BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-173B14
Chromosome3 (Build37)
Map Location 60,012,159 - 60,091,757
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneP2ry13, P2ry12, Igsf10, EG666751, EG666756, EG229330, EG435732, LOC433597, LOC433598, LOC100040407, LOC669780, EG666803, C130079G13Rik, LOC676914, Aadacl2, Aadac, Sucnr1
Downstream geneLOC669823, LOC100040485, Mbnl1, LOC676933, LOC100040501, EG666853, P2ry1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-173B14.bB6Ng01-173B14.g
ACCGA001541GA001542
length1,1471,035
definitionB6Ng01-173B14.b B6Ng01-173B14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,012,159 - 60,013,305)(60,090,719 - 60,091,757)
sequence
gaattcaactactctgctggaaattcaactgtgcataatcaaaacaataa
ggcaactttataaggcttggagaagatgatggcagcaataaagtcattat
caagcaaacagaagacacacaatcaactacaattgctttagtattttaac
cctgaaaattgcttctttcaaatacaaatctccaggcaaacaaaaatctc
atgcaaattaaaactaattgactccaccaactggtattgtttactgttga
ataatttccaacattcttctcatgtttccaataacaaaacaaagttatct
ttaagtttaagtctatctaatagcagattttgcagttacttcataaatgt
aaacttacagtttttttaaataaaaaaatctctaaattaatgaaacttta
taatacttggctaagaaatagctatctgtacttccatagagttttgtcct
tcttggctatatatttgtgaatttcaattatgatttttcaaacctggaac
ctggaggaatatgttttatatgctcaacaaaatttttgactgatcctgtg
atcatgtgtaaacaaggtaactgacgtgtctgtcacttccatagttatca
gagtccctggaaggcagtgaagtagatcttatctagaagcttgtgaggca
ccttccctcttgaccctggtactgtcaatacctcagggaagtccccctta
agacaattctatttgttcttagttcactattttgacagtgttcagcctac
attgtagtctcttgtccaaagcccttatgttactgtttctcagacagcat
tactggacaagctaccttctaagaggcatcttcataattaaatcaattag
ccatctcctgtattcaaccccatctagagcagttctaaaggacctagaac
tgtagcttggtgggtgagtgtctgactagcacatgcaagacccaagattg
aacccgcagaaaccccaaattaaaagaaggacatagagttatcacttatt
gagcatggatttttcagtgtttgtgagtttggagttttgtatgcagaagc
atttattgatcaaaccctgtgcactattgtaactatttcagaaaagttac
taataggccacatgtagctacagaaaggagtgatttcttgcatgtac
gaattcattgaataaagatatacacagcctatagctggggagaagagagg
taggcagagcatcagtttccaagcttggggtctgaggcagagaacacaag
gagataaaagagagagtagtgaagagagagagaagaagatgcaatgaggg
aggtgaatcctgacaacatggccatgagggttggccaattggataagagc
agcctaggtggaacatggcaaattataactcaggattattgacagggaag
tagacaaaatagccaaagagggttgatggctgtccagctctaatgctctt
aaaggcttattataaatgtaaggtttcattacttttatctgagaaatgaa
tgatcaaagtcagggtagaaacccccaattaatattaaaatttaccacag
cagtcatgctgcagctctgatgccagcctaagtaacttctctagttgtcc
ttcagtcatccatgatacaattatccacatatacagagagaagaaactca
ggcacagtactcatgatcagttctgcaagaaacatggcaaaaacttcatg
agtgtagggcttatagcaaccttatgtacttaaggaattgattatgccag
caaagtctcatggtggtaaactattctagaagtcataattggttcacagg
cagattagcaaaattatctatgactgttttagtataaatatcaaggaaag
caacaaaatgcctgtatgaattctcatattgcttggaattttatcataaa
tgataaaatatcaatttaaatgtggagataagtgaataatcttgaaggaa
agagttcgttgtaattgaacccttttaatcatatgattttgggcttattt
tatatatattctaatagttccattttattgctgcagaaagatctactgaa
atacatattttgttttaaattgatttttaaagaaatttagcaatgcaatt
aaccacagatccttacagtttattctacatgactaagtaattattgttat
tcatcaatgcatcttatagattttccccatgagac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_60012159_60013305
seq2: B6Ng01-173B14.b_45_1191

seq1  GAATTCAACTACTCTGCTGGAAATTCAACTGTGCATAATCAAAACAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTACTCTGCTGGAAATTCAACTGTGCATAATCAAAACAATAA  50

seq1  GGCAACTTTATAAGGCTTGGAGAAGATGATGGCAGCAATAAAGTCATTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACTTTATAAGGCTTGGAGAAGATGATGGCAGCAATAAAGTCATTAT  100

