BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-308A16.T7 (MSMg01no308_a16.b1) | MSMg01-308A16.TJ (MSMg01no308_a16.g1) |
ACC | AG432226 | AG432227 |
length | 739 | 925 |
length of high quality (start - end) | 345 (73 - 417) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no308_a16.b1 PHD_FILE: MSMg01no308_a16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:49:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no308_a16.g1 PHD_FILE: MSMg01no308_a16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:49:15 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATGCAGAACATCCGCGGA
ATTCTTTGGATTTTCATGAACAACCAGAGGTGACAGACTGATCCATTAGG
CAACATCGTGACCCAAACTGCTGAAGTGTGTTTCCATGATTCTTCTGCTT
GTACTTAAAGCTCATAGCAATAGTTGTCTCCTGAATCTCCTCTTTGTGTT
TTATTGGTACCCTTCACCTGCTTCATTGTGTGGGGCCTGGGGTATCAGTG
AGGAGGAATGAGTAAGTGTTGGAACTGCCAAGGTACGACGTTTTATCTTA
AAACACCAGCTATAGAATCTTATTTTGTTAGATAAGGGCCAGATAAGAGC
CTCCTGTAGATTAAGTCAAGATAGGTATTTTGCGTTTACCATGTTATTAT
GAATTTAAATAAGCCTGCCCCAACAGCCTATGTCTAGCCAGCAACTATGC
CATTAGGAAGCAAACAGAAGTAATGAATCTTTTTTGTTATGCAGGTGGTT
GTTGGATCTCTGATCCCAAATTCTTCTGGTGCAGGTAGCCAGCTTCTATC
AAAACTGAACATAGTTTTTATTATAAGACATCCATCGTCTAGCATCCCAT
ACAACCTTCTTCTTTACAGTTTTTCTATTAAGTATCAAGTCTCAGATTCT
AAAAGATATCACTCAGAATAATTTAACTTTCCTTTTCTTGACTATGTGTG
GAACATCTATTGTAGGAGCCCTCTGGGTCTTCCTGTTCC
| TGGTCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXNNGGAATTCTCACTCTGAGAGAATACATGAATGGGCACGAGAAA
CACCGTGAAAAAATGTCTCACCCTCCCTATAAACAGTGCAGGAAAATGCA
AANTTAAAACATACCCTGGAGATTTCCACCTTCACTCCCAGATCAGAATG
CGCTAATGATCAATAAACTCACGCCGACAGCCAAATAGATGGCGGAGGAT
GTACCACGAAAGGGGCAACACTCCCTTCTATTGTTTGGTAGCCATTCGCA
ACGCTTGATACAGCATCCGCTTTCTTACATGAACCCACTAACCCACCACG
TTTATTTTTTTTTTACCCCTCCTGTAAAGGCCGCCCTCCGAGAAAAAGAT
TTGGGGGTGGGATTTCCNANGACANAAGACCCCATTTATTTTTTTTTTTT
TTNNTGTNGNNGGGNGGGGGTGCCCCCCCCCCAAANNNTTNTATNNNNTA
AAAGTGGTTTCTCCCGCCCCCCCTGGCCTCTCCTTTTTTTTCCTTCCCTC
TCCCCCCTTCCCCGCTTAGCTCTTTCCCTTCCTTATCCCCCCTCCCGTTT
TCTTTTGTTCTCCCTCTATCTTTCCCCCCCGCGCCCCCGTCTCTCTCATT
GATACAGCCCGCGTATTATCCTATCCCCATACGCCCCCCCGCTTTTTTTA
ATCCCCGCCCCCATATTTATATCCCTCTACCCCCCTTTTATCGCCTATCG
CCCCCCTCATATCTATTACCCCCCATTTTAATCCATACCACACATTTTCT
TCGCCCCACCTCCCACTATTTATTATATATAATCAATGCCCCCCTTCACA
TACCCCACCCCCTCATTCTTCTACACACACCCCATATTACCCACTATTTA
TTTTTTACGCGTCCCAAATACCCCG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 13 6 6 6 14 17 37 37 39 39 39 34 34 37 24 25 25 28 28 28 41 46 28 25 23 23 18 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 12 27 27 31 31
31 31 33 33 59 59 30 23 10 10 10 8 7 7 7 7 7 9 8 8 8 10 16 16 26 30 37 37 43 50 41 53 53 50 50 47 48 47 47 50 53 47 47 50 50 48 48 57 50 57
68 68 68 51 51 51 47 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 48 44 48 41 43 42 39 35 35 39 42 48 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59
54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 68 68
68 68 57 57 57 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 54 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 59 59 44 59 43 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57
42 43 42 42 35 35 35 42 42 57 57 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 53 50 50 57 48 48 48 48 47 59 59 30 25 15 15 12 11 13 8 8 6 8 8 11 19 27 41 40 40 40 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 44
57 57 57 57 59 59 59 68 68 34 34 23 15 13 13 13 13 13 14 23 23 36 27 19 17 17 18 30 32 27 24 11 11 11 24 28 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 25 23 12 11 11 10 10 10 9 10 11 10 12 12 17 26 34 39 47 48 48 43 43 46 48 48 48 48 43 43 35 35 35 47 47 47 43 43
