BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-048F05.T7 (MSMg01no048_f05.b1) | MSMg01-048F05.TJ (MSMg01no048_f05.g1) |
ACC | AG278120 | AG278121 |
length | 1,249 | 1,233 |
length of high quality (start - end) | 728 (85 - 812) | 770 (76 - 845) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_f05.b1 PHD_FILE: MSMg01no048_f05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_f05.g1 PHD_FILE: MSMg01no048_f05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:08 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNNGGGGGCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAGAACTTTTCAGCTGGCCCTATAAAGTACCAGTGAGTACAGCTTTA
CAAGGTAAGTCTCTTCTTGAACTTTCTAAGGAAATTCAAGACAGTCTATC
AGAAGTAAAGTGGAAAATAGCTTTACAAGGTATGTTTGGCCTTAAACTTT
CTCTAGTGTTAGAAGCCCTTTTGTTCCTTTTCACATGTTATCAAGTGGTT
AAGGCAGGGCGGATTCTGGATGAATTTCAGGACAATCTATCAGAAGTAAA
GCGGGGAGAGAGAATAGGAGCAAAGAGAAAATATGGTTCACAAAATAAGT
ATACAGGCCTTTCCAAGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTAAGGTCAGGT
AATATTATCTGGGGAGAGATTAGAAGGAAGGAGAAAGAAAAAGAAAAGAA
AAAAAGATCAATTAGAGGAGCCAGTTCTTAGTAGTTCTGAATCAGATGAA
AAGGCTATTAGGGCCTGGAAGGCGCTCTCCCGAGCAGGTGAAGCCACTGG
ACAATAATGACAGAGGCAGGCTCTTGCAGCCTACAAGGTCTTATTGTCCA
CCCTGGAGTTGTAGATCAAGATTATAAAGGGGAACTTCAGGTTCTCTGTT
CTTGTCCTCAAGTTGTCTTTTCTATATCACAAGGGGACAAAATAGCTCAG
CTAATAATTTTGCCAAGCCTACATGGCTGTTTTTTCTTCCTCTGGAATTC
CTAGAGCTGCCAGAGGGATTGGTTCTACTGAGAATGATTCTGATTACTTA
ATAATGCCTTTAGATTGTTGTCAAATTTTATCTACTCACGTTAGGGTAAA
CCCTTCTGGCGTCAGGGCATTATCCGTCTGAACAATGGAAGTCCCACATA
TTTCCTCCTTTGAGAGAAATCAATATTTACTTGTTTTAGATAACAGAGGA
CACCTCCTTACTTTAATGATTTTCAAAAGTTGTTTTAAAATATAATTTGG
TTCAAACCTTTTTTAAGATTCCTTTCCCTTAATTAAAGGCTTTTGTTTGT
TTTTTATAAAAATAACTTCCTTCTTCTTCCTCTAAAATTTTTCTTTAAAG
GTTTATTTTGTCTTTTATATATTCGAATTATCTCTTTTTATTGCTACTTA
CATCTTTTGTGCTATCTTAACCTCTTTTTTGTTGTGTTTTATTATAATTA
TTTCCTCTCCTCTTCTTTATTAATTAACTCTCTTGTCTGTATTATTCTC
| NNNTTTATCAAGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTAAAATGTTAAAAATCTGTTTGAGAGAA
GTTGTGTGTATGGACTTAAACCTATGCTTGGTGTTCAACCCAGGCCTTCT
ACTACTATAAAATTAAGAGGGAAAATGAAAATATAAGCTCTGGAAATGTT
TACCATATGTCATGAGCTAGCAAGCATAATTATCCTATGTTCATATAATG
GCATACTCCCCAGAAATAAAATTGAATTGCTGGAACATGCACTAATACTC
ATCTGAGTATCAAAAGCATTGATCTAAGTGCAAAAGCCAGATACAAAAGA
GGGCATGAATTACAAATTTGTCTATATACCATTCAAAGAGATTAAGTTTG
TTCCTCAAGTACATTTATTGATATGAAATGTATTTCACATGCTAACTGCA
AAATACAACTGTTCTACAAAGTACATGCTGTCGCCCTTCAAGTACAGCCA
TTACTCTTTCCTGCATACACCATGTTTGATATTTGTCTCACTATACATTG
AACTCAGTATGCCTACCTAGTTGTCTGTGTTGCAGATATGCTCCTGTCTG
CACCTACTTAATGAAACCAATACATTTTTGTCTATTTTATTTTCTAGGTA
TAATAACATGAATTAATATGAAAAGGACAAGAGAGACAATTTAAGGATGC
TTCATAGATTTTTAACATAAAAAGAGTTTAGTCAATACCATATGCAGCTT
TTGTAGAGTTTTCTTAACTATTTAATTTTACATATTTCTCTTTCTTTCTC
CTCCCCTTCTTTATAATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAA
ACACACATCTTTTCTTATTCTTGTTTTACCTTATCACATTTTCTCCATTG
CTTTGATAATCTTTTCCCCCTCTTACCCTTATCCTTTCTGTTTCTTATTT
CCTATTTTTCTATCTTCTTTTTTGTGTGTGGGTTCTTGCTAACTTTTTTA
TTTATAAATTTTTTCCAAGTATGTTTTTAAATTCTTTCTTTTCTTTTTCT
CTCTTTCTTTTTATCTTTCTTCCTATATAATATATTTTTAGTTCTTTTTT
CCTATTAGTGGTTTTTACTCTCTTTATATTTTTTTTACTTACTATCTTAT
GTTGCTATTTATCCCTTCTATCTATAAATGTTCTTTATTTTCTTTAGTCT
TTGACTCTTTTCTTGAGTAACTTTTTTATTTAA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 6 9 7 7 8 7 10 8 10 10 10 8 8 10 8 8 8 10 12 9 8 8 12 15 16 24 24 42 33 29 33 30 36 36 42 42 42 42 48 50 50 50 50
