| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-048J06.T7 (MSMg01no048_j06.b1) | MSMg01-048J06.TJ (MSMg01no048_j06.g1) |
| ACC | AG278310 | AG278311 |
| length | 1,251 | 1,225 |
length of high quality (start - end) | 679 (80 - 758) | 662 (85 - 746) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_j06.b1 PHD_FILE: MSMg01no048_j06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_j06.g1 PHD_FILE: MSMg01no048_j06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:41 2005 |
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NNNCCTCATTGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCA
CAGCAGTTGTGACAGCCTTTAAGCGCCAGATCTATGCAAGCCCAAGCCAG
GAAAAATCCCAGTAGATTGGGAAACGGGCAAGAAGTCCCACCCATAGCTG
AGGAGCTATGAAAAATTAATTACTGCTGGAAGAGAAATAATCAGTTTTCT
TTAAAGGTGTGAGCTCTGGCAGGTTGACCACTCTCCACAGAGAGGTCATA
ACCCCAAGAATATATGAGAACCACAAACTGGGCTTGGAGGATGAAGAAGA
AGGAGGAGGAAGAAGAGGAAGAGGAAAACACAAAGTTGGATAGTGTCTTA
GTTACTTAGTTACTTTTCTATGGCCAGGACAAAACACCATGACCAAGGCT
TCTTAGAAAAGAAAGCATTTAAATGGGAGCTTAAAGCTCCAGAGAGTGAA
TCTATACTATGACCATCATGTCAGGGAGCATGGTGGCAGGCATGGTATTG
GAGCAGTAGCTGAGAGCTTACATATGACCCACCAGCAGACGGCAAAGAGA
TAGTTAACTGGGAATGGCATGGTCCTTAGAAATCTTACTCCCCCCAATTC
TTACTCCCCCGCCCCCCACTCCTACAGTGAGGCATTTCCTCCAAACCAGG
CCACACCTCCTAATCTTTCCCAAACAGTTCCACTAACTGAGGACCAAATA
TTCAAATATATGAGGGTCATTCTCATTCAAACAAACAAACAGGGAAGTCA
GGGTAGCTCTGGGAGGAGTTGTGGGGGGATGAATATCTGGCTCAAAATTC
TTAATTATTTCTACTATGTGTTTTAACAGTAATATTCTGATTATCTTACT
GCCATTTTTTTCTTTTACCATCTTTTTTTATCCTTTTTTACACAATTTAC
TTTTTTTCTCACTTTCATTTTTCTCTAATTTTTCTCTATCTCTTTATTTT
ACTTTGTCTGCTCTTCCTTCCTCTAATTCTCTACCTTCTTTATAGTTTTC
TTTCTTTGGTCCCCTTTTTCTCTCCTTACATCCTCTTAATTTTACTATTA
TCCTTTTTTTTCCATTTTCCTTGCACTTGATTCTTTCATTTCTTTTTCTT
CTTATTAACTTTTTTTCATTACTTTTTTTCACTCTCTATTCCTCTTCTTC
TTCTCTCCTTACCTCTTCTATTTATCTCTTCTCCTCTTATCTATATATCT
TCTTCTTTCTCTTCCTTTTATATCTATTTTTTCTTCCTACTTACTACTAC
T
| TTTTNNAACGGAGTGTAGCTGGGGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTTAATGCCATAAGTCGGCGACGCACAG
TTGCTTCAAATTGTAACTGCCTCTCTGACAGTGGAAAGAAACGGTGGCTG
TAAGCAGTTGGGGTGGCGGTCACCTGTCATCCTCACACTGGGAAGTTTGA
GGCAGGGGATCAAGAGTTCAAGGGTGACCTGCGCTTTATGAGAGAGTCTC
TTAACTTAAAAAATAAATAAATAGATAAAAACATAAAAAATGAATAAAAA
GGGAAACGCCAAAGAAAGCGTCATGATATGCACAGAACAAGGCCAGCTCC
CTTTTCTATGTGTTGTTTGAAAGTCTAAAACACATTGAAAAATCTCTCTT
TGATTCAACCCAGGTTTTTCAAGTCTATGTTGTTCCTCCACAGGCCTAGT
GAGGGGAAAACTTGTGCGTACCTGCTAAGTGCACTGCACAGCAACTGTTT
ATAAAAATTCTGGAAATAAAGCTAGAAATGTACTTTATTTATTCAACTCT
GAGCATGGAGAATAGTCGGGTTAGACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
TTCTTGTTTTCCTTCTTGTGCTATCAGGACTGAATGATGGTACTCTGCCC
TCAGCCCTTTTTACACTTCTTGAGACTATCACTATGTTGCCCAGGTTGGC
CTTGAACTCATGATGGTCCTTCTATCCTGGCGTCTGAAGTAACTGGAATT
CCACGTCTGTACTGCGGGGTCAGCTCACGACCCTGGTGGTGTTTTTGTGA
CTGACTGGCTCTTCATCCACGAATACTTCAGGCTCCTCAGGAAGCGGACC
TCCAGCACATCTTCCCGTGAGTCGCCAGACATCTGTGCGTCGACTTCAGC
CGTTTTCAACCTCTCCCCAAGCTGCTCTCTCATCTTCTAGCTGTAATCTC
TTCTCATCAAAACATTTTGGCTTCTTGAGCTCGACTTTCCTTATTACTAA
CGAACCTTCTGATGCTGAAATTGTTTCTCCAGATTTCCTCTTTTTGTTTC
TAACCCCCCATAATTTGAACTCCTTTTTTATTTCCCTTTCTTATATATTT
TCTTGGTTTATTTTTCTAAACTTTTACTGTATTTGTTTACCTCTTATTCA
