-170D14.g_73_390 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACAATGAAAAGAAGAAAAAGAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACAATGAAAAGAAGAAAAAGAAAAT  50

seq1  CCATGTAAGAAGAAACTTAATGGCTGAGAGTTGGATTTCTACTTCTGTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTAAGAAGAAACTTAATGGCTGAGAGTTGGATTTCTACTTCTGTCC  100

seq1  CGTCGCCTGAACACCTAACTTTGATTAGTTTCTCAACGGGCATCCTTGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCGCCTGAACACCTAACTTTGATTAGTTTCTCAACGGGCATCCTTGGG  150

seq1  TCATTATCTGATATCTGGTAATAAAGGCAGCCAGTGTCACATGCAACTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATCTGATATCTGGTAATAAAGGCAGCCAGTGTCACATGCAACTCT  200

seq1  TCTAAAACAAACTCGAGTGCCTCTGTGGGGACATGTTCTGGCGGTGTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAACAAACTCGAGTGCCTCTGTGGGGACATGTTCTGGCGGTGTGTG  250

seq1  ATCACTGTGGCTACTCTTAAAGCCAGCAGTGTGAGTCCTTCCCAGGCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTGTGGCTACTCTTAAAGCCAGCAGTGTGAGTCCTTCCCAGGCTCT  300

seq1  TTTTTTGCCAGTAGGAGG  318
      ||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGCCAGTAGGAGG  318