BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-342L01.T7 (MSMg01no342_l01.b1) | MSMg01-342L01.TJ (MSMg01no342_l01.g1) |
ACC | AG456180 | AG456181 |
length | 750 | 756 |
length of high quality (start - end) | 242 (63 - 304) | 325 (66 - 390) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no342_l01.b1 PHD_FILE: MSMg01no342_l01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:32:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no342_l01.g1 PHD_FILE: MSMg01no342_l01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:32:17 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGGCGCTATACGACTCACTATTTCAAGAGAAAGCGCGGAATTCAAAACTT
GCTNTACAAGAAATCTGAATTTAGAAATCTTAGCGGCTACACAAATTCTC
ACATTGGTTCAAAAACATTATCTACTTCTTTTTTTTTCATGCCTAGTAAA
ACAATACTCCAATATTTACTCTGTTTTAAATTGTCTCACATTCTATGTTT
TGTTTCTAAACATGATACTAAGCTCTTACAAGAGTTAATGCTAAGAGGTT
CTGGCTCCTTAGAGAATTCAGTCTATACAAATGACATCCTTTCATTTGAC
TAGTATCTTTTATATTAGATATGCATTACATAGCAAGCTCCTAATGCACT
TAAATGCTGACAGTTCAACTTATTGCTAGAGAATGTTGAAAGGCAGATAA
TTACCGACAGTATTGTGAGGGGTGTCTAAATCAAACAGAAGCACAGAANA
AAATAACTCTGCTAATGTAAGTCAATGTAATTAGATTTTCTTGTAATTTA
TTTAAATATGACTGTTTACAATTTTACCTAATGATTAACAAGCCTAATAT
CATTCAAATAATTTAAATGAAAGGGCATTTTTCAAATCCTGCCCCCTGGT
TGAAACCTTCCCAAAAGGTTAATAAATTTCCAAACAAAATTTTTCGCCCT
TTTATATATTTTTTTTCTCCCCATCCCCCCTTTCCATTTATATTTATCTC
GCCACTTCCGCCCATCCCTTATAATCCCCCCCCTTTCCTTAATAAACTCT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXTCTGTACCCCCTTTTAAAATTAGGTTATTTGGTTT
TTTTGGAATTTAACTTCTTGAGTTCTTTGTATATTTTGTATATTAACTCT
CTACTGGATGAAGGGCTAGTGAAGATCCTTTTCCAATTTATAGGTGCGCC
CTTCCCCCAGCCTTGAGCAGGATGGCTCATACCTGGCTTCCCACAGCTGG
CCAGCCCACCTAGGGTGGAGTCTTCTGACCTAGGTAAAGTCTATTGTCCT
GCCACATCTGAGGCTTTCCTTCAAGACGCCACTACCTGCTGAGGGGTTGA
ACCTGTTTTCCCTACAGTATCCTGACAAAGAAGAGATCCGGACAAAGCAA
TGCGGTCCGGCGATGGTTCCTATAACTCCCTACTTTAAGGTCGTAATATT
CTCCCTCACCCACCCTCTTTTTGCCCTCTTATTCATCCCTATCAGAATCT
TTTCTCCTTTAATCCTTGCCATTTCTCCCCCGCCCCTCTGATTCAATATA
TTTTCTCTTCCCGTATTTTTTGTTCTATTAAATCTTTTTCCTATTTACTA
TTCCCTCTCTTGTTTCAACATATTCGATCCTTCTTAGACCTATCATCTTA
TTCCCCATTTTTTCCTCCTCCCCATACCTTTTCCTCCTCCCCCGTCAGTA
TCTCTCTTTTTTCTCTTTTCATATTTTTTTTTTTTTCTCCTTCCCTTTTT
TTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 11 15 8 13 10 10 10 13 10 22 23 30 22 10 15 12 14 7 9 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 7 6 8 16 13 21 25 22 19 18 28 28 29 21 21 10 9 6 6 6
6 6 3 0 3 8 8 8 6 6 6 10 15 22 37 37 31 31 31 33 36 36 57 57 36 36 36 37 37 42 48 48 48 48 59 57 57 57 57 57 53 53 53 57 53 57 57 36 36 33
33 33 32 22 19 11 11 9 9 11 11 11 20 25 37 33 33 33 31 50 50 53 57 57 57 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 53 53 50 50 68 68 68 59 68 68 68 68 59 59 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 24 24 24 25 23 23 18 26 24 47 44 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 53 53 53 53 44 44 50 50 47 30
27 12 12 9 9 9 9 9 12 12 11 11 11 23 22 27 27 59 50 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 47 43 35 35 32 40
40 30 30 30 30 32 42 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 44 42 37 37 42 48 57 57 47 47 48 48 44 47 44 44 44 44 30 42 42 42
