BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-255D03
Chromosome3 (Build37)
Map Location 59,999,513 - 60,124,224
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneP2ry13, P2ry12, Igsf10, EG666751, EG666756, EG229330, EG435732, LOC433597, LOC433598, LOC100040407, LOC669780, EG666803, C130079G13Rik, LOC676914, Aadacl2, Aadac, Sucnr1
Downstream geneLOC669823, LOC100040485, Mbnl1, LOC676933, LOC100040501, EG666853, P2ry1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-255D03.bB6Ng01-255D03.g
ACCGA061463GA061464
length9741,117
definitionB6Ng01-255D03.b B6Ng01-255D03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,999,513 - 60,000,486)(60,123,107 - 60,124,224)
sequence
gaattccaatactagtaaaatgtttatggttttttctttgtgtgtgtgtg
tgtgcgagagagagagagagatgggtgggggagacacaaaggaagaacta
cctagtgctatggcatgacaaagagttcaaataagtatttaagaagatca
cctcttcaagttctgcagctctcatgggatgagctacagcttgcaatgag
gatggtggagcaggtaaaaggcacagaagtgaatggagccatgatagaat
cttcttttgtctggagtgtatcagattgcttatattgaggaggacaccgt
catcaggttctggaaaaatagtaatactcactgaactccaaatctgcctt
caactatgggtctgaaataacattggcccagtagaccatacagaatacag
ttttctgaagttatccatgtcctaatctttgaaatttctgaattttattt
tacatggcatggggatattgaggttatcatcaagttaaagcttctatcca
atgtaactgtttaattactaaaatgtggagaacctttctgcagtttgatg
agtcagataaactgtaggatctgtgatgcagtgaggctgcctgcaaagaa
aaatgaaattatgagtcatggattgtggcagcttctacgtgctgagaata
gccagggcaagtactcctggaattttaggaaagagcacagccttctagtt
tatgttattctatacgctgaatttgcattaagctaccaactcgtaaccat
ttttcacaacattgcagagtgttgagtcatgtacacccccaaaacatatg
tcaacctccaagtttacagaatgtttataaattataaatattattagcat
ttctactgataatatatctaagaattattgcagtagtttctattatgttt
atatgtatgtatatacatatatagacttcctgtgtgtagtagtagtagta
atagtagtagtagtagtagtagta
gaattctcctccactcctctagcaccatatttaccttcctgctgccttgc
ttcctgcctgataatggactagacttctgaaactgtaagctatccccaat
tcaatgtttgcctatttaagagtagccttggtcattgtgtcttcacagaa
atggaaattctaatgacgatacctttaaacctgatactggagagggcagc
tgtgcctcatgtggggtgacagtgagaagtctcttgctctggaggagcta
ggtggtgaccctccctgattactctcctggggaaaatcctagtcaattgt
aagcaatgtgtgcacagacatcaaaagacagggagaagaactctcaaaag
aggagcaagggaagctaactttcccatgtatgtacatacgcaaggggaaa
agtgcttgtccaagttaaggatgttcagggccacttatggctttcagtaa
ggataaacatgggaacaatatcagtgtccccaagcatccttgatactgtc
atctttgagagaagatcactgaggtcaaagccacatatcaaaggtcactg
ttattgagtttgaatgctaactgatttttaaaatgtggcatttgtatact
cattacttggcaatgttagtatataggtgtgtggtagattctttaatgct
ttgagactataaacaggtctctccaatggcgatcaatataacatgaaaaa
agttacatgctagttttctgtaggttaatttgtcactgtttatcacttgc
tactggtacatttcgaagatcaacaaattgttgacctttaattaaactat
agcaaggaaggtactactgcaaaaaccagcacatgctaaacagcactgct
tcacttgttgttctgttgattatacctataatatttttggaagaaacctt
tgtattaaacttgaagtaatttgcttagagtcactaggttagaaatgaca
caatttctctgctcaatttattttactagatctttgaaatgttctctatt
actaatagtgagtggcattgctctctctgtctctctgtctctgtccttgt
ctctgtgtctctctgactgccaacattaatgagtggctaacaaatattaa
cctcgaatcctgcacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_59999513_60000486
seq2: B6Ng01-255D03.b_44_1017

seq1  GAATTCCAATACTAGTAAAATGTTTATGGTTTTTTCTTTGTGTGTGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATACTAGTAAAATGTTTATGGTTTTTTCTTTGTGTGTGTGTG  50

seq1  TGTGCGAGAGAGAGAGAGAGATGGGTGGGGGAGACACAAAGGAAGAACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGAGAGAGAGAGAGAGATGGGTGGGGGAGACACAAAGGAAGAACTA  100

