BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023H07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 126,522,696 - 126,679,741
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAU040320
Upstream geneCsf3r, Mrps15, 1810007P19Rik, LOC100039645, Lsm10, Stk40, 2610027C15Rik, 1700029G01Rik, Thrap3, Mtap7d1, Trappc3, Col8a2, EG667193, Adprhl2, Tekt2, Eif2c3, Eif2c1, LOC100039351, Eif2c4, Clspn, LOC665197, 5730409E04Rik, LOC620877, Psmb2, Tcfap2e, Ncdn
Downstream geneSfpq, Zmym1, LOC665245, Zmym6, LOC100039968, LOC621588, Dlgap3, BC003266, Gja4, Gjb3, Gjb4, Gjb5, LOC667296, LOC635169
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023H07.bB6Ng01-023H07.g
ACCDH855369DH855370
length9241,154
definitionDH855369|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023H07, 5' end.DH855370|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023H07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,678,813 - 126,679,741)(126,522,696 - 126,523,863)
sequence
gaattccacacccctaagccccttaccccataaaaacccctagctttcga
gcctcggggccgacatccgttatctcctgtgtgggatgcatgtcggtccg
gagctccgtcattaaacgtcttcatgcaattacatcaagagatggtcctt
tgtgattttttgggtgcacgccgaatcagaaattgggtgggggtttcccc
actaggtctaacagtatcacgtatattcggggtacccagggaagtcactg
ggtcctctcgaactggagtggtagatggttgtgagtcactatgtaggtgc
tgagagttgaacctggttctttgcaaaagcagcgaatgctgtcatgtaat
gaggcatctctggtttcaaggcatttattgagtgtaattatggttcataa
tcgtgtgtgtggaaatattggaaaagtacagctttacaggtgagaaagga
gaagaggtccaacatgttctcaccttaagcacgctcccttgctagtttac
ctatgtttcccctttaagagtttaatctttattttaattttattgttatt
tttaatgtatattcagtgatttgcctatgtgtgtgtatgggtaccacatg
tgttcctggtgtccatggaagaagtcatcagataccctacaactgaagtt
atacacacttatgagtctccttataggtgatgagaaccagggtctcaatt
ggcttctctgccagagcaacgaatacttagctgataagatatctctcttg
ttttcttttttttttaaagatttatttattattatatgtaagtacactgt
agctgtcttcagacacaccagaagagggagtcagatcttgttgcggatgg
ttgtgagccaccatgtggtggtggtattgaacttggaccttcgaagaaca
atcgggtgtcttcccattgagcaa
gaattcccatcttttattgtaaaggctagggtctggagtttgcaggaccc
attgttagctttaagtcaaggacaggacagctcaactttacatcatacgt
ggaaggtgccgctgtactttggcatagcttgtcctggaagcagctggtca
gggcccctgggatacttgggaccctcagctgtcctgcatactgatgagtc
agtatcttggttgtatctagaatccatgtggcccaatgactgggaaggtt
tgctttatggtactaaggggcaggccctcagagagattgaaattaaggca
gagggagcagtcacaagttcaaacaacaggtagaaagcaaatggattctg
ggcttggagtgatgtcatttcaaaccagcagccccgctgtgtagggcctg
cccttttgctatcacagaattcagtgtttggtttacagataatctttcca
gcattgacattcacaaagcaatgacatgctttgcgtgtgaccggttacaa
acccaggtgcctggctgttttagcttgcaaaggctgatagcagggatgga
ggcacagccagaccctattctccctgctcctgctgactgtttggacggca
gcctcctgcaatcagagtatcttttaaaaaggagtaagcgttagggtcct
gggtaacagatggggaatctggctctgctccttggggccctctctgtgtt
gtcctctgtaacatgaagataggacagaacccctttcttgctggcctgct
gtggcagtgcatgtcaccaaaggctgagtactatgtctgtcacagacaca
gggtgagttgaagatgtggctaggggctgctaccatgcacactgacgctg
ctgtctgtctctgtgtggaccgtgtaagcacactgacgctgttgtctgtc
tctgcagcaccaagatgttgtttttgttcagaacgaccctccccacagct
cttcaaggccatgagtggcagcatgcttcaggagcgagctgcagaggcag
aagctgacttcctcatcttcagagccctggaaatcagccagtcagtagtt
ggggcctgggagccagctccttacaacattcctatgggactcctctcggg
ctcacaggcaccgtgacctggttagaaaatatctggatcttatattatca
gcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_126678813_126679741
seq2: B6Ng01-023H07.b_40_963 (reverse)

seq1  TGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGCTCTTCCGAAGGTCCAGAGTTC  50
      | ||||| |||| |||| ||||||| || |||| |||||||||| |||||
seq2  TTGCTCAATGGG-AAGA-CACCCGATTGTTCTT-CGAAGGTCCA-AGTTC  46