seq1  CAAGCAAACAGAAGACACACAATCAACTACAATTGCTTTAGTATTTTAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAACAGAAGACACACAATCAACTACAATTGCTTTAGTATTTTAAC  150

seq1  CCTGAAAATTGCTTCTTTCAAATACAAATCTCCAGGCAAACAAAAATCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAATTGCTTCTTTCAAATACAAATCTCCAGGCAAACAAAAATCTC  200

seq1  ATGCAAATTAAAACTAATTGACTCCACCAACTGGTATTGTTTACTGTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATTAAAACTAATTGACTCCACCAACTGGTATTGTTTACTGTTGA  250

seq1  ATAATTTCCAACATTCTTCTCATGTTTCCAATAACAAAACAAAGTTATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTCCAACATTCTTCTCATGTTTCCAATAACAAAACAAAGTTATCT  300

seq1  TTAAGTTTAAGTCTATCTAATAGCAGATTTTGCAGTTACTTCATAAATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTTAAGTCTATCTAATAGCAGATTTTGCAGTTACTTCATAAATGT  350

seq1  AAACTTACAGTTTTTTTAAATAAAAAAATCTCTAAATTAATGAAACTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTACAGTTTTTTTAAATAAAAAAATCTCTAAATTAATGAAACTTTA  400

seq1  TAATACTTGGCTAAGAAATAGCTATCTGTACTTCCATAGAGTTTTGTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACTTGGCTAAGAAATAGCTATCTGTACTTCCATAGAGTTTTGTCCT  450

seq1  TCTTGGCTATATATTTGTGAATTTCAATTATGATTTTTCAAACCTGGAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGCTATATATTTGTGAATTTCAATTATGATTTTTCAAACCTGGAAC  500

seq1  CTGGAGGAATATGTTTTATATGCTCAACAAAATTTTTGACTGATCCTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGAATATGTTTTATATGCTCAACAAAATTTTTGACTGATCCTGTG  550

seq1  ATCATGTGTAAACAAGGTAACTGACGTGTCTGTCACTTCCATAGTTATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGTGTAAACAAGGTAACTGACGTGTCTGTCACTTCCATAGTTATCA  600

seq1  GAGTCCCTGGAAGGCAGTGAAGTAGATCTTATCTAGAAGCTTGTGAGGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCCTGGAAGGCAGTGAAGTAGATCTTATCTAGAAGCTTGTGAGGCA  650

seq1  CCTTCCCTCTTGACCCTGGTACTGTCAATACCTCAGGGAAGTCCCCCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCTCTTGACCCTGGTACTGTCAATACCTCAGGGAAGTCCCCCTTA  700

seq1  AGACAATTCTATTTGTTCTTAGTTCACTATTTTGACAGTGTTCAGCCTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAATTCTATTTGTTCTTAGTTCACTATTTTGACAGTGTTCAGCCTAC  750

seq1  ATTGTAGTCTCTTGTCCAAAGCCCTTATGTTACTGTTTCTCAGACAGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAGTCTCTTGTCCAAAGCCCTTATGTTACTGTTTCTCAGACAGCAT  800

seq1  TACTGGACAAGCTACCTTCTAAGAGGCATCTTCATAATTAAATCAATTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGACAAGCTACCTTCTAAGAGGCATCTTCATAATTAAATCAATTAG  850

seq1  CCATCTCCTGTATTCAACCCCATCTAGAGCAGTTCTAAAGGACCTAGAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCCTGTATTCAACCCCATCTAGAGCAGTTCTAAAGGACCTAGAAC  900

seq1  TGTAGCTTGGTGGGTGAGTGTCTGACTAGCACATGCAAGACCCAAGATTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTTGGTGGGTGAGTGTCTGACTAGCACATGCAAGACCCAAGATTG  950

seq1  AACCCGCAGAAACCCCAAATTAAAAGAAGGACATAGAGTTATCACTTATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCGCAGAAACCCCAAATTAAAAGAAGGACATAGAGTTATCACTTATT  1000

seq1  GAGCATGGATTTTTCAGTG-TTGTGAGTTTGGAGTTTTGTATGCAGAAGG  1049
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAGCATGGATTTTTCAGTGTTTGTGAGTTTGGAGTTTTGTATGCAGAA-G  1049

seq1  CATTTATTGATCAAACCCTGTGCAACTA-TGTAACTATTTCAGAAAAGTT  1098
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
seq2  CATTTATTGATCAAACCCTGTGC-ACTATTGTAACTATTTCAGAAAAGTT  1098

seq1  ACT-ATAGGCCACATGTAGCTTACAGAAA-GAGTGATTTCTTGGCATGTA  1146
      ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||
seq2  ACTAATAGGCCACATGTAGC-TACAGAAAGGAGTGATTTCTT-GCATGTA  1146

