gaattcacagctgatgcactgcctggcttgtcaggctactcttcaaagtt
acactcaagagttttccaccttcagaacccccatgccacgggctgttgta
ggtgatgaaccctgatgtataatgccagcctcatagccaatgtgaccttc
tggtaccatggtgaaaagcagtggagccaatgatttacaataaattcctc
attagaacttgatctaattttatagccacattttctttctatacacatat
tctttgactccgcttatacatattcttgcctctccccccccccccataac
tgcttttctatgttcatcatgatttaacctttgttcatgctgaataacca
actgcttaggacatagcctagaactaattcgtctttcaaatccaacatga
ttcctcttccctcacactcttctgttgctcaacccaaacccgtttttagc
cttcactacatattttgagattgtaagctaaagtgttttcccccattggt
ctctaagcactatacagccttgtcttacttggcccccatctcaggaccag
gatcatggtgaacactgtcaaatctgaccaagtgcaacactgccttagga
ctttcttggacctcagccgtggcggtctctgcctttgctgagccccagtt
ctgtgactcggggcatctaagctcaaattgttcttaagggggggggggct
ctgttctgtcagtccacttcagtccttacggctactaagttacaggctcc
ttgtgtcagcccacagtacctagaagtgttgtttggatggaaataccaaa
gcaaagctggaggctgtttgttttctaagaaaggggatagtactaacctg
atcatgaaccacagaaaacaccctattttctaggagtagaactgccctgg
gtcaaatgtgatgggagattgtgtctgtaatcaactcccatttatcccgg
ctttctgtagccagcatgtacatacatgacacctcccttctatgataggt
cctttgtcttcatgagaggacccagaaaatgtagaggtagtcatgactct
cagggtcacctagctcttaaaagactccacacaaactgggaagatggtac
cccagcctgtattcttcatcattcaggctcaggcaggct

agtttttaaatattgaaatagctttatcatttcatttagtcatgtatttg
tgttttactgaacatcactgtagattttacttctatccttgttcatttca
tggccatgtttgttcattccttttttaaagtccatgaagttctaagatca
tgtgtatgatgatcttttaagttctggatcctggggtttacctaggttat
tcttattggagaacatttctttagggcgtgtgtgtgtggggggggg

seq1: chr3_34989910_34991065
seq2: B6Ng01-338F17.b_47_1185 (reverse)

seq1  AGCCTGCCTGAGCCTGGAGTGATGGAGAATACAGGCTGTGGTACCAATCC  50
      ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| 
seq2  AGCCTGCCTGAGCCT-GAATGATGAAGAATACAGGCTGGGGTACC-ATCT  48

seq1  TCTCCAGTGTTGTGTGGGGTCTTTTTAAAGAGCTGGGTGACCCTGGAGAG  100
      || ||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||
seq2  TC-CCAGT-TTGTGTGGAGTCTTTT--AAGAGCTAGGTGACCCT-GAGAG  93

seq1  TCATTGAACCTTACCTTCTACATTTTCTTGGGTCCTCTCATGAAGACAAA  150
      ||| |||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCA-TGA---CTACC-TCTACATTTTC-TGGGTCCTCTCATGAAGACAAA  137

seq1  GGAACCTATCATAAGAAGGGAGTGTTCATGTATGTAACATTGCTGGCTTA  200
      || ||||||||| |||||||||   |||||||||| ||| ||||||| ||
seq2  GG-ACCTATCAT-AGAAGGGAGGTGTCATGTATGT-ACA-TGCTGGC-TA  182

seq1  CAGAAAGCCCGGGATAAATGGGAGTTGATTACAGACACAATCT-CCATCA  249
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAGAAAG-CCGGGATAAATGGGAGTTGATTACAGACACAATCTCCCATCA  231

seq1  CATTTGA-CCAGGGCAGTTCTACTCCTAGAAAATAGGGTGTTTTCTGTGG  298
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGACCCAGGGCAGTTCTACTCCTAGAAAATAGGGTGTTTTCTGTGG  281