seq1  CCTAGTGCTATGGCATGACAAAGAGTTCAAATAAGTATTTAAGAAGATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTGCTATGGCATGACAAAGAGTTCAAATAAGTATTTAAGAAGATCA  150

seq1  CCTCTTCAAGTTCTGCAGCTCTCATGGGATGAGCTACAGCTTGCAATGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCAAGTTCTGCAGCTCTCATGGGATGAGCTACAGCTTGCAATGAG  200

seq1  GATGGTGGAGCAGGTAAAAGGCACAGAAGTGAATGGAGCCATGATAGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGGAGCAGGTAAAAGGCACAGAAGTGAATGGAGCCATGATAGAAT  250

seq1  CTTCTTTTGTCTGGAGTGTATCAGATTGCTTATATTGAGGAGGACACCGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTTGTCTGGAGTGTATCAGATTGCTTATATTGAGGAGGACACCGT  300

seq1  CATCAGGTTCTGGAAAAATAGTAATACTCACTGAACTCCAAATCTGCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGGTTCTGGAAAAATAGTAATACTCACTGAACTCCAAATCTGCCTT  350

seq1  CAACTATGGGTCTGAAATAACATTGGCCCAGTAGACCATACAGAATACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTATGGGTCTGAAATAACATTGGCCCAGTAGACCATACAGAATACAG  400

seq1  TTTTCTGAAGTTATCCATGTCCTAATCTTTGAAATTTCTGAATTTTATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGAAGTTATCCATGTCCTAATCTTTGAAATTTCTGAATTTTATTT  450

seq1  TACATGGCATGGGGATATTGAGGTTATCATCAAGTTAAAGCTTCTATCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGGCATGGGGATATTGAGGTTATCATCAAGTTAAAGCTTCTATCCA  500

seq1  ATGTAACTGTTTAATTACTAAAATGTGGAGAACCTTTCTGCAGTTTGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAACTGTTTAATTACTAAAATGTGGAGAACCTTTCTGCAGTTTGATG  550

seq1  AGTCAGATAAACTGTAGGATCTGTGATGCAGTGAGGCTGCCTGCAAAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGATAAACTGTAGGATCTGTGATGCAGTGAGGCTGCCTGCAAAGAA  600

seq1  AAATGAAATTATGAGTCATGGATTGTGGCAGCTTCTACGTGCTGAGAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAATTATGAGTCATGGATTGTGGCAGCTTCTACGTGCTGAGAATA  650

seq1  GCCAGGGCAAGTACTCCTGGAATTTTAGGAAAGAGCACAGCCTTCTAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGGCAAGTACTCCTGGAATTTTAGGAAAGAGCACAGCCTTCTAGTT  700

seq1  TATGTTATTCTATACGCTGAATTTGCATTAAGCTACCAACTCGTAACCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTATTCTATACGCTGAATTTGCATTAAGCTACCAACTCGTAACCAT  750

seq1  TTTTCACAACATTGCAGAGTGTTGAGTCATGTACACCCCCAAAACATATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCACAACATTGCAGAGTGTTGAGTCATGTACACCCCCAAAACATATG  800

seq1  TCAACCTCCAAGTTTACAGAATGTTTATAAATTATAAATATTATTAGCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCTCCAAGTTTACAGAATGTTTATAAATTATAAATATTATTAGCAT  850

seq1  TTCTACTGATAATATATCTAAGAATTATTGCAGTAGTTTCTATTATGTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACTGATAATATATCTAAGAATTATTGCAGTAGTTTCTATTATGTTT  900

seq1  ATATGTATGTATATACATATATAGACTTCCTGTGTGTAGTAGTAGTAGTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTATGTATATACATATATAGACTTCCTGTGTGTAGTAGTAGTAGTA  950

seq1  ATAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTA  974
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTA  974

seq1: chr3_60123107_60124224
seq2: B6Ng01-255D03.g_67_1183 (reverse)

seq1  CTGTGCA-GAATCGAAGTTAATA-TTGTTAGCCACTCAATTTATGTTTGC  48
      ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||
seq2  CTGTGCAGGATTCGAGGTTAATATTTGTTAGCCACTC-ATTAATGTTGGC  49

seq1  AAGTCAGAGAGACACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGC  98
       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
seq2  -AGTCAGAGAGACACAGAGACAAGGACAGAGACAGAGAGACAGAGAGAGC  98

seq1  AATGCCACTCACTTATTAGTAATAGAG-ACATTTCAAAGATCTAGTAAAA  147
      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCACTCAC-TATTAGTAATAGAGAACATTTCAAAGATCTAGTAAAA  147