37 28 18 18 11 12 21 22 23 18 28 28 34 32 36 43 43 33 36 28 30 36 39 43 43 43 43 43 48 43 43 41 39 47 41 43 43 41 37 37 41 37 47 39 41 22 23 3 0 3
19 23 37 35 36 28 31 23 25 25 21 19 19 21 13 13 9 6 6 6 8 13 12 15 11 13 10 9 9 10 13 13 9 9 9 9 9 9 18 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 14 29 21 28 23 16 14 15 22 16 16 14 19 21 11 11 10 8 6 6 6 6 6 10 9 9 10 16 10 10 13 13 13 9 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 7 7 12 10 10
8 10 8 13 11 11 9 9 9 9 8 15 12 8 8 10 8 8 8 10 10 16 11 10 9 9 9 11 10 16 8 8 8 8 9 8 8 8 8 9 11 10 17 8 8 8 10 11 10 13
10 9 9 9 8 10 15 11 13 13 19 15 18 18 30 14 9 8 10 8 8 9 11 10 12 12 24 21 16 16 15 10 10 11 12 12 8 6 6 6 9 9 12 10 10 10 10 15 12 15
22 22 11 12 11 8 8 6 6 8 6 11 19 10 10 8 8 8 8 11 11 14 12 12 9 10 10 17 22 36 25 18 17 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
11 11 15 15 15 15 16 15 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 11 11 12 9 9 10 10 16 16 11 11 11 12 12 15 12 12 10 12 11 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8
| Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 16 22 28 32 28 32 28 35 35 34 41 37 31 26 8 8 7 8 8 9 11 19 10 13 13 30 25 37 48 48 48 37 36 33 33 36 37 44 47 50 47 43 23 17
8 8 8 8 15 16 32 32 41 28 28 28 28 30 35 53 53 53 57 50 53 59 59 59 59 59 59 44 41 41 37 37 41 41 39 41 42 50 50 50 50 53 53 57 47 47 47 47 57 57
59 57 57 47 47 42 42 48 48 50 54 68 68 68 68 57 57 57 54 48 48 48 48 57 57 57 46 46 37 46 46 54 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 48 47 57 57 57 68
68 57 57 57 57 47 47 47 50 50 47 57 57 48 48 48 59 59 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 36 28 36 36 57 52 54 54
59 59 52 52 52 57 52 43 42 43 43 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 39 38 30 19 9 9 9 22 28 44 35 35 35 43 44 43 52 45 52 43 52 52 52 57 43 45
45 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 57 43 52 52 52 52 52 38 38 20 20 20 32 36 43 52 52 59 59 59 59 59 52 52 52 59 57 57
43 43 32 32 32 43 43 43 43 43 24 24 14 14 14 34 34 68 59 50 50 32 32 29 19 32 12 12 34 34 44 57 57 44 48 44 57 59 59 42 44 30 30 17 17 17 22 24 36 28
30 37 44 42 41 41 47 59 47 48 43 37 30 20 14 14 24 30 47 59 43 57 43 26 23 15 12 12 19 19 23 32 25 20 24 24 28 21 21 15 15 15 11 11 12 16 20 12 9 9
12 12 12 11 11 8 13 10 8 8 8 8 10 8 8 7 6 8 8 10 9 9 8 8 6 6 8 8 11 11 13 13 14 14 12 12 11 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8
11 11 11 11 11 12 12 10 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 14 11 11 10 11 13 10 10 10 10 10 11 10 10 9 9 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10
10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 11 9 8 10 8 8 8 8 11 11 10 9 9 8 8 8 16 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 11 8 8 9 11 11 9 14 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 17 14 15 13 10 9 9 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 11 15 15 10
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 21 24 13 15 11 13 10 10 11 18 19 17 17 8 8 8 8 8 8 11 11
8 8 6 6 6 6 15 20 26 32 23 21 12 11 11 11 10 10 10 10 6 6 8 8 8 8 8 9 10 14 18 36 36 15 14 10 8 8 12 13 9 9 8 8 9 9 11 11 13 12
16 18 23 28 28 23 |