seq1  AAATACCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGCAACAAGATCTGA  100
       ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -AATACCA-CCACCACATGGTGGCTCACAACCATCCGCAACAAGATCTGA  94

seq1  CTCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTACATATAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTACTTACATATAAT  144

seq1  AATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAAGAAAACAAGAGAGATATCTTATCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAAGAAAACAAGAGAGATATCTTATCAG  194

seq1  CTAAGTATTCGTTGCTCTGGCAGAGAAGCCAATTGAGA-CCTGGTTCTCA  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTAAGTATTCGTTGCTCTGGCAGAGAAGCCAATTGAGACCCTGGTTCTCA  244

seq1  TCACCTATAAGGAGACTCATAAGTGTGTATAACTTCAGTTGTAGGGTATC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTATAAGGAGACTCATAAGTGTGTATAACTTCAGTTGTAGGGTATC  294

seq1  TGATGACTTCTTCCATGGACACCAGGAACACATGTGGTACCCATACACAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGACTTCTTCCATGGACACCAGGAACACATGTGGTACCCATACACAC  344

seq1  ACATAGGCAAATCACTGAATATACATTAAAAATAACAATAAAATTAAAAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGCAAATCACTGAATATACATTAAAAATAACAATAAAATTAAAAT  394

seq1  AAAGATTAAACTCTTAAAGGGGAAACATAGGTAAACTAGCAAGGGAGCGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATTAAACTCTTAAAGGGGAAACATAGGTAAACTAGCAAGGGAGCGT  444

seq1  GCTTAAGGTGAGAACATGTTGGACCTCTTCTCCTTTCTCACCTGTAAAGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAGGTGAGAACATGTTGGACCTCTTCTCCTTTCTCACCTGTAAAGC  494

seq1  TGTACTTTTCCAATATTTCCACACACACGATTATGAACCATAATTACACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACTTTTCCAATATTTCCACACACACGATTATGAACCATAATTACACT  544

seq1  CAATAAATGCCTTGAAACCAGAGATGCCTCATTACATGACAGCATTCGCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAATGCCTTGAAACCAGAGATGCCTCATTACATGACAGCATTCGCT  594

seq1  GCTTTTGCAAAGAACCAGGTTCAACTCTCAGCACCTACATAGTGACTCAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTGCAAAGAACCAGGTTCAACTCTCAGCACCTACATAGTGACTCAC  644

seq1  AACCATCTACCACTCCAGTTCGAGAGGACCCAGTGACTTCCCTGGGTACC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCTACCACTCCAGTTCGAGAGGACCCAGTGACTTCCCTGGGTACC  694

seq1  CCGAATATACGTGATACTGTTAGACCTAGTGGGGAAACCCCCACCCAATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAATATACGTGATACTGTTAGACCTAGTGGGGAAACCCCCACCCAATT  744

seq1  TCTGATTCGGCGTGCACCCAAAAAATCACAAAGGACCATCTCTTGATGTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATTCGGCGTGCACCCAAAAAATCACAAAGGACCATCTCTTGATGTA  794

seq1  ATTGCATGAAGACGTTTAATGACGGAGCTCCGGACCGACATGCATCCCAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCATGAAGACGTTTAATGACGGAGCTCCGGACCGACATGCATCCCAC  844

seq1  ACAGGAGATAACGGATGTCGGCCCCGAGGCTCGAAAGCTAGGGGTTTTTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGATAACGGATGTCGGCCCCGAGGCTCGAAAGCTAGGGGTTTTTA  894

seq1  TGGGGTAAGGGGCTTAGGGGTGTGGAATTC  929
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTAAGGGGCTTAGGGGTGTGGAATTC  924

seq1: chr4_126522696_126523863
seq2: B6Ng01-023H07.g_69_1222

seq1  GAATTCCCATCTTTTATTGTAAAGGCTAGGGTCTGGAGTTTGCAGGACCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCATCTTTTATTGTAAAGGCTAGGGTCTGGAGTTTGCAGGACCC  50

seq1  ATTGTTAGCTTTAAGTCAAGGACAGGACAGCTCAACTTTACATCATACGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAGCTTTAAGTCAAGGACAGGACAGCTCAACTTTACATCATACGT  100

seq1  GGAAGGTGCCGCTGTACTTTGGCATAGCTTGTCCTGGAAGCAGCTGGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGTGCCGCTGTACTTTGGCATAGCTTGTCCTGGAAGCAGCTGGTCA  150

seq1  GGGCCCCTGGGATACTTGGGACCCTCAGCTGTCCTGCATACTGATGAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCCCTGGGATACTTGGGACCCTCAGCTGTCCTGCATACTGATGAGTC  200