50 42 42 30 24 17 17 28 41 43 50 41 37 37 33 33 17 17 11 11 11 17 6 6 6 6 6 7 10 13 13 14 19 16 21 22 29 35 35 35 35 35 36 36 50 57 36 36 36 53
53 53 41 33 33 33 33 33 21 19 8 7 7 8 8 8 11 15 15 14 26 28 37 37 31 35 32 29 28 28 35 39 59 43 43 43 44 44 50 50 57 57 57 48 43 43 43 42 42 42
43 33 42 32 32 37 42 42 48 47 47 47 43 43 43 41 41 41 41 41 41 47 44 44 36 25 25 36 40 39 39 39 46 44 48 48 46 44 43 57 57 57 57 48 48 48 44 50 50 50
48 50 50 50 50 43 43 36 43 43 57 57 57 59 59 57 52 57 57 57 57 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 43 43 43 39 39 35
57 43 44 43 52 52 43 57 43 43 41 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 43 37 43 43 59 43 43 43 59 59 68 68 68 50 50 35 35 43 43 52 52 52 59
59 50 50 41 35 35 43 43 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 43 59 59 59 59 48 48 54 57 57 44 43 37 43 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54
57 57 57 57 57 57 59 59 54 59 59 48 48 43 43 43 46 43 46 47 54 59 59 59 48 48 48 48 48 53 50 53 53 50 50 48 57 48 57 57 59 59 59 59 48 47 59 59 47 28
25 12 11 9 8 8 8 8 8 10 23 28 41 43 43 43 39 47 47 39 39 39 35 35 37 59 59 59 57 43 43 36 36 36 43 43 47 47 48 48 48 59 46 46 43 43 43 43 48 43
43 43 43 43 43 48 59 57 42 39 30 28 32 24 34 42 46 46 54 54 57 54 54 54 59 59 59 44 44 23 23 32 36 43 36 44 41 42 44 59 59 59 57 57 57 57 57 46 47 43
47 47 57 47 47 43 47 40 44 44 44 30 30 30 30 43 40 48 39 42 42 35 28 28 32 32 46 57 57 57 43 43 39 43 36 39 43 44 44 57 57 48 48 48 48 46 46 46 41 41
41 41 31 32 39 36 36 36 39 39 34 34 25 25 25 37 37 43 39 39 35 35 43 43 43 43 43 57 40 40 25 34 31 32 41 59 59 43 43 43 59 59 59 57 57 48 48 48 57 57
57 59 57 59 44 35 35 37 39 43 46 46 43 43 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 47 47 39 39 39 39 39 42 48 44 44 35 35 35 59 59 59 59 43 43 43
59 59 57 54 46 46 46 43 43 44 43 48 48 48 48 47 59 43 43 48 59 57 57 57 48 48 48 48 59 48 50 50 48 42 40 39 39 32 36 32 36 30 23 11 8 8 10 17 8 8
8 17 22 43 37 31 31 31 31 37 59 59 59 44 37 31 37 31 31 37 37 37 37 35 31 36 39 37 47 30 43 35 35 37 47 43 47 47 47 37 37 37 32 22 22 22 22 24 24 38
39 33 30 33 33 33 33 28 26 14 14 14 21 21 21 15 15 15 21 24 25 36 44 59 37 37 37 37 23 23 11 11 11 17 17 15 18 18 18 21 24 37 37 28 28 23 34 32 41 28
28 20 20 20 32 34 37 37 39 30 26 14 12 12 19 19 13 13 16 18 23 28 34 39 17 18 10 10 10 13 18 19 19 28 25 22 19 9 9 10 10 10 12 11 11 9 9 10 11 14
13 15 17 10 9 10 9 9 10 11 17 13 12 9 9 9 9 12 13 11 6 8 6 6 8 8 9 10 14 11 9 9 10 9 9 13 12 10 9 9 9 17 10 10 8 10 8 8 8 9
12 12 9 11 11 15 13 14 22 23 21 18 9 9 9 11 11 11 9 12 8 8 8 11 15 19 22 22 21 18 13 10 9 15 10 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9
9 10 10 11 11 11 11 12 12 19 10 10 8 8 8 13 10 11 11 11 19 27 13 10 10 10 10 11 10 9 8 11 8 8 6 6 7 8 17 15 9 9 9 10 10 13 8 8 6 6
8 11 10 9 10 10 12 10 9 10 13 21 16 10 10 10 11 8 8 8 8 6 6 8 7 6 8 6 8 8 8 8 8 17 17 12 11 10 10 11 12 17 19 10 10 10 19 13 13 8
8 9 12 13 8 9 9 10 11 9 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 9 9 9 10 10 13 13 13 18 10 10 7 6 6 8 10 8 8 8
8 8 14 12 9 9 8 8 8 8 9 11 11 10 10 10 12 6 6 6 6 8 8 9 8 8 7 8 8 8 8 8 6 9 12 10 11 15 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 10 15 10 8 9 8 8 8 10 6 6 6 7 10 12 10 10 8 8 6 7 10 12 17 10 12 6 6 8 8 6 7 8 10 10 10 12 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10