seq1  TTCATGATCAGGTTAGTACTATCCCCTTTCTTAGAAAACAAACAGCCTCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGATCAGGTTAGTACTATCCCCTTTCTTAGAAAACAAACAGCCTCC  331

seq1  AGCTTTGCTTTGGTATTTCCATCCAAACAACACTTCTAGGTACTGTGGGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTGCTTTGGTATTTCCATCCAAACAACACTTCTAGGTACTGTGGGC  381

seq1  TGACACAAGGAGCCTGTAACTTAGTAGCCGTAAGGACTGAAGTGGACTGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACAAGGAGCCTGTAACTTAGTAGCCGTAAGGACTGAAGTGGACTGA  431

seq1  CAGAACAGAGCCCCCCCCCCCTTAAGAACAATTTGAGCTTAGATGCCCCG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACAGAGCCCCCCCCCCCTTAAGAACAATTTGAGCTTAGATGCCCCG  481

seq1  AGTCACAGAACTGGGGCTCAGCAAAGGCAGAGACCGCCACGGCTGAGGTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACAGAACTGGGGCTCAGCAAAGGCAGAGACCGCCACGGCTGAGGTC  531

seq1  CAAGAAAGTCCTAAGGCAGTGTTGCACTTGGTCAGATTTGACAGTGTTCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAAGTCCTAAGGCAGTGTTGCACTTGGTCAGATTTGACAGTGTTCA  581

seq1  CCATGATCCTGGTCCTGAGATGGGGGCCAAGTAAGACAAGGCTGTATAGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGATCCTGGTCCTGAGATGGGGGCCAAGTAAGACAAGGCTGTATAGT  631

seq1  GCTTAGAGACCAATGGGGGAAAACACTTTAGCTTACAATCTCAAAATATG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGAGACCAATGGGGGAAAACACTTTAGCTTACAATCTCAAAATATG  681

seq1  TAGTGAAGGCTAAAAACGGGTTTGGGTTGAGCAACAGAAGAGTGTGAGGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAAGGCTAAAAACGGGTTTGGGTTGAGCAACAGAAGAGTGTGAGGG  731

seq1  AAGAGGAATCATGTTGGATTTGAAAGACGAATTAGTTCTAGGCTATGTCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAATCATGTTGGATTTGAAAGACGAATTAGTTCTAGGCTATGTCC  781

seq1  TAAGCAGTTGGTTATTCAGCATGAACAAAGGTTAAATCATGATGAACATA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGTTGGTTATTCAGCATGAACAAAGGTTAAATCATGATGAACATA  831

seq1  GAAAAGCAGTTATGGGGGGGGGGGGAGAGGCAAGAATATGTATAAGCGGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGCAGTTATGGGGGGGGGGGGAGAGGCAAGAATATGTATAAGCGGA  881

seq1  GTCAAAGAATATGTGTATAGAAAGAAAATGTGGCTATAAAATTAGATCAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAAGAATATGTGTATAGAAAGAAAATGTGGCTATAAAATTAGATCAA  931

seq1  GTTCTAATGAGGAATTTATTGTAAATCATTGGCTCCACTGCTTTTCACCA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAATGAGGAATTTATTGTAAATCATTGGCTCCACTGCTTTTCACCA  981

seq1  TGGTACCAGAAGGTCACATTGGCTATGAGGCTGGCATTATACATCAGGGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACCAGAAGGTCACATTGGCTATGAGGCTGGCATTATACATCAGGGT  1031

seq1  TCATCACCTACAACAGCCCGTGGCATGGGGGTTCTGAAGGTGGAAAACTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACCTACAACAGCCCGTGGCATGGGGGTTCTGAAGGTGGAAAACTC  1081

seq1  TTGAGTGTAACTTTGAAGAGTAGCCTGACAAGCCAGGCAGTGCATCAGCT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTGTAACTTTGAAGAGTAGCCTGACAAGCCAGGCAGTGCATCAGCT  1131

seq1  GTGAATTC  1156
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1139