BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-347I22.T7 (MSMg01no347_i22.b1) | MSMg01-347I22.TJ (MSMg01no347_i22.g1) |
ACC | AG459870 | AG459871 |
length | 880 | 763 |
length of high quality (start - end) | 98 (73 - 170) | 439 (78 - 516) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no347_i22.b1 PHD_FILE: MSMg01no347_i22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:38:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no347_i22.g1 PHD_FILE: MSMg01no347_i22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:38:34 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AAACCAAAATCTGCGGCGCTAAACGACTCACATATCCAAAAATCCGCGGA
ATTCTCTCTCCTGCTGCCAAGTGTAAACAAGCATATCCCAGAGAGAAAGC
CTGCTCTGTCCCTTTTCACGGGCTCCCACAGTCACAACCCAGTGGTGGGT
TGTTTGTTTGGTTTGTTGTTTGGCTGAAAACTACCATATTACCCAAAACC
CCCAATACCCCCCCAAAACCAAATTATCCCTACATATAATATATTACCAA
ACAATTTTTTTTTTAACATAACCACTATATTCCCTCCCTCCCCATATTAA
TAACTCTTCCCTAATTAAAACCAATTTTTCTTATTTCNAAAACAAAAACC
ACACTCTACAAACTACCACATTCTCCCTATCCATTACTCTTTCACTTTAT
AACACTCTATAATATACTTTATTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCATTTATA
CCCCAAACCATAAACCCACCCCTCTATTTTCTCCCCTATCCCCCCCTCAC
TTATACATATTCAAAATCCATTTTCCCTCCCCTCTCCCTATCACTAATTC
CACTTATAATACCCAATAAAAACTAACAAACAAATATTCATCTCTCCCCC
CCCTTCTATTCCTATATAATTTCTTTATCACATATATTACCCCCCTCCAT
ACACAATAATATAACCTATTCTTATCCCCCCCCCCCCTATCCCCTTATTT
ATTCTCCTATCCCTTTCATCCCTACTCCTTTTTATATTTTTCCCCCCCCC
TATCTCCCTTATATTACCTCCACCCTTCCTCCACTATAATTATTCACCCA
TCCATACTATTTCTCCCTCCTCATTTACCCCCCTTTTCCCCCACCATCTT
TATCCCTTTCTATTTTTAATTTACTCACTC
| NCCCGATGATATTGCGTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTCTGTGCCCCTAAATTTAAAT
TTCGAAGAGGCTCTGATTGGACCGGAATGTAATTTGCTATGTCAGGTCAT
TGTTATGGCAGAGGCTGGTAGGCTGTGGGTCACCTCTTGCCTAACCCATT
GGAATAATAGGGTGTAGACATGGAAAATGGGGTAGTCTCTGTCTCAGGAC
GTGGTTCAGCAATGGCGCATTTGCTTAACTTGTGCAAAGCCCTGGCTTTG
ACCCTCAGCACGACAAGGAATCATTTTTAATTTGTTTTAAGGAGTTTCTC
CTGAGGGAACACAGGTGAGCAAGGCACTGAACACATGCAGTTACTGTGAA
GGAATTAAAAAGAATTCCCCAAGTTTAAACCTCCAGGCTCCCTTGCGAGG
CTAGAGTCTGTTCTCAGCCCATCTAAGTCTCGGCCTGATCACCTTGAGTA
TCTGAAGACCCTGCTTATGAAGGAGGAAAAGGTGTGTAAATAATTTAAGT
TATATTTATGGAATTCTTCAGGTGCTATGGTATAAAAATTTGCCCGAGTA
AAGACTATTTCTTCTCCATTAACATGCCCTTCCTTTGGCTTGGCCTGCTT
TCTTTACCGGCCTACTCTCTAAAATGGAATTGGCCTTTGAAAATGCTCCA
CCTTATGGCGGTCATCCCTTTTTTGCAGCCCATCCTATTTTACAAAACTT
TCTATTCCTGAAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 12 15 10 8 8 8 10 13 9 10 10 10 13 9 8 8 8 9 9 11 13 10 15 8 8 8 6 6 6 8 8 11 12 9 11 9 8 8 10 16 22 23 21 19
11 15 22 29 59 59 27 27 9 9 9 9 9 9 9 9 12 16 18 15 11 11 12 20 30 33 36 35 35 35 35 50 50 50 50 57 53 44 43 36 36 43 43 43 43 44 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 47 42 36 24 24 15 18 18 34 32 57 57 57 57 57 68 68 51 51 51 68 68 68 57 57 54 48 48 48 48 48 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 47 48 43 43 43 42 42 30 30 28 28 23 19 20 15 12 9 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 12
10 11 8 8 7 6 8 8 9 9 9 9 10 10 15 10 10 10 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 10 12
13 14 14 16 19 13 21 23 22 12 11 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 12 8 8 6 6 8 8 8 10
8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 9 9 11 12 13 11 11 10 9 9 11 9 9 9 9 16 10 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 10 11 9 10 10 9 9 9 10 10 10
8 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7 7 10 8 8 8 9 9 9 9 9 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 8
