BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-064E23.T7 (MSMg01no064_e23.b1) | MSMg01-064E23.TJ (MSMg01no064_e23.g1) |
ACC | AG289817 | AG289818 |
length | 1,241 | 1,213 |
length of high quality (start - end) | 548 (124 - 671) | 63 (219 - 281) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_e23.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_e23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_e23.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_e23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:09 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCCCCCTNNNNNGGCACTGGGCGCATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCCCTCCTGGACTGCGCCCCCTAAAAGACTGNGGGNGGNTAAGA
AGGCTGTCTCAGACCCCTTGGACAGCCATGACTTAGCTCAATTGGGGAGC
AGGGGGTCACTCACCATCCAGCCCATACCCTGGCGGGGGGCAAACCTCTG
ATGCCTCCTTCTTGGGTTTCATCGGACACCAGGATCCATCTTCCATGAAC
TGGATCTCATCACAATCCGAACAGGAATTAAGAATTTCCATGAATAAACT
AGGGAGGAGGACATGTGGATTCACGAGGCTGGACGCGGCTGGAGCCACCC
ACGGTGTTCTGACACTCACTTCCTATGCTTTAGTCACCTCATCTGCATCA
CCCACCCTCCTGGACCTCCCTGAGCTGCTGCTGGGATAGAATACAGCTGG
GACTGTAGCTCAGTAACAGAGCACCTGCAGGCTGAGTCTGATCCCTAGCA
CTGTGAGGGGAAAGGATGTAAGAGAGCTTCAGAAAGCTCAGGCCCCGCCT
TTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAAGCAGGCAAATTTCTGAGTTCGAAG
GCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAG
AAACTCTGTTTCGAAAAAACAAAAACTATCTTTCCATTTTAATAATTAAT
CTAGAAAAGAATAAGAATGCAAGCAAGCTCAGGCCCAGGGTTAAACCTTC
CTAAGAGAGAATGTGTGAACCCTAGTAAAGGAAGGGGAAAGAAACTAAGG
CCACTTAAGAACCAAAATATCACTTGGCTTATTAGGCTAGGGGGAAAGTC
CAGCTTATATAAGTACTTCCAGGACCTCAAAAACAAAACAAAAAAAACCC
TTATTTCCTCAATCCAAAAAAAGGCCTTTTGTAATAAGGAAAAAATGAAA
AGGAGCCCCAACCCCTAATGGCCCTGTTGTAAAGGCTCGGGAAATTGTCA
CACATGCCCGTGGAAAAAATTTTAAGGGCCAGGGCCCTGTTCCCCCTATC
TCATGGGAACCCTTCTGGCCCTAAAGTTCCCTTTTCCCCCTCCAATAGGG
GAAGGGCCCCTCATGTTCCCGGGGGCGTCTTCTTGTGTTGGACCTTGTTG
TTAAAAACATGGCTTTTCCCTGGTTGTTGTGTAAACCCCCTTTATTGGCT
CCACATACCACTGGGTGGCTAATTCCTAATATAAAATAAAT
| NAAATCAGTGTAGCTGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTAGGGAAGCTGAGGCGCCAGGATCAGG
AGTTCAAGGTTATTCTCAGCTGCATAGCAAGTTCCAGGTCAGCCTGGGTT
ACATAAAACCTTGCCTGCACATACATACATGCATACATACACACACATAC
TTACATACTTACATACATACATACATACATACATACATACAAAAGGAAAT
TATGTGACGCACCCTAAGGACTTCAAGGATAAGTCTAAAGATCTCTTGTG
AACAGCCGCCTCTCCTGGCCAGGCCCGCAAACATCCCCTGGAAGGTTTGA
GGAGCCACCAACACCCTGAACAGGTGAAAGTGGTGGCTTGGCCTGAAAAT
TTTTACTCAAAAAAGGATCCAGGCCAAGTAAGGAAAAGGGGAGGGGTTTT
TTTTTTTCCCCCCCCCCCCCGGAAAGGCCCCCCCAACAAAAAAAAAGGGG
GGGNGAGAGGATTGGGGGAGCTTTGCGAAAGGCTGCTTCTCCCTCAAAAA
AGGAGTGCTTCTCCCACAAAACGCCCATCTTCGATAACTTCCTTTCACCA
CCATGGCCTGGCAAAAGCATTCGCTGGAGGAGGAAGTTTCCTCTCAAAAT
GTTTGCCTCCGAGGCCACAGCAGGCCAAAGGGAAAAAAAACGAGAAGGCT
CCTTTCCTGACTAAGGAAATGTGGAAAGCATCTCCATGACAAAAAAAACA
TCCGATTTTAACCGCCCTTTCCTGTTTTTGCTTGCTTGCATTGAGCGCGC
ACCATCCCTTATCCTTCATCACTTACCCTTTCTTTCTATATTTCATTCCC
TTCTTCTCTTTTATCTCCCTCACCATTCTTTACTCTTCTAACTCTCTCTA
CTTCCCTACCTCCTTCCCTATACTCCCTCAATTTTCCACACCTTTCTTTA
TCTTCTTCTCTATAACCTACACCTACCCTTTTTATCACTTCCCCTCCCAC
CTCCCTCTTTCTCTCTCCTCTTTCCCCATCTCTATCATCCTCTTACCATC
CTCCATTCCCCCTATCCTTCACTTTCTCTATCAATCACTTATTTACCCCT
TACTACCTATTACCTCCCCATTTATCCCTATCCCCCTCTGTTCACTCCTA
CTCTCTTCTCCCTCCTATCTCTCTCCTATCCTATCTACTTTCACCACTCT
TCACCCCTTCGTT
|
quality values | Open.Hide.11 11 13 13 11 9 11 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 9 14 13 8 8 6 6 8 15 19 8 8 8 8 8 8 8 22 15 24 28 28 28 34 34 43 43 39 33