CATTCTTCTCTTTGTCAGTTCTTTTTCATATTGTCGTATCATTCTCTCAT
ATGTATTACCCTTCTCTTAACCTTC
|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 13 12 9 10 10 14 8 8 10 8 8 15 19 9 8 8 8 8 8 19 22 34 28 34 34 37 37 42 42 42 42 39 39 40 34 43 43 34 47 47 47
35 35 36 36 36 36 31 31 31 31 31 23 25 15 11 11 16 17 18 13 13 12 9 9 10 8 8 8 10 19 27 33 33 33 33 41 53 53 57 59 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57
57 57 57 40 43 41 29 41 28 16 13 13 16 15 29 30 44 44 36 23 16 9 8 8 8 8 8 17 34 40 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
48 48 48 48 48 50 47 47 50 57 50 50 59 59 51 51 51 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 54 54 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 43 43 27 14 10 10
10 10 10 33 12 13 13 39 41 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 23 23 17 23 23 43 43 62 62 62 62 44 43 39 39 43 43
52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 38 38 13 13 13 24 38 44 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 41 39 43 43 52 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 52 52 52 52 57 57 54 57 57 57 57 57 59 68 68 59 34 32 12 12 24 34 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 54 57 54 59 59 59 43 43 43 47 59 59 48 47 47 47 48 50 57 59 57 48 43 32 32 21 24 23 28 37 34
43 43 43 42 39 36 43 43 48 48 48 48 48 48 57 57 50 50 50 48 47 47 47 47 41 27 20 11 11 16 18 22 33 47 39 40 48 43 44 48 36 36 36 36 36 36 48 47 37 37
37 37 42 36 47 47 47 57 50 50 43 27 22 9 9 9 23 23 37 27 37 30 30 30 37 23 30 12 12 12 16 17 17 22 26 18 20 18 30 30 32 30 25 19 25 25 27 28 30 37
32 22 22 19 21 11 12 12 25 23 17 13 17 13 26 23 26 23 10 10 10 10 10 10 15 19 10 12 8 10 10 8 8 10 10 13 12 21 11 11 11 13 12 18 10 9 11 8 8 8
8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 8 8 10 11 12 12 12 9 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 6 6 8
8 11 11 11 11 16 11 11 11 12 11 11 11 15 12 12 11 15 11 10 10 10 12 15 21 18 12 10 8 8 10 10 10 13 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
9 9 9 10 11 10 10 8 8 6 6 8 15 11 6 6 8 8 12 11 11 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 7 8 8 8 8 11 11 13 11 11 11 12 12 9
9 9 8 8 8 9 11 11 10 9 9 9 8 8 8 13 8 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 6 10 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 8 6 6 10 8 8 8
9 10 10 11 12 14 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 10 9 9 9 9 12 12 10 11 12 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 13 11 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 11 11 11 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 12 10 8 8 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 12 9 8 8 6 6 10 10 10 10 6 10 6 6 8 8 8 10 10 13 8 7 8 8 9 8 8 8 8 8 8 13 9 10 8 8 8 8 11 10 10 10 12 12
15 10 10 10 9 8 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 15 13 15 22 16 12 12 11 8 8 6 6 6 6 8 8 9 7 7 8 10
8 | Open.Hide. 6 6 7 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 6 6 7 15 10 10 6 6 6 6 8 7 9 19 16 15 8 8 10 15 23 33 28 28 32 36 35 34 34 28
