BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-431F06.T7 (MSMg01no431_f06.b1) | MSMg01-431F06.TJ (MSMg01no431_f06.g1) |
ACC | AG523612 | AG523613 |
length | 777 | 1,303 |
length of high quality (start - end) | 455 (40 - 494) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no431_f06.b1 PHD_FILE: MSMg01no431_f06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:54:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no431_f06.g1 PHD_FILE: MSMg01no431_f06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:54:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCA
GTACAGGATCCATGGAAGAAAAAAAGGAGAATTATTTGGGGAAGTTCTAA
ATGAGGAAAGTGTGAGCAGGCAAGACAGAGGTGGGAATGGTTAATACTAA
TGATCTAGGATATGCAAACCTGGTGTTTTGGAATGCCATCTAGTATGGGA
TACATTTCTTGGAGTTGTTGGTTTATAGTAATGTTTCAAATAGATTGCCA
ACATTAAGAGGCTATTGCCTTAACCCCCAATCTAACAGAATATGAGAGGA
AAACCCTTCTGTAGAAGACATCACATACATGTGTCACAGGACACAGAGAA
ACCAGGCTGACATTAATGTGGATGACTCTCACATTGTGGATAGCTTTAAT
GTTACTAGAAGGCACTGTATAGACTTCTGAAGGAGAAATAATCTTACTGA
ACTATGAATCCTATGAACCCATATATTAACAGTTTTCAATCCTCAACAAA
GAGGTTTCATTTTTCAGTGAATAATGGCTTACTAGGAATTTACCTCTGGG
GATACTTTGACAGGACACTTGGTATCTACTTGCAAACCTTTTTCTGTTTC
AAGAAGTAGGTGGAACATTTTTTCCAAGTGTTTTCCCACCCTCCTCTGTA
TTCCTCCAGATGAGAATTTTCTGTTTTTATCCTTTTCCCCCATTTTTTTA
TATGGGGGTTTTTTCCCCCTTCCTTGATGTATCCTTCTCCTTGCGCGGTC
CTTTTTTCTCCTTCGCCAATTTTTCCN
| AGCGGAGCAGCGAGGGAGCGAGGAGGACGTTAGCGAACTCGCGGTCCATA
TCTACTATATATACTACACTGATAATANTATATCTAAAATACAATCACTC
CCTACACTAATACTTTCTCTATATGCCATTCATATCGCGCACCAGCGATA
CGTAGATGTTGAGCCAACCACATGTGTCTGATAGTACGCAGCAGTACCGA
TTATTATAGAGATATATACACCTATTATATTATATCTACAGAACAGCCAC
ATCCGAGCACATTACTGGTCACTGCACAGAGGACGCAGCGCGGTAGATAN
GGAAGCGACTACATAACGCATTTGAAGAGTCACAAGTCCTCATAGGGAGC
TACACGTATAATTGATTATTATATGTTAAGCGGGCTCGGACTGTGCTTCA
CGTCACGCTTGTACTTTCATCCGCGGCACACCCTCGACCAGCACTCGACA
CCATAAACTGTATAAAGCGCCGCAATCGGTTTCTCCCCTGTATTCCCTTT
CTAAAACACCTATTGTGTGCGCACAACACGAATATCCACATTGCCAGACT
AGAGCGCACAGCCTACACGACCACATAGGCGGTGGCGGGGCGCGACGAAA
GTCGAGTTGGTTATGTAGAGTAAGCGCAGCTGTGTGCTGTGGTGTAGGAG
TGGCGATACAGCGCGCGGCGCGATGAGGGACGAGCACACGGACGCTCGCG
TCGGGACACCAGAGAACTGGCCGTGTCTGACTAGACCCCGCGCCGCTGGC
TAGGGTCCCCGCCTATAATAACGCCGCCCTCGTATACCGGACGGGGCGAT
ATTAATAATATGTGAGGGAATGATACGCACGACGCGCGGCGCGCGAGGCA
CGCGGAAGAGGCGCACGCGGCGTGTGCGTGTAACCCGCTCTGCACTGCAC
CCACTGTACCCTCCTACTAGTTGTTGAGTGGGTGGCGATATGATGAGATC
AGCTGTGGTCTGTATGGCCGCCGCGTCATCCTTCACTCCCGCGCGCGCAC
TGCTAATATTCTGTGTCGCCTATGTATATCACACGATATGCGAGCCGACT
GAGTGGATACACGCGCTACGTGGCCGACATATGTGTGTAGTCGCAATCTA
TCGTCTTACATAGCGTAACTCTTGGTATGACTCTTATTGTCGGGCGCCAC
TGTTGTGCGTGACTCATGATTCTCTCCGACTCGCCCCACCTACTATATCT
ACAGTCTCGCCGATATACGCGCGGGCTGCATACTCGCGAGGCGGACTGAC
ATATCGACGATCGATGTGATGTAAGCACGTCACCGTTAGTACGCTGTGAC
GCC
|
quality values | Open.Hide.35 37 37 37 59 37 22 15 11 10 17 8 10 11 19 19 39 39 48 26 24 21 20 20 21 23 11 11 10 15 12 12 12 22 15 19 24 28 29 31 59 48 57 36 36 36 36 36 31 31
31 31 26 25 15 9 9 9 9 9 9 10 19 23 30 47 47 47 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 47 57 57 57 59 59 57 57 54 54 54 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 59 57 57 68 50 57 57 57 47 54 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 68 68 57 57 68 68
50 50 50 50 50 50 52 41 41 46 46 46 48 51 50 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 50 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 43 35 35
43 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 62 62 62 52 52 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 44 44 28 27 26 35 35 35 31 27 39 44 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57 52 57 52 57 52 52 52 52 52 52 57
57 57 57 57 54 50 50 43 50 52 52 52 54 59 59 57 68 57 57 52 52 52 57 57 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 44 44 43 43 43 57 57 68 68 68 59 59 59 48 48
48 48 54 59 41 32 20 20 31 28 35 35 36 36 25 33 25 30 32 27 20 20 28 41 59 68 68 59 59 43 43 32 32 28 36 24 28 28 28 28 28 37 37 41 57 42 42 32 39 30
42 42 48 57 57 59 57 57 43 59 39 41 41 47 39 39 39 39 41 37 37 30 37 39 37 22 13 8 8 8 12 13 34 34 39 39 35 35 25 30 29 23 23 15 19 15 19 17 10 10
12 22 28 28 22 22 13 12 11 21 21 21 16 19 19 17 17 17 19 18 26 32 23 23 16 12 9 9 9 9 16 10 15 11 11 8 8 8 8 8 12 14 11 16 10 15 12 8 8 8
8 8 10 15 23 23 33 33 19 19 12 12 12 12 11 9 9 6 10 14 7 9 10 8 8 8 8 8 8 11 10 8 6 7 8 8 10 13 12 8 8 8 7 7 9 9 10 10 8 8