seq1  C  1147
      |
seq2  C  1147

seq1: chr3_60090719_60091757
seq2: B6Ng01-173B14.g_68_1102 (reverse)

seq1  GTCTCATTGGGGAAAATCTAT-AGATGCATTTGATGGAATAACAATAATT  49
      |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  GTCTCA-TGGGGAAAATCTATAAGATGCA-TTGAT-GAATAACAATAATT  47

seq1  ACTTAGTCATGTAGAATAAACTGTAAGGATCTGTGGTTAATTTGCATTGC  99
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACTTAGTCATGTAGAATAAACTGTAAGGATCTGTGGTTAA-TTGCATTGC  96

seq1  TAAATTTTCTTTAAAAATCAATTTAAAACAAAATATGTATTTCAGTAGAT  149
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAA-TTTCTTTAAAAATCAATTTAAAACAAAATATGTATTTCAGTAGAT  145

seq1  CTTTCTGCAGCAATAAAATGGAACTATTAGAATATATATAAAATAAGCCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGCAGCAATAAAATGGAACTATTAGAATATATATAAAATAAGCCC  195

seq1  AAAATCATATGATTAAAAGGGTTCAATTACAACGAACTCTTTCCTTCAAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCATATGATTAAAAGGGTTCAATTACAACGAACTCTTTCCTTCAAG  245

seq1  ATTATTCACTTATCTCCACATTTAAATTGATATTTTATCATTTATGATAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTCACTTATCTCCACATTTAAATTGATATTTTATCATTTATGATAA  295

seq1  AATTCCAAGCAATATGAGAATTCATACAGGCATTTTGTTGCTTTCCTTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAAGCAATATGAGAATTCATACAGGCATTTTGTTGCTTTCCTTGA  345

seq1  TATTTATACTAAAACAGTCATAGATAATTTTGCTAATCTGCCTGTGAACC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATACTAAAACAGTCATAGATAATTTTGCTAATCTGCCTGTGAACC  395

seq1  AATTATGACTTCTAGAATAGTTTACCACCATGAGACTTTGCTGGCATAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATGACTTCTAGAATAGTTTACCACCATGAGACTTTGCTGGCATAAT  445

seq1  CAATTCCTTAAGTACATAAGGTTGCTATAAGCCCTACACTCATGAAGTTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCCTTAAGTACATAAGGTTGCTATAAGCCCTACACTCATGAAGTTT  495

seq1  TTGCCATGTTTCTTGCAGAACTGATCATGAGTACTGTGCCTGAGTTTCTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCATGTTTCTTGCAGAACTGATCATGAGTACTGTGCCTGAGTTTCTT  545

seq1  CTCTCTGTATATGTGGATAATTGTATCATGGATGACTGAAGGACAACTAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGTATATGTGGATAATTGTATCATGGATGACTGAAGGACAACTAG  595

seq1  AGAAGTTACTTAGGCTGGCATCAGAGCTGCAGCATGACTGCTGTGGTAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTACTTAGGCTGGCATCAGAGCTGCAGCATGACTGCTGTGGTAAA  645

seq1  TTTTAATATTAATTGGGGGTTTCTACCCTGACTTTGATCATTCATTTCTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATATTAATTGGGGGTTTCTACCCTGACTTTGATCATTCATTTCTC  695

seq1  AGATAAAAGTAATGAAACCTTACATTTATAATAAGCCTTTAAGAGCATTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAAAAGTAATGAAACCTTACATTTATAATAAGCCTTTAAGAGCATTA  745

seq1  GAGCTGGACAGCCATCAACCCTCTTTGGCTATTTTGTCTACTTCCCTGTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGACAGCCATCAACCCTCTTTGGCTATTTTGTCTACTTCCCTGTC  795

seq1  AATAATCCTGAGTTATAATTTGCCATGTTCCACCTAGGCTGCTCTTATCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATCCTGAGTTATAATTTGCCATGTTCCACCTAGGCTGCTCTTATCC  845

seq1  AATTGGCCAACCCTCATGGCCATGTTGTCAGGATTCACCTCCCTCATTGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGCCAACCCTCATGGCCATGTTGTCAGGATTCACCTCCCTCATTGC  895

seq1  ATCTTCTTCTCTCTCTCTTCACTACTCTCTCTTTTATCTCCTTGTGTTCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCTTCTCTCTCTCTTCACTACTCTCTCTTTTATCTCCTTGTGTTCT  945

seq1  CTGCCTCAGACCCCAAGCTTGGAAACTGATGCTCTGCCTACCTCTCTTCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCAGACCCCAAGCTTGGAAACTGATGCTCTGCCTACCTCTCTTCT  995

seq1  CCCCAGCTATAGGCTGTGTATATCTTTATTCAATGAATTC  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGCTATAGGCTGTGTATATCTTTATTCAATGAATTC  1035