43 48 43 43 32 35 35 42 42 43 43 43 48 48 48 48 48 57 48 48 48 47 47 48 54 54 54 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 57 57 57 42 42 35 35 47 59 44 42 33 33
42 44 46 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 37 37 57 57 57 57 57 57 57 42 39 35 37 37 39 43 43 48 59 44 47 28 31 28 25 24 25 43 43 48 48 42 39
32 32 32 43 37 59 43 32 32 30 24 24 19 21 43 41 57 36 38 38 36 31 30 19 19 14 30 30 22 20 22 19 20 27 28 43 41 47 46 46 43 43 30 30 25 30 32 37 34 37
37 35 17 16 11 11 19 22 28 32 37 37 37 34 21 18 20 21 20 24 33 36 39 46 46 48 59 59 43 43 23 23 20 28 31 37 37 48 48 34 34 24 24 11 19 11 15 15 36 32
32 23 17 14 14 14 21 26 39 35 36 36 26 25 19 15 15 19 28 30 30 30 33 33 39 39 28 28 30 24 20 24 24 25 34 37 31 31 31 34 30 36 37 17 15 9 9 10 11 9
12 17 10 11 14 30 30 25 25 21 25 19 23 15 15 15 11 11 12 13 16 19 30 29 20 11 13 11 11 16 15 21 10 10 10 14 12 11 11 | Open.Hide. 8 11 8 6 6 6 8 11 12 11 18 10 10 9 9 8 7 12 8 8 8 8 8 8 13 10 22 22 29 16 16 19 30 13 19 13 15 21 13 7 6 6 6 6 6 6 6 9 15 19
33 30 30 21 25 3 0 0 3 14 15 37 37 37 34 34 15 11 8 8 8 17 19 10 10 9 9 9 12 10 10 8 8 8 18 17 16 9 9 9 8 11 6 6 8 10 22 37 39 41
41 34 19 12 9 9 17 17 30 30 37 27 30 17 13 6 6 6 10 8 11 6 6 6 7 15 15 8 8 8 15 18 8 8 6 6 6 6 8 10 19 29 32 31 30 23 21 14 14 16
8 3 0 3 6 6 18 24 19 15 8 6 6 15 19 18 9 9 9 9 13 13 19 8 6 6 10 7 9 13 19 39 36 15 13 6 6 8 15 11 6 6 8 10 21 34 39 37 17 14
9 9 12 12 14 6 6 8 8 12 10 9 10 10 12 12 11 18 19 10 10 8 8 8 8 14 17 15 11 8 8 8 13 19 15 12 9 9 10 8 8 6 6 6 13 19 22 24 16 24
8 8 8 8 8 8 8 8 10 18 28 32 17 13 10 10 10 13 17 12 12 9 8 8 12 8 8 8 8 8 12 11 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 12 11 12 11 12 8
6 6 8 8 10 10 10 10 10 12 22 21 10 8 8 6 8 6 7 13 12 25 18 17 17 15 10 11 8 9 10 8 13 15 10 8 8 8 8 8 10 6 6 7 7 10 6 8 8 8
8 8 9 9 10 16 19 29 27 15 11 11 11 11 11 11 15 10 10 16 13 19 10 9 10 10 9 6 6 8 8 8 8 8 10 13 10 9 9 9 9 10 10 12 10 10 6 6 7 7
7 6 9 9 7 6 6 6 6 6 7 7 7 9 8 8 3 0 3 0 3 9 9 3 0 3 9 9 9 9 16 17 11 11 11 12 11 12 9 17 14 14 19 19 15 9 8 8 8 8
11 3 0 0 3 9 3 0 3 0 0 3 14 3 0 3 9 9 9 10 11 11 10 12 14 16 17 17 17 11 12 12 9 12 3 0 0 0 3 3 0 3 6 3 0 0 0 0 3 9
16 8 8 8 6 7 7 9 9 7 7 7 7 7 7 11 12 9 9 9 9 7 7 7 7 9 6 9 13 13 16 13 10 11 11 14 15 9 12 9 9 9 9 10 9 9 10 8 8 8
8 8 8 11 13 12 11 14 10 11 9 9 10 9 9 10 10 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 11 11 13 12 18 13 15 9 9 9 10 11
10 10 8 8 8 9 7 6 7 7 9 9 7 10 8 8 8 8 8 8 10 16 13 12 9 9 9 7 11 6 6 6 6 9 9 12 11 9 10 10 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 11 11 11 8 11 8 9 10 10 7 6 8 8 8 10 10 13 11 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 6 6 8 10 8 16 15 11 11 11 11 12 15 15 11 11 9 9
8 8 10 11 12 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 7 7 12 12 17 13 15 13 26 17 9 10 9 9 10 6 8 8 8 8 12 10 6 6
6 12 8 24 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 11 15 15 24 9 9 9 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9
10 10 13 8 9 9 9 7 7 13 24 30 15 13 9 9 9 9 10 13 9 8 8 8 6 6 6 6 7 9 8 8 6 6 8 11 11 11 11 13 17 9 9 8 8 8 8 10 12 12
12 13 12 9 10 9 9 9 9 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 11 15 10 16 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 15 11 7 10 6 6 6 6 8 8 13 8 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 |