8 10 10 10 8 8 8 8 11 11 13 10 10 10 10 12 10 10 9 9 9 10 12 12 13 14 14 16 14 15 20 15 13 9 14 18 11 11 11 15 15 9 8 8 8 9 9 8 8 8
8 8 8 11 9 9 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 15 14 11 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 8 8 8 8 9 9 10 11 8 8 8
8 8 8 8 10 8 11 9 11 10 8 8 8 8 8 11 11 10 16 13 12 12 15 13 13 11 11 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 6 7 8 8 6 6 8 8 10 10 10 13
10 10 11 11 9 9 10 10 10 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 12 11 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 10 9 10 10
10 10 8 12 12 12 10 11 11 15 13 10 10 8 7 6 7 6 8 8 10 10 14 14 12 10 10 17 10 10 10 13 13 13 17 13 8 8 6 7 8 8 10 10 10 14 10 10 10 8
8 7 6 8 8 8 8 8 8 6 7 7 9 7 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 10 10 10 15 15 14 10 8 8 10 9 8 11 8 8 11 9 9 9 10 11 9 8
7 6 8 8 9 9 9 11 15 9 9 9 9 12 12 8 8 6 6 8 8 11 10 10 9 9 12 17 11 16 10 12 8 8 8 9 13 15 14 15 12 11 11 12 15 15 15 15 12 12
14 12 12 10 9 9 9 8 12 12 15 17 7 6 8 8 10 10 10 10 9 9 13 12 9 10 10 11 11 9 9 8 8 7 8 10 6 6 6 6 8 7 6 8 6 8 8 6 6 6
6 8 8 10 9 9 9 9 9 9 7 8 8 6 6 8 8 13 10 10 8 6 6 6 8 8 9 9 9 12 10 8 8 8 8 10 6 7 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10
8 12 12 15 8 9 10 11 8 8 8 8 8 8 6 10 7 6 8 8 8 10 8 8 6 8 13 13 10 10 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 13 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 10 10 15 21 37 39 39 39 39 36 37 44 37 21 17 8 6 6 6 6 7 10 12 10 10 10 18 19 29 28 33 36
27 22 12 12 14 27 21 42 41 25 21 10 9 9 9 9 20 21 22 26 25 15 19 28 28 30 35 47 50 50 50 53 50 53 53 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 57 54
54 54 57 57 57 59 68 68 68 50 54 54 54 50 50 50 57 57 37 37 37 46 57 47 41 41 48 48 46 46 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 50 50 50 50 50 57 57 54 57 57
57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 68 57 57 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 57 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 39 43 43 43 44 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 39 31 31 31 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 57 57 57 59 59 59 57 39 35 35 43 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 54 54 52 52 52 57 57 59 57 57 43 43 35
44 43 57 57 57 57 54 43 43 43 43 43 43 46 57 54 54 50 59 57 54 54 59 59 59 68 59 59 54 54 57 44 41 27 20 20 34 41 47 57 57 59 59 59 42 41 41 42 47 46
59 43 43 43 47 47 54 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 43 43 46 48 54 57 48 48 57 48 48 48 48 48 43 43 36 36 43 43 43 43 43 43 43 43 48 46 43 37 37 37 37
37 37 41 37 32 22 30 23 22 22 32 43 39 23 22 17 10 9 9 11 12 22 26 24 28 14 16 17 30 18 8 8 8 8 13 11 13 10 10 10 19 26 35 35 32 34 33 22 15 12
10 13 12 19 30 34 18 18 15 12 12 18 18 16 24 25 22 21 13 15 17 13 10 8 11 11 11 13 11 13 14 17 14 16 23 23 20 20 20 25 19 14 10 11 10 10 10 13 9 9
9 10 12 8 10 8 7 7 7 7 16 16 13 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 9 11 23 19 19 10 10 10 10 10 8 10 10 8 9 13 15 24 18 17 17 13 15 10 10 10 17
23 28 15 15 10 10 10 10 16 11 12 11 10 12 9 9 8 8 10 10 10 10 10 9 10 10 9 9 8 10 10 9 7 8 8 8 13 17 28 14 12 10 9 8 8 8 8 8 8 11
10 10 15 19 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 14 11 11 16 13 13 6 6 8 8 10 10 8 10 8 8 8 10 8 9 9 9 15 8 8 8 8 10 8 10 9 11 8
6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 3 0 |