| Query= MSMg01no054_n09.g1 MSMg01no054_n09.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no054_n09.g1 PHD_FILE: MSMg01no054_n09.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 16:56:07 2005
(601 letters)
>mm_chr3_4725758_4726758
Length = 1001
Score = 1056 bits (546), Expect = 0.0
Identities = 589/612 (96%), Gaps = 15/612 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 gtttcccaggctggtcttgagcacatattgcagcttgcctcaggcagacacacaacaatc 64
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 190 gtttcccaggctggtcttgagcacatattgcagcttgcctcaggcagacacacaacaatc 249
Query: 65 ctacctcaacctcagcagaaaaaaggaattatatgcatttctcatcacactttgttcctc 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 ctacctcaacctcagcagaaaaaaggaattatatgcatttctcatcacactttgttcctc 309
Query: 125 aaaatatttcatatatcagtgtcctcatcatctctcaatctttaccatctaccaattggt 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 aaaatatttcatatatcagtgtcctcatcatctctcaatctttaccatctaccaattggt 369
Query: 185 caagccaaatactgcatatgcttctataaagtataaagtgcatcactgtcttgaattact 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct: 370 caagccaaatactgcatatgcttctataaagtataaattgcaacactgtcttgaattact 429
Query: 245 ccttcatatctcattttagaaaaaaataactgtaatttatttaaaaccacgtgt--atat 302
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||
Sbjct: 430 ccttcatatctcattttagaaaaaaataactgtaatttatttgaaaccaagagtttatat 489
Query: 303 atatatatatatatatatatatatatatatata-------------aagataaaaactgt 349
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 490 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatttaagataaaaactgt 549
Query: 350 attcaagttaaaggtgagcatacataatttctcaccacagtacttttctgcatgcttagg 409
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 attcaagttaaaggtgagcatacgtaatttctcaccacagtacttttctgcatgcttagg 609
Query: 410 actgcaacaacccttccagttccatgctgccaaatcagtttcttatgcaaaataagactg 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610 actgcaacaacccttccagttccatgctgccaaatcagtttcttatgcaaaataagactg 669
Query: 470 ccaccaaacaggaatggtaatgtgtttgttgtcattttcttttctttaagattatttaaa 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 ccaccaaacaggaatggtaatgtgtttgttgtcattttcttttctttaagattatttaaa 729
Query: 530 attatgtgtttatttttcagtgagtgcaattgcaggcaagtgataaaatagaatgctgaa 589
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 attatgtgtttatttttcagtgagttcaatttcaggcaagtgataaaatagaatgctgaa 789
Query: 590 ttttctgaagct 601
||||||||||||
Sbjct: 790 ttttctgaagct 801
Score = 78.1 bits (40), Expect = 2e-18
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 298 tatatatatatatatatatatatatatatatatatataaa 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 tatatatatatatatatatatatatatatatatatataaa 483
Score = 74.2 bits (38), Expect = 3e-17
Identities = 38/38 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 298 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 524 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 487
Score = 74.2 bits (38), Expect = 3e-17
Identities = 38/38 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 298 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 526 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 489
Score = 74.2 bits (38), Expect = 3e-17
Identities = 38/38 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 298 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 528 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 491
Score = 74.2 bits (38), Expect = 3e-17
Identities = 38/38 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 298 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 530 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 493
Score = 74.2 bits (38), Expect = 3e-17
Identities = 38/38 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 298 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tatatatatatatatatatatatatatatatatatata 495
Score = 72.3 bits (37), Expect = 1e-16
Identities = 37/37 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 299 atatatatatatatatatatatatatatatatatata 335
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 533 atatatatatatatatatatatatatatatatatata 497
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 88
Number of extensions: 33
Number of successful extensions: 33
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 15
Number of HSP's successfully gapped: 10
Length of query: 601
Length of database: 1001
Length adjustment: 10
Effective length of query: 591
Effective length of database: 991
Effective search space: 585681
Effective search space used: 585681
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
|
