BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-029D14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 46,971,761 - 47,038,141
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGabbr2, Anks6
Upstream geneTdrd7, Tmod1, BC057893, AU014645, Xpa, LOC624430, LOC666379, LOC666389, Foxe1, 5830415F09Rik, Hemgn, LOC100040643, Anp32b, Nans, Trim14, Coro2a, Tbc1d2
Downstream geneLOC435781, Galnt12, Col15a1, Tgfbr1, LOC666236, LOC666473, Alg2, Sec61b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-029D14.bB6Ng01-029D14.g
ACCDH859483DH859484
length1,0941,024
definitionDH859483|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-029D14, 5' end.DH859484|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-029D14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,037,049 - 47,038,141)(46,971,761 - 46,972,789)
sequence
gaattcaagcagccgccattgggctcagctttccttgtaggggataaaaa
tgtcctcaaactgggctggaactgggggtggagggtagttctggtgatag
acagttacttagcatgtcccaagtcctaggttcaaatcccagcactgctc
aaaacagctgtggctgtgcacacaaccccgcactcaggaggtggagaccg
gaaggaagttcaaagacagcttgagaccctgctcccagaaggaagtcctg
acaccaagtgtactaatctaattgcatgctttaaacacagctgtatatgg
tgacttgcagagcaggtgggttatatatcagtaacatttaaaaactcact
gtattaaccaaataaaatgtcctgcaggccaccagccctgggctgtgatc
accggtttagagttctctagtgacagcttgacacataaaagctgctgtca
ttcatcgccccctgcaagctggggattcggggaaagctacagagacagat
gtgtgcacacagatgtgtgcacagccttcttcctcaatttccttcctgtc
ctgtcctctcttgtctccttggcctttgaaacttccacagagctttcttt
gtttccaagagccgtttcctgattcctcgctactgcctgctcttcgttga
ggtgtccacagaacatgtctcagactgtacctcgcttctattccgtgagc
tgtgtggcccttgtcctcaaagtctagtgtggctctgaagctccagccat
cacacctacactgtgtatgcaggactgggtggatagggctggatttgttg
ggtgtgggagcctgttcctgcccctctgggtttcaggctgctgcagagtg
ggtggggtgtcttcacctgggccactctgacaatctcccagccccaggga
tgggaagcctgttagcctctctccatagcacgggccatttcttcttgaca
cgtagataggccaatagggctggcagcatgtcacctgcaggacatagggt
acagttgcaccacgtcgctgctggtggtcttgcctggctctctatgaccc
ttctctcttctcttgcatctgctcatctctcaagcggtcttctc
gaattccccagaagctcacagagcagctagctaggagttcacagggtggt
agaacaagggaggcctgcctcaacatggtggaagaagaaaatcaactccc
tgaagttacacatggactgtggcaacttgcacctgtacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacaaacaaataaaaacat
acttagagagagagagagagacagagaggagtgctgccatgtcttctaca
cacacatgtctgctttcctaagtaacagaacctgagacactcacgctgtg
tgtatttgctatggttgggtttactgctatggtggatattgagggctcca
ttagtatccagccattagtggctcacggctgggacccttcctggatgaag
ctggcctcatggtcaggggcctggctcatgccagaggagagcccctaacc
tcggagtcacactgcacagcactgcaaatgagctcaccaccactggatgc
tgggtccttcgagttgttaaactggtaacacttggcatcatttcccttct
tttataaaattagaaacttaaaactgggtatggcggagcattcctgtaac
ctcagcacttgggagacagaggcaggaggatctagagtttgaggccagcc
tgatctacatgatgaatttagcctgtctctaaaaacaaataaaacaagac
aagttcacctgctgtttcctacctcatggctcagaattttacttcggggg
tgactttgaggttaaagggttgcactcagcagtggccgtaacatggctgt
ggggcgctgttggggcttctgatcattattccccagggtagcagcttaga
cgatagcatcagtatacagaaatatagtgcttgaaattgtctgaagatca
aaactatggttttgctaatcttggctctcaggaaggggcagtgtggagaa
cctacgcagggctcacggagaggcttggctggcgagtgggtgaacagcgc
aacacaagtagggaaaacgaactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_47037049_47038141
seq2: B6Ng01-029D14.b_47_1140 (reverse)

seq1  GAGAAGACAGCCTGAGAGATGAGCAGATGCAAGAGAGGAGAGAAGGGTCA  50
      |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GAGAAGACCGCTTGAGAGATGAGCAGATGCAAGAGAAGAGAGAAGGGTCA  50

seq1  TAGAGAGCCAAGGCAGAGA-CACCAGCAGCGACGT-GTGCAACTGTACCC  98
      ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAGAGAGCC-AGGCA-AGACCACCAGCAGCGACGTGGTGCAACTGTACCC  98