33 33 33 34 34 34 42 42 42 38 53 36 36 31 31 31 31 31 30 33 19 17 10 10 12 9 9 9 9 11 15 10 12 10 9 13 3 0 3 27 3 0 3 3 0 3 17 19 30 47
47 37 31 31 28 28 28 30 28 21 21 10 9 9 12 13 13 11 11 11 12 12 18 21 26 23 28 29 29 31 31 33 26 26 24 24 34 43 43 43 48 48 57 57 43 43 43 43 43 48
48 48 48 48 43 42 42 47 47 47 48 50 50 50 50 50 50 50 48 57 46 43 39 42 42 47 47 41 41 41 42 48 41 42 42 28 28 23 28 28 35 42 42 57 57 57 47 46 57 44
47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 50 52 52 52 52 57 57 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 43 43 35 35 35 44 44 52 52 43 44 39 31 31 35 43 43 52 43 57 43 52 52 62 62 52 52 52 62 52 52 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 43 43 35 35 39 43 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 44 38 18 14 12 22 12 13 12 13 12 12 15 24 38 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 57 35 35 43 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57
44 32 32 32 28 28 23 27 43 44 50 38 38 43 38 38 33 33 33 35 35 35 43 50 57 59 59 52 52 43 43 43 59 59 59 54 54 54 57 57 68 68 57 59 57 44 37 32 32 37
44 57 57 37 37 36 40 24 25 25 44 44 47 54 59 59 48 48 48 48 47 57 44 43 43 47 46 46 47 43 37 37 43 43 57 54 54 54 54 54 54 54 54 54 59 43 57 46 46 46
57 48 48 48 48 39 39 32 32 30 37 39 47 39 39 32 30 37 37 37 33 35 31 30 25 25 32 36 37 37 30 30 30 37 37 43 46 48 57 57 48 48 48 48 48 43 43 41 39 39
39 36 36 36 35 28 29 27 30 30 33 33 34 37 28 28 28 37 37 40 43 43 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 43 43 32 32 23 23 23 32 23 30 28 29 33 32 35
39 39 34 47 37 37 39 40 40 39 39 36 39 39 43 39 39 32 26 22 17 17 18 16 13 8 8 8 8 8 9 9 8 10 10 10 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 11 8 8 6
6 8 8 8 10 11 11 11 13 9 12 12 12 10 10 10 11 11 11 16 15 19 19 23 19 19 23 24 22 26 17 12 12 16 21 20 37 30 34 23 18 18 18 18 17 21 19 24 16 16
14 15 15 11 13 13 18 18 28 18 17 19 14 14 14 10 11 21 20 17 9 10 10 7 8 9 18 12 12 18 18 17 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 17 11 17 11
10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 10 8 10 17 10 9 8 11 10 8 9 9 14 13 13 13 13 11 11 11 12 12 12 10 8 8 8 8 7 7 8 10 13 10
16 11 10 9 12 16 19 16 17 13 10 9 11 11 14 13 10 10 10 12 8 8 8 8 10 10 18 14 15 11 13 12 13 10 13 8 8 8 8 12 15 20 22 21 13 10 10 10 11 11
11 11 12 11 11 10 9 9 9 10 12 6 6 8 8 10 10 11 14 14 16 16 12 12 9 10 10 15 9 9 9 11 13 8 10 10 9 10 15 19 21 15 14 6 6 6 6 8 8 9
9 9 9 9 9 9 15 11 6 6 6 8 9 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 10 9 10 10 11 10 8 8 6 6 6 11 8 11 10 10 13 18 14 10 8 8 6
6 8 8 12 12 10 10 10 10 10 10 11 12 11 12 13 10 8 8 10 8 9 11 9 9 9 10 8 10 8 8 7 8 12 11 10 10 11 10 10 9 10 10 13 14 13 11 8 8 8
9 8 8 8 6 6 8 8 6 7 8 10 16 15 13 13 12 12 14 20 15 15 10 8 8 8 8 8 9 10 10 11 17 12 14 14 15 16 16 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8 11
12 12 10 9 12 12 16 10 9 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 12
8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 10 12 11 15 13 19 13 12 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 10 10
9 8 8 6 6 8 7 7 10 10 12 12 12 8 11 6 6 8 8 6 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 10 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 7 6 6 6 8 8 15 8 8 3 0 3 13 9 10 10 9 9 12 15 17 19 10 13 8 13 13 23 31 33 30 34 24 24 18 23
