BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-446E16.T7 (MSMg01no446_e16.b1) | MSMg01-446E16.TJ (MSMg01no446_e16.g1) |
ACC | AG535022 | AG535023 |
length | 743 | 746 |
length of high quality (start - end) | 328 (317 - 644) | 278 (318 - 595) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_e16.b1 PHD_FILE: MSMg01no446_e16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:14:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_e16.g1 PHD_FILE: MSMg01no446_e16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:14:46 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCGCGGAATTCTGCATAAT
TTACAGATAAAGTTTATAAATCTTGCATTTGTCTCTTGAAAAGTTAACAA
GATATTTCTAACAGTACTTTGGCAGTTTTTCAACTATTTTATGCATCATG
AAATTGAGTTCATGTGGTTTGCTTAAGGTTTCTTTACTAAATGGGAGTGT
TGAGTTCTTGTTTGCTTAAATGTAACTATTTCTCAACAACATTTATGTTT
TCCAATCACAAGAATCACAGTTACTGTGTTATATCTCTTGTCTTTCCTCA
ACTACATTCCATACTCTTCCACTTTTGTTGGTGTTGAGAAGGAGGAGACT
GAAGATGCACAGCTTGGTTCCATAATGCATCAGAGAAGAGTTTCTAAAGA
TTAAAAAAGTCCATGGAGATACTTTTAATCAAATAGACCACTGGAAACCA
GAAGTCATTATGCTATCAAAACAGAAGAAGAACCTGAAGAGTGAATTTAT
ATGTATTTTTAGGTATTTGGACTCTGTTCAAATTCATCCTTCTTTAGTTT
TCCTTTTTTTTTTACTTGGTGGTATTAATTAAAGTCAGTCAACTATTTAG
GATATATATATATATATATTACATAGATGATTAACGGTAGAAAGATTTAT
TTTATATGATGGATAAATAACAGATAGATAGATAGATAGAAACCTACCTA
CCTACTTACTTACCTACATACCTACATACCTACCTAGATACTT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXT
TCAGGAATTCCTATGTCATGAGAAGACTTCGGAGAAGAAAAGGTCTGGCC
AGATGAAGAGAACAGAGGCACGAAGGAGGGCACTGAAGTCAGAAAGATGA
ATTGCAACAAAGTATAATGACCTTATGTATGAAAATGCCGTAGGCCCCTA
AAGAAGGAGCTAGAGAAAATACCCAAGGAGCTAAAGGTGTTGTGCAACCC
TATAGGAAGATCAACAATATGAACTCACCACTACCCCCCAGAGCTGTGTC
TCTAGTTGTCNATTATCAGAGAATGGCCTAGTCGGCCATCAATGGAAAGA
GAGGACCTTGGTCTTGAGAAGGTCATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCA
GGGCCAGGAACACAGGAGTGGGTAGGTTGGGGGAGCAGGGCAGGGGGAGG
CTATAGGGGACTTTCAGGATAGCATTTTAAATGTAAATGAAGAAAATATC
TAATAAAAAAGAGAAAAAAAGAAAAAGAAAATGCTGTAATGATGCCTGCT
ACTCTGCATGCTAACTTTGAAAAATTAATTGAGAAAACATATTCACACAC
TTAGTAGTTTCCATTTAACATCTCTTAGAGAGCCTCTAATCACATGAAGA
GTGTTTTTCACCTGTCTAGAAAAAAATTATAATACCAGAATTTATAAGGA
GAAACAGAAAGGACCTTCCCGAACTTTATTGTGGCTGATGGATTTG
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 17 10 8 8 8 8 21 21 36 22 13 16 15 15 19 19 7 7 7 8 7 9 9 9 10 10 8 8 8 8 10 22 18 21 21 17 25 23 25 37 37 33 21 23 9 9 9
9 6 6 6 6 9 9 14 14 16 11 11 11 18 18 37 34 39 37 39 44 44 53 36 38 38 42 50 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 59 43 43 43 43 42 42 47 50 50 47
53 50 50 50 41 46 41 41 28 28 13 13 13 26 28 40 41 47 50 50 50 50 53 53 57 57 57 57 47 53 47 47 47 53 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 46 46 41 46
41 41 41 43 41 42 50 50 48 48 50 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 41 41
17 22 17 32 32 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 59 59 59 50 50 50 50 37 30 23 16 11 11 10 10 10 10 12 25 28 41 41
37 37 39 41 41 53 53 53 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 50 59 59