seq1  TAAATTTGAGCAGAGAAATTGTGTCATTTCTAACCTAGTGACTCTAAGCA  197
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAA-TTGAGCAGAGAAATTGTGTCATTTCTAACCTAGTGACTCTAAGCA  196

seq1  AATTACTTCAAGTTTAATACAAAGGTTTCTTCCAAAAATATTATAGGTAT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACTTCAAGTTTAATACAAAGGTTTCTTCCAAAAATATTATAGGTAT  246

seq1  AATCAACAGAACAACAAGTGAAGCAGTGCTGTTTAGCATGTGCTGGTTTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAACAGAACAACAAGTGAAGCAGTGCTGTTTAGCATGTGCTGGTTTT  296

seq1  TGCAGTAGTACCTTCCTTGCTATAGTTTAATTAAAGGTCAACAATTTGTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTAGTACCTTCCTTGCTATAGTTTAATTAAAGGTCAACAATTTGTT  346

seq1  GATCTTCGAAATGTACCAGTAGCAAGTGATAAACAGTGACAAATTAACCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTCGAAATGTACCAGTAGCAAGTGATAAACAGTGACAAATTAACCT  396

seq1  ACAGAAAACTAGCATGTAACTTTTTTCATGTTATATTGATCGCCATTGGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAACTAGCATGTAACTTTTTTCATGTTATATTGATCGCCATTGGA  446

seq1  GAGACCTGTTTATAGTCTCAAAGCATTAAAGAATCTACCACACACCTATA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCTGTTTATAGTCTCAAAGCATTAAAGAATCTACCACACACCTATA  496

seq1  TACTAACATTGCCAAGTAATGAGTATACAAATGCCACATTTTAAAAATCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAACATTGCCAAGTAATGAGTATACAAATGCCACATTTTAAAAATCA  546

seq1  GTTAGCATTCAAACTCAATAACAGTGACCTTTGATATGTGGCTTTGACCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCATTCAAACTCAATAACAGTGACCTTTGATATGTGGCTTTGACCT  596

seq1  CAGTGATCTTCTCTCAAAGATGACAGTATCAAGGATGCTTGGGGACACTG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGATCTTCTCTCAAAGATGACAGTATCAAGGATGCTTGGGGACACTG  646

seq1  ATATTGTTCCCATGTTTATCCTTACTGAAAGCCATAAGTGGCCCTGAACA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTTCCCATGTTTATCCTTACTGAAAGCCATAAGTGGCCCTGAACA  696

seq1  TCCTTAACTTGGACAAGCACTTTTCCCCTTGCGTATGTACATACATGGGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAACTTGGACAAGCACTTTTCCCCTTGCGTATGTACATACATGGGA  746

seq1  AAGTTAGCTTCCCTTGCTCCTCTTTTGAGAGTTCTTCTCCCTGTCTTTTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTAGCTTCCCTTGCTCCTCTTTTGAGAGTTCTTCTCCCTGTCTTTTG  796

seq1  ATGTCTGTGCACACATTGCTTACAATTGACTAGGATTTTCCCCAGGAGAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGTGCACACATTGCTTACAATTGACTAGGATTTTCCCCAGGAGAG  846

seq1  TAATCAGGGAGGGTCACCACCTAGCTCCTCCAGAGCAAGAGACTTCTCAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCAGGGAGGGTCACCACCTAGCTCCTCCAGAGCAAGAGACTTCTCAC  896

seq1  TGTCACCCCACATGAGGCACAGCTGCCCTCTCCAGTATCAGGTTTAAAGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACCCCACATGAGGCACAGCTGCCCTCTCCAGTATCAGGTTTAAAGG  946

seq1  TATCGTCATTAGAATTTCCATTTCTGTGAAGACACAATGACCAAGGCTAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCGTCATTAGAATTTCCATTTCTGTGAAGACACAATGACCAAGGCTAC  996

seq1  TCTTAAATAGGCAAACATTGAATTGGGGATAGCTTACAGTTTCAGAAGTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAATAGGCAAACATTGAATTGGGGATAGCTTACAGTTTCAGAAGTC  1046

seq1  TAGTCCATTATCAGGCAGGAAGCAAGGCAGCAGGAAGGTAAATATGGTGC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCATTATCAGGCAGGAAGCAAGGCAGCAGGAAGGTAAATATGGTGC  1096

seq1  TAGAGGAGTGGAGGAGAATTC  1118
      |||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGAGTGGAGGAGAATTC  1117