BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-292M21
Chromosome3 (Build37)
Map Location 144,593,624 - 144,747,425
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAI747448, Clca6, Clca3, Clca5
Upstream geneLOC100039952, Lmo4, LOC545572, Hs2st1, Sep15, LOC435761, Sh3glb1, LOC668890, Clca1, Clca2, Clca4, EG622139
Downstream geneOdf2l, Col24a1, 2410019A14Rik, Cyr61, Ddah1, LOC100040331, Bcl10, 2410004B18Rik, Syde2, Wdr63
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-292M21.bB6Ng01-292M21.g
ACCGA089348GA089349
length6461,119
definitionB6Ng01-292M21.b B6Ng01-292M21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(144,746,780 - 144,747,425)(144,593,624 - 144,594,733)
sequence
gaattcttttggatctcagactatccagtaaaggtttactgaggtctagt
actctgcagtgagcctgagaaaacacccatgaactgacagccaaactcct
tatggccgaatgcctcatagttacatcagctgtcattcaaagtgagcaaa
gcacatctcccactacctcccaccagcactttcttgtagacacagtttgt
cagagaagatttactctgttctttttatgtatctgtcttaatagttgaca
ttcaaattatgtatttcaggaggtctaaagttcttcattccagataaatt
tacttctaatggaatgactgaagctttcgttcgaatctcttctggaacag
gagacattttccagcaaagcttacaggtcagaatgtcagtgtttctatat
agatggagagtggaccagattggctgcactatctgcattattattattct
ttggatatcgaactctctgtgtgtggatagctctaaggagcttctgggta
tccccattttacctcacgtctgtacggctcagttccaggagttgttttct
gtaatgactttagctttcaaggtccatgagaagacttctttgtgacggaa
aatggagctaggggttggatagggtagagtaggatcaggtagggta
gaattcaaaaaaatttgaagccaatcatttattcctgtacaacaagaatc
caccattgacagtctggtctttgtattctatgggaaaaatatgttttatc
ttttagagttcaaaggacaccaggtacgacacctctgagctgatgggtgg
gtgacagagaatgcatggcaagtggaagccaactgaaatcataaggaaaa
ttcagttcatgcccagcagggagctcaacaacgagcattggggcccagtg
gggacgaccccaaaccaagtagaagttgtggatgttgctcctgaggacgt
gagaaatgatcatgtagctgaaatggcagtctttacatggaatgttggag
ttggaagagactttatcaaactaaagtcctaggattagtgagggggcctc
tccctctgtttgcaaccacttggtgggctcacaccctccacacactggtc
atctctaattttcatctaagttcacattttacatctctccatggattcag
aggtctgtctcttctacatggatgtcaaaaatctcctcaatctgtaacca
cctcgagctcctcctccccaggcacagctctttgttgtagtttcccttcc
cagctgatgaaagttctctacaagtagttaagccaaagttggaaagtttg
ccttgcctcttaacatttcctctctaccttctccgttccacacaagaata
aaccaacaagagtgttgtctttcatgctttcaaaatatgttcagcatcac
ttgaatcactcctcacacctccttgtcccaggcaatgctcctgttcataa
ccacagcctggctccttcttcacccctatcctgcaatcatacagtgatgt
gatatgagtgagccttctatggtttcaggtagacagagcagtcatagaat
agaccccaaagtgtccacatcctccactaagctctttcatggagtctcat
tactttccaaaggtctgggctctgcctctgtgcataagcctctcccagct
tcagtgtaagacagacacccctcccctccagcttattccactgtttccct
ggattatgtggacctgctattacccaacataaagctcttcgttcttgccg
tctgcttcacatgtcatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_144746780_144747425
seq2: B6Ng01-292M21.b_47_692 (reverse)

seq1  TACCCTACCTGATCCTACTCTACCCTATCCAACCCCTAGCTCCATTTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTACCTGATCCTACTCTACCCTATCCAACCCCTAGCTCCATTTTCC  50

seq1  GTCACAAAGAAGTCTTCTCATGGACCTTGAAAGCTAAAGTCATTACAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACAAAGAAGTCTTCTCATGGACCTTGAAAGCTAAAGTCATTACAGAA  100

seq1  AACAACTCCTGGAACTGAGCCGTACAGACGTGAGGTAAAATGGGGATACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACTCCTGGAACTGAGCCGTACAGACGTGAGGTAAAATGGGGATACC  150

seq1  CAGAAGCTCCTTAGAGCTATCCACACACAGAGAGTTCGATATCCAAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCTCCTTAGAGCTATCCACACACAGAGAGTTCGATATCCAAAGAA  200

seq1  TAATAATAATGCAGATAGTGCAGCCAATCTGGTCCACTCTCCATCTATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATAATGCAGATAGTGCAGCCAATCTGGTCCACTCTCCATCTATAT  250

seq1  AGAAACACTGACATTCTGACCTGTAAGCTTTGCTGGAAAATGTCTCCTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACACTGACATTCTGACCTGTAAGCTTTGCTGGAAAATGTCTCCTGT  300

seq1  TCCAGAAGAGATTCGAACGAAAGCTTCAGTCATTCCATTAGAAGTAAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAAGAGATTCGAACGAAAGCTTCAGTCATTCCATTAGAAGTAAATT  350

seq1  TATCTGGAATGAAGAACTTTAGACCTCCTGAAATACATAATTTGAATGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGGAATGAAGAACTTTAGACCTCCTGAAATACATAATTTGAATGTC  400

seq1  AACTATTAAGACAGATACATAAAAAGAACAGAGTAAATCTTCTCTGACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTAAGACAGATACATAAAAAGAACAGAGTAAATCTTCTCTGACAA  450

seq1  ACTGTGTCTACAAGAAAGTGCTGGTGGGAGGTAGTGGGAGATGTGCTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTCTACAAGAAAGTGCTGGTGGGAGGTAGTGGGAGATGTGCTTTG  500

seq1  CTCACTTTGAATGACAGCTGATGTAACTATGAGGCATTCGGCCATAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTTTGAATGACAGCTGATGTAACTATGAGGCATTCGGCCATAAGGA  550

seq1  GTTTGGCTGTCAGTTCATGGGTGTTTTCTCAGGCTCACTGCAGAGTACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGCTGTCAGTTCATGGGTGTTTTCTCAGGCTCACTGCAGAGTACTA  600

seq1  GACCTCAGTAAACCTTTACTGGATAGTCTGAGATCCAAAAGAATTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCAGTAAACCTTTACTGGATAGTCTGAGATCCAAAAGAATTC  646

seq1: chr3_144593624_144594733
seq2: B6Ng01-292M21.g_64_1182

seq1  GAATTCAAAAAAATTTGAAGCCAATCATTTATTCCTGTACAACAAGAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAAAATTTGAAGCCAATCATTTATTCCTGTACAACAAGAATC  50

seq1  CACCATTGACAGTCTGGTCTTTGTATTCTATGGGAAAAATATGTTTTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATTGACAGTCTGGTCTTTGTATTCTATGGGAAAAATATGTTTTATC  100

seq1  TTTTAGAGTTCAAAGGACACCAGGTACGACACCTCTGAGCTGATGGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGAGTTCAAAGGACACCAGGTACGACACCTCTGAGCTGATGGGTGG  150

seq1  GTGACAGAGAATGCATGGCAAGTGGAAGCCAACTGAAATCATAAGGAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAGAGAATGCATGGCAAGTGGAAGCCAACTGAAATCATAAGGAAAA  200

seq1  TTCAGTTCATGCCCAGCAGGGAGCTCAACAACGAGCATTGGGGCCCAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTTCATGCCCAGCAGGGAGCTCAACAACGAGCATTGGGGCCCAGTG  250

seq1  GGGACGACCCCAAACCAAGTAGAAGTTGTGGATGTTGCTCCTGAGGACGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACGACCCCAAACCAAGTAGAAGTTGTGGATGTTGCTCCTGAGGACGT  300

seq1  GAGAAATGATCATGTAGCTGAAATGGCAGTCTTTACATGGAATGTTGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAATGATCATGTAGCTGAAATGGCAGTCTTTACATGGAATGTTGGAG  350

seq1  TTGGAAGAGACTTTATCAAACTAAAGTCCTAGGATTAGTGAGGGGGCCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAGAGACTTTATCAAACTAAAGTCCTAGGATTAGTGAGGGGGCCTC  400

seq1  TCCCTCTGTTTGCAACCACTTGGTGGGCTCACACCCTCCACACACTGGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTGTTTGCAACCACTTGGTGGGCTCACACCCTCCACACACTGGTC  450

seq1  ATCTCTAATTTTCATCTAAGTTCACATTTTACATCTCTCCATGGATTCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTAATTTTCATCTAAGTTCACATTTTACATCTCTCCATGGATTCAG  500

seq1  AGGTCTGTCTCTTCTACATGGATGTCAAAAATCTCCTCAATCTGTAACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTGTCTCTTCTACATGGATGTCAAAAATCTCCTCAATCTGTAACCA  550

seq1  CCTCGAGCTCCTCCTCCCCAGGCACAGCTCTTTGTTGTAGTTTCCCTTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGAGCTCCTCCTCCCCAGGCACAGCTCTTTGTTGTAGTTTCCCTTCC  600

seq1  CAGCTGATGAAAGTTCTCTACAAGTAGTTAAGCCAAAGTTGGAAAGTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGATGAAAGTTCTCTACAAGTAGTTAAGCCAAAGTTGGAAAGTTTG  650

seq1  CCTTGCCTCTTAACATTTCCTCTCTACCTTCTCCGTTCCACACAAGAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCCTCTTAACATTTCCTCTCTACCTTCTCCGTTCCACACAAGAATA  700

seq1  AACCAACAAGAGTGTTGTCTTTCATGCTTTCAAAATATGTTCAGCATCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACAAGAGTGTTGTCTTTCATGCTTTCAAAATATGTTCAGCATCAC  750

seq1  TTGAATCACTCCTCACACCTCCTTGTCCCAGGCAATGCTCCTGTTCATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATCACTCCTCACACCTCCTTGTCCCAGGCAATGCTCCTGTTCATAA  800

seq1  CCACAGCCTGGCTCCTTCTTCACCCCTATCCTGCAATCATACAGTGATGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCCTGGCTCCTTCTTCACCCCTATCCTGCAATCATACAGTGATGT  850

seq1  GATATGAGTGAGCCTTCTATGGTTTCAGGTAGACAGAGCAGTCATAGAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGAGTGAGCCTTCTATGGTTTCAGGTAGACAGAGCAGTCATAGAAT  900

seq1  AGACCCCAAAGTGTCCACATCCTCCACTAAGCTCTTTCATGGAGTCTCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCCAAAGTGTCCACATCCTCCACTAAGCTCTTTCATGGAGTCTCAT  950

seq1  TACTTTCCAAAGGTCTGGGCTCTGCCTCTGTGCATAAGCCTCTCCCAGCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTCCAAAGGTCTGGGCTCTGCCTCTGTGCATAAGCCTCTCCCAGCT  1000

seq1  TCAGTGTAAGACAGACACCC--TCCCTCCAGCTTATT-CACTGTTT-CCT  1046
      ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||
seq2  TCAGTGTAAGACAGACACCCCTCCCCTCCAGCTTATTCCACTGTTTCCCT  1050

seq1  TGATTATGT-GACCTGCTATTACCC-ACATAAGGCTC-TCG-TCTTGGCG  1092
       |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||
seq2  GGATTATGTGGACCTGCTATTACCCAACATAAAGCTCTTCGTTCTTGCCG  1100

seq1  TCTGC-TCACATGTCATAT  1110
      ||||| |||||||||||||
seq2  TCTGCTTCACATGTCATAT  1119