seq1: chr3_7850053_7850162
seq2: B6Ng01-247D24.b_51_160
seq1 TCACCTGAGGAATACCGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAAAAATGTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCACCTGAGGAATACCGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAAAAATGTTC 50
seq1 AACATCCTTTAGCAATTTCTAAAGATGCCTATAGATGGATGGGTAGGGGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACATCCTTTAGCAATTTCTAAAGATGCCTATAGATGGATGGGTAGGGGA 100
seq1 TTGGGGGGGG 110
||||||||||
seq2 TTGGGGGGGG 110
| seq1: chr3_7943214_7944311
seq2: B6Ng01-247D24.g_66_1169 (reverse)
seq1 --CTCTCTC--TCTTTCTCTC-TCTGTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCAT 45
||||||| || ||||||| || |||||||||| || ||||||||
seq2 CTCTCTCTCCTTCCTTCTCTCATCCGTCTCTCTCTCTCCTCCTCTCTCAA 50
seq1 TTTGGGAAATTTTATTT-CCATATTCTTTGTATGGTAAGCATCAGAGTCA 94
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TT--GGAAATTTTATTTCCCATATTCTTTGTATGGTAAGCATCAGAGTCA 98
seq1 GAAACTTTGTCCTGCTCATCACTAGAATT-CCCAGGACTGAAGTAGGCCT 143
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2 GAAACTTTGTCCTGCTCATCACTAGAATTCCCCAGGACTGAAGTAGGCCT 148
seq1 GCCTCATCTGCGTTAGTTATAATAATATTTGAATGAATGAGCAAGTGAAT 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCTCATCTGCGTTAGTTATAATAATATTTGAATGAATGAGCAAGTGAAT 198
seq1 GAATGAATGGATGGATGGATGAATAAAAATTATGGAAATTTCACCCTTGA 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATGAATGGATGGATGGATGAATAAAAATTATGGAAATTTCACCCTTGA 248
seq1 -TTTCCATTCTTTTCTTTAGAATGAGACTCTTTTCTCATTCGCAGCAAAC 292
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTTCCATTCTTTTCTTTAGAATGAGACTCTTTTCTCATTCGCAGCAAAC 298
seq1 CTGACTTGATTGGCTGTGATGGACTTACCCCTCCTGAATGGTTACAACAG 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGACTTGATTGGCTGTGATGGACTTACCCCTCCTGAATGGTTACAACAG 348
seq1 ATCCAACCTGTATAAAATGAAAATAAAATAAACAATTAGATGTAATGGCA 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCCAACCTGTATAAAATGAAAATAAAATAAACAATTAGATGTAATGGCA 398
seq1 TTGGGGTTAACTGCATCTTCCTGTCAAGGACACTGGAAATTAGATATGCT 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGGGGTTAACTGCATCTTCCTGTCAAGGACACTGGAAATTAGATATGCT 448
seq1 GCTACAGGGCATGAACCTCTATACAATAACAGTTGCAGATTCAAAGCTTT 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTACAGGGCATGAACCTCTATACAATAACAGTTGCAGATTCAAAGCTTT 498
seq1 GGCTCTGCAGTGTTTGGCAGTTTCTATGGGAACAATATGATTCTGTTCTG 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTCTGCAGTGTTTGGCAGTTTCTATGGGAACAATATGATTCTGTTCTG 548
seq1 TTTATAAGCTTAAAATACATGGTGGCAGGAAAGTGCTGCTGTAACAAACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTATAAGCTTAAAATACATGGTGGCAGGAAAGTGCTGCTGTAACAAACC 598
seq1 ACATGTGGATGATTCAAAAGATGGAAGCCCATAAAAATTAATGATCAGAG 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACATGTGGATGATTCAAAAGATGGAAGCCCATAAAAATTAATGATCAGAG 648
seq1 AAGAATGTGGGCTAGTAAATCAATGGCCACATTATTAAAAACAGAGGAAA 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAATGTGGGCTAGTAAATCAATGGCCACATTATTAAAAACAGAGGAAA 698
seq1 TGTAATTGGCCACATATAGTCACAGTCTATGGAGGCACGGGGCTCGAGGC 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTAATTGGCCACATATAGTCACAGTCTATGGAGGCACGGGGCTCGAGGC 748
seq1 ACTGAGCTCTTTAAGCCAGTTATGTACATACACTCACACAGAGCAACATG 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTGAGCTCTTTAAGCCAGTTATGTACATACACTCACACAGAGCAACATG 798
seq1 CAGAGGGAGTATTATGTTGCAACAGCCTGACAGAAAGGAACTCTATCCTC 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGAGGGAGTATTATGTTGCAACAGCCTGACAGAAAGGAACTCTATCCTC 848
seq1 TAGTAATACTTTTCTTGACATCTAATTAGCAATTATGAAAACGACTTAAC 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGTAATACTTTTCTTGACATCTAATTAGCAATTATGAAAACGACTTAAC 898
seq1 AGTGAGAACAAGTAACTCAAGTAAAACCACCCTCATAAATTAGTGCTGTC 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGAGAACAAGTAACTCAAGTAAAACCACCCTCATAAATTAGTGCTGTC 948
seq1 GGATCCACTTGTAAGCAAAGGGGGCTTTGGAAAGAACAGACTCCAGGTAA 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGATCCACTTGTAAGCAAAGGGGGCTTTGGAAAGAACAGACTCCAGGTAA 998
seq1 CAACGGAAACGCAGCACCCCAGCGCTCCACATCTTCCCTTAATTGCCTCA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAACGGAAACGCAGCACCCCAGCGCTCCACATCTTCCCTTAATTGCCTCA 1048
seq1 GCTTCTTGAGGCAGAAAAACGAAAGCTTATTCTTTTAACAGGCCACTAAA 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTTCTTGAGGCAGAAAAACGAAAGCTTATTCTTTTAACAGGCCACTAAA 1098
seq1 GAATTC 1098
||||||
seq2 GAATTC 1104
|