BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256K15
Chromosome3 (Build37)
Map Location 14,882,827 - 15,004,392
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCar2, EG634323
Upstream gene0710005M24Rik, EG622229, LOC668062, Slc7a12, LOC668068, Lrrcc1, E2f5, 1810022K09Rik, LOC100039929, Car13, EG545507, Car1, LOC100041785, Car3
Downstream geneLOC100039985, LOC751864, Sirpb1, LOC668101, LOC100038947, LOC622425, LOC664795, LOC381484
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256K15.bB6Ng01-256K15.g
ACCGA062564GA062565
length1,1261,094
definitionB6Ng01-256K15.b B6Ng01-256K15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,882,827 - 14,883,937)(15,003,294 - 15,004,392)
sequence
gaattctccctcatcagtttacaatggagcaggggaagttgcaagagact
gcctatgttgctcagggctatactgaagccctatcgtggactccactcac
actgaaagcttaaatctaatttcacaaatggggacttctcccgatgataa
cagggacactaacagaggagttaataacacaggaagccacagctaagcca
cataagtgaaatttatcactcagcagccctgggtatgctatatgtattcc
acacatgaacatggaggcttgaagactagaacaaatcatgcaggcttatg
tagaaggtaagacctagagacacagtacaaatccacaaaacctggctctc
attccttaagaggaatgctggtaggttcacaggccaaaagggaagccaga
gccagagtttccatatcaaagggacttggatctttttctggaagtaattc
ttagaaagacacacagaaaggcacaggtagcaagagtcacccagaccctc
cgtcttgtctgtaaaatgaagagatgaattagattgcctaaagctcctaa
ttgtcttagttctagtctgtgttattctctcctttgcatctgtcccctgg
cttccttgtacacttaaacagaaaacctctccttggtacagtggtctgta
ctgcccttctggctgcaagtcctgcctggctgatgtcactgcttgtcttc
tttttcttcatcccagtgataaagctagaaacttctttgagcaggctttt
atactgacttcttgtatgtgagctgttctgttcctggtccttccttactg
gttctttaaagggcttccttcagcagggcttctaggactctcggtgtgag
agtggcctcttatcctgtgccactctgcctcatccctggctctcgagctt
cacactcattggcacggctgggaattcaccttgcttgtgtttgctcactg
ttccctacagccttccacatccactcatcatgggactccaagaggatcgg
catcaagtttgacatgggtagcggcccaaagtagcacttggagatctttg
ggaagtgatggggctaccttatggtaggccccccaacatattggcaaaat
attgtaggcaccttaggtagtagctc
gaattcaatgatttggttgactgccagcttgatggggtagacaacccatt
ggaaataaacaaaagcattttctaaaaaaaaaaaacccaaaatgcttttg
cttggggagcacaaatagcaatgtaactagccaccttgagctcactatag
tgtgttcttttcacctttgtaaaatcattgttaaggacaatgggcacagt
aagtactgtgggattgaatacatttgggcttagtgatccaatgccggaaa
gcacaccaggaacagaaatcctcacataagagtcaacccattaattacat
tttgtttactaagctaaaaaatagatcgtagacatgtttcaacaaggaac
aactaaaagagcattttgctccgacctcattttgtaaaatccaattatct
gggacaatgctttgtttgaatagtctcactttattgagataaaggctcct
tgaaaaaaagaaaaccctactttatggaaaccagataactcaagcgaagc
atacaaatgaatgccagacatattaaaggtactggaaataagaatgcaga
cagaaagaactgcttcatctggtgtggtcatgcatatgcattgtgacttt
taacttcctgttttgctttgatttatattcatcctcctcatctctaaaag
ttcagcatctctgtgacaggtgcaatgtcaaagcgcacgaacagacctta
gttgagctccaaatgtatcttacaagtggagtcagagcaaacgatgttcc
ccagagtgccacagaagggaaaggaaagtgacttagggaacacaggcagt
ctctagtcaaaggtaagtgagtgagtgggtgggcatctctgcacctgcat
ctgacagggcagaggaaggagcaagggacacatctgccatgagagcagga
ctctgttcccaaaaggattgttcacagtttaagttttatgactcagccaa
gccctggtctccgagaaacttagtctgcatgttagtaattcataagaagt
ccaggcttggaggatagaggggctggaaatatgatctaaaggaaaagtca
gatctcagtcacctcagaatggacgttgctgacccagagctgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_14882827_14883937
seq2: B6Ng01-256K15.b_47_1172

seq1  GAATTCTCCCTCATCAGTTTACAATGGAGCAGGGGAAGTTGCAAGAGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCTCATCAGTTTACAATGGAGCAGGGGAAGTTGCAAGAGACT  50

seq1  GCCTATGTTGCTCAGGGCTATACTGAAGCCCTATCGTGGACTCCACTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATGTTGCTCAGGGCTATACTGAAGCCCTATCGTGGACTCCACTCAC  100

seq1  ACTGAAAGCTTAAATCTAATTTCACAAATGGGGACTTCTCCCGATGATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAGCTTAAATCTAATTTCACAAATGGGGACTTCTCCCGATGATAA  150

seq1  CAGGGACACTAACAGAGGAGTTAATAACACAGGAAGCCACAGCTAAGCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGACACTAACAGAGGAGTTAATAACACAGGAAGCCACAGCTAAGCCA  200

seq1  CATAAGTGAAATTTATCACTCAGCAGCCCTGGGTATGCTATATGTATTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGTGAAATTTATCACTCAGCAGCCCTGGGTATGCTATATGTATTCC  250

seq1  ACACATGAACATGGAGGCTTGAAGACTAGAACAAATCATGCAGGCTTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGAACATGGAGGCTTGAAGACTAGAACAAATCATGCAGGCTTATG  300

seq1  TAGAAGGTAAGACCTAGAGACACAGTACAAATCCACAAAACCTGGCTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGTAAGACCTAGAGACACAGTACAAATCCACAAAACCTGGCTCTC  350

seq1  ATTCCTTAAGAGGAATGCTGGTAGGTTCACAGGCCAAAAGGGAAGCCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTTAAGAGGAATGCTGGTAGGTTCACAGGCCAAAAGGGAAGCCAGA  400

seq1  GCCAGAGTTTCCATATCAAAGGGACTTGGATCTTTTTCTGGAAGTAATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGTTTCCATATCAAAGGGACTTGGATCTTTTTCTGGAAGTAATTC  450

seq1  TTAGAAAGACACACAGAAAGGCACAGGTAGCAAGAGTCACCCAGACCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAAGACACACAGAAAGGCACAGGTAGCAAGAGTCACCCAGACCCTC  500

seq1  CGTCTTGTCTGTAAAATGAAGAGATGAATTAGATTGCCTAAAGCTCCTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTTGTCTGTAAAATGAAGAGATGAATTAGATTGCCTAAAGCTCCTAA  550

seq1  TTGTCTTAGTTCTAGTCTGTGTTATTCTCTCCTTTGCATCTGTCCCCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTAGTTCTAGTCTGTGTTATTCTCTCCTTTGCATCTGTCCCCTGG  600

seq1  CTTCCTTGTACACTTAAACAGAAAACCTCTCCTTGGTACAGTGGTCTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTGTACACTTAAACAGAAAACCTCTCCTTGGTACAGTGGTCTGTA  650

seq1  CTGCCCTTCTGGCTGCAAGTCCTGCCTGGCTGATGTCACTGCTTGTCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTTCTGGCTGCAAGTCCTGCCTGGCTGATGTCACTGCTTGTCTTC  700

seq1  TTTTTCTTCATCCCAGTGATAAAGCTAGAAACTTCTTTGAGCAGGCTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTTCATCCCAGTGATAAAGCTAGAAACTTCTTTGAGCAGGCTTTT  750

seq1  ATACTGACTTCTTGTATGTGAGCTGTTCTGTTCCTGGTCCTTCCTTACTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGACTTCTTGTATGTGAGCTGTTCTGTTCCTGGTCCTTCCTTACTG  800

seq1  GTTCTTT-AAGGGCTTCCTTCAGCAGGGCTTCTAGGACTCTCGGTGTGAG  849
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTTAAAGGGCTTCCTTCAGCAGGGCTTCTAGGACTCTCGGTGTGAG  850

seq1  AGTGGCCTCTTATCCTGTGCCACTCTGCCTCATCCCTGGCTCTCGAGCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCTCTTATCCTGTGCCACTCTGCCTCATCCCTGGCTCTCGAGCTT  900

seq1  CACACTCATTGGCACGGCT-GGAATTCACCTTGCTTGTGTTTGCTCACTG  948
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCATTGGCACGGCTGGGAATTCACCTTGCTTGTGTTTGCTCACTG  950

seq1  TTCCCTACAGCC-TCCACATCCACTCATCAT-GGACTCCAAGAAGATCGG  996
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  TTCCCTACAGCCTTCCACATCCACTCATCATGGGACTCCAAGAGGATCGG  1000

seq1  CATCAAG-TTGACAT-GGTAGCGGCCCAAAGTAGCACTT-GAGATC-TTG  1042
      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||
seq2  CATCAAGTTTGACATGGGTAGCGGCCCAAAGTAGCACTTGGAGATCTTTG  1050

seq1  GGAAGTGAATGGGTTTACCTTAT-GTA-GCCCCCCAACATAT--GGAAAA  1088
      ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||
seq2  GGAAGTG-ATGGGGCTACCTTATGGTAGGCCCCCCAACATATTGGCAAAA  1099

seq1  TA-TGTA-GCA-CTTA-GTAGTAGCTC  1111
      || |||| ||| |||| ||||||||||
seq2  TATTGTAGGCACCTTAGGTAGTAGCTC  1126

seq1: chr3_15003294_15004392
seq2: B6Ng01-256K15.g_66_1159 (reverse)

