BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-444E14.T7 (MSMg01no444_e14.b1) | MSMg01-444E14.TJ (MSMg01no444_e14.g1) |
ACC | AG533489 | AG533490 |
length | 771 | 743 |
length of high quality (start - end) | 69 (177 - 245) | 521 (78 - 598) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no444_e14.b1 PHD_FILE: MSMg01no444_e14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:12:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no444_e14.g1 PHD_FILE: MSMg01no444_e14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:12:09 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATAATTTGCGGCGCTAAACGACTCACATAGGTACGTATCTCGCGGAAT
CAGCCAGGACTTTCGAACACTACGTTGNACTCTATGGAGGAAAGAGGTTA
CAGAAGGAATGTATATGTACACATACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACATTCACACACACACACACACACTCTTATTATTTCCTGAGA
CAGGTTCTTCCTGTGCAGGCTGTGTCTGGCTCCTGCCTCGCTGCTCTATT
TTTGGGATTTGGAGCTCCTGCCTTTATCCTTGGTTCTAGCTTGGAAATGC
TGAACCTGGCTGTTATTTTTTTTGCAGACAAACACAAACCCAAAGGACAC
AGGCCTGATGTTTTTTGCCTTACCAAGAGTCTAAAATTTGGAATATGGCT
TTACAGAAAATAAAAATCGCAGCCCAAGTGGATACAAGTGACTGAAGATG
ACTTTACCAGAACATATTTGAGCTACTCAGTCCACAGAGGTATCATGACA
GGCTTTCCTAGCCACCTACTGTTCGATTGCCTATTCTCCCCCTGAGTTCT
TCAGCCTCACTTTTATAACACTCCCCCGGCTACCACCTATAAAGACCTTG
CTTCGTTTGTGATTTTCAACCCCCTTCTCCCTCGTCTCCCTTTTTACTCG
CCNTACCTTCATTATTATTTTCTATAAATATAAATAACTCATTGTATGTC
TAAAATCACTTTCCTCTTGTTCTCTCCCCATTACACCCTCCCCTATCTTC
TCCATTTCCCGCTCCCCACAG
| CCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATACTTAACCTCCTGAATTCAAA
GCAAAAACTAAAACTAAAAATAGAGTTACTGTACTAGCCAGCTGTACCAC
TCAAAGGACTATGTATACATGGTTAAGGTTTGCTTGTACTCGAAGGGCTC
TGAAGTCAACATATCACAAAGATACCCACACATCCGTGCTTGCTGTAGCA
CTGATCATAAGAGCAAAGTTATGAATGTTATGAGCTAGGTGAGCATTGGC
AACTGAGTCCAAAAAATGATGTTCATATACACAGTAGAGTTTTACTCATC
ATGAAATTATGTCATTTTTCAGGAAAATGGAGGCAACTGAAGAGCATCGT
ATTAAGCAAAAAAGACAGATACAAAGAGCTCATTCAATAGCTTTAGATGT
TATATAAACATATGAAATAATTTTTAAATGTGTCACAATAGTAGAAGTGA
ACTGTCTATAGGAACAATGAGGACTAACAGGATGACGGGGAAGGAAGGGA
GAATATATAGACAGATAGACACAATCCAGATACAGAATATACTCATAAGT
AAATATCTTCATGAAATCTATTACTATGCATAATAACTATATGCTGATAA
AAGCACCAAGCATTCTAACAAAATAGGAGAATGCAGAATTAGAGTAATCA
GTAGAGTTTGAGAGACAAATTAGAGATGCCCAGATTTTTAGTA
|
quality values | Open.Hide. 9 10 8 8 8 8 12 13 27 19 18 15 16 15 15 9 9 10 10 9 19 21 27 19 10 15 15 18 11 19 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11 15 11 9 9
19 19 33 33 33 21 21 8 7 7 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 15 3 0 3 29 29 59 59 47 50 50 50 50 53 53 59 59 59 59 57 57 48 48 43 37
37 37 36 37 48 59 48 42 36 36 36 23 28 22 22 25 19 16 32 17 17 17 29 28 44 48 54 54 54 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54
48 59 48 47 47 47 44 32 28 13 11 11 11 11 15 12 13 13 15 18 15 13 13 13 13 13 13 15 26 32 47 57 57 57 57 43 47 47 57 54 48 48 48 48 48 42 42 44 39 48
48 48 44 43 37 37 37 41 43 47 39 43 40 30 28 30 34 41 43 43 43 47 43 48 43 43 39 39 35 35 39 47 43 43 43 50 48 48 43 43 30 30 17 18 12 23 12 12 12 10
11 10 12 10 9 16 23 30 28 30 37 39 43 43 41 43 43 59 59 47 47 35 39 39 43 43 48 57 59 43 39 39 35 35 39 39 43 43 48 48 48 59 48 48 43 43 39 39 39 39
39 39 43 43 37 37 35 39 39 34 23 12 8 7 7 7 11 16 28 19 14 12 8 7 7 12 18 28 19 13 8 8 8 17 17 37 37 37 34 28 24 23 16 18 11 9 9 9 11 6