8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 19 19 8 8 6 6 6 6 9 9 9 12 9 9 9 9 13 19 15 11 10 10 10 10 9 9 9 8 10 8
8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 9 8 8 10 10 10 10 15 16 11 8 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 12 11 11 11 17 16 27 23 13 10 9
9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 13 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 14 22 15 13 11 8 8 8 8 8 11 10 10 10 12 13 13 10 8 10 8 8 6 6 8 6 6 8
13 15 24 13 12 11 9 10 6 8 6 7 10 9 9 10 7 8 8 8 13 13 10 9 9 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 10 8 6 8 6 6 6 6 6 7 7 12 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 6 6 6 7 7 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 10 8 10
10 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 12 11 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 3 0 3 6 6 6 8 8 12 11 10 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6
10 6 6 8 6 6 8 6 8 8 6 6 7 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 10 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6
6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 13 9 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 11 11 11
6 7 9 7 7 7 10 10 10 8 9 9 8 8 10 10 12 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 15 15 13 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10
12 10 11 6 6 6 7 10 8 8 8 12 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 9 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 7 7 8 6 9 10 8 8 8 3 0
3 8 10 8 8 8 12 8 8 8 6 7 8 7 7 7 6 10 10 10 8 10 10 10 10 10 10 13 11 10 10 8 8 8 8 11 8 6 7 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 14 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 6 8 8 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 9 9 9 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 6 8 6 6 8 8 6 7 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12 11 8 10 8
8 8 10 6 6 8 6 8 8 8 13 11 12 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 8 8 8 10 8 8 8 13 10 10 11 9 9 8 13 12 10 10 10 10 11 11 9
9 7 7 8 8 8 8 8 8 7 8 7 9 8 10 10 10 8 8 8 9 9 10 15 18 13 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 9 6 8 6 6 8 6
6 6 8 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 10 7 9 10 10 8 8 8 8 9 11 11 10 10 10 8
8 8 8 8 8 7 8 7 6 6 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 8 11 8 9 9 9 12 9 9 9 9 9 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 11 11 11 8 8 8 6 6 8 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 11 11 10 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8
8 8 10 10 12 12 12 12 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 12 14 8 10 6 6 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6
6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 13 7 6 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 9 10 15 11 8 6 8 6 6 8 8 10 8 7 7 7 7 6 6 6 8
8 10 10 6 7 7 7 7 10 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 12 8 10 6 6 6 6 8 8 8 10 13 13 10 8 9 9 10 8 8 8 8 10 10 11
16 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 10 10 10 10 9 9 8 8 7 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 13 10 10 10 10 10 10 13 17 16 10 10 9 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 10 7 6 6 6 11 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6
8 8 13 10 9 9 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 8 11 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6
6 13 7 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 12 10 6 6 6 6 6 8 8 8 10 9 9 9 9 9 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 10 11 10 11 10 7 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 7 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 7 6 6 6 8 6 8 6 6 7 6 8 8 10 6 6
6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 6 6 6 10 11 13 10 8 8 8 11 10 10 9 9 9 6 7 7 7 8 6 6 8 8 8 6 6 7 7 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 7 8 10 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 9 11 10 9 9 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 10 10 8 8 9 8 6 6 6 8 6 9 9 11 11 6 6 6 6 6 10 15 9 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 6 8 10 10 6 6 6 8 6 8 8
8 8 8 |