seq1  TACAGCTCCTGTGTCAGCAACGTCCCATTCTGA-GTGACTGAGATCTGAC  49
      ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TACAGCT-CTGGGTCAGCAACGT-CCATTCTGAGGTGACTGAGATCTGAC  48

seq1  TTTTTCCTTTAGAATCATATTTCCAG-CCCTCTATCCCTCCAAGCCTGGG  98
       ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
seq2  -TTTTCCTTTAG-ATCATATTTCCAGCCCCTCTAT-CCTCCAAGCCT-GG  94

seq1  ACTTCTTATGAATTACTAACATGCAGACTAAGTTTCTCGGAGACCAGGGC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTTATGAATTACTAACATGCAGACTAAGTTTCTCGGAGACCAGGGC  144

seq1  TTGGCTGAGTCATAAAACTTAAACTGTGAAACAATCCTTTTGGGAACAGA  198
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGAGTCATAAAACTTAAACTGTG-AACAATCCTTTTGGGAACAGA  193

seq1  GTCCTGCTCTCATGGCAGATGTGTCCCTTGCTCCTTCCTCTGCCCTGTCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGCTCTCATGGCAGATGTGTCCCTTGCTCCTTCCTCTGCCCTGTCA  243

seq1  GATGCAGGTGCAGAGATGCCCACCCACTCACTCACTTACCTTTGACTAGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGGTGCAGAGATGCCCACCCACTCACTCACTTACCTTTGACTAGA  293

seq1  GACTGCCTGTGTTCCCTAAGTCACTTTCCTTTCCCTTCTGTGGCACTCTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCCTGTGTTCCCTAAGTCACTTTCCTTTCCCTTCTGTGGCACTCTG  343

seq1  GGGAACATCGTTTGCTCTGACTCCACTTGTAAGATACATTTGGAGCTCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACATCGTTTGCTCTGACTCCACTTGTAAGATACATTTGGAGCTCAA  393

seq1  CTAAGGTCTGTTCGTGCGCTTTGACATTGCACCTGTCACAGAGATGCTGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGTCTGTTCGTGCGCTTTGACATTGCACCTGTCACAGAGATGCTGA  443

seq1  ACTTTTAGAGATGAGGAGGATGAATATAAATCAAAGCAAAACAGGAAGTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTAGAGATGAGGAGGATGAATATAAATCAAAGCAAAACAGGAAGTT  493

seq1  AAAAGTCACAATGCATATGCATGACCACACCAGATGAAGCAGTTCTTTCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTCACAATGCATATGCATGACCACACCAGATGAAGCAGTTCTTTCT  543

seq1  GTCTGCATTCTTATTTCCAGTACCTTTAATATGTCTGGCATTCATTTGTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCATTCTTATTTCCAGTACCTTTAATATGTCTGGCATTCATTTGTA  593

seq1  TGCTTCGCTTGAGTTATCTGGTTTCCATAAAGTAGGGTTTTCTTTTTTTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCGCTTGAGTTATCTGGTTTCCATAAAGTAGGGTTTTCTTTTTTTC  643

seq1  AAGGAGCCTTTATCTCAATAAAGTGAGACTATTCAAACAAAGCATTGTCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGCCTTTATCTCAATAAAGTGAGACTATTCAAACAAAGCATTGTCC  693

seq1  CAGATAATTGGATTTTACAAAATGAGGTCGGAGCAAAATGCTCTTTTAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAATTGGATTTTACAAAATGAGGTCGGAGCAAAATGCTCTTTTAGT  743

seq1  TGTTCCTTGTTGAAACATGTCTACGATCTATTTTTTAGCTTAGTAAACAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTTGTTGAAACATGTCTACGATCTATTTTTTAGCTTAGTAAACAA  793

seq1  AATGTAATTAATGGGTTGACTCTTATGTGAGGATTTCTGTTCCTGGTGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAATTAATGGGTTGACTCTTATGTGAGGATTTCTGTTCCTGGTGTG  843

seq1  CTTTCCGGCATTGGATCACTAAGCCCAAATGTATTCAATCCCACAGTACT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCGGCATTGGATCACTAAGCCCAAATGTATTCAATCCCACAGTACT  893

seq1  TACTGTGCCCATTGTCCTTAACAATGATTTTACAAAGGTGAAAAGAACAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTGCCCATTGTCCTTAACAATGATTTTACAAAGGTGAAAAGAACAC  943

seq1  ACTATAGTGAGCTCAAGGTGGCTAGTTACATTGCTATTTGTGCTCCCCAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAGTGAGCTCAAGGTGGCTAGTTACATTGCTATTTGTGCTCCCCAA  993

seq1  GCAAAAGCATTTTGGGTTTTTTTTTTTTAGAAAATGCTTTTGTTTATTTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAGCATTTTGGGTTTTTTTTTTTTAGAAAATGCTTTTGTTTATTTC  1043

seq1  CAATGGGTTGTCTACCCCATCAAGCTGGCAGTCAACCAAATCATTGAATT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGGTTGTCTACCCCATCAAGCTGGCAGTCAACCAAATCATTGAATT  1093

seq1  C  1099
      |
seq2  C  1094