BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-207A03.T7 (MSMg01no207_a03.b1) | MSMg01-207A03.TJ (MSMg01no207_a03.g1) |
ACC | AG390404 | AG390405 |
length | 1,145 | 1,221 |
length of high quality (start - end) | 718 (43 - 760) | 384 (71 - 454) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no207_a03.b1 PHD_FILE: MSMg01no207_a03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:29:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no207_a03.g1 PHD_FILE: MSMg01no207_a03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:29:23 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNNAATCATTGCGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCAGTATTGCGGTCAGGGCCTTATATAAGAGATTTAAAATGCTCTCAGAG
AAAAGGGCATTCCTATAGATAGGAGATAGTGTGCAGGGGCTGAAAATCTA
TTACAGGCCAAAGGAAAGAAAATGTAAAATGTCAGCAAGGCTGACATAGT
ATTTGGAGACAAACGCTTGCCTTGGTTAATTCTGCAGCAGAGTTGGTGTA
CTACTGGGCATGTGACTACAGAGGATGTAGGCCTACTAAGTGTGCTAGTC
AATAATCTTAGAGAGTCAGGAGGCCAAGGCAGGAGCATTGCAAATTCAAG
GCTAGTCTGCGGGAACCTAACCAGACCTTTACACAAAATACATTAGAAAA
AAGACTTACATGCAACTTAGCAGTGCGAGCTTGCCTGCTAGGTACAGTGT
CCTAGGATCAATTGCCAGCTGCACACACAGAGGTAGAATGAAAAACAAAG
AAGTATACCAAGGCCTCAAATGCTCAGACTATGGATTTTAATGCCAATTT
TTTTTATTTAAGTACTAAATAGTAGTATGACTTTCACCCTGAATTGTTAC
TTTGTCCTCAGATAAGAACCTCACAGATTATTCAATAAATAGCATTCTGA
ATCATCCTGCTATTACTTCTGCTACCATCTGCAAGCCATGCCTTATACGG
TATTCCATGTGCTTAAATAAATTGGTTGTGAGGATGTAGTTGGATACTGA
ACCTATACATAATTCTGGTATGCATGGGAAGGTGTCATTTTATATGCTCA
TCCATCATTTCCCAGGATAATTTAAATGGGGGCTTCCCTGAATCCAGTCC
AAGCAGACTACCACTAATCAAAAAACCATTGTGTGTGTTGTGTTTTATTT
CTTTCTCTCCTTTCTCATATCTACTTATTTTCAACATTCCCACTTCTTAT
TTTTCTTTTTCTCTTATTTCTCATTTTTCTTCTATCTTCTCTCTTATTCT
TCCTCTCTTTCTATCTTTTTTTTTATTCTTTCTTTTTTCTCCTCCTTTTC
TTTCCTTTTTATCATCTTTACCTCATTTTTTCTTCTTCCCTCTTTCTCTT
ATCTCTTTTCTTTACTTAACTTTTTTCTTTACTTCTTTCTCCTCC
| NNNGGGCAGATGGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGATCTTTCCAAGACTTTTATCATGAAAG
GGGTGATGACTTTTGTTAAATGCTTTCTCAACATCTAATGAGATGATCAT
TTTTTTTTCCTTTAAGATTGTTTATATGAGAGCCAGAGAGCTTCTGAGGC
GGCACCATCTTCTGCTCCAGACAACCGGCCACCTTCCTGGTGAGAGCACA
GGGGTCCGCCCGGCCCGAGAGGTTTGTGCCTCAGGCCCCGGCGGCAGGAG
CCTCCTTGGCTCCGGGACTCCACGGAGGGCAGGCTGCACGGGTGAGGGTG
TGGAATACAGAGGCCAGCTGTTTCTGGGCCAGGCGAGAGCCACAGAGCTT
CTGAGGCGGCGCCATCTTCGGCTCCAGGCAACCGGCCACCTTCCTGGCCA
AAGCATCTCAGCTCCTGGGAAAGATCCTGTTTTGGGCCTTCATCTTCAGC
CAGGAGGAGGTCCAAACACCAGATAACTGTGCACCTTCCCTGAAAGAGGA
GAGCTTGCCTGCAGGGACTGCTCTCACCACTGAAACTCAGAGGAGAGAGC
TAGTCTCCCACGTCTGCTGATAGAGGGTAACAAAATCAACAGAGGAACAA
TCTCTAAACAAAGACAACTATAAAAACTAACTCCAGAGATTGCCAGATGG
CGAAAGGTAAACGTAAGAATCCTACTAACAGAAACCAGGACCACTCACCA
TCATCAGAACCCAGAACGTCCACTTTGCCAAGTCCAGGGCATCCTAACAC
ACCTGAAAAAGTAGACCTGGATTTAAAAGCATATCTCATGATGATGGTAG
AGGACATAAAGAAGGAATTTTTTAACTCCCTTAGGAAAAACAGGAAACAC
CTGCTAAGGGTTTCAGGCCTTTATGAAAAACAGGAATAACCCCCCCACAG
GTTGAATTCCTTTTATTAAAAAGGGAAACACTTCTCCCCGATGGGGGAGT
GGATCAAACCCTCCTAACCTCAAATGGGGGTATGTCCATGCTAAAACCCT
ACTGTGGCACGCTTCTGATATAAATTTTTAATAATTCTTGGTCTTTAATT
CCTCTTTCCTCCAATATTTCAGATGTAAAGAAAATTTCCGGCAAATTTCT
TTTTAAATATTGTCCTCTTCTCTAAAATGGTTTGGTTAATTCTCTTTTTA