23 28 25 21 26 26 36 47 47 47 41 41 39 42 42 23 23 9 9 10 10 10 9 8 8 8 8 13 8 6 6 6 8 8 17 22 33 33 33 41 41 47 53 53 53 53 57 50 50 42
42 47 47 53 53 53 44 28 24 11 16 11 11 11 11 11 18 18 26 31 33 46 33 36 32 32 27 25 15 32 26 48 48 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 42 42 36 36 36 43
48 57 57 57 57 59 57 57 44 44 43 42 42 50 50 50 50 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52
57 52 54 54 57 57 52 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 57 57 35 35 43 57 57 68 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 52 52 59 59 59 59 59 57 50 50 35 35 43
59 50 54 59 59 59 52 52 52 52 43 47 57 59 59 59 57 48 48 44 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59
54 54 57 59 57 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 53 59 59 59 59 59
41 41 34 25 18 11 11 12 16 28 34 41 59 59 59 59 59 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 39 39 59
47 47 47 35 35 35 44 44 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 38 36 19 28 28 40 38 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 57 57 44 44 35 35 37 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 57 44 43 23 43 43 44 44 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 68 68 34 44 23 23 23 44 25 44 21 19 8 8 8 22 25 57 48 48 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 54 59 59 59
59 48 43 43 48 48 48 54 54 57 68 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 48 48 43 44 43 57 48 48 48 48 41 41 46 43 43 59 43 41 41 44 39 39 39 37 37 39 39 39
37 39 43 44 47 47 46 59 47 42 33 33 32 30 25 30 43 37 47 47 47 47 47 42 33 33 26 23 16 24 32 39 59 43 44 32 29 25 30 30 29 25 30 28 20 11 12 12 16 19
21 11 11 11 11 23 27 37 39 35 35 28 32 28 16 10 10 10 15 19 31 28 30 30 30 30 30 32 32 25 18 14 14 15 11 12 10 10 8 8 8 15 23 31 21 12 8 6 6 13
15 39 41 39 37 24 13 9 9 9 13 14 25 20 28 24 21 13 11 10 10 11 12 20 16 21 12 14 10 9 9 9 10 11 16 16 14 10 9 10 10 11 10 19 15 8 8 8 8 8
12 14 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 13 11 11 11 11 17 19 16 11 11 11 10 10 11 11 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 12 13 15 15 10 8 8 8 9
9 9 12 13 19 12 8 8 8 8 10 12 15 9 8 6 6 10 10 10 9 9 12 12 12 8 10 8 10 8 8 11 11 10 10 19 15 10 10 8 9 13 10 8 8 8 8 9 9 9
8 8 6 8 8 8 10 8 8 8 13 6 8 6 6 8 7 8 9 9 10 11 15 21 16 12 10 10 9 9 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 11 9 9 11 10 9 9 9 6 6 6 8 10 8 14 15 10 11 10 10 10 11 10 9 9 12 12 9 9 8 10 9 9 9 9 9 9 11 12 8 10 7 9 13 10 10
10 8 8 15 19 27 22 16 8 8 7 6 8 8 8 7 8 9 10 8 8 8 8 8 13 13 11 11 10 10 10 15 16 10 10 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 17 21
15 10 10 10 10 10 9 15 10 11 14 16 15 10 7 8 7 6 6 6 9 15 18 12 9 9 9 9 9 11 11 11 15 12 12 14 13 13 10 10 10 10 9 9 9 9 10 10 10 9
9 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 13 8 6 6 8 8 8 10 11 12 11 11 10 10 8 8 6 7 8 13 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 11 8 8 8 9
9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 12 10 8 8 9 9 8 10 9 9 8 8 8 8 |