59 59 34 25 15 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 25 25 39 47 47 50 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 43 34 24 15 13 13 13
12 15 11 12 15 32 32 32 34 20 20 20 28 28 32 32 32 35 39 44 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 44 59 36 36 36 44 44 50 50 50 47 47 39 39 41 36 34 35
41 41 43 59 59 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 48 48 48 48 41 42 42 41 41 43 44 41 41 30 26 26 30 30 30 40 31 32 39 43 59 59 47 50 50 50 50 53 53 57
57 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 47 47 47 44 44 44 37 37 39 39 39 41 41 40 40 43 43 39 50 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 47 47 41 41 41 37 37 43
36 44 41 46 46 47 48 48 48 48 47 47 47 47 44 39 34 27 24 28 24 29 30 37 29 29 36 36 36 43 37 37 41 37 36 28 31 31 34 28 24 24 34 34 39 39 39 39 39 36
35 37 37 44 47 47 47 59 59 50 50 48 48 48 48 48 47 42 50 36 36 31 32 20 20 20 20 32 32 39 34 31 24 19 30 27 37 39 39 35 23 25 28 21 19 10 10 6 6 6
6 8 9 9 9 13 9 11 11 21 15 28 30 30 31 29 29 30 26 24 20 20 20 25 29 23 23 32 32 32 36 43 43 21 17 14 12 10 12 9 9 8 8 8 8 17 11 26 19 22
19 22 18 21 14 18 10 16 11 11 11 11 13 20 28 23 10 9 9 10 12 13 18 18 10 11 16 15 11 11 11 13 10 12 10 14 10 10 10 9 9 11 11 | Open.Hide.15 15 25 25 32 37 39 39 37 37 37 32 32 44 41 27 23 12 9 9 9 7 8 3 0 3 8 8 10 12 15 15 24 25 19 12 12 14 26 21 47 47 44 29 29 6 6 6 6 7
7 9 9 9 9 9 9 9 10 19 32 41 37 39 32 33 33 36 36 50 59 59 59 57 57 57 53 53 33 33 33 33 33 33 44 44 37 35 35 35 35 37 37 33 33 33 50 33 33 37
47 27 35 32 26 18 15 21 18 24 24 37 37 37 42 48 57 57 57 57 43 42 42 48 48 50 50 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 50 42 42 41 41
41 41 42 41 54 54 48 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 32 25 10 9 9 9 9 9 19 32 44 57
57 46 46 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 29 25 8 10 8 3 0 3 6 6 6 6 8 8 16 27 34 47 50 50 50 50 50 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 44 43 39 41 41
43 43 43 46 48 54 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 68 57 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 46 46 41 41 59 43 41 41 44 44 44 47 47 42 39 39 39 43
43 59 59 59 57 57 59 57 57 43 43 43 47 48 43 48 48 48 48 48 42 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 57 54 54 59 59 59 57 46 37 37 33 33 30 39 39 43 47
48 48 59 43 39 39 43 47 43 35 43 37 34 34 24 20 23 28 20 20 32 25 24 28 25 28 28 34 34 41 39 39 37 43 39 39 35 35 37 43 43 43 48 43 43 37 39 35 47 40
57 39 39 28 23 18 14 24 28 39 43 48 47 47 30 32 37 28 28 23 26 30 30 39 39 35 28 28 36 32 39 35 35 32 27 29 32 36 36 37 30 25 21 11 11 15 23 12 14 14
25 22 17 17 22 24 27 27 27 25 22 22 28 39 34 30 15 15 15 19 10 13 10 10 10 10 9 9 14 26 26 21 16 12 15 15 15 14 11 11 12 16 22 25 12 16 12 9 9 9
9 9 12 12 16 16 20 16 11 11 12 22 21 11 11 11 16 15 20 31 29 29 14 14 14 15 15 12 10 10 13 13 13 13 10 10 10 10 12 18 12 8 8 8 8 7 8 9 20 22
28 18 12 12 13 11 13 12 18 18 18 15 15 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 14 21 23 28 23 21 11 11 11 11 11 11 13 17 10 10 10 9 9 11 12 10 |