10 10 11 9 8 8 8 8 8 10 8 10 12 16 18 15 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 15 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 8 11 13 9 7 9 8 11 11 19 19 22 22 22 25 25 37 32 36 30 30 35 35 36 36 37 37 37
37 39 39 39 39 47 48 53 50 50 50 50 47 41 33 23 12 9 9 9 12 12 12 12 12 23 18 33 28 37 30 30 30 30 32 43 43 50 53 53 43 43 43 43 43 43 43 46 46 59
57 48 53 53 68 68 34 23 12 11 15 12 13 18 21 31 33 37 46 41 41 50 41 23 23 8 8 8 15 19 40 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 51
50 50 50 46 46 50 50 50 50 57 50 47 50 44 43 37 57 59 59 59 52 52 57 57 57 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 52 52 52 52 52 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 62 62 62 52
52 52 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 39 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 35 43 44 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 43 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
44 43 41 41 39 29 23 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45
45 52 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 44 44 44 43 39 39 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 62 59 68 68 68 62 59 57 57 57 57 52 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 44 44 43
39 35 44 41 43 39 39 43 43 59 59 59 52 57 57 59 59 59 59 52 52 52 59 59 52 57 52 52 52 57 59 52 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 50 50 36
21 14 8 8 10 10 27 44 59 59 59 59 57 57 47 47 43 43 43 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 46 47 43 43 43
59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 54 43 47 43 33 28 29 29 30 34 40 48 59 43 39 39 35 35 35 37 32 35 39 39 40 41 41 41 39 39 39 39 37 37 37 41 59 44 47
40 41 40 37 37 37 37 46 59 59 59 59 37 31 31 37 37 37 36 36 39 39 47 48 48 43 41 37 37 30 37 37 41 32 20 21 10 10 10 23 26 41 48 59 59 59 59 59 57 57
57 57 43 43 37 37 36 39 39 41 43 43 47 39 19 15 15 17 19 30 39 37 32 29 29 32 39 39 34 41 23 23 23 23 21 15 15 14 27 30 41 39 39 39 32 27 32 30 30 25
27 37 37 39 39 39 39 39 41 37 31 39 36 28 24 22 28 15 15 14 14 14 26 28 33 33 30 30 30 31 31 35 35 28 24 24 24 22 21 30 32 25 25 25 12 10 10 12 11 11
8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 11 17 15 9 12 8 8 13 11 10 8 8 6 6 6 6 8 11 10 10 8 8 8 8 9 12 10 10 8 6 6 6 6 8 8
10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 11 10 10 9 10 10 8 8 8 10 11 12 14 14 12 10 10 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 19 14 13 10 10 8 8 8 10
13 22 11 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 7 6 10 10 15 12 9 9 8 8 12 8 8 8 12 12 12 10 6 6 8 8 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10
10 8 12 7 9 9 7 14 9 9 9 13 15 15 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 12 14 10 10 13 14 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 8 11 13 14 10 10 8 8 8 8 8 8 11 7 6 8 8 9 9 9 9 8 8 6 7 7 9 12 12 10 12 10 10 10 9 14 18 24 27 18 9 10 10
10 10 8 10 10 10 10 9 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 10 11 11 8 10 6 6 8 6 6 8 8 10 10 11 11 11 9 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 8 8 8
6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 10 10 12 11 10 10 10 10 14 10 10 8 6 6 10 10 6 6 8 7 8 11 10 10 8 8 8 12 16 16 13 12 14 11 8 8 8 8 8
8 9 8 8 9 9 9 8 13 8 8 8 8 8 6 7 8 9 9 9 11 12 20 12 15 10 10 8 8 8 7 7 7 |