15 25 20 30 32 32 32 20 15 15 12 12 13 28 21 32 30 16 15 15 19 21 25 27 15 25 11 14 14 23 12 12 12 19 12 22 21 11 9 9 10 12 10 16 20 23 22 23 18 18
14 27 15 23 23 28 21 22 18 17 17 21 20 22 28 19 20 13 11 11 12 20 11 11 11 11 12 16 24 28 30 37 33 36 37 31 31 24 25 25 21 24 12 19 19 12 21 17 10 13
13 15 19 24 37 31 32 32 32 29 21 21 11 12 11 13 12 27 24 25 25 22 29 25 28 28 24 16 13 13 18 19 15 20 24 24 24 24 32 22 28 25 32 18 19 12 12 12 30 15
19 19 32 28 35 22 32 17 17 13 32 15 15 12 24 15 14 14 24 24 24 32 43 35 43 32 38 20 20 20 32 20 25 22 36 17 18 17 32 19 38 20 27 28 29 29 31 38 35 35
43 32 32 27 20 20 28 28 39 39 42 43 43 35 35 33 43 23 23 23 38 32 43 43 33 32 19 20 18 19 19 19 11 11 12 24 24 32 18 18 18 32 27 31 29 19 19 12 18 12
17 17 32 32 32 36 27 23 27 28 28 27 27 27 18 16 11 25 16 23 36 27 27 27 31 28 23 23 23 37 32 35 28 33 41 44 42 24 24 14 18 18 23 36 36 28 19 15 15 15
18 18 18 22 22 23 23 23 37 23 30 30 31 30 33 25 25 17 29 21 26 28 23 26 14 14 15 18 18 12 12 11 12 12 12 12 12 19 21 12 19 11 11 16 16 12 11 11 9 9
9 8 8 10 11 11 11 18 25 28 30 17 17 17 22 22 28 33 37 33 31 37 32 34 28 32 25 25 25 28 28 22 14 14 14 17 18 22 16 11 11 16 23 25 30 17 16 10 10 12
13 18 20 21 19 13 10 10 10 11 23 26 37 32 32 32 26 11 9 8 10 8 8 10 9 19 19 8 10 8 8 8 13 8 8 8 8 8 9 9 17 11 17 11 12 12 12 9 12 12
16 20 3 0 3 18 18 30 29 23 20 10 10 13 12 12 11 9 9 9 9 10 19 13 13 11 18 10 21 21 26 16 15 12 12 13 12 18 11 19 18 21 17 17 17 30 24 24 28 23
32 15 15 14 12 11 11 11 11 11 16 17 19 29 28 28 31 23 23 22 28 28 39 39 31 31 25 25 25 19 23 11 11 11 15 15 14 21 28 30 22 23 28 30 28 14 14 12 20 12
12 12 11 13 11 14 11 15 16 9 11 9 12 12 19 11 11 11 11 11 23 12 11 11 16 15 18 18 12 12 12 21 19 24 17 13 13 12 12 12 12 12 12 18 13 11 11 13 11 10
10 10 10 10 12 11 19 14 13 10 10 15 11 11 11 22 21 17 13 12 12 10 15 11 11 11 13 20 16 16 11 11 11 12 12 18 19 16 12 13 11 11 11 10 10 12 13 10 12 11
11 11 11 17 18 19 17 10 18 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 15 13 14 11 11 10 10 10 10
10 15 9 9 10 10 10 12 12 8 10 11 11 11 11 11 11 11 11 10 10 13 11 12 12 10 11 9 8 10 8 9 11 13 13 12 13 13 11 10 10 15 11 11 11 10 10 10 11 10
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 12 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 11 10 11
8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 9 9 9 9 8 8 9 13 10 8 10 10 10 12 6
6 8 6 6 8 8 6 8 8 8 11 11 10 10 11 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 11 8 8 6 6 8 8 12 12 11 11 10 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 11 11 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 12 12 11 11 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 10 8 8 8 9 8 10 10 11 11 11 12 11 11 10 10 9 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 6 6 6 6
8 6 6 8 8 8 10 10 10 8 10 6 6 8 6 6 8 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 11 10 9 9 9 10 11 12 12 10 10 10
10 10 13 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 8 12 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 9 8 8 6 6 11 8 8 7 7 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 10 10 11 10 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 11 11 10 8 8 7 6 8 8 9 9 9 |