TTCTTTTTTCTCCGCCTGGAT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 7 6 6 6 6 8 10 12 10 10 8 8 8 8 8 10 17 9 8 8 8 8 8 12 12 29 21 17 24 23 22 28 33 37 37 37 33 37 37 32 28 28 37
37 33 33 33 33 33 33 41 47 44 41 39 37 37 30 25 9 9 9 7 7 7 10 10 10 23 23 35 35 47 47 59 33 36 36 36 36 50 59 57 57 57 57 53 47 47 42 39 39 47
47 44 48 46 46 34 28 16 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 23 41 41 42 42 48 48 48 53 39 30 24 13 10 10 10 12 13 19 31 37 43 48 57 48 59 57 68 68 68 68 47
47 68 68 47 50 68 50 51 50 50 50 48 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 59 44 34 18 10 10 10 10 10 16 25 44 57 57 57 59 59 57 54 54 54
57 57 57 59 54 54 54 57 57 68 68 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 48 48 48 57 48 48 48 47 57 47 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 42 42 42 42 47 48 59 59 46 43 43 46 48 54 54 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 43 41 47
39 30 28 28 22 22 16 15 11 11 12 29 28 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 57 53 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 46 47 43 40 43 46 48 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 48 48 48 48 48 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 54
54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 57 52 52 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 54 54 59 59 57 68 54 54 54 54 57 57 59 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 59 59 48 48 48 42 42 42 41 39 39 39 34 37 41 59 59 59 59 59 50 50 48 48 48 57 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 53 53 50 50 50 50 47 47 37 37 37 31 31 37 44 44 47 47 50 59 59 59 59 59 57 57 48 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 53 50 50 50 50 50 57 57 53 53 48 48 48 48 48 48 57 48 50 37 34 30 19 19 26 26 37 39 27 27 14 19 21 34 34 19 13
14 14 14 19 37 47 47 28 22 10 11 11 16 16 30 32 21 22 13 13 16 25 19 23 21 13 11 11 11 16 27 26 22 14 10 10 13 7 8 8 21 14 28 28 28 23 28 28 30 30
32 32 24 23 12 15 13 17 30 32 39 32 26 24 22 19 19 21 14 14 15 14 12 12 12 12 15 10 11 11 10 10 8 10 13 16 22 18 20 12 9 9 10 10 11 11 11 13 10 10
10 10 15 15 13 11 10 10 12 9 8 8 10 9 9 8 8 10 8 10 10 11 9 10 10 8 8 8 12 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 9 9 8 8 7
6 8 8 13 10 8 8 8 8 11 10 10 19 20 19 17 10 8 8 8 7 6 6 6 8 10 10 8 10 13 10 8 8 8 8 10 10 8 10 10 10 11 11 8 8 6 7 10 10 8
8 8 8 6 7 10 11 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 17 16 10 10 6 6 8 8 9 8 10 6 6 6 6 6 8 11 12 11 10 10 10 8 8 6 7 7 8 10 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 9 13 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 14 10 9 8 11 13 15 10 8 6 7 6 12 10 19 12 11 11 10 10 10 22 12 11 12 11 19 10 10
10 10 12 8 8 8 11 8 12 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 12 13 8 8 6 6 8 6 9 10 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 9 9 10 11 11 9 9
13 13 19 10 12 12 20 20 18 18 10 10 14 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 12 13 13 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 8 8 8 15 8 9 11 13 9 7 9 9 16 12 19 19 19 9 9 10 21 21 31 28 28 30 38 36 36 36 37 37 34 37