seq1  TTTGTCCTTGCAGGTGACATGCTGCCAGCCCTATTGGCCTATCTACGTGT  148
      | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCC-TGCAGGTGACATGCTGCCAGCCCTATTGGCCTATCTACGTGT  147

seq1  CAAGAAGAAATGG-CCGTGCTATGGAGAGAGGCTAACAGGCTTCCCATCC  197
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAGAAATGGCCCGTGCTATGGAGAGAGGCTAACAGGCTTCCCATCC  197

seq1  CTGGGGCTGGGAGATTGTCAGAGTGGCCCAGGTGAAGACACCCCA-CCAC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTGGGGCTGGGAGATTGTCAGAGTGGCCCAGGTGAAGACACCCCACCCAC  247

seq1  TCTGCAGCAGCCTGAAACCCAGAGGGGCAGGAACAGGCTCCCACACCCAA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGCAGCCTGAAACCCAGAGGGGCAGGAACAGGCTCCCACACCCAA  297

seq1  CAAATCCAGCCCTATCCACCCAGTCCTGCATACACAGTGTAGGTGTGATG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCCAGCCCTATCCACCCAGTCCTGCATACACAGTGTAGGTGTGATG  347

seq1  GCTGGAGCTTCAGAGCCACACTAGACTTTGAGGACAAGGGCCACACAGCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGCTTCAGAGCCACACTAGACTTTGAGGACAAGGGCCACACAGCT  397

seq1  CACGGAATAGAAGCGAGGTACAGTCTGAGACATGTTCTGTGGACACCTCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGAATAGAAGCGAGGTACAGTCTGAGACATGTTCTGTGGACACCTCA  447

seq1  ACGAAGAGCAGGCAGTAGCGAGGAATCAGGAAACGGCTCTTGGAAACAAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAAGAGCAGGCAGTAGCGAGGAATCAGGAAACGGCTCTTGGAAACAAA  497

seq1  GAAAGCTCTGTGGAAGTTTCAAAGGCCAAGGAGACAAGAGAGGACAGGAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCTCTGTGGAAGTTTCAAAGGCCAAGGAGACAAGAGAGGACAGGAC  547

seq1  AGGAAGGAAATTGAGGAAGAAGGCTGTGCACACATCTGTGTGCACACATC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAAATTGAGGAAGAAGGCTGTGCACACATCTGTGTGCACACATC  597

seq1  TGTCTCTGTAGCTTTCCCCGAATCCCCAGCTTGCAGGGGGCGATGAATGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTGTAGCTTTCCCCGAATCCCCAGCTTGCAGGGGGCGATGAATGA  647

seq1  CAGCAGCTTTTATGTGTCAAGCTGTCACTAGAGAACTCTAAACCGGTGAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCTTTTATGTGTCAAGCTGTCACTAGAGAACTCTAAACCGGTGAT  697

seq1  CACAGCCCAGGGCTGGTGGCCTGCAGGACATTTTATTTGGTTAATACAGT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCCCAGGGCTGGTGGCCTGCAGGACATTTTATTTGGTTAATACAGT  747

seq1  GAGTTTTTAAATGTTACTGATATATAACCCACCTGCTCTGCAAGTCACCA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTTTAAATGTTACTGATATATAACCCACCTGCTCTGCAAGTCACCA  797

seq1  TATACAGCTGTGTTTAAAGCATGCAATTAGATTAGTACACTTGGTGTCAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGCTGTGTTTAAAGCATGCAATTAGATTAGTACACTTGGTGTCAG  847

seq1  GACTTCCTTCTGGGAGCAGGGTCTCAAGCTGTCTTTGAACTTCCTTCCGG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCCTTCTGGGAGCAGGGTCTCAAGCTGTCTTTGAACTTCCTTCCGG  897

seq1  TCTCCACCTCCTGAGTGCGGGGTTGTGTGCACAGCCACAGCTGTTTTGAG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCACCTCCTGAGTGCGGGGTTGTGTGCACAGCCACAGCTGTTTTGAG  947

seq1  CAGTGCTGGGATTTGAACCTAGGACTTGGGACATGCTAAGTAACTGTCTA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTGGGATTTGAACCTAGGACTTGGGACATGCTAAGTAACTGTCTA  997

seq1  TCACCAGAACTACCCTCCACCCCCAGTTCCAGCCCAGTTTGAGGACATTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAGAACTACCCTCCACCCCCAGTTCCAGCCCAGTTTGAGGACATTT  1047

seq1  TTATCCCCTACAAGGAAAGCTGAGCCCAATGGCGGCTGCTTGAATTC  1093
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCCCTACAAGGAAAGCTGAGCCCAATGGCGGCTGCTTGAATTC  1094