seq1  AGTATCTTGGTTGTATCTAGAATCCATGTGGCCCAATGACTGGGAAGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCTTGGTTGTATCTAGAATCCATGTGGCCCAATGACTGGGAAGGTT  250

seq1  TGCTTTATGGTACTAAGGGGCAGGCCCTCAGAGAGATTGAAATTAAGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTATGGTACTAAGGGGCAGGCCCTCAGAGAGATTGAAATTAAGGCA  300

seq1  GAGGGAGCAGTCACAAGTTCAAACAACAGGTAGAAAGCAAATGGATTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAGCAGTCACAAGTTCAAACAACAGGTAGAAAGCAAATGGATTCTG  350

seq1  GGCTTGGAGTGATGTCATTTCAAACCAGCAGCCCCGCTGTGTAGGGCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGGAGTGATGTCATTTCAAACCAGCAGCCCCGCTGTGTAGGGCCTG  400

seq1  CCCTTTTGCTATCACAGAATTCAGTGTTTGGTTTACAGATAATCTTTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTTGCTATCACAGAATTCAGTGTTTGGTTTACAGATAATCTTTCCA  450

seq1  GCATTGACATTCACAAAGCAATGACATGCTTTGCGTGTGACCGGTTACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGACATTCACAAAGCAATGACATGCTTTGCGTGTGACCGGTTACAA  500

seq1  ACCCAGGTGCCTGGCTGTTTTAGCTTGCAAAGGCTGATAGCAGGGATGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGTGCCTGGCTGTTTTAGCTTGCAAAGGCTGATAGCAGGGATGGA  550

seq1  GGCACAGCCAGACCCTATTCTCCCTGCTCCTGCTGACTGTTTGGACGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGCCAGACCCTATTCTCCCTGCTCCTGCTGACTGTTTGGACGGCA  600

seq1  GCCTCCTGCAATCAGAGTATCTTTTAAAAAGGAGTAAGCGTTAGGGTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCTGCAATCAGAGTATCTTTTAAAAAGGAGTAAGCGTTAGGGTCCT  650

seq1  GGGTAACAGATGGGGAATCTGGCTCTGCTCCTTGGGGCCCTCTCTGTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAACAGATGGGGAATCTGGCTCTGCTCCTTGGGGCCCTCTCTGTGTT  700

seq1  GTCCTCTGTAACATGAAGATAGGACAGAACCCCTTTCTTGCTGGCCTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTGTAACATGAAGATAGGACAGAACCCCTTTCTTGCTGGCCTGCT  750

seq1  GTGGCAGTGCATGTCACCAAAGGCTGAGTACTATGTCTGTCACAGACACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCAGTGCATGTCACCAAAGGCTGAGTACTATGTCTGTCACAGACACA  800

seq1  GGGTGAGTTGAAGATGTGGCTA-GGGCTGCTACCATGCACACTGACGCTG  849
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGAGTTGAAGATGTGGCTAGGGGCTGCTACCATGCACACTGACGCTG  850

seq1  CTGTCTGTCTCTGTGTGGACCGTGTAAGCACACTGACGCTGTTGTCTGTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTGTCTCTGTGTGGACCGTGTAAGCACACTGACGCTGTTGTCTGTC  900

seq1  TCTGCAGCACCAAGATGTTGTTTTTTGTTCAGAACGACCCTCCCCACCAG  949
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TCTGCAGCACCAAGATGTTG-TTTTTGTTCAGAACGACCCTCCCCA-CAG  948

seq1  CTCTTCAAAGGCCATGAGGTGGCAGCCATGC-TCAAGAGCGAGCTGCAGA  998
      |||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||
seq2  CTCTTC-AAGGCCATGA-GTGGCAG-CATGCTTCAGGAGCGAGCTGCAGA  995

seq1  AGCAGAAGGCTGACTTCCTCATCTTCAGAGCCCTGGAAATCAGCACAGTC  1048
       |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGCAGAA-GCTGACTTCCTCATCTTCAGAGCCCTGGAAATCAGC-CAGTC  1043

seq1  AGTAAGTTGTGGGCTGTGAGCACAGCTCCTACAAACATTCCCATGGGGAC  1098
      ||| ||||| || ||| |||| ||||||||   |||||||| || |||||
seq2  AGT-AGTTGGGGCCTGGGAGC-CAGCTCCTTACAACATTCCTAT-GGGAC  1090

seq1  TCACCCCGGGGCCCACAGGGGAACTGTGAGCCTGGTAAGAAAATAACTGG  1148
      || | |  |||| ||||  || || |||| |||||| |||||||| ||||
seq2  TC-CTCTCGGGCTCACA--GGCACCGTGA-CCTGGTTAGAAAATATCTGG  1136

seq1  ATCTTTATTTTATCCAGCCT  1168
      ||| |||| |||| ||||||
seq2  ATC-TTATATTAT-CAGCCT  1154