34 42 43 53 53 53 57 57 68 68 68 68 57 46 34 28 21 18 23 20 25 25 42 39 48 57 54 54 48 50 46 46 46 48 57 68 68 51 51 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 44 21 14 8 8 8 14 23 44 42 47 47 41 50 50 51 51 51 51 48 48 36 31 23 20 20 20 32 28 50 50 50 50 50 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 53 53 53 53 53 53 53 50 50 59 59 57 57 53 53 53 53 50 50 50 50 59 59 30 25 23 13 12 12 25 27 43 47 50 50 50 50 53 53 57 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 59 59 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 59
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 68 68 59 59 48 48 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 44 44 37
37 36 37 24 24 20 24 30 44 47 59 59 59 59 59 59 59 68 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 41 34
28 28 11 9 9 9 9 9 10 12 13 13 18 19 13 12 12 12 12 19 28 34 41 48 48 48 48 59 48 48 48 59 59 59 57 59 59 47 47 30 40 30 28 30 23 23 18 24 18 26
26 31 29 43 42 54 54 48 48 54 57 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 48 57 57 57 57 44 43 43 43 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 48 57 46 57 43 42 42 28
28 28 35 35 44 47 43 43 43 59 43 52 52 57 57 57 48 50 50 37 43 43 57 57 48 47 50 57 57 57 43 46 47 48 57 59 46 46 29 32 17 26 26 35 35 35 39 39 37 37
42 42 47 44 41 57 57 57 48 47 47 47 47 47 59 37 43 37 46 37 39 36 46 46 48 50 57 57 57 57 54 48 48 59 43 34 28 28 33 43 43 39 39 39 43 39 39 48 43 43
43 47 47 47 39 47 37 43 39 34 34 39 34 34 28 22 18 27 32 47 35 39 39 41 43 48 48 48 57 59 48 43 47 43 37 37 28 28 30 37 37 32 31 28 37 37 37 39 31 31
43 43 44 39 37 41 41 41 39 41 41 42 42 41 39 39 39 36 36 39 41 47 47 47 43 41 41 37 44 44 44 39 39 39 44 44 41 39 39 39 37 34 41 43 37 35 25 30 22 22
23 28 24 28 34 34 39 34 34 37 37 39 39 25 22 15 18 18 18 20 22 30 41 34 28 28 17 17 17 28 24 35 35 31 31 35 31 31 25 26 14 18 20 25 34 24 31 28 28 14
14 14 24 23 28 18 17 21 23 27 25 30 26 17 10 9 9 9 11 13 19 16 24 15 17 17 28 28 36 39 33 26 32 24 24 21 14 14 19 23 22 22 25 25 19 21 13 13 15 9
9 11 14 14 10 11 11 12 10 16 15 14 14 13 18 18 18 9 12 10 10 11 11 10 10 11 10 10 10 10 12 12 11 11 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 9 10 9 9 8 12 8 9 8 8 10 10 11 11 14 19 15 11 8 8 8 8 8 8 10 11 8 12 6 6 6 6 6 8 13 9 9 9 9 11 10 13 13 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 21 21 11 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 10 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 9
9 7 8 8 8 8 11 19 13 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 6 6 7 6 8 6 6 6 6 8 8 11 11 11 9 9 9 9 9 10 20 11 9 8 8 8
8 8 10 10 13 10 10 10 8 8 8 9 9 10 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 9 9 9 11 9 9 9 11 11 11 11 11 9 10 10 12 13 13 13 11 8 8 10
8 8 8 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 7 10 8 9 9 9 9 9 6 7 6 6 8 6 8 9
9 9 9 14 13 14 12 12 7 7 8 8 8 10 7 7 10 11 8 8 8 8 8 8 8 13 10 9 9 10 10 23 23 19 19 16 11 11 11 11 10 10 10 10 8 9 12 12 16 24
9 10 8 8 8 8 12 8 8 8 8 12 10 8 8 6 6 6 8 8 8 |