seq1: chr4_46971761_46972789
seq2: B6Ng01-029D14.g_67_1090

seq1  GAATTCCCCAGAAGCTCACAGAGCAGCTAGCTAGGAGTTCACAGGGTGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCAGAAGCTCACAGAGCAGCTAGCTAGGAGTTCACAGGGTGGT  50

seq1  AGAACAAGGGAGGCCTGCCTCAACATGGTGGAAGAAGAAAATCAACTCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAGGGAGGCCTGCCTCAACATGGTGGAAGAAGAAAATCAACTCCC  100

seq1  TGAAGTTACACATGGACTGTGGCAACTTGCACCTGTACACACACACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTTACACATGGACTGTGGCAACTTGCACCTGTACACACACACACAC  150

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACAAATAAAAACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACAAATAAAAACAT  200

seq1  ACTTAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGGAGTGCTGCCATGTCTTCTACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGGAGTGCTGCCATGTCTTCTACA  250

seq1  CACACATGTCTGCTTTCCTAAGTAACAGAACCTGAGACACTCACGCTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATGTCTGCTTTCCTAAGTAACAGAACCTGAGACACTCACGCTGTG  300

seq1  TGTATTTGCTATGGTTGGGTTTACTGCTATGGTGGATATTGAGGGCTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTGCTATGGTTGGGTTTACTGCTATGGTGGATATTGAGGGCTCCA  350

seq1  TTAGTATCCAGCCATTAGTGGCTCACGGCTGGGACCCTTCCTGGATGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTATCCAGCCATTAGTGGCTCACGGCTGGGACCCTTCCTGGATGAAG  400

seq1  CTGGCCTCATGGTCAGGGGCCTGGCTCATGCCAGAGGAGAGCCCCTAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTCATGGTCAGGGGCCTGGCTCATGCCAGAGGAGAGCCCCTAACC  450

seq1  TCGGAGTCACACTGCACAGCACTGCAAATGAGCTCACCACCACTGGATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGAGTCACACTGCACAGCACTGCAAATGAGCTCACCACCACTGGATGC  500

seq1  TGGGTCCTTCGAGTTGTTAAACTGGTAACACTTGGCATCATTTCCCTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCCTTCGAGTTGTTAAACTGGTAACACTTGGCATCATTTCCCTTCT  550

seq1  TTTATAAAATTAGAAACTTAAAACTGGGTATGGCGGAGCATTCCTGTAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAAAATTAGAAACTTAAAACTGGGTATGGCGGAGCATTCCTGTAAC  600

seq1  CTCAGCACTTGGGAGACAGAGGCAGGAGGATCTAGAGTTTGAGGCCAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCACTTGGGAGACAGAGGCAGGAGGATCTAGAGTTTGAGGCCAGCC  650

seq1  TGATCTACATGATGAATTTAGCCTGTCTCTAAAAACAAATAAAACAAGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTACATGATGAATTTAGCCTGTCTCTAAAAACAAATAAAACAAGAC  700

seq1  AAGTTCACCTGCTGTTTCCTACCTCATGGCTCAGAATTTTACTTC-GGGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAGTTCACCTGCTGTTTCCTACCTCATGGCTCAGAATTTTACTTCGGGGG  750

seq1  TGACTTTGAGGTTAAA-GGTTGCACTCAGCAGTGGCCGTAACATGGCTGT  798
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTGAGGTTAAAGGGTTGCACTCAGCAGTGGCCGTAACATGGCTGT  800

seq1  GGGGCGCTGTTGGGGCTTCTGATCATTATTCCCCAGGGTAGCAGCTTAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCGCTGTTGGGGCTTCTGATCATTATTCCCCAGGGTAGCAGCTTAGA  850

seq1  CGATAGCATCAGTATACAGAAATATAGTGCTTGAAATTGTCTGAAGATCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATAGCATCAGTATACAGAAATATAGTGCTTGAAATTGTCTGAAGATCA  900

seq1  AAACTATGGTTTTGCTAAGCTTGGCTCTCAGGAAGGAGGCAGTGTGGAGA  948
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAACTATGGTTTTGCTAATCTTGGCTCTCAGGAAGG-GGCAGTGTGGAGA  949

seq1  ACCTACGCAGGGCTCACGGGAGAGGCTTGGCTGGCGAGTGGGTGAACAAG  998
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACCTACGCAGGGCTCAC-GGAGAGGCTTGGCTGGCGAGTGGGTGAAC-AG  997

seq1  CGGCAACACAAGGTTGGGAAAATCTGAACTC  1029
      | ||||||||| || |||||||   ||||||
seq2  C-GCAACACAA-GTAGGGAAAA--CGAACTC  1024