6 6 7 6 6 9 8 8 8 8 8 15 10 14 12 21 10 10 13 13 11 21 19 13 15 11 11 11 14 11 13 11 21 13 15 15 30 19 23 20 15 13 12 12 12 15 13 11 16 18
30 26 22 18 13 13 13 13 15 18 21 14 10 11 9 10 10 18 15 11 11 11 12 12 15 15 17 17 19 18 14 12 11 13 10 19 10 8 8 8 8 11 8 10 12 10 10 10 13 10
13 15 21 12 11 11 12 11 11 11 12 11 11 11 14 14 18 34 30 25 21 12 12 12 16 15 10 8 8 8 8 10 10 10 12 12 13 12 13 11 11 10 10 10 10 10 10 11 11 11
11 11 11 9 9 9 9 10 12 10 10 9 9 9 8 8 9 6 6 6 6 8 8 9 10 10 13 10 11 11 14 9 9 6 10 6 9 9 9 9 9 10 11 8 8 10 10 11 8 8
8 8 11 12 12 14 9 9 9 9 9 9 15 12 12 11 11 10 8 8 8 10 10 10 12 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 18
11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 10 9 8 8 6 7 12 12 13 10 8 8 17 12 12 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 15 13 18 19 13 10 9 8 8 10 8
8 3 0 3 8 8 8 8 11 9 9 10 10 8 10 8 8 10 12 15 15 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9
9 10 12 13 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 13 8 10 8 8 8 8 10 11 12 12 15 13 13 13 9 9 9 9 9 10 10
11 11 11 11 10 10 12 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 12 8 6 6 | Open.Hide. 3 3 8 8 8 10 8 8 8 8 12 17 26 26 30 37 31 36 37 36 39 39 39 39 39 37 31 31 37 17 16 10 6 6 6 6 6 7 8 10 8 13 13 26 21 30 22 19 33 28
30 33 30 33 33 37 37 37 23 18 8 6 6 6 7 7 16 17 17 23 21 11 18 23 28 29 24 33 33 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 33 33 33 23 28 15 15 19 28
34 37 37 37 39 50 50 50 50 57 57 59 57 53 53 44 43 34 34 34 37 34 42 43 43 43 48 50 57 57 57 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 50
51 50 47 47 47 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 50 50 57 57 59 59 59 59 50 50 57 57 57 57 47 47 41 41 39 37 59 59 39
44 32 28 28 32 37 37 47 47 50 59 50 50 53 50 50 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 43 59
57 54 54 54 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 68 68 59 59 57 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50
50 57 53 57 57 57 57 47 47 47 37 37 39 37 34 29 23 15 12 10 9 9 9 13 15 24 36 41 59 50 50 50 50 48 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48
48 54 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 48 44 39 35 35 41 43 57 57 57 57 57 57 57 44 44 32 37 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 37 37 37 44 44 57 59 59 59 57 57 54 54 54 54 48 57 59 59 48 48 59 59 59 59 57 48 48 48
48 53 57 59 50 50 50 50 50 47 59 59 59 44 41 41 44 39 39 41 42 41 39 39 39 37 37 41 59 47 47 47 47 47 48 48 48 48 48 48 43 44 43 50 47 47 44 44 44 37
37 44 44 41 59 59 47 41 41 39 39 39 37 37 39 44 39 47 47 46 46 41 43 43 41 36 32 43 59 39 41 40 40 39 39 39 27 24 24 24 27 27 32 33 33 39 41 37 37 41
59 59 59 47 47 46 59 47 48 48 48 48 48 48 48 46 43 32 28 18 18 17 17 17 30 27 19 20 20 28 32 37 35 35 35 27 27 15 20 20 28 22 30 25 30 17 22 13 19 19
19 14 14 19 32 23 20 20 20 18 18 14 11 11 11 11 16 19 33 30 33 36 39 37 43 37 48 39 39 36 36 37 39 39 34 37 41 43 47 59 59 43 37 37 30 31 30 24 24 28
34 29 30 24 23 18 20 25 30 37 39 34 37 34 25 25 17 17 17 18 17 23 13 10 10 10 10 12 12 18 28 25 23 12 11 10 10 12 10 10 8 10 10 15 13 11 10 10 8 10
12 12 11 15 11 17 13 20 21 23 22 22 24 30 28 30 24 21 10 8 6 6 8 6 11 21 18 18 20 19 17 18 24 27 15 11 8 9 9 9 9 9 9 |